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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ein auf lebenden Zellen basierendes Verfahren zur Beleuchtung von zellulären Vakuolen (Einschlüssen), die Chlamydien enthalten, wird beschrieben. Diese Strategie ermöglicht eine schnelle, automatisierte Bestimmung der Infektiosität von Chlamydien in Proben und kann zur quantitativen Untersuchung der Wachstumsdynamik des Einschlusses verwendet werden.
Das obligate intrazelluläre Bakterium Chlamydia stellt eine große Belastung für die globale öffentliche Gesundheit dar. C. trachomatis ist die häufigste bakterielle Ursache für sexuell übertragbare Infektionen und auch die Hauptursache für vermeidbare Blindheit in der Welt. Eine wesentliche Determinante für eine erfolgreiche Infektion von Wirtszellen durch Chlamydien ist die Fähigkeit des Bakteriums, die Signalübertragung der Wirtszelle aus einem neuartigen, vakuolären Kompartiment, dem sogenannten Einschluss, zu manipulieren. Aus dem Einschluss erhalten Chlamydien die Nährstoffe, die für ihr 2-3-tägiges Entwicklungswachstum erforderlich sind, und sie sezernieren zusätzlich eine Reihe von Effektorproteinen auf die zytosolische Fläche der Vakuolenmembran und in das Zytosol des Wirts. Lücken in unserem Verständnis der Biologie der Chlamydien stellen jedoch erhebliche Herausforderungen für die Visualisierung und Analyse dieses intrazellulären Kompartiments dar. Kürzlich wurde eine Reverse-Imaging-Strategie zur Visualisierung des Einschlusses mit Hilfe von GFP-exprimierenden Wirtszellen beschrieben. Dieser Ansatz nutzt die intrinsische Undurchlässigkeit der Einschlussmembran für große Moleküle wie GFP rational aus. In dieser Arbeit beschreiben wir, wie GFP- oder mCherry-exprimierende Wirtszellen für die anschließende Visualisierung von Chlamydieneinschlüssen erzeugt werden. Darüber hinaus hat sich gezeigt, dass diese Methode kostspielige Antikörper-basierte Enumerationsmethoden effektiv ersetzt, zusammen mit anderen fluoreszierenden Markierungen, wie z. B. GFP-exprimierenden Chlamydien, verwendet werden kann und zur Ableitung wichtiger quantitativer Daten über das Wachstum der Einschlussmembran aus einer Reihe von Chlamydien-Spezies und -Stämmen genutzt werden kann.
Infektionskrankheiten durch Arten der intrazelluläre Bakterium Chlamydia verursacht entlocken eine große Belastung für die globale Gesundheit, einschließlich sexuell übertragbare Krankheit, entzündliche Erkrankungen des Beckens, Blindheit, Pneumonie und möglicherweise Atherosklerose 1-4. Die Fähigkeit von Chlamydia um mit der Wirtszelle wechselwirken, innerhalb einer Vakuole (genannt die Aufnahme), ist ein kritischer Faktor für die erfolgreiche Infektion von Zellen und dem Host. Die Aufnahme ist eine neuartige pathogenen Fach, die Chlamydien-Wachstum ermöglicht und wird dynamisch über die gesamte 2-3 Tag Entwicklungszyklus von Chlamydia 5 modifiziert. Die obligat intrazelluläre Natur der Chlamydien stellt zahlreiche Herausforderungen für die Forschung, insbesondere für direkt an das Studium der einzigartigen Biologie der Eingliederung. Ein großes Handicap war die Unfähigkeit, entweder intrazellulären Chlamydien oder ihre Aufnahme von Fluoreszenz Ansatz effizient visualisierenes in lebenden Zellen. Eine neue Entdeckung hat endlich enthüllt die Mittel, um GFP-exprimierenden C. generieren trachomatis 6; aber dieses Ergebnis noch nicht auf eine spezifische Markierung der Aufnahme geführt. Einige Techniken zur Markierung von Bakterien und Einschlüsse 7,8 beschrieben worden, aber sie Mängel auf, wie nicht-Spezifität transiency und die Anfälligkeit gegen Ausbleichung leiden. Ein Schlüssel Entdeckung von unserer Arbeitsgruppe gegründet, eine neue Strategie für die Beleuchtung der Aufnahme mit GFP-exprimierenden Wirtszellen 9. Diese Strategie rationell nutzt die intrinsische Undurchlässigkeit der Einschlußmembran bis größer als 520 Da 10 Molekülen. Wenn Zellen entwickelt, um stabil eine bestimmte cytosolische fluoreszierende Protein (zB GFP oder mCherry) zum Ausdruck bringen, sind Chlamydia Einschlüsse mit außergewöhnlicher Klarheit durch ihre vollständigen Ausschluss der Fluoreszenz sichtbar. Diese umgekehrte Imaging-Strategie ermöglicht eine sofortige Visualisierung von Einschlüssen für alle Chlamydia Arten und es kann leicht für die meisten Wirtszellen von Interesse angepasst werden. Als Demonstration der Nützlichkeit wurde dieses Verfahren bisher verwendeten zu offenbaren und zu definieren, die zellulären Austrittswege für Chlamydia spp 9.
