Thomas Dandekar Department of Bioinformatics University Wuerzburg Biography Publications Institution JoVE Articles Thomas Dandekar has not added a biography. If you are Thomas Dandekar and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Verso Una Comprensione Sistemica Di Listeria Monocytogenes Metabolismo Durante L'infezione Frontiers in Microbiology. 2012 | Pubmed ID: 22347216 PlateletWeb: Una Biologico Analisi Dei Sistemi Di Segnalazione Reti in Piastrine Umane Blood. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22123846 Time-resolved in Silico Modellazione Dell'accampamento Perfezionata Segnalazione Nelle Piastrine: Anelli Di Retroazione, Titolate Fosforilazioni E Modulazione Farmacologica BMC Systems Biology. 2011 | Pubmed ID: 22034949 Integrazione Di Modelli Booleani Esemplificato Sulla Trasduzione Del Segnale Degli Epatociti Briefings in Bioinformatics. Oct, 2011 | Pubmed ID: 22016404 Limiti Fisiologici Di Crescita Di Staphylococcus Aureus: Intuizioni Da Calcoli Di Flusso Costruiti Su Dati Esterni Metabolita E Proteomica Proteomics. May, 2011 | Pubmed ID: 21472852 Risposta Immunitaria Della Formica Camponotus Floridanus Contro Agenti Patogeni E Suoi Endosimbionti Mutualistiche Obligate Insect Biochemistry and Molecular Biology. Aug, 2011 | Pubmed ID: 21440063 Modellazione Effetti Citotossici E Antibiotici Dell'isochinolina Dimerica IQ-143 Sul Metabolismo E Sua Regolazione in Staphylococcus Aureus, Staphylococcus Epidermidis E Cellule Umane Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21418624 Un Metabolomica E Proteomica Studio Dell'adattamento Di Staphylococcus Aureus Alla Fame Di Glucosio Molecular BioSystems. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21327190 Due Chinasi CDK-come Nucleo Localizzato Con Ruoli Cruciali Per La Replica Eritrocitari Parassita Di Malaria Sono Coinvolti Nella Fosforilazione Del Fattore Di Splicing Journal of Cellular Biochemistry. May, 2011 | Pubmed ID: 21312235 Cella Singola Genomica Rivela Lo Stile Di Vita Di Poribacteria, Un Phylum Candidato Associato Simbiosi Con Spugne Marine The ISME Journal. Jan, 2011 | Pubmed ID: 20613790 Cavo Espansione E Screening Virtuale Di Indinavir Opacizzare HIV-1 Inibitori Di Proteasi Utilizzando Pharmacophoric - Somiglianza Di Forma Funzione Di Punteggio Bioinformation. 2010 | Pubmed ID: 20978602 Tecnologia Di Microarray Di Alto-rendimento Nella Diagnostica Di Enterobatteri Basati Su Analisi Di Regressione E Selezione Sonda Genome-wide BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20964857 Decifrando Il Metabolismo Intracellulare Della Listeria Monocytogenes Da Mutante Di Screening E Di Modellazione BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20955543 Farmacogenomica Strategie Contro La Resistenza Microbica: Dal Brillante Al Tetro Innovativi Pharmacogenomics. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20860457 Protecs, Un Completo E Potente Deposito E Sistema Di Analisi Per Dati OMICA, Applicato Per L'analisi Della Risposta Di Anaerobiosi Di Staphylococcus Aureus Col Proteomics. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20662099 Profilatura Dello Sviluppo Tramite Spettrometria Totale Di Fosfocolina Contenenti Fosfolipidi Nel Sistema Nervoso Ratto Rivela Gradienti Temporo-spaziale Journal of Neurochemistry. