2024年3月1日
本方案描述了一种检测化合物与蛋白质分子结合的独特方法,具有蛋白质样品损耗极小和数据准确性高的优势。
本方案具有显著优势,无需使用专业设备即可开展实验。与传统的氟化物定量 PCR 方法不同,该方法简化了实验流程,避免了繁琐的数据处理步骤,降低了整体操作复杂性,因而更加简便易行。本实验要求操作者必须非常熟悉实验步骤及荧光酶标仪的使用,在溶液加热和荧光检测过程中避免浪费过多时间。
我们将重点关注伞形酮通过CD40蛋白产生免疫效应的分子机制。首先,将500倍浓度的橙色染料加入PBS溶液中,以获得不同的染料比例。启动桌面上的数据采集软件。
单击仪器,然后选择相应的微孔板型号并单击“确定”。单击采集设置并选择荧光模式。在波长界面下,将激发波长设置为470纳米,发射波长设置为570纳米,然后按“确定”。将每种浓度的橙色染料各100 µL用移液器加入96孔板的孔中。
将培养板放入荧光酶标仪的检测位置。在软件中点击读数图标,于室温下以两分钟间隔对每种染料浓度的荧光值连续测量13次。每次测定后,点击导出图标,然后选择导出为 XML、XLS 或 TXT 格式。
选择所有孔板,然后在输出格式中选择孔板,点击“确定”以XLS格式保存数据,用于后续分析。现在打开数字加热振荡干燥浴。将加热温度设置为35摄氏度,加热时间为2分钟。
在1.5毫升微量离心管中配制染料的最佳稀释比例,然后将其置于数字加热振荡干浴仪中孵育2分钟。随后,向板的各孔中分别加入100微升PBS和染色溶液。
将培养皿放入仪器的检测阶段。在数据采集软件中点击读取图标。设置加热温度为40摄氏度,加热时间为2分钟。
现在将孔板中的染料溶液重新用移液器转移回1.5毫升微量离心管中。在数字加热振荡干浴仪中加热2分钟。重复加入染料溶液,并导出结果数据,以检测染料溶液在35至95摄氏度之间每升高5摄氏度时的吸光度。
将CD40蛋白溶液与PBS混合,配制终浓度分别为5、10、15和20微克/微升的溶液。接着,将橙色染料与PBS混合,配制终浓度为1:500的溶液。在35至95摄氏度范围内,以每5摄氏度为增量测定CD40蛋白溶液的吸光度。
将数据保存为 XLS 文件,然后使用数据分析软件计算熔点或 TM 值。接着,将 CD40 和伞形酮加入 PBS 溶液中。然后用移液器将橙色染料加入 PBS 中,得到 1:500 的溶液浓度。
在35至95摄氏度范围内,以每5摄氏度为增量,测定CD40伞形酮复合物溶液的吸光度。橙色染料在室温及高温条件下均表现出稳定的荧光激发特性。确定最佳稀释比例为1:500。
在15微克/毫升的浓度下可检测到51.82摄氏度的稳定TM值,随着CD40蛋白浓度的增加,该值下降至45.79摄氏度。
本方案描述了一种检测化合物与蛋白质分子结合的独特方法,具有蛋白质样品损耗极小和数据准确性高的优势。该方法简化了实验流程,无需特殊设备即可开展。
差示扫描荧光法(DSF)能够快速、定量地评估蛋白质-配体相互作用,有助于免疫学相关发现项目中的早期靶点验证和机制性风险排除。该方法以高灵敏度检测CD40蛋白与伞形酮的结合,且样品损耗极低,从而简化了免疫调节化合物的评价流程。此工作流程使DSF成为生物制药研发中推进蛋白质稳定性与相互作用研究的一种可扩展且易于获取的工具。
基于DSF的蛋白质-小分子相互作用检测方法可融入从发现到临床前研究的连续流程,架起免疫通路调节剂早期靶点验证与先导化合物筛选之间的桥梁。