1. Arenavirus Rettung Transfektion
Unsere Rettungssystem auf der Verwendung beider Polymerase II-Protein-Expressionsplasmide Codieren des Nucleoprotein (NP) und RNA-abhängige RNA-Polymerase-(L), die viralen trans-wirkende Faktoren für die RNA-Replikation und Genexpression des Arenavirus Genoms erforderlich basierend 7, 19, und in der Lage, Plasmide intrazellulären Synthese über die zelluläre RNA-Polymerase I (Pol-I), der S-und L-Antigenom RNA-Spezies 7 leiten. In unseren Untersuchungen verwenden wir die pCAGGS Proteinexpression Plasmid, das das Huhn β-Actin-Promotor und polyadenylanation (pA) Signalsequenzen verwendet, und die menschliche pol-I-Plasmid, die den menschlichen Polymerase I verwendet Promotor und Terminator-Sequenzen der Maus (Abbildung 2) . Die S-und L-RNA-Segmente in das HPOL-I-Plasmid in einer antigenomische Orientierung für die Erzeugung von genomischer RNA-Segmente bei der Transkription von HPOL-I lassen kloniert. Für die Rettung von Wildtyp-type rekombinanten LCMV (rLCMV) und offenen # 1 (rCandid # 1) der pCAGGS NP und L von jedem Virus zusammen mit ihren jeweiligen menschlichen Pol-I S und L RNA-Segmente (3) co-transfiziert. Erzeugung von rekombinantem trisegmented LCMV (r3LCMV) und Candid # 1 (r3Candid # 1) folgte ein ähnliches Protokoll, aber die S-Segment wurde in zwei verschiedenen pol-I S Plasmide, die jeweils für ein unverwechselbares Reportergen aufgeteilt: in eine, die NP open reading Frame (ORF) wurde mit dem Green Fluorescent Protein (GFP)-Reportergen (HPOL-I S GFP / GP) und in der anderen, die virale Glycoprotein Vorstufe (GPC) ORF mit dem Gaussia Luciferase (Gluc) Reporter-Gen ersetzt ist (HPOL-I S NP / Gluc). Eine schematische Darstellung des Protokolls ist in Abbildung 4 dargestellt. Die folgende Transfektion und Infektion Protokoll wurde für 6-well-Platten aufgebaut.
- OptiMEM-Lipofectamine 2000 (LPF2000) Mischung: Bereiten Sie 250 ul OptiMEM Medien und jeauf das Virus zu retten, 10 - 12 ug LPF2000 (1 ug / ul) pro Transfektion (Tabelle 1). Ein Verhältnis von 2,5 ug LPF2000 pro ug DNA wird empfohlen. Inkubation für 5 - 10 min bei RT. Unterdessen bereiten die Plasmidtransfektion Mischung in einem separaten Mikrozentrifugenröhrchens (Schritt 1.2).
- Plasmid-DNA Transfektion Mischung: Bereiten Sie die Plasmidtransfektion Cocktail in einem Mikrozentrifugenröhrchen mit den empfohlenen Mengen für jeden Virus Rettung (siehe Tabelle 1). Bringen Sie das Endvolumen auf 50 ul mit OptiMEM.
- OptiMEM-LPF2000-DNA-Plasmid Mischung: In 250 ul der OptiMEM-LPF2000 Mischung (Schritt 1.1) in das Plasmid DNA Transfektion Mischung (Schritt 1.2). Inkubieren dieser Mischung für 20 - 30 min bei RT. Unterdessen bereiten und zählen 1 x 10 6 Zellen pro Vero Transfektionsreaktion. Vero-Zellen in Suspension transfiziert werden.
- Vorbereitung von Vero-Zellen: Vero cells werden in 100 mm Schalen kultiviert. Vor dem Start bringen 1x PBS, DMEM 10% FBS 1% PS Medien und Trypsin-EDTA Gemisch auf 37 ° C.
- Waschen der Zellen zweimal mit 5 ml 1x PBS.
- Trypsinize Zellen mit 1 ml Trypsin-EDTA und warten, bis die Zellen getrennt werden (ca. 5 min). Antippen vielleicht erforderlich, um vollständig lösen die Zellen von den Gerichten.
- Vorsichtig die Zellen in 10 ml DMEM 10% FBS 1% PS in einem 15 ml Zentrifugenröhrchen.
- Zentrifugation der Zellen 5 min bei 1000 rpm in einer Zentrifuge.
- Resuspendieren der Zellen in 10 ml DMEM-10% FBS 1% PS und Zählen der Zellen unter Verwendung eines Hämozytometers und stellen Konzentration auf 1 x 10 6 Zellen / ml. Es wurde festgestellt, daß 0,5 - 1 x 10 6 Vero Zellen pro Transfektion wurden die besten Ergebnisse erzielt.
