February 2nd, 2021
在这里,为酵母的代谢标记提供 14个C-醋酸,这与薄层色谱相结合,用于中性脂质的分离。
该技术使用大多数实验室环境中常见的仪器,并允许同时分析多个样本。这种方法可以提供关键见解,了解脂质代谢酶在细胞上下文和不同遗传背景中是如何调节的。将菌落从酵母培养板中接种到含有2%德克斯特罗斯的20毫升SC介质中,并在30摄氏度下孵育过夜,在200转/分处摇晃。
第二天,将50毫升新鲜介质中的培养物质稀释至0.2的最终OD,并将其生长24小时,直到达到静止阶段。为每个样品准备两个20毫升的淬火缓冲器,并将它们储存在零下80摄氏度。同时,通过将醋酸钠盐加入无脱氧核糖核酸的无SC介质中,以每毫升10微库里的最后浓度,准备放射性标签介质。
通过离心在 4,100 x g 下收集细胞 10 分钟。取出超高颗粒,用20毫升的脱氧层自由SC介质清洗细胞颗粒一次。通过在 4,100 x g 下离心五分钟再次收集细胞,然后使用脱氧自由介质将其转移到标记为 2 毫升的微中心管中。
再离心细胞两分钟。将细胞重新吸收到 500 微升的 dextrose 自由 SC 介质中,并通过快速在每个细胞悬架中添加 500 微升的无线电标签介质来开始无线电标签期。在30摄氏度的旋转孵化器中孵育管子20分钟。
同时,预冷离心机配备50毫升圆锥管零下10摄氏度,解冻一个20毫升的淬火缓冲器。一旦无线电标签期结束,使用移液器将整个一毫升样品放入冰上解冻的淬火缓冲器中。在预冷却离心机中旋转5000 x g,收集细胞颗粒3分钟,并加入20毫升新鲜的冷淬火缓冲器。
漩涡和摇动样品,以完全恢复他们在淬火缓冲和离心样品再次收集细胞。一旦细胞被颗粒化,彻底去除所有淬火缓冲从样品中倒出超强的和去除多余的移液器。将管子存放在零下 80 摄氏度,以便进一步加工。
每份样品重0.3克酸洗玻璃珠,并储存在冰上两毫升微中心管中。从零下80度的冰柜中取出细胞颗粒,并将其放在冰上。然后,在每个样品中加入350微升甲醇和700微升氯仿,然后重新使用细胞。
将其转移到含有预称重玻璃珠的微型离心机管中。通过在一分钟内通过三次漩涡来解冻细胞,在搅拌之间的冰上孵育30秒。将细胞倒入15毫升玻璃离心机管中,将管子标记为A管,用一毫升甲醇清洗微中心管,旋涡,将甲醇倒入A管中,加入两毫升氯仿,然后加入400微升水到A管,最终样本量为4.45毫升。
将样品旋转一分钟,然后在 1000 x g 下离心 5 分钟,以明确分离水性和有机相,并将细胞碎片位于接口中。使用玻璃牧场移液器,将有机相收集到标有 B 的新型玻璃离心机管中,并加入一毫升一毫升的摩尔氯化钾。在A管中加入1毫升甲醇和2毫升氯仿,并重复涡流和离心步骤。
漩涡和离心机管B分离水性和有机相。取出上部水性层,将整个底部有机层收集到四毫升玻璃瓶中。通过在惰性气体下干燥,将溶剂从脂质提取物中完全蒸发,并将烤箱预热至 145 摄氏度,以加热 TLC 板。
在将细胞加载到 TLC 板之前,确定细胞占用的相对放射性标签量。通过涡流五分钟,以一比一的比例将氯仿和甲醇的样品脂质重新计算在 40 到 50 微升中。在玻璃分级气缸中准备 101 毫升移动相溶剂。
然后,将溶剂倒入玻璃 TLC 室,其中包含 20 乘 20 TLC 饱和垫和紧贴盖子。准备一个通道20乘20硅胶60G板,并用铅笔标记一条线1.5厘米以上的板底。一旦板已充分加热,TLC饱和垫已饱和溶剂,从烤箱中取出TLC板,并立即开始加载。
使用移液器,将五微升样品发现到位于 TLC 板底部上方 1.5 厘米的每个车道的原点上,然后重复装载,直到每个车道装载 20 到 40 微升样品。一旦标准和样品被加载,将板放在开发室中,等待溶剂到达板的顶部。当板完全开发时,将其从腔室中取出,使其在烟气罩中干燥 20 分钟。
盘子干燥后,用塑料薄膜盖住它,然后用自传屏幕把它放入一个正在开发的盒式磁带中。从正在开发的盒式磁带中取出屏幕,并将其放入荧光成像仪中。用p-Anisal醛试剂喷洒TLC板,直到二氧化硅饱和,然后在145度的烤箱中烘烤5分钟或直到带出现。
要量化脂质物种,刮碎含有单个脂质物种的二氧化硅凝胶,并将其转移到玻璃闪烁小瓶中。大力加入六毫升闪烁液和涡流,直到硅带减少到小块。将带有闪烁小瓶的机架放入闪烁计数器中,通过将计数时间调整到每瓶两分钟进行计数。
磷成像允许无标签脂肪酸、三乙基甘油、二乙酰甘油、胆固醇和沙烷的自射光图的可视化。结果表明,纯化脂质物种可以用这种方法分离,然后用p-Anisal醛试剂喷洒TLC板进行可视化。可视化物种除无菌酯外,还包括所有先前提到的脂质。
通过在脉冲后的无无线电标签介质中应用10分钟的追逐期,在主要的污秽池中观察到其消失,总胆固醇升高。同样,在追逐期中二乙酰甘油的外观与自由脂肪酸信号的减少相关。在执行完整协议之前,重要的是确定细胞是否会在生长条件和遗传背景中吸收醋酸放射性标签。
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本文介绍了一种使用14C-乙酸对酵母进行代谢标记的协议,并结合薄层色谱法分离中性脂质。该方法允许同时分析多个样本,为脂质代谢调节提供了洞察。
Quantitative analysis of neutral lipid synthesis in Saccharomyces cerevisiae enables mechanistic de-risking of lipid metabolism targets and pathways relevant to metabolic disease and energy homeostasis. This protocol supports predictive confidence in target validation and functional pathway interrogation by providing robust, reproducible quantification of lipid species across genetic backgrounds. Its adaptability and scalability position it as a reusable capability for early discovery and translational research pipelines.
This method integrates into the discovery continuum from early hypothesis testing and target validation through assay development and translational research, supporting both mechanistic studies and preclinical model alignment.