>1. Organoid-Verarbeitung für die Histologie: Die Agarose-Spin-Down-Methode
HINWEIS: Dieses Protokoll wurde von einer früheren Veröffentlichung von Vlachogiannis et al. übernommen. Wir haben einen Schritt hinzugefügt, der die Agarose-Einbettung beinhaltet, um alle Populationen von Organoiden erfolgreich einzubetten.
- Entfernen Sie vorhandene Medien aus der Vertiefung. Achten Sie darauf, die Basalmembrankuppeln nicht abzusaugen.
- Geben Sie ein gleiches Volumen der Zellrückgewinnungslösung hinzu (entspricht dem Volumen des in Schritt 1 entnommenen Mediums) und inkubieren Sie es 60 Minuten lang bei 4 °C.
- Lösen Sie die Basalmembrankuppel mit einer Pipette und zerdrücken Sie die Basalmembrankuppel mit einer Pipettenspitze. Sammeln Sie die dissoziierte Dome und die Zellrückgewinnungslösung in einem 1,5-ml-Röhrchen.
- Zentrifugieren Sie bei 300 x g und 4 °C für 5 min.
- Entfernen Sie den Überstand (Zellrückgewinnungslösung). Bewahren Sie alle Überstände bis zum Ende in getrennten Röhrchen auf, wenn das Vorhandensein von Organoiden im letzten Pelletierungsschritt bestätigt wird.
- Fügen Sie das gewünschte Volumen (Tabelle 1) kaltes PBS hinzu und pipettieren Sie vorsichtig auf und ab, um das Pellet mechanisch zu stören.
- Zentrifugieren Sie bei 300 x g und 4 °C für 5 min.
- Entfernen Sie den Überstand (PBS).
- Fixieren Sie das Pellet 60 Minuten lang bei Raumtemperatur in einem abgestimmten Volumen (z. B. 500 μl für ein Pellet aus der 24-Well-Plattenkultur, Tabelle 1) mit 4 % PFA.
- Nach der Fixierung bei 300 x g und 4 °C 5 min zentrifugieren.
- Entfernen Sie den Überstand (PFA).
- Mit angepasstem Volumen (z. B. 500 μl für ein Pellet aus der 24-Well-Plattenkultur, Tabelle 1) von PBS waschen und bei 300 x g und 4 °C für 5 Minuten zentrifugieren.
- Bereiten Sie warme Agarose zu (2 % Agarose in PBS).
Anmerkung: Hier können Zellpellets für den Gefrierbereich direkt in 200 μl OCT-Verbindung resuspendiert werden.
- Resuspendieren Sie das Zellpellet in 200 μl Agarose (2% in PBS).
- Unmittelbar nach der Zugabe von Agarose lösen Sie das Zellpellet vorsichtig von der Wand des 1,5-ml-Röhrchens mit der 25-G-Nadel, die an der 1-ml-Spritze befestigt ist. Wie in Abbildung 1 gezeigt, besteht die Gefahr, dass das Zellpellet während des Agarose-Einbettungsprozesses ganz oder teilweise verloren geht, wenn das Zellpellet nicht physisch von der Wand des 1,5-ml-Röhrchens gelöst wird.
- Warten Sie, bis die 2% Agarose in PBS vollständig verfestigt sind.
- Lösen Sie den erstarrten Agaroseblock von der 1,5-ml-Tube mit einer 25-G-Nadel, die an der 1-ml-Spritze befestigt ist.
- Übertragen Sie den abgelösten Agaroseblock mit dem Zellpellet in ein neues 1,5-ml-Röhrchen.
- Füllen Sie das Röhrchen mit 70 % EtOH und fahren Sie mit dem herkömmlichen Protokoll zur Gewebedehydrierung und Paraffineinbettung fort.
Tabelle 1: Aussaatdichte, Volumen der Basalmembran und mittleres Volumen, das für eine Kuppel benötigt
wird
| Kulturplatte | Seeding-Dichte (Zellen) | Volumen der Basalmembran (μL) | Medium (μL) |
| 48 gut | 25.000-50.000 | 20 | 250 |
| 24 gut | 50.000-250.000 | 40 | 500 |
| 6 gut | 50.000-250.000 | 40 | 2.000 |