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DOI: 10.3791/64832-v
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
本方案描述了一种对蒙古传统药物Zadi-5在抑郁症中的治疗效果的行为测试验证和生物信息学预测的方法。
Zadi-5 治疗抑郁症的疗效可以通过行为测试确定,而网络药理学可以预测其效力背后的潜在机制。网络药理学可以支持对具有复杂作用机制的传统药物的探索,并进一步减少研究所需的时间和费用。在神经系统疾病动物模型中,露天试验、蔗糖消耗试验和莫里斯水迷宫等测试是评估食欲、动机水平、学习能力和记忆力的黄金标准。
这些测试是简单、客观、合理的评估方法。建立动物模型对于理解抑郁症研究中新药的病理机制和作用至关重要。为了建立一个良好的抑郁模型,研究人员必须对刺激强度进行适当的排序和调整。
首先,将选定的抑郁刺激与隔离相结合,对除对照组以外的所有大鼠施加28天,并将大鼠饲养在单独的笼子中。要执行开放场测试,请将黑匣子划分为九个面积相等的方形区域。为盒子配备视频跟踪分析系统。
最后一次管饲后一天,将老鼠放在中心广场上,记录其水平和垂直活动三分钟。然后,将所有停顿时交叉的方格数作为水平活动进行评分,并将站立和梳理作为垂直活动进行评分。每次测试后,用75%的酒精清洁盒子,以去除大鼠的气味,以便进行后续测试。
接下来,通过在食用前后称量各自的瓶子来执行蔗糖消耗测试。并使用此公式计算第 0 天、第 7 天、第 14 天、第 21 天和第 28 天的 60 分钟蔗糖偏好率。要执行莫里斯水迷宫测试,请将游泳池分为四个象限。
将象限从一到四排序,并将隐藏平台放置在水面以下一厘米的第三象限中。将牛奶添加到池中以获得一定程度的不透明度。然后将大鼠受试者放入不同象限的迷宫中,寻找平台120秒。
并使用 Morris Water Maze 视频轨迹分析系统记录延迟时间。将大鼠受试者置于池中的固定位置。如果受试者在 120 秒内找不到隐藏平台,则将延迟记录为 120 秒。
接下来,移开平台,将老鼠放入水中,并记录 120 秒的区域穿越次数。浏览中医药体系的药理学网页,在药材名称部分输入肉豆蔻科精液种子、al-glandia-radiks 根和 piperis longi fructus,以获取化学品的名称。将口服生物利用度(OB)的药代动力学指数设置为大于30%,将类药指数设置为大于0.18。
在中药药典中搜索活性成分,找出每种成分的化学名称。接下来,在 Pub Chem 中搜索已识别的化学名称,以找到异构体微笑或墨色。使用 SEA、Batman 和 Swiss 靶标预测,用异构微笑或墨色来识别活性成分的靶蛋白,并找到重叠的蛋白。
将数据复制到 Excel 文件。接下来,使用 GeneCards、DisGeNET 和 DrugBank 中的关键字 depression and depressive disorder 搜索并确定抑郁症的潜在蛋白质靶点。将数据复制到 Excel 文件。
浏览维恩图并上传列表一中的抑郁症目标。然后上传列表二中 Zadi-5 活动组件的目标并提交。获取维恩图并过滤掉重叠的目标候选者。
构建一个名为 network 的电子表格。还要构造一个称为 type 的电子表格。将片材导出到Cytoscape构建网络,Zadi-5草药成分疾病靶点。
在字符串数据库中设置公共目标以分析它们的交互作用。将蛋白质类型设置为智人。将交互阈值设置为 0.9 以仅选择经过实验验证的类型,并且不显示孤岛节点。
打开DAVID工具,将Zadi-5的86个潜在抗抑郁靶点粘贴到起始分析支架中,研究相关的信号通路。下载小桶通路文档。从富集分析中选择PI3k-AKT通路中的基因,并将它们粘贴到电子表格上以构建类型和网络文档。
将网络文档类型导出到 Cytoscape 以生成 PI3K-AKT 可视化化合物靶标通路网络。测试动物组在慢性不可预测的轻度应激或CUMS刺激之前没有显着差异。建立CUMS模型后,该组的纵向和水平得分均低于对照组。
与模型组相比,阳性对照组和Zadi-5组的纵向和水平得分显著更高。在第0天,测试组在蔗糖消耗量方面没有显着差异。第28天,Zadi-5和阳性对照组高于模型组。
在莫里斯水迷宫中,与对照组相比,模型组找到平台的延迟明显更高。阳性对照组和Zadi-5组的潜伏期低于模型组。关于区域交叉计数,模型组显示的交叉次数少于对照组。
阳性对照组和 Zadi-5 组比模型组表现出更多的交叉。维恩图分析显示,在1000个抑郁症相关蛋白靶点中,有86个重叠靶点是Zadi-5的关键抑郁症相关靶点。基于这些发现,构建了Zadi-5草本成分疾病靶点,并构建了靶点候选物的蛋白-蛋白相互作用网络分析。
根据KEG通路分析,PI3K-AKT信号通路排名第七。它与许多信号通路有关。因此,PI3K-AKT通路被认为比其他富集通路更重要。
在尝试此过程时,避免连续几天重复相同类型的刺激至关重要。在在线数据库中对Zadi-5的成分进行分析后,液相色谱、质谱和核磁共振波谱可以保证验证质量。
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