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Mitunter verhält sich eine Gruppe von Bakterien wie eine Gemeinschaft. Um dies zu erreichen, verwenden sie das Quorum Sensing, wobei es sich um die Wahrnehmung der höheren Zelldichte handelt, was zu einer Veränderung der Genexpression führt. Quorum Sensing umfasst sowohl extrazelluläre als auch intrazelluläre Signale. Die Signalkaskade beginnt mit einem Molekül, das als Autoinduktor (AI) bezeichnet wird. Einzelne Bakterien produzieren Autoinduktoren, die sich aus der bakteriellen Zellmembran in den extrazellulären Raum bewegen. AIs können sich passiv entlang eines Konzentrationsgradienten aus der Zelle heraus bewegen oder aktiv über die Bakterienmembran transportiert werden.
Wenn die Zelldichte in den Bakterienpopulationen niedrig ist, so diffundieren die AIs von den Bakterien weg. So wird die Konzentration der AIs in der Umgebung niedrig gehalten. Wenn sich die Bakterien teilen und weiterhin AIs ausscheiden, steigt die Konzentration der AIs und bis schließlich ein Schwellenwert erreicht ist. Dieser Schwellenwert erlaubt es den AIs, Membranrezeptoren der Bakterien zu binden, wodurch Veränderungen in der Genexpression in der gesamten Bakteriengemeinschaft ausgelöst werden.
Viele Bakterien werden allgemein als gram-positiv oder gram-negativ eingestuft. Diese Bezeichnungen beziehen sich auf die Farbe, die die Bakterien annehmen, wenn sie mit einer Reihe von Farbstoffen behandelt werden. Diese Methode wurde von Hans Christian Joachim Gram vor über einem Jahrhundert entwickelt. Nehmen Bakterien eine violette Farbe an, sind sie gram-positiv, sehen sie rot aus, sind sie gram-negativ. Diese Färbungen werden von den Bakterien aufgrund der unterschiedlichen Chemie ihrer Zellwände aufgenommen. Die unterschiedliche Zusammensetzung der bakteriellen Zellwände bestimmt die Art und Weise, wie die Bakterien miteinander und mit ihrer Umgebung interagieren. Sie ist oft direkt an der Entstehung von Krankheiten beteiligt. Zum Beispiel bestehen die Zellwände von gram-negativen Bakterien hauptsächlich aus Lipopolysaccharid, was auch als Endotoxin bekannt ist und einen septischen Schock im Blut verursacht.
Bei gram-positiven Bakterien erfolgt das Quorum Sensing meist in zwei Schritten. Zunächst bindet das AI, ein autoinduzierendes Peptid (AIP), an einen Membranrezeptor, wenn die äußere Konzentration ausreichend hoch ist. Diese Bindung aktiviert interne Enzyme, so genannte Second Messenger Kinasen, welche dann Transkriptionsfaktoren phosphorylieren. Diese Transkriptionsfaktoren regulieren dann die Expression verschiedener Gene.
Bei vielen gram-negativen Bakterien erfolgt das Quorum Sensing jedoch in einem einstufigen Prozess. Erreicht die äußere Konzentration der AIs den Schwellenwert, durchqueren diese die Membran (über einen Transporter) und treten wieder in die Zelle ein. Im Inneren können sie direkt mit Transkriptionsfaktoren interagieren, um die Genexpression zu regulieren. Diese Art der Signalübertragung erfordert keinen Zwischen -oder Botenstoff. Der Autoinduktor fungiert in diesem Fall selbst als Botenstoff. Aber auch ohne einen zweiten Botenstoff kann die intrazelluläre Signalübertragung kompliziert sein.
Ein Beispiel dafür ist das Bakterium Photorhabdus luminescens, das gram-negativ ist. Es produziert den Autoinduktor 2 (AI-2) als Quorum Sensing Signal und als intrazelluläres Signal. Die Bakterien geben AI-2 an die Umgebung ab. Wenn die AI-2-Konzentration außerhalb der Bakterienzellen einen Schwellenwert erreicht, bindet AI-2 einen ATP-bindenden Kassetten-(ABC)-Transporter an der Bakterienmembran und wird durch den ABC-Transporter wieder aufgenommen. Daraufhin phosphoryliert die intrazelluläre Kinase, LsrK, das AI-2. Einmal aktiviert, kann AI-2 selbst als Transkriptionsfaktor fungieren und Gene aktivieren, die das Luciferase-Enzym kodieren. Die Luciferase produziert Licht, wenn sie spezifische Reaktionen katalysiert. Erst wenn die Photorhabdus luminescens Population eine kritische Dichte erreicht hat, kann man ihre Biolumineszenz sehen. Es wurde vermutet, dass dieses Bakterium für das bläulich-grüne Leuchten in den Wunden einiger US-Bürgerkriegssoldaten nach der Schlacht von Shiloh verantwortlich war.
Die Ausbreitung von Bakterien auf der Oberfläche von medizinischen Implantaten erfolgt durch Quorum-Signalwege und kann lebensbedrohliche Infektionen verursachen. Es wird viel geforscht, um Wege zu finden, die die Bildung von bakteriellen Biofilmen in der Medizin zu verhindern. Ein Großteil dieser Forschung konzentriert sich auf die Entwicklung neuer Materialien, die für das Bakterienwachstum nicht geeignet sind. Doch auch biologische Verbindungen, darunter Substanzen, die von einigen Bakterienarten produziert werden, werden auf ihre bakterienhemmenden Eigenschaften hin untersucht.
Ähnlich wie bei Eukaryonten findet die chemische Signalisierung bei Bakterien zwischen und innerhalb von Zellen statt. Die Zell-zu-Zell-Kommunikation, bekannt als Quorum Sensing, beinhaltet die Produktion, die Freisetzung und den gemeinschaftsumfassenden Nachweis von kleinen Signalmolekülen, nämlich Auto-Inducern. Diese Moleküle sind hydrophobe Peptide, die Hormonen ähneln, weil sie chemische Signale zur Informationsübermittlung zwischen den Zellen produzieren, nachdem eine Grenzwertkonzentration erreicht wurde.
Einzelne Zellen können die Dichte extrazellulärer Auto-Inducer erkennen, die die Produktion eines spezifischen sekundären Kuriers, nämlich zyklischer diGMP, innerhalb der Zelle signalisieren, so dass die Produktion der Proteine, die an der Genomik von Verhaltensweisen wie z. B. der Biolumineszenz beteiligt sind, geregelt werden kann. Durch diese Prozesse können bakterielle Zellen so miteinander agieren, als ob es sich bei ihnen um einen multizellulären Organismus handelt - dies kann sogar typenübergreifend erfolgen.
Diese Kommunikation ist wichtig in der Bildung eines Biofilms, nämlich bakterielle Zellgemeinschaften, die auf Oberflächen anhaften, von denen sie sich ernähren. Biofilme können sich auf Zähnen befinden oder auch in medizinischen Implantaten.