- Mix LPF2000/DNA und Zellen: Nach 20 - 30 min Inkubation bei Raumtemperatur (Schritt 1.3), 1 ml von Vero-Zellen (1 x 10 6) (Schritt 1.4) zudie OptiMEM-LPF2000-DNA-Plasmid Mischung und Inkubation für 5 min bei Raumtemperatur.
- Seed LPF2000/DNA-cell Mischung in 6-well-Platten: Fügen Sie die DNA-LPF2000-Vero Mischung (Schritt 1.5) in die Vertiefungen der 6-Well-Platte. Schütteln Sie die 6-well-Platte und lassen Sie die Transfektion Inkubation über Nacht im Brutschrank bei 37 ° C und 5% CO 2.
- Ändern Transfektionsmedium: Etwa 16 - 24 h nach der Transfektion, entfernen Sie die Transfektion Medien, 2 ml Infektion Medien und Inkubation transfizierter Zellen für eine zusätzliche 48 Stunden.
- Zellpassage: Nach 48 Stunden Inkubation in Medien Infektion, entfernen Sie die Gewebekulturüberstand (TCS) und passieren die transfizierten Zellen in einer 100 mm-Schale. Der TCS selten enthält infektiösen Virus, weil die transfizierten Zellen zusätzliche Inkubation müssen Viruspartikel zu generieren. Für die Zellpassage:
- Waschen der Zellen zweimal mit 2 ml 1x PBS.
- Trypsinize Zellen w it 0,5 ml Trypsin-EDTA und warten, bis die Zellen lösen.
- Die Zellen in 1 ml DMEM 10% FBS 1% PS in einem 1,5-ml-Röhrchen.
- Zentrifugation der Zellen 5 min bei 5000 rpm, 4 ° C in einer Mikrozentrifuge.
- Vorsichtig werden die Zellen in 1 ml einer Infektion Medien und die Übertragung der Zellen in einer 100 mm-Schale. Um das Gesamtvolumen in der Platte, mit infektiösen Medien bis 8 ml, ein ausreichendes Volumen, um die Trocknung der Zellen, sowie zum Konzentrieren des Virus zu verhindern.
- Schütteln Sie die 100 mm-Schale und setzen die Inkubation von Vero-Zellen im Brutschrank bei 37 ° C und 5% CO 2 für 72 Stunden.
- Sammlung von TCS: Nach 72-stündiger Inkubation, sammeln die TCS in einem 15 ml Zentrifugenröhrchen. Entfernen Zelltrümmer durch Zentrifugation für 5 min bei 2500 rpm in einer Zentrifuge. Infektiöse Arenavirus im TCS gefunden wird, so von der Zelltrümmer Pellet Entfernung und Speicherung des TCS bei -80 ° C.
le "> 2. Bestätigung von rekombinanten Arenavirus Rettung
Nachweis einer erfolgreichen Rettung von rLCMV und rCandid # 1 ist über dem Schwerpunkt bildende Einheit (FFU) Immunofluoreszenz-Assay (IFA) erreicht. Für Wildtyp-Virus Rettung verwenden wir spezifische Antikörper gegen das virale NP. Die r3LCMV und r3Candid Nr. 1 kodieren zwei Reportergene (GFP und Gluc), so dass virale Detektion und Titration ohne die Notwendigkeit von Antikörpern durch Fluoreszenzmikroskopie (GFP) und / oder Lumineszenz (Gluc).
- Bestätigen Wildtyp rekombinanten Arenavirus Rettung: Der Tag vor der Titration, waschen Vero-Zellen zweimal mit PBS, trypsinize und bereiten 96-Well-Platten bis 80 zu erreichen - 90% Zusammenfluss nächsten Tag (4 x 10 4 Zellen / well). Schütteln Sie die Platten von Hand auf einen uniformierten Verteilung der Zellen zu erhalten. Kultur die Zellen über Nacht in der 37 ° C-Inkubator mit 5% CO 2. Überprüfen Sie die Zellen unter dem Mikroskop, um eine Monoschicht zu bestätigen, bevor mit der Infektion:
- Serienmäßig verdünnen (10 fache Verdünnungen) das Virus enthaltenden TCS erholte sich von den transfizierten Zellen in der 100-mm-Schale (Schritt 1.10) in OptiMEM.
- Entfernen Sie das Medium aus den gesäten Vero-Zellen, zweimal waschen mit 50 ul 1x PBS und infizieren Zellen mit 50 ul der seriell verdünnten Virus (Schritt 2.1). Infect Zellen für 1,5 h bei 37 ° C und 5% CO 2.
- Nach der Infektion, entfernen Sie die Virusinokulum, fügen Sie 100 ul Infektion Medien / well und Inkubation der Zellen für 16 - 18 Stunden. Viral Re-Infektion kann nach 18-stündiger Inkubation führen, was in Überschätzung der viralen Titer führen.
