2021年11月20日
生物膜力探针(BFP)是一种 原位 动态力谱学(DFS)技术。BFP可用于测量活细胞上分子相互作用的弹簧常数。本方案介绍了通过BFP检测到的分子键的弹簧常数分析方法。
本视频详细介绍了使用生物膜力探针(Biomembrane Force Probe,BFP)测量分子弹簧常数的逐步操作流程。在力探针技术中,BFP 近年来已逐渐应用于天然细胞表面或原位动态力谱分析。该技术的主要目的是测量单个分子结合的力学特性。
该数据分析方法简单而有效,可提供机械信息,特别是表达分子的细胞膜的动态作用力和炎症情况。在BFP实验循环过程中,探针微生物组与红细胞及目标细胞发生相互作用,探针与目标之间的配体-受体分子结合可视为一个串联的弹簧系统。根据胡克定律,串联弹簧系统的总劲度系数的倒数等于各个组分劲度系数倒数之和,如公式所示。
红细胞的弹簧常数是基于事件运动计算的,该运动依赖于探针微管在孔口处的径向位置。该参数涉及红细胞、红细胞与探针之间的圆形接触区域以及微管吸吮压力。BFP 路径数据由自制的左视图虚拟仪器获取,该仪器通过 PAs 平移器控制目标微管的运动。
一个完整的PFP触碰循环包含五个阶段:接近、接触、压紧、回撤和分离。开始时,将Robusto APICS的位置标记为应力起始点,即X等于0,以黑色虚线表示。
随后,目标通过一个部件或转换器驱动,撞击并压缩robusto,从而引起负向的probate运动。你将其记为X小于零的红色虚线。在回缩阶段,红色busto顶点从X小于零的位置移回X等于零的位置,该过程称为压缩相。
如果配体与受体分子之间形成了化学键,红细胞将进一步向其他正方向发生形变。这一 X 大于零的阶段被称为回缩阶段的拉伸相。回缩阶段是确定键合分子弹簧常数的最关键阶段。
使用BSP数据采集平台收集力-时间曲线数据。每次实验通常记录50至200次触碰循环。打开PFP数据分析软件,单击黄色文件夹图标,通过双击选择相应的原始数据文件。
我们已进入程序。然后点击上下箭头按钮以在事件之间切换。使用离群值排除标准筛选无效事件。
选择强制转换为时间格式的导出数据类型,并选择合适的时间段范围。点击导出图表数据按钮。导出的数据默认以文本文件形式保存。
此文本文件包含两列数据:第一列为时间数据,第二列为每个时间点对应的力值。使用电子表格软件绘制力-时间曲线,以获得力-位移曲线。
将每个数据点的时间值乘以 Willow Steel PSO 的运动值。通过从每个数据点中减去最小的位移值,使第一个数据点归零。此水平变换不影响后续的弹簧常数计算。
在力-位移曲线中,若可识别出新的力斜率,则两个不同的作用力组存在差异。每组分别代表压缩阶段和10级阶段。对每组数据拟合一条回归直线。
斜率较大的直线代表压缩相期间的总弹簧常数,记为 K1。而位于最上方且斜率最小的直线代表该 10 style 相期间的弹簧常数,记为 K2。如前所述,总弹簧常数为各组件串联弹簧常数之和的倒数。在拍打细胞模式的压缩相期间,分子键未被拉伸,因此不考虑分子键的弹簧常数。目标细胞的弹簧常数由所示公式描述,其中 K1 表示压缩相期间的总弹簧常数。
在搏动销售模式的10个阶段中,总弹簧常数是红细胞分子键的反向弹簧常数与靶细胞弹簧常数之和。使用所示公式计算分子键的弹簧常数,其中K2表示总弹簧常数。您已读取10个阶段的停止相位。
在逐搏模式下,由于B形变可忽略不计,描述靶细胞弹簧常数倒数的项趋近于零,因此压缩阶段的总弹簧常数等同于红细胞的弹簧常数,如以下公式所示。在拉伸阶段,分子键合的弹簧常数可通过减去红细胞的影响来计算,如以下公式所示。收集侧向整合姿态B、Beta 3复合物、K562细胞以及沸碱整合姿态B Beta 3复合物的弹簧常数,在牛顿或纳米尺度上计算所得弹簧常数的平均值和标准差。
现在您应该对如何利用VFD数据测量弹簧常数及其相关要求有了更深入的理解。应注意“节拍-细胞模式”与“节拍-节拍模式”之间的差异。不同的分子呈现表面会对弹簧常数的测量产生不同的影响。
综上所述,本逐步操作流程描述了如何利用BFP进行分子弹簧常数分析。我们预计未来将致力于实现BFP数据采集与DFS分析的自动化,并将其整合为一个计算机软件程序,从而使整个BFP操作与数据分析更加用户友好并具备高通量性能。
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生物膜力探针(BFP)是一种动态力谱技术,用于测量活细胞上分子相互作用的弹簧常数。本方案概述了通过BFP检测到的分子键弹簧常数的分析方法。
通过生物膜力探针光谱法测量分子弹簧常数,可定量揭示配体-受体相互作用的力学特性,通过表征键合稳定性与构象动力学,支持靶点验证。该方法通过将分子力学特性与功能信号传导关联,可在化合物筛选前为早期发现阶段的决策提供依据,实现机制层面的风险评估。该技术通过揭示力依赖性结合行为,提高了靶点选择的预测可信度,而这些结合行为与生理性的机械感知通路密切相关。
该方法通过在初步结合确认后、大规模筛选前提供靶标的力学表型分析,整合到早期发现工作流程中,有助于优先选择具有理想力-稳定性特征的靶标。