2023年3月24日
本实验方案描述了两种通过荧光底物结合流式细胞术或荧光分光光度计来检测caspase活性的方法。
本方案使研究人员能够确定caspase活性是否伴随细胞死亡发生,从而识别不同的细胞死亡模式。该技术的优势在于可灵活地在群体水平或单细胞水平上评估caspase活性。演示该实验操作的是博士毕业生Stefanie Rufli,以及来自Wendy Wei-Lynn Wong实验室的访问博士生Jing Tong。
按照文稿中所述方法分化并收获骨髓来源的巨噬细胞(BMDMs)后,将其以每毫升1×10⁶个细胞的密度接种于6孔板中。用SMAC类似物处理细胞16小时。为制备细胞裂解液,将含有处理后细胞的培养板置于冰上,收集细胞培养基至1.5 mL离心管中。
在4 °C条件下,以300 ×g离心5分钟。吸除上清液,并将试管置于冰上。然后向细胞培养板中加入1 mL冷的PBS以洗涤细胞。
吸尽所有 PBS 后,向细胞中加入 100 微升胰蛋白酶。待细胞从培养皿上脱落,将其收集至 1.5 毫升离心管中。离心细胞悬液后,弃去上清液,并将沉淀重悬于 100 微升 DISC 裂解缓冲液中。
将样品置于冰上孵育20分钟,然后离心裂解液以沉淀不溶性组分。取25微升裂解液加入白色平底96孔板中,用于caspase-3/7活性检测;另取10微升裂解液加入透明平底96孔板中,用于二辛可宁酸(bicinchoninic acid,BCA)检测。为进行蛋白质定量,配制一系列不同浓度的牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)作为标准蛋白。
向含有样品的平底96孔板中加入标准BSA后,将BCA试剂一和试剂二按50:1的比例混合,并向每个标准样品中加入200微升。在37摄氏度孵育30分钟后,使用荧光检测仪在562纳米处测定吸光度,并根据标准曲线定量蛋白质浓度。进行基于群体的检测时,启动荧光检测仪并将仪器加热至30摄氏度。
将激发波长和发射波长分别设置为 360 和 465 纳米。然后按照论文中所述,在冰上配制主反应混合液以测定caspase活性。向每个样品和标准品中加入 75 微升混合液,使总反应体积达到 100 微升。
立即使用荧光检测仪器装置测量荧光,并每分钟记录一次读数,持续40分钟,以确定反应动力学。接种后,将贴壁细胞按先前所示方法收集至一个5毫升聚苯乙烯管中。然后在4摄氏度下以300 ×g离心5分钟,并弃去上清液。
配制染色液时,取1 µL荧光底物,用150 µL PBS稀释。每份样品加入50 µL染色液,在37°C避光孵育30分钟,每15分钟混匀一次。在此基于群体的检测中,caspase-3/7活性动力学检测的代表性数据显示,随着SMAC模拟物浓度增加,底物切割作用增强。
然而,基于单因素方差分析(ordinary one-way ANOVA)与多重比较,500 纳摩尔浓度下的增加无显著性差异。通过流式细胞术分析caspase-3/7活性显示,与未处理细胞相比,经SMAC类似物处理的细胞荧光发生偏移,这在绘制的中位荧光强度图中也明显可见,且500 纳摩尔浓度下的增加具有显著性差异。该操作步骤应在冰上进行。
然而,在基于群体的检测中,样品不能无限期地置于冰上。裂解步骤后,应立即对样品进行后续处理或冷冻。利用活细胞显微镜成像半胱天冬酶活性可作为另一种方法,用于获取单细胞水平上的动力学信息。
本方案描述了使用流式细胞术或荧光分光光度计检测caspase活性的方法,使研究人员能够评估细胞死亡机制。
对caspase活性进行定量测量对于降低靶向细胞死亡通路的早期药物发现风险至关重要。本方案可稳健评估凋亡和焦亡机制,有助于提高靶点验证和机制研究的预测可信度。可靠的caspase检测可通过阐明在疾病相关体系中信号通路的参与情况及化合物效应,为项目组合决策提供依据。
该caspase活性检测方法可融入从发现到临床前研究的连续过程中,支持早期的机制研究以及后期的转化研究。