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1. Immunfluoreszenz
Das folgende Protokoll wird koronalen Hirngefrierschnitten von Mäusen transkardial perfundiert (20 ml PBS, 0,1 mol / Liter, pH 7,4, gefolgt von 50 ml gekühltem Paraformaldehyd 4% in PBS) erhalten wurden. Nach Perfusion werden Gehirne vorsichtig abgenommen und in 30% Saccharose in PBS bei 4 ° C über Nacht zur Kryokonservierung übertragen. 45 ° C für 3 Minuten, bevor sie in Ampullen versiegelt und bei -70 ° C bis zur Verwendung gelagert - Die Gehirne werden dann schnell durch Eintauchen in Isopentan bei froren. Koronare Gehirn Gefrierschnitte (20 um) seriell zu schneiden und Immunfluoreszenz-Protokoll 11, 6 unterzogen.
Alle Reagenzien und Proben auf Raumtemperatur gebracht. Bitte beachten Sie, dass die vorgestellten Arbeits Verdünnungen von Antikörpern und Serum ergaben sich aus Studien, um die beste Leistung zu erhalten, gemacht. Wenn verschiedene Antikörper und Serum verwendet werden, muss das Protokoll validiert werden.
Hinweis, dass da sowohl anti-CD11b-und Anti-CD68-Antikörper werden in primären Ratten gemacht, die grenzSignal durch anti-Ratte Alexa 546, verwendeten wir eine hohe Verdünnung von Anti-CD11b, gefolgt von Fluoreszenz-Signal-Amplifikation mit vermeiden TSA-Kit (Cy5 Tyramid). Wir haben die optimale Arbeitsverdünnung für Anti-CD11b durch die Durchführung der beschriebenen Protokoll außer Schritt 1.17 und unter Verwendung von mindestens 7 verschiedene Verdünnungen von anti-CD11b, wie in Tabelle 1 angegeben eingestellt. Als Ergebnis hat 1:30.000 gewählt, der einzige Verdünnung zu erreichen: 1) sichtbares Signal mit Cy5 bei Anregungswellenlänge 646 nm, 2) kein Signal mit Alexa 546 bei 532 nm Anregungswellenlänge. Auf diese Weise wird Alexa 546 Fluoreszenzsignal selektiv mit CD68-Expression assoziiert.
Die optimale Verdünnung für die Anti-CD11b-und Anti-CD68-Antikörper können je nach der Art des Gewebes zu variieren und muss vor der Co-Markierungsprotokoll beginnen definiert werden.
- Zweimal waschen Gehirn Gefrierschnitte mit PBS.
- Incubate Kryoschnitte für 5 min in PBS mit 1% H 2 O 2 (Schritt erforderlich, da die Fluoreszenzverstärkung benötigt Inkubation mit Meerrettich-Peroxidase-Streptavidin-HRP, siehe Schritt 1.12).
- Wash Kryoabschnitte 2x mit PBS.
- Gefrierschnitte Inkubation für 60 min in PBS mit 10% NGS und 0,3% Triton.
- Gefrierschnitte Inkubation bei 4 ° C über Nacht in PBS mit primären Ab Ratte anti-CD11b [1:30.000], 10% NGS und 0,3% Triton.
- Wash 2x Gefrierschnitte (5 min) mit PBS.
- Gefrierschnitte Inkubation für 60 min in PBS mit biotinylierten sekundären anti-Ratte Ab [1:200] und 1% NGS.
- Wash Kryoabschnitte 2x mit PBS.
- Mit TNT (0,1 M Tris-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,05% Tween 20 Tris-HCl, NaCl, Tween) gewaschen Gefrierschnitten.
- Gefrierschnitte Inkubation für 1,5 h in TNB (Tris-HCl-NaCl-Blocking-Puffer: 0,1 M Tris-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,5% Blocking-Reagenz aus entsprechenden Kit (siehe Tabelle der Reagenzien)).
- Wash KryoAbschnitte 3x mal mit TNT.
- Inkubieren Gefrierschnitten in TNB enthält Streptavidin-HRP [1:100].
- Wash Kryoabschnitte 3x mit TNT.
- Gefrierschnitte Inkubation für 8 min in Amplification Diluent enthält Cyanine 5 Tyramid [1:300].
- Wash Kryoabschnitte 3x mit PBS.
- Gefrierschnitte Inkubation für 60 min in PBS mit 10% NGS und 0,1% Triton.
- Gefrierschnitte Inkubation bei 4 ° C über Nacht in PBS mit primären Ab Ratte anti-CD68 [1:200], 3% NGS und 0,3% Triton.
- Wash Kryoabschnitte 3x mit PBS.
- Gefrierschnitte Inkubation für 60 min in PBS mit fluorconjugated Sekundär Ab Alexa 546 anti-Rat [1:500] und 1% NGS.
- Wash Kryoabschnitte 3x mit PBS.