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20524967 Metabolismo Del Carbonio Di Agenti Patogeni Batterici Intracellulari E Possibili Collegamenti Con Virulenza Nature Reviews. Microbiology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20453875 Transcriptome Survey of La Anhydrobiotic Tardigrade Milnesium Tardigradum Rispetto Ai Hypsibius Dujardini E Richtersius Coronifer BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20226016 Analisi Proteomic Di Muschi: Verso Una Migliore Comprensione Dei Meccanismi Molecolari Degli Organismi Anhydrobiotic PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20224743 Il Pacchetto Di Valutazione IronChip: Un Pacchetto Di Moduli Perl Per Robusta Analisi Di Microarrays Personalizzato BMC Bioinformatics. 2010 | Pubmed ID: 20193060 BioNet: Un R-pacchetto Per L'analisi Funzionale Delle Reti Biologiche Bioinformatics (Oxford, England). Apr, 2010 | Pubmed ID: 20189939 Caratterizzazione Di Un Romanzo Interazione Tra Fosfoproteina Stimolata Vasodilatatore E Abelson Interazione 1 in Piastrine Umane: Un Approccio Computazionale E Sperimentale Concordato Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20110575 Comprese Strutture Secondarie Del RNA Migliora La Precisione E La Robustezza Nella Ricostruzione Di Alberi Filogenetici Biology Direct. 2010 | Pubmed ID: 20078867 Stress Response in Muschi: Espressione Genica Differenziale Di Chaperoni Molecolari Cell Stress & Chaperones. Jul, 2010 | Pubmed ID: 19943197 Modellizzazione Cross-ibridazione Su Filogenetico Microarrays Del DNA Aumenta Il Potere Di Rilevazione Della Specie Strettamente Correlate Molecular Ecology Resources. Jan, 2009 | Pubmed ID: 21564570 JANE: Efficiente Mapping Di Sequenza Di Lunghezza Variabile E Procariote ESTs Legge Sui Genomi Modello Correlato BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19943962 Tardigrade Workbench: Confrontando Le Proteine Legate Allo Stress, Dei Cluster Di Proteine Simili in Sequenza E Funzionale Così Come Elementi Di RNA in Muschi BMC Genomics. 2009 | Pubmed ID: 19821996 Modellazione Degli Stati Del Sistema in Cellule Del Fegato: Sopravvivenza, Apoptosi E Loro Modifiche in Risposta All'infezione Virale BMC Systems Biology. 2009 | Pubmed ID: 19772631 Il Virus Del Vaiolo Vaccino Ricombinante Oncolytic Altamente Attenuato GLV-1 H 68: Caratteristiche Comparative Genomic E Il Contributo Di Inattivazione Di F14.5L Molecular Genetics and Genomics : MGG. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19701652 CA/C1 Peptidasi Della Malaria Parassiti Plasmodium Falciparum E P. Berghei E Loro Ospiti Mammiferi - Un'analisi Bioinformatical Biological Chemistry. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19663681 Rilevare Le Dipendenze Specie-sito in Grandi Allineamenti Multipli Di Sequenza Nucleic Acids Research. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19661281 Approcci Bioinformatical Per Rilevare E Analizzare Le Interazioni Della Proteina Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2009 | Pubmed ID: 19544036 Meccanismi Molecolari Di Tolleranza in Muschi: Nuove Prospettive Per La Conservazione E La Stabilizzazione Del Materiale Biologico Biotechnology Advances. Jul-Aug, 2009 | Pubmed ID: 19472511 5.8S-28S RRNA Interazione E Basato Su HMM ITS2 Annotazione Gene. Feb, 2009 | Pubmed ID: 19026726 Unsupervised Meta-analisi Su DataSet Di Espressione Genica Diversi Permettono La Comprensione Della Funzione Del Gene E Regolamento Bioinformatics and Biology Insights. 2008 | Pubmed ID: 19812781 Modellazione Reti Di Lipidi Phagosomal Che Regolano L'assemblaggio Dell'actina BMC Systems Biology. 2008 | Pubmed ID: 19061496 Nuove Tendenze Nella Farmacogenomica Strategie Contro Lo Sviluppo Di Resistenza in Caso Di Infezioni Microbiche Pharmacogenomics. Nov, 2008 | Pubmed ID: 19018725 Sincrono Analisi Visiva E La Modifica Della Sequenza Di RNA E Gli Allineamenti Di Struttura Secondaria Usando 4SALE BMC Research Notes. 