2023年1月13日
本文介绍了利用自动化设备从全血中简便高效地分离和收集无细胞DNA及循环肿瘤细胞等物质的方法。
我们的方案操作简便。采用此技术,任何人都能轻松地从血液中分离出目标组分。可将污染降至最低,并实现材料的精确分离。
通过自动化及本实验方案的建立,研究人员可轻松获得高纯度的癌症相关物质,这有助于开展多种下游研究。特别是,该方法有望为终端用户的研究提供重要优势。本实验操作将由癌症基因组学研究所的高级研究员兼助理经理 Jay Jeong 进行示范。
首先,在仪器的触摸屏面板上选择卡匣类型,以加载 LBx 1 卡匣。按下箭头按钮以更改样本数量。然后,打开仪器门,按照卡匣架上的编号顺序插入所有要使用的卡匣。
总共四个 cartridge 时,将 dummy cartridge 放入 cartridge holder 的空位中。使用支撑轮安装 cartridge,并拧紧锁紧螺母以固定。关闭门,然后按下触摸屏上的运行按钮。
仪器会关闭试剂盒上的阀门,此过程大约需要30秒。根据提示打开门,取下支撑轮,并从试剂盒支架中取出已关闭阀门的试剂盒。
使用血清学移液管吸取最多10毫升的全血样本。将移液管尖端深入 cartridge 的样本入口,缓慢注入全血样本。将 cartridge 插入仪器后,关闭仪器门并按下 OK 按钮。
血浆和白细胞层会从全血中自动分离,整个过程大约需要30分钟。当血浆和白细胞层分离完成后,屏幕将显示提示信息并伴随警报声。通过打开门或按下停止按钮来关闭警报。
打开门。取出 cartridge 并将其放在桌面上。使用 1 mL 移液器吸头从血浆出口收集 3 mL 血浆。
然后,使用1毫升移液枪头从血沉棕黄层出口回收3毫升血沉棕黄层。接下来,在仪器的触摸屏面板上选择 cartridge 名称,以加载 LBx 2 cartridge。按下箭头按钮以更改样本数量,并按照与 LBx 1 cartridge 相同的操作步骤,将 cartridge 插入 cartridge 支架中。
插入 cartridge 并关闭门后,按下触摸屏上的运行按钮。按照先前展示的步骤,将阀门关闭的 cartridge 从 cartridge 持架中取出并放置在桌面上。使用血清移液管吸取密度梯度溶液。
将移液器吸头深入插入 cartridge 的进样口,缓慢注入溶液。然后吸取全血样本,缓慢注入样本进样口。插入并固定 cartridge 后,关闭门并按下 OK 按钮。
当血浆和外周血单个核细胞(PBMC)从全血中自动分离后,将出现一条伴随警报声的消息。打开门并取出 cartridge。使用1毫升移液枪头从血浆出口回收3毫升血浆,然后从PBMC出口回收3毫升PBMC。
同样,对于 FAST-auto 试剂盒,从试剂盒支架中取出阀门已关闭的试剂盒后,将六毫升 PBS 溶液注入试剂盒的 PBS 加样口。然后,用移液器吸取三毫升来自 LBx 1 的全血或白膜层,或来自 LBx 2 的 PBMC 样本,并缓慢注入试剂盒的样本加样口。插入试剂盒并固定后,关闭门并按下“确定”按钮。
自动富集循环肿瘤细胞(CTCs)完成后,关闭警报。取出 cartridge,将背板移除器(BPR)插入 cartridge 前端的四个孔中。用双手拇指按压深蓝色翼状部分,然后按压浅蓝色主体,直至听到咔嗒声。
轻轻抬起移除滤芯外壳。使用镊子极为轻柔地夹住滤膜边缘,将滤膜放入1.5毫升离心管中用于核酸提取,或置于载玻片上进行染色。如有需要,使用1毫升移液枪头将过滤后的血液回收至血液出口。
采用 Bioanalyzer 对提取的 cfDNA 进行评估,并使用 cfDNA 筛选胶带配合电子标记 ladder。绿色线条用于对齐标记 ladder 与样本。三角形标记指示 DNA 条带。
大多数cfDNA的长度为166个碱基对,部分cfDNA的长度为其整数倍。通常,cfDNA的浓度范围可达50至700个碱基对。尽管不同个体样本中获得的cfDNA含量存在差异,例如分别为8.47纳克/毫升和5.2纳克/毫升,但在所有情况下,cfDNA提取结果在浓度和片段大小分布方面均表现良好。
这些结果表明,LBx 1 方法能够准确分离含有 cfDNA 的血浆。在 FAST-auto 中,将膜取出后用荧光抗体染色,以检测循环肿瘤细胞(CTCs)和白细胞。将染色后的膜置于载玻片上,在荧光显微镜下观察。
膜染色后,细胞显示蓝色的 DAPI 或核阳性信号,而 EpCAM 和 CK 或循环肿瘤细胞(CTCs)阳性信号呈绿色,CD45 或白细胞(WBC)阳性信号呈红色。去除膜并不困难,但需注意避免循环肿瘤细胞的丢失和污染。
全血、外周血单个核细胞(PBMC)以及血沉棕黄层均可使用。您只需设定总体积即可。也可使用其他液体,但需进行测试验证。
该技术可直接在医院中操作,且能快速获得物质。
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本文介绍了一种用户友好的自动化方案,用于从全血中分离和收集物质,包括游离DNA和循环肿瘤细胞。该技术可最大限度地减少污染,并实现精确分离,有助于高纯度提取与癌症相关的物质,用于后续研究。
从临床样本中自动分离与癌症相关的物质,能够实现游离DNA(cfDNA)和循环肿瘤细胞(CTCs)等分析物的高纯度、可重复提取,从而解决了液体活检工作流程中的关键瓶颈问题。该技术通过减少污染并标准化样本制备过程,显著提高了早期发现和转化研究中的预测可靠性。该平台具有高度灵活性,可支持多种下游组学及生物标志物研究,有助于在关键转折点上加强项目组合的决策能力。
该自动化分离平台在样本采集与下游分子分析的接口处进行整合,连接了早期发现、先导物鉴定以及转化研究的工作流程。