Hier haben wir weiter zu zeigen, wie dieses Verfahren durchgeführt wird, und kann genutzt werden, um Schlüssel quantitative Daten über die Aufnahme Wachstumsdynamik abgeleitet werden. Darüber hinaus kann sie wirksam für teure Antikörper-basierte Zählverfahren ersetzen und kann in Kombination mit anderen fluoreszierenden Markern, wie mKate2 exprimierenden Chlamydia 11 verwendet werden. Diese leistungsstarke Kombination von Werkzeugen ermöglicht Erforschung der physikalischen Eigenschaften des Chlamydien-Aufnahme-Membran im Inneren lebenden Wirtszellen.
1. Erzeugung von Leuchtstoff-Wirtszelllinien
2. Erzeugung von GFP-exprimierenden Chlamydia trachomatis
3. Infektion von Zellen mit Chlamydia
4. Live Cell Visualisierung von Chlamydia Einschlüsse
5. Quantifizierung von Inclusion Wachstumsparameter in lebenden Zellen
Säugetierzellen, die cytosolische fluoreszierende Proteine (zB GFP) kann konstruiert werden, um die Beleuchtung des Chlamydiaeinschlüssen einem lebenden, infizierten Zellkulturen zu ermöglichen. Nach Infektion mit Chlamydia, sind Einschlüsse leicht als schwarze Flecken in den Wirtszellen (Abbildung 1) sichtbar. Die Klarheit der fluoreszenz fehlt Einschlüsse für die automatisierte Identifikation der Einschlüsse in zahlreichen Bereichen und / oder den Behandlungen (Figur 1) ausgenutzt werden. Sobald fluoreszierende Wirtszellen erzeugt wurden, ist ein leistungsfähiges neues Workflow für die schnelle, quantitative Analyse von Chlamydien-Infektion Ebenen in experimentellen Proben aktiviert. Eine wichtige Anwendung ist die Bestimmung von Chlamydia Aufnahme bildenden Einheiten (IFU) in lebenden infizierten Zellen (Figur 2). Dieses experimentelle Strategie vermeidet die Notwendigkeit für Immunfluoreszenzverfahren, die routinemäßig auf dem Gebiet verwendet werden, die beide zeitaufwändig undkostspielig.
Ein weiteres Schlüsselmerkmal der beschriebenen Abbildungs Ansatzes ist, dass sie leicht auf irgendwelche Chlamydia Spezies oder Stamm aufgebracht werden, und ferner können für die Ableitung von wichtigen biologischen Eigenschaften von Chlamydien Einschlüssen ausgenutzt werden. Als ein Beispiel kann eine Zeitverlaufsanalyse der GFP-HeLa-Zellen mit C infiziert trachomatis LGV Serovar L2, C. trachomatis Serovar D, C. muridarum und C. pneumoniae wurde bei 16, 24 und 48 hpi (Figur 3) durchgeführt. Für jede dieser Chlamydia Spezies und Stämme wurden Einschlüsse markiert und analysiert, um ihre mittlere Fläche zu berechnen, Umfangslänge, und die Anzahl pro Zelle bei angegebenen Zeiten (Abbildung 4). Diese Attribute liefern wichtige Informationen über die Biologie der Chlamydieneinschlüsse und darüber informieren, wie sie mit der Wirtszelle interagieren. Das beschriebene Verfahren stellt eine einfache Vorgehensweise für den Zugriff auf diese Informationen in einer Weise, dass su rpasses, was durch andere experimentelle Techniken erreicht werden. Eine abschließende Nützlichkeit des Umkehrmarkierungsstrategie ist für die Echtzeit-Bildgebung des Chlamydiaeinschlüssen in lebenden Zellen. Ein Beispiel hierfür ist in der Film 1 dargestellt ist.