- Bei 16 - 18 Stunden nach der Infektion, entfernen Sie den TCS aus jeder Vertiefung und fixieren Sie die Zellen mit 4% Formaldehyd in 1x PBS verdünnt, für 15 min bei RT.
- Dann entfernen Sie den Fixierungslösung und permeabilisieren die Zellen mit 0,1% Triton X-100 verdünnt in 1x PBS, für 10 min bei Raumtemperatur.
- Saugen Sie die Permeabilisierung Lösung, dann waschen Sie die Zellen 3 mal with 1x PBS.
- Blockieren der Zellen mit 2,5% Rinderserum Albumin (BSA) in 1x PBS (Blockierungslösung) für 1 h bei RT. Alternativ können die Zellen über Nacht bei 4 ° C blockiert und weiterhin mit Antikörper-Inkubation des folgenden Tages.
- Inzwischen bereitet die primären Antikörper. Verdünnen Sie die LCMV-und Candid # 1-spezifischen primären Antikörper in Blocking-Lösung und dann zentrifugiert den Antikörper / Blocking-Lösung für 15 min bei 3.500 Umdrehungen pro Minute. Der monoklonale anti-LCMV NP Antikörperklon 1.1.3 (1:30 Verdünnung) 16 und der monoklonale anti-NP JUNV Antikörper SA02-BG12 von BEI Ressourcen (1:500 Verdünnung) können für den Nachweis von rLCMV und rCandid Nr. 1 verwendet werden sind.
- Nach einer 1-stündigen Inkubation absaugen Blocking-Lösung und 50 ul des primären Antikörpers an die Zellen und Inkubation für 1 Stunde bei 37 ° C.
- Zu diesem Zeitpunkt verdünnen sekundären Antikörper in Blocking-Lösung, und dann zentrifugiert, die den Antikörper / Blockieren Lösung für 15 min bei 3.500 UpM. Das Polyklonalen Kaninchen-anti-Maus-IgG-FITC sekundären Antikörper für den Nachweis von primären monoklonalen Antikörper wurde verwendet, um Bilder in 5 beobachtet erhalten.
- Nach 1 Stunde Inkubation absaugen primärer Antikörper, 3 x waschen mit 1x PBS, und fügen Sie die sekundären Antikörper für 30 min bei 37 ° C
- Nach 30 min Inkubation absaugen sekundären Antikörper und waschen 3 mal mit 1x PBS. Die Zellen sind nun bereit, beobachtet werden mittels Fluoreszenzmikroskopie sowohl bestimmen den Erfolg von viralen Rettung und Titration durch Zählen der Schwerpunkt bildende Einheiten pro ml (FFU / ml).
- r3LCMV und r3Candid Nr. 1 virale Rettung: Da diese Viren zwei Reporter Gene exprimieren, rettet ihr kann durch Fluoreszenzmikroskopie überwacht werden, um die GFP-Expression oder Gluc Ausdruck in TCS erkennen. Rettung kann auch durch die Expression von Gluc werden in TCS bestätigt. Um die trisegmented Viren titrieren, wir Schritte 2.1 bis 2.1.4 folgen, jedoch Zellen nicht zu b brauchene befestigt, um eine erfolgreiche virale Rettung, weil der GFP-Expression zu bestimmen. Die Titration des Virus wird durch Zählen der FFU / ml bestimmt werden. Um eine erfolgreiche virale Rettung durch Gluc Ausdruck, Gluc Ausdruck von TCS bestimmen kann unter Verwendung eines Gluc Assay-Kit (Biolux Gaussia Luciferase Assay Kit, New England Biolabs) werden. Zu diesem Zweck:
- Je 100 ul TCS in eine 96-Well-Platte, weiß (Flat Mikrotiterplatten, Fisher Scientific).
- Richten Sie das Luminometer (LumiCount, Packard Biosciences).
- In 50 - 100 ul Gluc Assay-Lösung (wie vom Hersteller empfohlen) zu jeder Probe und messen Sie die Gluc Reporter Genexpression mit dem Luminometer. Als Negativ-Kontrolle wurde Gluc Ausdruck des TCS von den Wildtyp-Viren infizierten Zellen gemessen.
3. Passage von Gewebekulturüberstände
Viral Rettung hängt Transfektionseffizienzen. Vero-Zellen wurde gezeigt,zu niedrigeren Transfektionseffizienzen als andere Zelllinien 14 haben. Wenn Virustiter in der TCS niedrig sind, infizieren frisch Vero-Zellen mit einer Multiplizität der Infektion (MOI) von 0,01 (LCMV) bzw. 0,1 (Candid # 1) für 72 Stunden, um das Virus zu verstärken.