2008 | Pubmed ID: 18854023 ProfDistS: (profilo) Distanza Basato Phylogeny Sulla Sequenza - Allineamenti Di Struttura Bioinformatics (Oxford, England). Oct, 2008 | Pubmed ID: 18723521 ITS2 Dati Confermano Un Monofiletico Chlorophycean-gruppo (Sphaeropleales) BMC Evolutionary Biology. 2008 | Pubmed ID: 18655698 Identificare I Moduli Funzionali in Reti Di Interazione Della Proteina-proteina: Un Approccio Integrato Esatto Bioinformatics (Oxford, England). Jul, 2008 | Pubmed ID: 18586718 Il Cromosoma Lineare Del Micoplasma Della Pianta-patogeno 'Candidatus Phytoplasma Mali' BMC Genomics. 2008 | Pubmed ID: 18582369 Le Interazioni Della Proteina Delle Piastrine: Mappa, Componenti Di Segnalazione, Fosforilazione Della Groundstate Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18451328 Analisi Esplorativa Dei Dati Di MCL Rivelano Reti Di Espressione Di Gene Implicati Nella Sopravvivenza E Prognosi Supportate Da Analisi CGH Esplorativa BMC Cancer. 2008 | Pubmed ID: 18416826 Interazioni Di Blu Di Metilene Con Reductases Disolfuro Umano E Loro Orthologues Da Plasmodium Falciparum Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Jan, 2008 | Pubmed ID: 17967916 Del Database ITS2 II: Omologia Modellazione Struttura RNA Per La Sistematica Molecolare Nucleic Acids Research. Jan, 2008 | Pubmed ID: 17933769 Uso Delle Piastrine Umane Altamente Purificate Funzionale Per L'identificazione Di Nuove Proteine Dell'IPP Signaling Pathway Thrombosis Research. 2008 | Pubmed ID: 17931695 Exonization Del Mouse Attivo L1s: Un Driver Del Transcriptome Evoluzione? BMC Genomics. 2007 | Pubmed ID: 17963496 Ricostruzione Di Rete Integrata, Visualizzazione Ed Analisi Tramite YANAsquare BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17725829 Filogenesi Profondo Metazoi In Silico Biology. 2007 | Pubmed ID: 17688440 Distinguere Specie RNA (New York, N.Y.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17652131 Utilizzo Dei Metodi Di Contesto Analisi E Genoma Pathway Per La Genomica Funzionale Del Metabolismo Nucleotidi Di Mycoplasma Pneumoniae Gene. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17467928 Una Visione Integrata Dei Profili Di Espressione E Di Soluto Gene Di Arabidopsis Tumori: Un Approccio Genome-wide The Plant Cell. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17172353 4SALE - Uno Strumento Per La Sequenza Di RNA Sincrono E Allineamento Della Struttura Secondaria E La Modifica BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17101042 Schemi XML Per Tipi Di Dati Di Bioinformatic Comuni E La Loro Applicazione Nei Sistemi Di Flusso Di Lavoro BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17087823 InGeno - Un Genoma Integrato E Visualizzatore Di Ortholog Per I Confronti Del Genoma Di Genoma Migliorati BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17054788 Modellizzazione Interazione Siti Nei Domini Della Proteina Con Interazione Profile Modelli Nascosti Di Markov Bioinformatics (Oxford, England). Dec, 2006 | Pubmed ID: 17000753 Un Applet Java Per Esplorare La Nuova Classificazione Di Livello Più Elevata Di Eucarioti Con Enfasi Sulla Tassonomia Dei Protisti The Journal of Eukaryotic Microbiology. Sep-Oct, 2006 | Pubmed ID: 16968448 Intero-genome Sequence of Listeria Welshimeri Rivela Passaggi Comuni Nella Riduzione Del Genoma Con Listeria Innocua Rispetto Alla Listeria Monocytogenes Journal of Bacteriology. Nov, 2006 | Pubmed ID: 16936040 Il Database Interno Trascritto Distanziale 2 - Un Server Web Per (e Non Solo) Bassi Livelli Analisi Filogenetiche Nucleic Acids Research. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16845103 Ferro Regolamento E Il Ciclo Cellulare: Identificazione Di Un Elemento Ferro-reattivo in 3'-untranslated Regione Di Divisione Delle Cellule Umane Del Ciclo 14A MRNA Da Una Strategia Di Screening Basati Su Microarray Raffinato The Journal of Biological Chemistry. