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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Wir stellen ein detailliertes Protokoll für die Induktion von Langzeit-Potenzierung in der CA1-Region des Hippocampus und der anschließenden Trennung der Kern angereicherten Fraktionen aus dem tetanized Bereich der Scheibe. Dieser Ansatz kann verwendet werden, um abhängig Kernproteinimport in Zellmodellen von Lernen und Gedächtnis zu bestimmen Aktivität.
Studium Aktivität abhängige Protein-Expression, subzelluläre Translokation oder Phosphorylierung ist unerlässlich, um die zugrunde liegenden zellulären Mechanismen der synaptischen Plastizität zu verstehen. Langzeit-Potenzierung (LTP) und Langzeit-Depression (LTD) bei akuten Hippocampus induziert werden allgemein als Zellmodelle von Lernen und Gedächtnis akzeptiert. Es gibt zahlreiche Studien, die Live-Cell-Imaging oder Immunhistochemie Ansätze verwenden, um Aktivität abhängige Proteindynamik zu visualisieren. Diese Verfahren stützen sich auf die Eignung der Antikörper für Immunzytochemie oder Überexpression von Fluoreszenz-markierten Proteine in einzelnen Neuronen. Immunoblotting von Proteinen ist eine alternative Methode, die unabhängige Bestätigung der Ergebnisse. Die erste limitierende Faktor in der Vorbereitung subzellulärer Fraktionen aus einzelnen tetanized Hippocampus ist die geringe Menge an Material. Zweitens ist die Handhabung Verfahren entscheidend, weil auch sehr kurze und kleinere Manipulationen living Scheiben könnten Aktivierung bestimmter Signalkaskaden auslösen. Hier beschreiben wir einen optimierten Arbeitsablauf, um eine ausreichende Menge von Kern angereicherte Fraktion von ausreichender Reinheit aus der CA1-Region des Hippocampus akuten aus Rattenhirn erhalten. Als ein repräsentatives Beispiel gezeigt, dass die ERK1 / 2 phosphorylierte Form des synapto-Kernprotein Messenger Jacob aktiv transloziert in den Kern nach der Induktion von LTP und kann in einem Kern angereicherte Fraktion von CA1-Neuronen nachgewiesen werden.
Synaptischen N-Methyl-D-Aspartat-Rezeptoren (NMDARs) spielen eine entscheidende Rolle bei der synaptischen Plastizität und Zellüberlebenssignalwohingegen die Aktivierung von extrasynaptischen NMDARs können Neurodegeneration und Zelltod auslösen. Diese Veränderungen hängen von streng kontrollierten / reglementierten Tätigkeit abhängige Genexpression und erfordern daher eine ständige Kommunikation zwischen aktivierten Synapsen oder Dendriten und den Zellkern 7. Die MAP-Kinasen ERK1 / 2 Effektoren der synaptischen NMDARs Signalisierung und in NMDAR-Aktivierungs-induzierte Genexpression beteiligt, während Signalisierung über extrasynaptischen NMDAR keine oder eine hemmende Wirkung auf ERK1 / 2 Aktivität 8,11.
Es gibt eine Reihe von Proteinen, die Shuttle zwischen dem distalen Dendriten und den Zellkern gezeigt wurden. Viele dieser Proteine enthalten ein Kernlokalisierungssignal und aktiv an Mikrotubuli in einer Dynein und Importin-abhängige Weise in den Zellkern transportiert 6,9. Interestingly, einige dieser Botenstoffe nur Transit an den Kern in Reaktion auf spezifische Stimuli synaptische. Beispielsweise retrograden Transport von cAMP response element binding protein 2 (CREB2) durch chemische LTD aber nicht LTP 12 induziert. Lokalisierten NMDAR-abhängige synaptische Stimulation treibt CREB-regulierten Transkriptions Coaktivator (CRTC1) in den Zellkern, einer Translokation, die in langfristigen hippocampalen Plastizität 4 beteiligt ist. Es wurde kürzlich gezeigt, dass das Protein Bote Jacob transloziert in den Zellkern, nachdem beide, synaptic und extrasynaptischen NMDAR-Aktivierung und regelt CREB abhängigen Gentranskription 5. Die synaptische oder extrasynaptischen Ursprung des Signals in einer posttranslationalen Modifikation von Jacob kodiert. Synaptische Aktivität induziert ERK1 / 2 abhängige Phosphorylierung von Jacob an einem entscheidenden Serin an Position 180 (pJacobS 180), die eine Voraussetzung für die anschließende Translokation in den Zellkern in der Grund Hippocampus Kultur ist. Außerdem habe ichn CA1 Neuronen des Hippocampus akuten pJacobS 180 transloziert in den Zellkern nach Schaffer Sicherheiten LTP aber nicht LTD 1,10. PS-180 Jacob führt zu einer erhöhten Expression von Genen Plastizität und das Gen-Expression zurückführt, die synaptische Funktion. In scharfem Kontrast dazu Jacob, die in den Zellkern transloziert nach extrasynaptischen NMDARs Aktivierung nicht an Ser180 phosphoryliert und kann mit verschiedenen Protein-Komplex in den Zellkern bewirkt in Verbindung gebracht werden "CREB abgeschaltet" und ein Zurückziehen der synaptischen Kontakte 10.
