EasyFiji：用于Fiji中用户友好型荧光图像处理的图形界面

如果你曾经使用过Fiji，就会知道它功能有多么强大，同时也容易在众多菜单和设置中迷失方向。EasyFiji通过简单的按钮、滑块和智能工具，让图像处理变得轻松无忧，操作直观且高效。它就是更友好的Fiji。

安装 EasyFiji 的推荐方法是通过 Fiji 更新站点。只需点击帮助、更新，然后点击管理更新站点并输入 EasyFiji。请记住勾选此项，然后点击应用并关闭。

应用更改，然后重启 EasyFiji。高级用户也可以选择从 GitHub 网页下载 JAR 文件。对于颜色通道调整，我们可以打开任意多通道图像，并通过通道颜色选项卡，选择不同的调色板。

我们可以选择红色、绿色、蓝色、额外通道，或选择黑色以禁用特定通道。我们可以使用所有通道来显示所有通道的颜色，也可以仅使用单个通道来显示特定通道。对于增益滑块，我们可以使图像变得更亮。

如果图像过暗，我们可以将其调亮。对于偏移图像，可以设置图像上的最低强度。因此，我们可以调整所有通道的颜色，或仅调整特定通道的颜色。

对于通道视图，打开感兴趣的图像。这是一幅多通道图像，因此每个单独的通道具有不同的强度和位置。

对于共定位按钮，它将使用两个通道生成RGB图像，并通过将两个通道强度相似的区域以黄色像素显示来突出这些区域。FFMerge按钮也会将两个通道合并为RGB图像，但采用的是另一种方式。

此处，每个通道均保持相同的可见度。这使得重叠区域更易于解释，同时不破坏通道间的平衡。FGMerge 按钮可将一个或多个通道叠加到绿色通道上。

当与绿色调图像（如微分干涉差（DIC）或电子显微镜图像）结合使用时，该方法利用绿色通道的尺寸保留各通道信息，整体对比度可显著提升图像质量。以下是使用 FGMerge 的另一个示例图像。对于图像堆栈的显示，EasyFiji 插件提供了最大强度投影、正交切片视图以及显微轨迹图（kymograph）等功能。

图像处理选项卡。打开图像后，点击记录按钮以开始记录命令。平滑功能将应用高斯模糊，去噪功能将应用中值滤波器，锐化按钮将应用二维非锐化掩模，而分离背景将应用滚动球信号，即使用滚动球算法去除背景。

应用查找表将根据显示面板中指定的增益和偏移进行调整。我们可以看到，在应用此处理命令后，图像质量得到显著改善。接下来，我将演示如何使用局部校正按钮来应用校正因子，使每帧的中等强度值局部匹配拟合曲线的数值。

局部校正和全局校正可依次应用于同一数据集。此处显示了漂白校正前后的强度分布曲线。可以看出，信号已得到校正。

此处我们展示不同的保存选项。保存面板面向非专业用户，帮助其为特定用途选择正确的文件格式。我们可以将图像保存为原始数据集。

它将包含图像的全部信息。我们可以将图像保存为JPEG格式用于展示，也可以保存为PNG格式。此外，还可以将图像序列保存为视频。

图像信息面板，该面板以人类可读的方式显示迄今为止获取的图像的厂商特定采集元数据。观看本视频后，您应能够充分理解如何使用此插件来可视化和处理生物医学图像。我们开发 EasyFiji 的目的是使生命科学家的图像分析更加简便、快速和易于获取。

无论您是在调整对比度、应用滤镜，还是在探索图像元数据，EasyFiji 都旨在让您的 Fiji 使用过程更加顺畅和愉快。