2023年6月30日
描述了一种基于光密度的微孔板方法,用于量化噬菌体存在下的长期细菌生长,适用于放线菌和其他生长缓慢的细菌。此方法包括减少蒸发和盖冷凝的修改,以及用于计算病毒感染指标的 R 代码,包括曲线下面积、生长最大值和相对毒力。
最终,我们对噬菌体 - 宿主相互作用感兴趣。该协议能够测量生长缓慢的细菌中的噬菌体感染,生成描述性的感染指标。该方法有助于研究生长缓慢的放线菌细菌中的噬菌体-宿主协同进化。
快速微孔板方法对快速生长的细菌宿主提供了极好的结果,但太短,无法显示生长较慢的细菌宿主(如放线菌)中的细菌噬菌体感染进展。我们的方法适用于生长缓慢的细菌,允许细菌和噬菌体在表征噬菌体感染动态所需的多天内共培养。我们的协议允许评估噬菌体 - 宿主相互作用以评估微孔板中生长缓慢的细菌,而不是要求从较大的培养瓶中进行子采样。
该方案使用现成的材料来适应延长的培养时间,并允许在单个微孔板中接种多个重复。
本研究提出了一种基于光密度的新型微孔板方法,用于定量检测在存在噬菌体的情况下长期细菌生长,特别适用于放线菌等生长缓慢的细菌。该方案解决了在这些细菌宿主中测量噬菌体感染动态的难题,能够实现长时间共培养,并有助于深入分析感染相关指标。
量化噬菌体在生长缓慢的放线菌中的感染动态,对于理解宿主-病原体相互作用以及降低抗菌药物研发早期发现阶段的风险至关重要。本改进的基于光密度的微孔板检测方法可在较长时间内实现对感染指标的高通量、可重复测量,有助于提升靶点验证和机制研究的预测可靠性。该方案具有可扩展性和定量输出的特点,可作为评估整个研发管线中噬菌体-细菌系统的可重复利用工具。
该检测方法通过在生长缓慢的细菌模型中实现假设验证、通路解析和感染指标的定量,融入了从发现到临床前研究的连续过程。