2022年8月17日
根系性状表征是目前仍处于起步阶段的研究领域之一,尤其是在甘蔗中。整合多种方法对甘蔗根系进行精确表型分析,可获得全面且整体性的结果,从而有助于将所鉴定的性状和机制应用于常规育种和分子育种。
作为水分和养分的主要传导器官,根系对植物的生长发育至关重要。由于甘蔗完成其生命周期需要一年时间,因此深入了解其根系具有重要意义。本文提出的整体性方法整合了可用于表型分析的有效平台,这将有助于推进对甘蔗根系及其应对环境条件响应机制的认识。
该方法专用于甘蔗作物,因为甘蔗作为长期作物具有独特的根系结构。然而,经过少量修改后,该方法也可适用于其他作物。首先,在田间使用两个顶端相连的种茎种植商业甘蔗杂交种或品种,行距为120厘米,行内株距为90厘米。
遵循推荐的综合管理措施,以确保作物良好定植和生长。在成熟期结束时,使用挖掘机在田间挖掘一条深1.5米、宽1.0米的沟槽。通过持续的水射流清除根区土壤,同时避免损伤根系。
当喷水使附着的土壤松动后,将甘蔗连同根系一起拔出,并带至实验室进行生长参数的手动测量,包括根数、根长、体积和重量。在田间采集甘蔗根系样品时,使用由低碳钢(MS材料)制成的圆柱形根钻取样器,其高度为61厘米,直径为16厘米,重量为8千克。取样器底部带有锋利边缘,便于插入土壤,顶部配有直径为3厘米的套环,用于提拉取样器。
在商业甘蔗作物成熟阶段,将取样器的上边缘固定在主溜槽或甘蔗上,并持续锤击以达到45厘米的所需土壤深度。然后将整个土体抬入取样器中,并在流动水下小心冲洗,以分离附着的根系。在实验室中测量植株的物理参数,如株高和叶面积。
然后将根系展开放置在透明托盘中,利用软件扫描并分析相应的数字化图像。构建一个根系表型分析结构,包含三个相邻的区域,每个区域大小为4.5米×10.1米,用于取样甘蔗根系。预留人工拆卸侧壁的条件,以暴露地下根系,深度可达80至100厘米。
用田间土壤填满并压实结构,留出约20厘米的顶部空间,并设置足够的排水孔以促进土壤通气。保存包含甘蔗(Saccharum officinarum)、割手密(Saccharum spontaneum)、巴巴多斯甘蔗(Saccharum barberi)、中国甘蔗(Saccharum sinense)和大茎野生甘蔗(Saccharum robustum)的种质克隆芽片。将其置于育苗盘中,在生根培养基中萌发30天。
萌发30天后,将生长一致且健康的幼苗移栽至田间,行距为90厘米,株距为60厘米。遵循推荐的种植密度(POP),以确保良好的作物出苗和生长。在种植后60至120天的形成期以及种植后120至150天的快速生长期,人工拆除由预制板构成的侧壁,随后持续喷射水柱以暴露根系。
将整个根系挖出并转移至实验室,以测量其物理参数。随后将根系铺展在透明托盘上,进行扫描,并利用软件分析相应的数字化图像。为了研究根际生物学及根系生物学的细微结构,可在环境可控的玻璃温室中自行构建一套水培系统,以利于甘蔗的生长。
在尺寸为20厘米×20厘米×50厘米的水族箱中,配备水族泵用于通气,加入约15升改良的霍格兰营养液。将甘蔗品种及甘蔗属(Saccharum species)克隆系的芽片播种于育苗盘中,育苗基质为堆肥化的茎髓,使其萌发30天,之后选取生长一致且健康的蔗苗,以每箱3株的密度移栽至水培箱中。在萌发阶段结束后的第60天,将完整植株的根部浸入50毫升无菌双蒸水或捕获液中持续4小时,并在光合作用最旺盛的时段收集根系分泌物。
根据标准方案,在第三个月测定过氧化物酶、超氧化物歧化酶的活性以及总酚含量。最后,通过使用无菌手术刀在主根上沿纵轴切至根尖造成根部损伤,评估其响应,并定期监测变化情况。在根系表型分析中,CO 62175 的较长根系在累计根长、根表面积、根体积和平均根直径方面表现出更优良的根系结构。
甘蔗属物种在形态特征上于形成期表现出显著差异。Saccharum spontaneum 每丛的累积根长最高,而 Saccharum sinense 最低。Saccharum spontaneum 的根表面积、根干重、根体积以及根冠比均最高。
割手茅(Saccharum robustum)表现出最高的根体积和根直径。解剖学研究表明,在干旱条件下,长根毛、厚壁组织外皮层、减少的皮层细胞层数、增加的皮层薄壁组织、增大的维管束面积以及大直径导管数量的增多具有有利作用;而在渍水胁迫下,则观察到根直径增大、皮层细胞面积增加以及通气组织细胞增多的现象。割手茅(Saccharum robustum)的总羧酸根系分泌量最高,而割手茅野生种(saccharum spontaneum)的分泌量最低。
在甘蔗品种中,根毛密度存在显著差异,且根冠的形态和色素沉着也有所不同。C086032 的过氧化物酶活性和总酚含量最高,而 C062175 的最低。在复壮研究过程中,Cox 671 在三天内出现次生根,而 Co-06022 则需 10 天,且在第三天即出现衰老症状。
在解读单个实验方案所得结果时,我们必须谨慎行事。对根系进行机构化研究非常适合甘蔗,但对照平台可能在特定用途中具有实用价值。充分理解根系表型的各个方面,对于培育和释放新的甘蔗品种至关重要。
将这些技术自动化,并结合大数据分析或人工智能来解读结果,将拓宽我们在该领域的专业知识。这些结果在表征正常和周期性胁迫条件下根系性状方面,为根系可塑性、辐射营养现象以及有丝分裂胁迫等探索性研究领域开辟了道路。
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本研究探讨了甘蔗的根系性状,重点是整合多种表型分析方法以更深入地理解这些性状。该研究旨在提供可用于甘蔗常规育种和分子育种的见解。
对甘蔗根系进行多维度表型分析,能够稳健地表征对作物抗逆性和生产力至关重要的地下性状。结合田间、平台及水培分析,可提高性状筛选的预测可靠性,并推动适应胁迫的转化研究。这些方法使根系表型分析成为推进作物改良流程和降低育种决策风险的基础性能力。
根系表型分析方法贯穿从早期发现到筛选及转化研究的全过程,支持作物改良流程中的性状验证和候选基因优先排序。