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16760464 Alterazioni Lisosomiali, Citoscheletriche E Metabolici Nella Cardiomiopatia Di Topi Knockout Catepsina L FASEB Journal : Official Publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16636100 Genome-wide Mappatura Delle Integrazioni Di Vettore Di Virus Schiumoso in Una Linea Cellulare Umana The Journal of General Virology. May, 2006 | Pubmed ID: 16603537 Analisi Dei Dati SAGE in Piastrine Umane: Caratteristiche Del Transcriptome in Una Cella Anucleate Thrombosis and Haemostasis. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16601835 RIP Interazioni Strutturali Di Morte Dominio Implicate Nella Sopravvivenza E Proliferazione Di TNF-mediata Proteins. May, 2006 | Pubmed ID: 16470584 C 13 Isotopologue Studi Di Perturbazione Della Listeria Monocytogenes Carbonio Metabolismo E Sua Modulazione Dal Regolatore Virulenza PrfA Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16461909 Analisi E Previsioni Funzione Per Proteine Ipotetiche O Putative Precedentemente Conservate in Blochmannia Floridanus BMC Microbiology. 2006 | Pubmed ID: 16401340 Piastrine Di Comprensione. Lezioni Dalla Proteomica, Genomica E Promesse Dall'analisi Di Rete Thrombosis and Haemostasis. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16363231 B-Raf E Segnalazione C-Raf Indagato in Un Modello Semplificato Della Cascata Della Chinasi Mitogeni Biological Chemistry. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16307482 Modellistica Di Omologia Ha Rivelato Più Di 20.000 Distanziale Di Trascritto Interna Da RRNA 2 (ITS2) Strutture Secondarie RNA (New York, N.Y.). Nov, 2005 | Pubmed ID: 16244129 CBCAnalyzer: La Deduzione Di Filogenesi Basati Su Modifiche Base Compensative in Strutture Secondarie Del RNA In Silico Biology. 2005 | Pubmed ID: 15996120 Metaboliti E La Flessibilità Del Percorso In Silico Biology. 2005 | Pubmed ID: 15972010 YANA - Uno Strumento Software Per L'analisi Dei Modi Di Disossidante, Attività Di Espressione Genica Ed Enzima BMC Bioinformatics. 2005 | Pubmed ID: 15929789 ITS-2 E 18S Phylogeny Gene RRNA Di Aplysinidae (Verongida, Demospongiae) Journal of Molecular Evolution. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15871043 Gli Sforzi Attuali Nell'analisi Di RNAi E RNAi Obiettivo Geni Briefings in Bioinformatics. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15826358 ProfDist: Uno Strumento Per La Costruzione Di Grandi Alberi Filogenetici Basati Sulle Distanze Di Profilo Bioinformatics (Oxford, England). May, 2005 | Pubmed ID: 15677706 L1Base: Dall'annotazione Funzionale Alla Previsione Di Elementi Attivi Di Linea-1 Nucleic Acids Research. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15608246 Interdipendenza Metabolica Di Batteri Intracellulari Obbligati E Loro Ospiti Dell'insetto Microbiology and Molecular Biology Reviews : MMBR. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15590782 I Componenti Dei Complessi Della Proteina - Versatile Costruzione Blocchi O Biochimiche Manufatti Condivisi? BioEssays : News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15551274 Stima Accurata E Robusto Phylogeny Basato Su Distanze Di Profilo: Uno Studio Delle Chlorophyceae (Chlorophyta) BMC Evolutionary Biology. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15222898 Riboswitch Finder - Uno Strumento Per L'identificazione Di Riboswitch RNAs Nucleic Acids Research. Jul, 2004 | Pubmed ID: 15215370 Farmacogenomica Strategie Contro Lo Sviluppo Di Resistenza in Caso Di Infezioni Microbiche Pharmacogenomics. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15165173 Phylogeny Di Firmicutes Con Particolare Riferimento Al Mycoplasma (Mollicutes) Come Dedotto Da Dati Di Sequenza Dell'amminoacido Fosfoglicerato Chinasi International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. May, 2004 | Pubmed ID: 15143038 Un Romanzo Conservato Famiglia Dell'ossido Nitrico Sintasi? Trends in Biochemical Sciences. May, 2004 | Pubmed ID: 15130557 NO-bound Mioglobina: Diversità Strutturali E Dinamiche Del Legante NO Journal of the American Chemical Society. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14971914 Un Sistema Open Source Proteina Gel Di Documentazione Per L'analisi Del Proteoma Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14741024 In Cerca Del Prototipo Dell'ossido Nitrico Sintasi FEBS Letters. Nov, 2003 | Pubmed ID: 14596904 Un Metodo Per La Classificazione Dei Metaboliti Nelle Analisi Topologica Percorso Basati Sulla Minimizzazione Del Numero Di Percorso Bio Systems. Aug, 2003 | Pubmed ID: 12941488 Verso La Predizione Di Sito Di Clivaggio Basati Su Computer Di Endopeptidases Cisteina Biological Chemistry. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12887057 Metaboliti: Una Mano Per L'evoluzione Del Percorso? Trends in Biochemical Sciences. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12826406 Un Software Tool-box Per Analisi Di Elementi Di RNA Regolatori Nucleic Acids Research. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12824342 Sospetta Utilità Degli Enzimi Con Molteplici Attività Nel Genoma Piccola Specie Di Micoplasma: La Sostituzione Del Mancante "domestico" Nucleoside Difosfato Chinasi Gene Dell'attività Di Chinasi Glicolitica Omics : a Journal of Integrative Biology. 2002 | Pubmed ID: 12427276 Ricostruzione Comparativa Del Genoma Di Analisi E Percorso Pharmacogenomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11972445 Un Dominio Strutturale Versatile Analysis Server Utilizzando Matrici Peso Profilo Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Mar-Apr, 2002 | Pubmed ID: 11911710 Un Tessuto 3D combinata Engineered Claudia Göttlich*1, Lena C. Müller*1, Meik Kunz*3, Franziska Schmitt1, Heike Walles1,4, Thorsten Walles2, Thomas Dandekar3, Gudrun Dandekar1,4, Sarah L. Nietzer1 1Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine (TERM), University Hospital Wuerzburg, 2Department of Cardiothoracic Surgery, University Hospital Wuerzburg, 3Department of Bioinformatics, University Wuerzburg, 4Translational Center Wuerzburg, Fraunhofer Institute Interfacial Engineering and Biotechnology IGB Biotechnik Il ITS2 Database Benjamin Merget1,2, Christian Koetschan1, Thomas Hackl1, Frank Förster1, Thomas Dandekar1, Tobias Müller1, Jörg Schultz1, Matthias Wolf1 1Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry, University of Würzburg JoVE 3806 Biologie
Un Tessuto 3D combinata Engineered Claudia Göttlich*1, Lena C. Müller*1, Meik Kunz*3, Franziska Schmitt1, Heike Walles1,4, Thorsten Walles2, Thomas Dandekar3, Gudrun Dandekar1,4, Sarah L. Nietzer1 1Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine (TERM), University Hospital Wuerzburg, 2Department of Cardiothoracic Surgery, University Hospital Wuerzburg, 3Department of Bioinformatics, University Wuerzburg, 4Translational Center Wuerzburg, Fraunhofer Institute Interfacial Engineering and Biotechnology IGB Biotechnik
Il ITS2 Database Benjamin Merget1,2, Christian Koetschan1, Thomas Hackl1, Frank Förster1, Thomas Dandekar1, Tobias Müller1, Jörg Schultz1, Matthias Wolf1 1Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry, University of Würzburg JoVE 3806 Biologie