2022年7月14日
本实验方案的目的是为小组织(如 果蝇 脑组织,采用基质辅助激光解吸/电离(MALDI)质谱成像技术。
基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI MS成像)是一种成熟且有效的工具,可用于鉴定和可视化脂质的丰度与分布,且无需对样品进行过度修饰。MALDI成像的主要优势在于能够无需标记而原位检测脂质,并可同时分析大量样品。熟能生巧。
在处理真实实验样品之前,务必进行充分练习。尽量缩短样品制备时间,并在整个操作过程中避免污染。开始时,将最佳切割温度介质(OCT)加入塑料冷冻模具中,填充至模具深度的一半,同时避免产生气泡。
将模具在平坦的表面上静置数分钟,然后转移至干冰上。保持冷冻模具在干冰上处于水平状态,使OCT形成平整且均匀的表面。等待直至OCT在模具中完全凝固。
立即使用冷冻的OCT载片,或将其在-80摄氏度下保存。用二氧化碳麻醉成年果蝇后,准备一个含有实验室擦拭纸的培养皿。用水润湿擦拭纸的一部分,以减少静电。
保持擦拭纸一半湿润、一半干燥。在解剖显微镜下切下果蝇头部后,收集四到五个头部,置于实验擦拭纸的干燥区域。将OCT载台从干冰转移至显微镜二。
立即将头部转移到OCT包埋台上并迅速排列,整个过程需在30至60秒内完成,以避免OCT融化。每个果蝇大脑周围应预留约1毫米的空白空间,以确保OCT提供足够的支撑;同时,包埋块边缘应预留4至5毫米的空白空间,以便于后续切片操作。将OCT包埋台放回干冰上,静置约三分钟,确保OCT包埋台保持完全冻结和固态。
在所有果蝇头部对齐后,将包埋盒(OCT)置于干冰上再静置5到10分钟。将包埋盒从干冰上转移至平坦表面,迅速加入足量OCT包埋剂,完全覆盖所有样品并填满整个冷冻模具,此过程约需三秒钟。随后立即将冷冻模具放回干冰中,冷冻含有包埋组织的完整OCT组织块。
将OCT载板置于干冰上再静置5到10分钟。在冷冻模具边缘标记样品,并将冷冻后的样品在-80摄氏度条件下保存,直至准备切片。通过使用万用表(调至电阻模式)检测ITO载玻片的导电性,以确认ITO编码侧。
将具有电阻测量值的一侧标记为用于黏附组织的一侧。对其进行标注,并始终在载玻片底部放置一张实验室擦拭纸,以避免载玻片污染。然后,将组织置于冷冻切片机舱内平衡30至45分钟。
用70%乙醇清洁冷冻切片机。擦拭切片阶段的滚轮板并更换已使用的刀片。使用额外的洁净擦拭纸确保乙醇已完全挥发,并在开始切片前保证所有表面干燥。
接下来,根据组织类型调整冷冻切片机腔室和样本头的温度。使用OCT将组织固定在样本托上。注意使用足量的OCT覆盖OCT包埋块的底部,并尽可能平整地安装包埋块。
将洁净的刀片放置于载物台上并固定。根据需要调整样本头部朝向载物台的位置,以达到所需的切割角度。随后以厚切片开始切割,直至找到目标区域。
用预冷的艺术家画笔不断刷去多余碎屑,以保持工作区域清洁。根据需要适当调节切片室温度,当到达目标区域后,将切片厚度调整为10至12微米。小心收集目标切片。
取一片室温的ITO载玻片,将其置于切片上方。轻柔地接近切片,使其黏附在载玻片上,避免在冷冻切片机载物台上留下痕迹。将载玻片放置在架子上或冷冻切片机外的实验擦拭纸上,以备多次切片收集期间使用。
若需对同一队列的不同样本进行比较,可将多个样本的切片置于同一张载玻片上,以便同时分析,从而最大限度地减少变异。如有必要,可分置于两张载玻片上,因为 Maldi 目标板架可在单次运行中容纳两张载玻片。将载玻片放入真空盒中运输,并置于装有干燥剂(作为底层)的干燥器中。
将载玻片置于真空条件下驱动30至60分钟,然后进行基质沉积。使用两种五羟基苯甲酸(即DHB)溶于甲醇-水的溶液作为基质。将载玻片放入载玻片转运器中,并用石蜡膜严密封住开口。
用密封袋封好,放入另一个含有干燥剂的密封袋中。标记外部,并将样本连同充足的干燥剂一起运送至MALDI核心实验室。
进行基质沉积时,使用40毫克/毫升的DHB溶于甲醇-水作为基质,采用HTX M5自动基质喷涂仪进行喷涂。氮气压力设置为10 PSI。使用MALDI飞行时间质谱仪(MS)在正离子模式下采集质谱图。
通过在ITO载玻片上点样0.5微升乙酸硝酸中的红磷乳液来校准仪器。应用二次校准曲线,利用其光谱在100至1000兆质荷比(MZ)质量范围内校准仪器。将激光光斑直径设为中等,以匹配40微米光栅宽度的调制光束轮廓,并在每个阵列位置以每秒1000次的激光重复频率累积500次激光脉冲来采集成像数据。
然后记录光谱数据。使用均方根归一化方法进行成像数据分析,以生成带宽为±0.10道尔顿的离子图像。利用软件对同一实验中的OCT和脑组织光谱进行比对,评估OCT在离子抑制干扰中重叠峰的情况。
最后,对含有组织样本的MALDI载玻片进行苏木精-伊红(H&E)染色。MALDI质谱分析结果显示,LPR1基因敲除突变体脑组织中的脂质含量普遍下降。此处展示的是代表性成年果蝇脑切片的H&E染色结果。
该图像中还标明了脂质种类、相应的质荷比(MZ)值以及热图的刻度。与对照组相比,LPR1基因敲除突变体中脂质减少的平均倍数(基于至少四个生物学重复实验)以箭头旁的数字表示。对照组和突变体果蝇脑组织区域中选定空白OCT区域的质谱图显示在MZ1至1000以及MZ520至900范围内。
OCT的干扰与离子抑制现象以及信号重叠问题均有关。为保持脂质组学数据的准确性,适当的样品制备、解剖和冷冻切片至关重要。在完成MALDI实验后,可通过LCMS(即基于液相色谱-质谱的脂质组学)对脂质的种类进行验证。
该技术利用强大的软模式系统研究脑脂质稳态的分子机制,为理解人类脑部疾病相关的代谢变化开辟了道路。
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本方案提供了从少量组织(如果蝇脑)中制备脂质和代谢物样本的详细指导,采用基质辅助激光解吸/电离(MALDI)质谱成像技术。该方法可在无需对样本进行显著修饰的情况下实现脂质分布的可视化。
快速且最大限度减少污染的样本制备方法用于基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI MSI),可在小型组织体系中实现高通量、空间分辨的脂质组学分析。该工作流程支持早期发现研究团队,用于绘制疾病相关模式生物中脂质分布和代谢变化的图谱。该方法可提高在中枢神经系统及代谢研究项目中靶点验证和机制去风险化的预测可信度。
该MALDI质谱成像样本制备方案贯穿从早期发现到临床前研究的全过程,可在基因工程模型中实现空间分辨的脂质组学分析。