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DOI: 10.3791/68083-v
Lea Lough1, Mingyu Sheng2, Takeshi Namekawa2, Adrian Ion-Margineanu3, Christian W. Freudiger3, Samir S. Taneja4,5,6, Miles P. Mannas2,7
1Genecentrix Inc., 2Vancouver Prostate Center,University of British Columbia, 3Invenio Imaging, 4Dept. of Urology,NYU Langone Health, 5Dept. of Radiology,NYU Langone Health, 6Dept. of Biomedical Engineering,NYU Langone Health, 7Dept. of Urologic Sciences,University of British Columbia
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
在这里,我们提出了一种标准化方案,由于优于传统组织病理学,因此在活检样本上使用刺激拉曼组织学 (SRH) 检测前列腺癌,专注于样本制备、成像和人工智能,以提高癌症与组织的比率。此外,它还支持用于转录组学、类器官或异种移植模型的生物样本库,以及术中手术切缘的识别。
我们的目标是将人工智能和 SRH 成像相结合,以近乎实时地检测前列腺癌,同时改进下游分析的组织选择并加速诊断。人工智能模型可在几分钟内创建和解释 SRH 图像,从而在手术和活检期间实现实时、无标记的癌症诊断,减少对传统组织学的依赖并保留组织以供进一步分析。SRH 与人工智能和深度学习相结合,可实现实时、无标记的组织成像和分类,加速癌症诊断、手术决策和生物标志物发现,无需传统的处理或染色。确保活检中有足够的肿瘤含量以进行准确的基因组分析,同时改善 SRH-AI 与标准病理学的一致性,仍然是将 SRH AI 整合到前列腺癌常规诊断中的关键挑战。我们正在满足对更快、更准确的前列腺癌诊断和更好质量的需求。我们的方案改进了肿瘤检测,增加了肿瘤含量,并保留了组织以进行分子表征。
[旁白]首先,打开 SRH 成像仪。将装满灭菌水的 50 毫升注射器连接到位于成像仪接口左侧的注射器阀门上。确保注射器安装牢固。系统加载后,使用触摸屏显示器输入用户名和密码,然后点击登录。接受免责声明,承认如果在美国或欧盟以外使用,则该研究用于研究目的。现在,从显示选项中选择创建新研究。输入案例信息后,将样本保存在适当的文件名下,例如 John Doe。在“主要解剖位置”下,选择“前列腺,仅供研究使用”。对于分析模块,选择前列腺癌,仅供研究使用,以启用用于前列腺癌检测的集成人工智能。现在点击 创建研究 输入案例信息后。出现提示时,点击“确认”以确认数据将仅用于研究目的。按照说明用消毒水填充液体室。出现提示时点击下一步,然后从显示的选项中选择获取。现在按加载新试样提示系统显示准备试样和加载 NIO 幻灯片。取回前列腺活检载玻片。使用带齿的组织镊子,打开连接的盖玻片,并将 RPMI 培养基的前列腺活检牢固地放入载玻片的凹槽中。轻轻关闭盖玻片并固定样品。打开 SRH 成像仪接口上的载玻片支架,插入准备好的载玻片,确保正确对齐。通过为标本名称选择活检 1A 来设置成像参数,将 0.4 毫米设置为 18.3 毫米的扫描区域,仅供研究使用。关闭盖子,当系统检测到关闭时点击下一步。对于扫描位置,使用屏幕图像手动调整扫描位置。然后点击 获取图像 继续。查看屏幕上的示例详细信息,然后选择“继续”进行确认。让成像仪组合各个部分以生成 SRH 图像。然后通过单击大于图标来应用人工智能叠加,以红色突出显示癌症区域,以绿色突出显示非癌症区域,以紫色突出显示非诊断区域。现在查看显示癌性、非癌性和非诊断性组织百分比的条形图。单击小于图标可返回到没有人工智能叠加的原始 SRH 图像。使用放大和缩小功能详细检查活检图像。然后,使用导航图标检查活检图像。初始扫描后,使用带齿的组织镊子提起盖玻片,然后轻轻地从载玻片上取出活检。将活检转移到浸泡在盐水中的湿润 Telfa 上,以保持组织完整性。使用手术刀片,根据人工智能叠加层修剪非癌症区域,以提高癌症与组织的比例,通常集中在末端。重新扫描修剪后的活检。调整扫描区域和位置以确认增加的癌组织比。现在使用组织镊子从载玻片上取出活检,并将其放入冷冻管中。然后将冷冻管冷冻在液氮中。要导出图像数据,请按纸飞机图标开始导出图像数据。点击选择导出位置并选择 USB,完成,然后选择外部硬盘。现在选择“整个研究”以导出所有 SRH 图像系列。等待“导出正在进行”消息,完成后点击“确认”。要关闭仪器,请按退出并按照屏幕上的关机说明进行作。如果已导出数据,则在提示存档数据时选择“不继续”。按照实验室协议处理样品。然后点击下一步。并使用随附的注射器清空液室。再次点击下一步,然后从显示选项中选择是。现在取出并处理注射器。然后按关机关闭 SRH 显微镜。对活检标本进行了三次不同的扫描,以生成假苏木精和伊红染色刺激的拉曼组织学图像。人工智能叠加在SRH图像上,分别使用红色、绿色和紫色片段区分肿瘤、非肿瘤和非诊断区域。修剪非诊断区域后,重新扫描的活检显示肿瘤比例从 27% 增加到 72%。修剪后癌症与组织的比率显着增加,在 46 次活检中,平均癌症百分比从切割前的 45% 上升到切割后的 78%。由于参数设置不当,在没有墨水的情况下进行 10 微米深度的扫描次优会导致图像清晰度降低。墨水边距的成像引入了视觉伪影,由于对激光信号采集的干扰,表现为变暗或不清晰的区域。
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