2022年4月29日
我们介绍了一种通过定量反转录聚合酶链式反应来评估伴有年龄依赖性肾功能损伤的小鼠肾脏及血清中微小RNA表达水平的方法。
该qRT-PCR方法可用于研究小鼠在年龄依赖性肾功能损伤等条件下血清中microRNA表达谱的相关问题。该技术通过简单流程实现对microRNA表达的高准确度和高灵敏度检测,节省时间并避免技术误差。首先,使用镊子和手术剪切开腹部皮肤。
从膀胱至肋骨左下缘切开腹膜上的肌肉。用镊子提起腹膜,使用手术剪在腹膜上缘做一侧向切口,然后沿肋骨最下缘继续延伸切口。
使用两个经 PBS 润湿的棉签识别下腔静脉。将连接1毫升注射器的30 G针头插入下腔静脉,并回抽注射器。缓慢拔出针头,以避免溶血。
将血液转移至含有肝素的1毫升尖底管中,通过倒置混匀。在室温下以3000 × g离心10分钟。将上清液转移至新的1.5毫升微量离心管中。
取200 µL血清样本,加入1,000 µL基于苯酚/胍的裂解试剂。涡旋混合5秒,在室温下孵育5分钟。加入200 µL氯仿,通过倒置离心管15次进行混合。
将样品在室温下孵育3分钟,随后进行离心。勿扰动沉淀,将上清液转移至新的1.5毫升微量离心管中。加入450 µL 100%乙醇,并涡旋振荡管子5秒。
然后将700 µL样品加载到膜固定的离心柱上,并进行离心。弃去穿流液,加入700 µL试剂盒中提供的洗涤缓冲液1。再次离心,并弃去穿流液。
用500微升洗涤缓冲液2重复洗涤,以去除痕量盐分。加入500微升80%乙醇,离心,并弃去收集管中的流穿液。再次离心吸附柱,然后将吸附柱转移至一个新的1.5毫升收集管中。
然后加入14 µL无RNase的水,在室温下孵育5分钟。再次在室温下以15000 ×g离心柱子1分钟。制备主混合液,并在8孔联管中每孔加入8 µL。
每个试管中加入12 µL提取的总RNA,在室温下以2000 × g离心15秒。将试管放入热循环仪中,开始孵育以合成cDNA。孵育结束后,将cDNA转移至新的微量离心管中。
用蒸馏水将cDNA稀释十倍。然后涡旋混匀,再在室温下以2000 × g离心5秒。在微量离心管中,按照文本方案所述配制预混液,并涡旋混匀该溶液。
向96孔板的每个孔中加入22.5 µL等分试样,随后加入2.5 µL cDNA。使用粘性封板膜密封反应板,并在1000 ×g 条件下离心30秒。将反应板放入实时PCR系统中。通过输入实验名称来修改实验设置。
然后选择96孔0.2毫升作为实验类型,以比较CT法作为定量方法,标准模式作为系统运行模式,SYBR Green试剂作为检测目标序列的试剂。为每个孔中的样品和目标miRNA提供名称。设置重复样品,选择一个参考样品和内参对照,并在被动参考染料处选择“无”。
为避免试剂交叉污染,需为miRNA表达设置无逆转录酶的阴性对照和无模板对照。接下来,确保反应体系为20微升,PCR扩增循环条件设置为:95°C预变性15分钟,随后进行40个循环,每个循环包括94°C变性15秒、55°C退火30秒和70°C延伸30秒。程序完成后,单击“分析”以分析qRT-PCR数据。
确认程序自动选择的阈值线是否适用于每个孔。检查每个样本中内源性对照和目标miRNA的阈值循环值。通过扩增曲线与阈值线的交点确定CT值。
在年龄依赖性肾功能损伤模型中,miRNA qRT-PCR 数据显示,与 SAMR1 对照小鼠相比,SAMP1 实验小鼠肾脏中 miRNA-7219-5p 的水平显著升高,而 miRNA-7218-5p 的肾脏水平则下降。miRNA-223-3p 在两种小鼠品系中的表达水平均无变化。SAMP1 小鼠血清中 miRNA-7219-5p 和 miRNA-7218-5p 的水平均明显升高,而 miRNA-223-3p 的水平保持不变。
应将针头插入下腔静脉并抽取血液,同时避免穿透血管壁。该方法可用于解答多种病理条件下小鼠血清中微小RNA表达谱研究中的关键问题。
本研究介绍了一种定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)方法,用于评估伴有年龄依赖性肾功能损伤的小鼠肾脏及血清中微小RNA(microRNA)的表达水平。该技术具有高准确性和高灵敏度,可有效检测微小RNA的表达,有助于推动该领域的研究进展。
准确的microRNA表达谱分析可在肾脏和血清中实现对年龄依赖性肾功能损伤机制的早期检测,从而支持临床前模型中的靶点验证。该qRT-PCR方法可提供定量且可重复的数据,提高生物标志物发现流程中的预测可信度。该方法解决了转化型肾脏研究中microRNA分析标准化的关键空白。
该方法适用于从靶点假设验证到临床前验证的研究连续过程,尤其适用于肾纤维化及与衰老相关通路的研究。