- Gefrierschnitte inkubieren für 10 min in PBS mit Hoechst 1 ug / ml.
- Wash Kryoabschnitte 3x mit PBS.
- Montieren Gefrierschnitten in Prolong Gold.
2. Erwerb der dreidimensionale Bilder durch konfokale Mikroskopie
Das hier verwendete Mikroskop war ein IX81-Mikroskop mit einem konfokalen Scaneinheit FV500 mit 3 Laserlinien ausgestattet: Ar-Kr (488 nm), He-Ne-rot (646nm) und He-Ne-Grün (532 nm) und eine UV-Diode ist.
- Aus den Anregungslaser in Abhängigkeit von den Wellenlängen der Fluoreszenzfarbstoffe angeregt werden (He-Ne rot für Cy5, CD11b, He-Ne-Grün für Alexa546, CD68 und UV-Diode für Hoechst, Kerne).
- Wählen Sie die beste Kombination für dichroitischen Spiegel Lichtsignal-Sammlung.
- Richten Sie die Bildauflösung auf mindestens 800 x 600 Pixel.
- Identifizieren Sie einen Bereich von Interesse, indem Auflicht-Fluoreszenz und die schrittweise Erhöhung der Vergrößerung auf dem 40X-Objektiv.
- Wechseln Sie in der Laser Scanning Mikroskopie (LSM) Modalität.
- Führen repetitiven Scans, um die Photomultiplier (PMT) und die Verstärkung für jeden Kanal eingestellt werden. Laser können einzeln eingeschaltet, um die Einrichtung zu erleichtern. Halten Verstärkung so gering wie möglich, um unerwünschte nicht-spezifische Signale zu vermeiden.
- Mit repebewerbs Scan läuft, bewegen Sie den Fokussteuerung, um untere und obere Extrem der z-Achse (z-Achse Gesamtlänge = 10 um) zu definieren.
- Stoppen wiederholende Scan.
- Definieren Sie die Schrittweite. Es sollte so nah wie möglich an die Pixelgröße (0,225 um), einen Standard 1:1 Größe-Verhältnis über die z-Achse zu erhalten.
- Aktivieren Kalman-Filter mindestens 2 mal.
- Aktivieren sequentiellen Scan-Modus zu bluten Durcheffekte zu vermeiden.
- Gehen Sie auf halbem Weg entlang der z-Achse und führen Sie einen xy sequentiellen Scan. Überprüfen Sie die Einrichtung von PMT und Verstärkung (gutes Signal / Rausch-Verhältnis). Wenn nicht zufriedenstellend ist, wiederholen Sie Schritt 2.6.
- Führen xyz Akquisition.
- Exportieren von Daten als MultiTIFF Datei. Jeder MultiTIFF Datei enthält typischerweise 3 Farbkanäle (blau, grün und rot) und 44 Fokusebenen.
3. Dreidimensionale Ansicht der konfokale Akquisitionen und dreidimensionale Wiedergabe
Galerie MultiTIFF Dateien Imaris Software und verarbeiten sie wie folgt:
- Offene Software.
- Wählen Sie die Ansicht übertreffen.
- Laden Sie die Datei MultiTIFF.
- Wählen Sie die gewünschte Farbe für jeden Kanal.
- Rauschen entfernen aus dem Hintergrund durch die Erhöhung der Mindestwert auf dem Display-Panel Einstellung. Stellen Sie jeden Kanal einzeln.
- Gehen Sie auf die Schnittansicht. Bewegen sich entlang der z-Achse nach Co-Lokalisation (gelbe Pixel).
- Klicken Sie auf eine gelbe Fläche, um zu sehen, ob die Co-Lokalisation entlang der z-Achse (dh gehört zu einem festen Objekt) vorhanden ist. Z-Achsen-Projektionen sind in der rechten und unteren Teil der Figur sichtbar ist.
- Machen Sie einen Schnappschuss.
- Gehen Sie auf Ansicht zu übertreffen.
- Crop 3D, um eine Zelle oder eine Gruppe von Zellen zu isolieren.
- Wählen Sie einen Kanal auf der Displayanpassung Panel.
- Wählen Sie die zu übertreffen / Oberflächen Algorithmus Builder. Algorithmusschritte:
- Wählen Sie Kanal.
- Schwelle definieren (mit dem gleichen Mindestwert in ter angezeigt Anpassung Platte).
- Definieren Sie Größenänderung.
- Definieren Glättung (beste = 0,200).
- Farbe definieren Aussehen.
- End-Algorithmus.
- Wiederholen Sie Schritt 3.12 für jeden Kanal.
- Deaktivieren Fluoreszenzkanäle auf dem Display-Panel Einstellung und wählen Sie alle drei Flächen.
- Bewegen Sie die Lautstärke auf den besten Blick zu finden.
- Machen Sie einen Schnappschuss.