Abbildung 1. Automatisierter Nachweis von C. trachomatis Einschlüssen. (A) GFP-HeLa-Zellen wurden mit (B) mKate2 exprimierenden C. infiziert trachomatis L2 und bei 24 hpi abgebildet. Eine Bildverarbeitungssoftware basierten Algorithmus wurde verwendet, um Chlamydieneinschlüsse automatisch zu identifizieren durch (c) Auswählen schwarze Löcher in GFP-HeLa-Zellen, in orange markiert. (D) ein zusammengesetztes Bild der infizierten Zellen von den Feldern A und B wird ebenfalls gezeigt. Maßstabsbalken = 20 & mgr; m. .jove.com / files / ftp_upload / 51.131 / 51131fig1large.jpg "target =" _ blank "> Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 2. Die Quantifizierung von Chlamydia Aufnahme bildenden Einheiten (IFU) in GFP-HeLa-Zellen. GFP-HeLa-Zellen wurden mit C infiziert trachomatis L2 an zwei verschiedenen Multiplizitäten der Infektion und bei 24 hpi abgebildet. Einschlüsse für 10 Felder pro Infektion nachgewiesen und gezählt unter Verwendung von automatisierten Software und die Ergebnisse sind angegeben (n = 3). Fehlerbalken stellen den Standardfehler des Mittelwerts. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.
oad / 51.131 / 51131fig3.jpg "/>
Abbildung 3. Zeitlicher Verlauf der C. trachomatis Serovar L2, C. trachomatis Serovar D, C. muridarum und C. pneumoniae-Infektion in GFP-HeLa-Zellen. GFP-HeLa-Zellen wurden mit C infiziert trachomatis LGV Serovar L2 und von Live-Fluoreszenzmikroskopie bei (A) 16 hpi, (B) 24 hpi, und (C) 48 hpi abgebildet. GFP-HeLa-Zellen mit C infiziert trachomatis Serovar D bei (D) 16 hpi, (E) 24 hpi und (F) 48 hpi abgebildet. GFP-HeLa-Zellen mit C infiziert muridarum wurden bei (G) 16 hpi (H) 24 hpi und (I) 48 hpi abgebildet. GFP-HeLa-Zellen mit C infiziert pneumoniaewurden bei (J) 16 hpi (K) 24 hpi und (L) 48 hpi abgebildet. Repräsentative Bilder werden für alle Infektionen und mal aufgerufen. Maßstabsbalken = 20 & mgr; m. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 4. Repräsentative quantitative Daten aus Zeitverlauf Experimenten abgeleitet. Einschlüsse von GFP-HeLa-Zellen mit (A) C infiziert trachomatis LGV Serovar L2, (B) C. trachomatis Serovar D, (C) C. muridarum und (D) C. pneumoniae nachgewiesen wurden und bei 16, 24 aufgezählt, und 48 hpi (5 Felder pro Zeitintervall, n = 3). Physikalische Eigenschaften von chlamydial Einschlüsse für die Aufnahme-Oberfläche, Aufnahme Umfangslänge und die Anzahl der Einschlüsse pro Zelle quantitativ bestimmt. Fehlerbalken stellen den SEM. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Bitte klicken Sie hier, um dieses Video anzusehen. Film 1. Zeitraffer-Video der mCherry-HeLa-Zellen mit GFP-C infiziert trachomatis L2, bei 48 hpi gemacht. Video wurde aus einer Reihe von Zeitraffer-Aufnahmen bei 5 min-Intervallen für 125 min entnommen zusammengestellt. Geschleift Video wechselt in mCherry-HeLa-Zellen (rot), C. trachomatis L2 (grün) und eine Zusammenführung der beiden Felder aus.
Die Autoren erklären, dass sie keine konkurrierenden finanziellen Interessen.
Ein auf lebenden Zellen basierendes Verfahren zur Beleuchtung von zellulären Vakuolen (Einschlüssen), die Chlamydien enthalten, wird beschrieben. Diese Strategie ermöglicht eine schnelle, automatisierte Bestimmung der Infektiosität von Chlamydien in Proben und kann zur quantitativen Untersuchung der Wachstumsdynamik des Einschlusses verwendet werden.
Die Autoren danken Ian Clarke und P. Scott Hefty für die Plasmide pGFP-SW2 bzw. pASK-GFP-mKate2-L2. Wir danken Paul Miller für die technische Unterstützung und Richard Stephens für weitere Ressourcen. Diese Arbeit wurde durch das NIH Grant AI095603 (KH) finanziert.
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668 | |
| Opti-Mem | Invitrogen | 31985 | |
| Polybrene | Sigma | H9268 | |
| 0,45 &Mikro; m filter | Fisher | 09-719D | |
| G418 | Invitrogen | 10131 | |
| HBSS | Invitrogen | 14025 | |
| DMEM | Invitrogen | 11995 | |
| RPMI 1640 | Invitrogen | 11875 | |
| RPMI 1640 ohne phenolrot | Cellgro | 17-105-CV | |
| Penicillin G | Sigma | 13752 | |
| Cycloheximid | Sigma | C7698 | |
| Glasbodenschalen | MatTek | P35G-1.5-14-C | |
| Objektkammern, Lab-Tek II | Nunc | 154526, 154534 |