2026年1月27日
本方案介绍了一种优化的荧光检测筛选方法,用于鉴定天然产物/小分子蛋白合成抑制剂。该方法具有良好的实用性,既适用于本科生药物发现技术的教学,也适用于药物化学研究项目的实施。
一种基于荧光的天然来源蛋白合成抑制剂初步筛选方案。蛋白合成涉及高度调控的过程,包括转录和翻译。转录主要由转录因子、染色质修饰和调控性RNA进行调控。
尽管翻译过程受到起始因子、信号通路和RNA稳定性机制的调控,这些调控系统使细胞能够维持正常的细胞功能,并有效应对压力或损伤。癌细胞通过劫持翻译机制来扰乱蛋白质合成,以满足其高能量需求和不受控制的生长。
这种重编程几乎导致所有主要致癌信号通路的失调,促进细胞存活、增殖和转移,同时抑制细胞死亡通路。由于增强的蛋白质合成对癌症的存活至关重要,因此靶向并阻断这一过程的治疗方法有望成为潜在的治疗策略。为鉴定蛋白质合成抑制剂,可采用以下蛋白质合成抑制荧光检测方法。
在开始实验之前,为了获得可靠的结果,化合物必须在其毒性阈值以下的适当浓度下给药。为确定起始浓度,应进行细胞毒性检测,以测定该化合物的半数有效浓度(EC 50)。如果此方法不可行,则可在本实验中以剂量依赖的方式测试化合物,以确定最有效的浓度参数。
如果化合物浓度引发细胞死亡,则有必要在较低浓度下进行测试。此外,染料在不使用时必须始终避光保存。长时间暴露于光照下会导致荧光淬灭,从而影响数据质量。
步骤 3.1,配制主混合液 A,标记一个离心管为 A,然后向其中加入 598.5 µL 培养基和 1.5 µL 蛋白标记物。通过上下吹打混匀该混合物,确保其均一性。接下来配制主混合液 B。标记另一个离心管为 B,向其中加入 1.5 µL 蛋白标记物、6.6 µL 环己酰亚胺和 591.9 µL 培养基。同样通过上下吹打混匀该混合物,确保其均一性。在两个孔中分别加入 1 µL 待测化合物和 1 µL 溶剂对照后,轻轻向这两个孔中各加入 99 µL 主混合液 A,加样时应倾斜移液枪头,沿孔壁缓慢加入,以避免对细胞造成机械扰动。
将100微升B号主混合液移液至两个未经处理的孔中。移液时应倾斜地将移液器对准孔壁,以防止对细胞造成机械扰动。轻轻敲击培养板,使目标组分充分进入细胞内。
将细胞在37摄氏度下孵育30分钟至2小时。通过抽吸去除细胞培养基。倾斜培养板,从孔的侧壁而非中心位置进行抽吸,以避免对细胞造成机械扰动。
然后向每个孔中加入 100 µL PBS 缓冲液,并在 900 × g 条件下离心 5 分钟。离心后,需通过抽吸去除 PBS 缓冲液。第五步,固定与透化处理。
向每个孔中加入 100 µL 固定液。然后将细胞在室温下避光孵育 15 分钟。随后吸除固定液。
用100微升洗涤缓冲液洗涤细胞,并通过抽吸去除。重复此步骤两次。向每个孔中加入100微升透化缓冲液。
此后,在室温下孵育10分钟。通过抽吸去除透化缓冲液。第六步,蛋白质反应与染色。
配制反应鸡尾酒主混合液。向离心管中加入651 µL PBS缓冲液,然后加入7 µL 100倍浓度的铜试剂。
然后加入7 µL荧光叠氮化物。最后,向离心管中加入35 µL还原剂。添加试剂时请严格遵循此顺序,随后将100 µL反应混合液加入每个孔中。
将细胞在室温避光条件下孵育30分钟,以防止光漂白。以900g离心5分钟。吸除上清,洗涤细胞,然后再一次吸除液体。
制备总DNA染料的1倍稀释液,向每孔中加入100微升。将细胞在室温下避光孵育20分钟,以防止光漂白。以900×g离心5分钟。
用100微升洗涤缓冲液洗涤细胞,通过抽吸去除。重复此步骤两次。最后,用100微升预冷的PBS缓冲液重悬细胞,以准备成像。
第八步,成像。将培养板插入酶标仪中,并将放大倍数设置为 20 倍。使用 GFP 469/525 纳米通道分析细胞核染色。
使用自动弯曲和自动聚焦功能以增强成像效果。利用Texas Red 586/647纳米通道分析活性蛋白质合成。使用自动弯曲和自动聚焦功能以增强成像效果。
荧光探针易受光漂白影响,光漂白是指光照辐射导致荧光分子失去荧光特性的现象。染料在不使用时应始终避光保存。此外,还需限制每个孔内的扫描次数以及暴露在光照下的时间。
长时间光照会导致光漂白,最终影响数据质量。让我们来看一下代表性结果。此处活细胞显示为绿色,而活跃的蛋白质合成则以红色表示。
已知的蛋白质合成抑制剂环己酰亚胺导致蛋白质合成显著减少,如图1B所示,与图1A中的阴性对照DMSO相比,红色荧光信号减弱。化合物一处理组如图1C所示,出现细胞脱落或细胞死亡现象。因此,我们无法对其蛋白质合成抑制活性作出明确结论。
这需要进一步开展剂量反应研究,以确定其在较低浓度下是否仍能抑制蛋白质合成。化合物二表现出中等程度的蛋白质合成抑制作用,如图1D所示。该荧光检测法是一种有价值的研究工具,也是一种适合用于培训本科生的易行化学生物学方法。
通过提供一种易于操作、高效且数据处理量最少的实验方案,使学生能够获得实践经验和现代药物发现技术,同时加快药物发现进程。该方案采用荧光底物和先进的荧光显微技术,系统性地检测并量化天然产物化合物一和化合物二的抑制能力。以环己酰亚胺作为参考抑制剂,两种天然产物均表现出不同程度的蛋白质合成抑制活性。
随着对新型蛋白质合成抑制剂的需求不断增长,该方法为本科生提供了富有意义的研究机会,同时推动了癌症治疗领域的进步。
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本方案介绍了一种基于荧光的方法,用于筛选源自天然物质的蛋白质合成抑制剂。该方法适用于药物发现和药物化学领域的实际应用。
从天然来源中快速鉴定蛋白质合成抑制剂对于肿瘤学早期药物发现至关重要,因为在这一阶段,作用机制的去风险化和靶点验证尤为关键。本基于荧光的筛选方案可高效地对候选化合物进行分类,有助于在苗头化合物向先导化合物转化的关键节点提升预测可信度。该方法提供定量且可重复的实验结果,从而加强项目组合的决策能力,并加速对新型化学物质的评估进程。
本方案整合了早期发现与先导化合物鉴定的衔接环节,将化合物筛选与针对肿瘤学研究组合的机制验证相结合。