Die meisten veröffentlichten Studien über die Kernimport synapto-Kernprotein Messenger in dissoziierten neuronalen Primärkulturen durchgeführt worden. Daher wäre es interessant zu sehen, ob solche Erkenntnisse in physiologisch relevanter Bedingungen mit Hippocampus wiedergegeben werden, wo neuronale Konnektivität und Funktion sind viel besser erhalten. Hier präsentieren wir ein optimiertes Protokoll für die Beurteilung der LTP-dependent nukleäre Translokation von Protein Boten durch Immunoblotting. Dieses Verfahren ist auch für die Analyse Aktivität abhängige Phosphorylierung von Proteinen in einer rohen Kernfraktion. Insbesondere beinhaltet das aktuelle Protokoll Vorbereitung der akuten CA1 des Hippocampus, Induktion, und die Aufnahme von LTP. Als nächstes wird CA1 Region mikroskopisch seziert, um den angeregten Bereich zu isolieren. Wir kombinierten und modifizierte das Protokoll für die Isolierung durch Atomkern CellLytic Extraction Kit mit Änderungen von Zhao und Kollegen 17 eingeführt wird. Das optimierte Verfahren umfasst die Lyse von seziert CA1 Regionen in hypotonischen Puffer ermöglicht Zellschwellung und die Freisetzung von Kernen. Zell-Lyse und Kerne Morphologie kann durch mikroskopische Untersuchung festgestellt werden. Urananreicherung wird durch einen kurzen Zentrifugationsschritt erzielt. Immunoblotting-Analyse mit Antikörpern gegen NeuN und NSE2, spezifische Marker für nukleare oder cytosolischen Fraktionen zeigt, dass dieser Ansatz als schneller eingesetzt werdenund reproduzierbare Protokoll, diese subzellulären Fraktionen zu isolieren und sehr labil posttranslationale Modifikationen wie Protein-Phosphorylierung zu studieren. Darüber hinaus ist dieses Verfahren für kleine Gewebeproben, die aus sezierten Bereiche CA1 des Hippocampus und kann vorteilhaft in Kombination Immunhistochemie von Schnitten des Hippocampus verwendet werden.
1. Vorbereitung der akuten Hippocampus von erwachsenen Ratte Gehirn
2. Positionierung der Elektroden, Baseline-Aufnahme, und die Induktion von LTP
3. Sammlung von Scheiben nach der Induktion von LTP und Snap-Freezing
4. Isolierung von Kern angereicherten Fraktionen aus der CA1-Region des Hippocampus
5. Semiquantitative Immunoblotting für Synapto-Kernproteine
6. Datenanalyse
| Name der Puffer | Reagens | Konzentration (mM) | Menge | Kommentare / Beschreibung |
| Gey-Lösung (pH-Wert: 7,3 ~ 7,4) | NaCl | 130 | 7,6 g | Sterilfiltration |
| 1000 ml | KCl | 4.9 | 0,37 g | |
| CaCl 2 · 2H 2 O | 1,5 | 0,22 g | ||
| MgSO 4 · 2H 2 O | 0,3 | 0,0739 g | ||
| MgCl 2 · 6H 2 O | 11 | 2,24 g | ||
| KH 2 PO 4 | 0,23 | 0,0313 g | ||
| Na 2 HPO 4 · 7H 2 O | 0,8 | 0,2145 g | ||
| Glucose · H 2 O | 5 | 0,9909 g | ||
| HEPES | 25 | 5,96 g | ||
| NaHCO 3 | 22 | 1,85 g | ||
| ACSF (pH-Wert: 7,3 ~ 7,4) | NaCl | 110 | 6,428 g | Sterilfiltration |
| 1000 ml | KCl | 2.5 | 0,1865 g | |
| CaCl 2 · 2H 2 O | 2.5 | 0,368 g | ||
| MgSO 4 · 2H 2 O | 1,5 | 0,370 g | ||
| KH 2 PO 4 | 1,24 | 0,169 g | ||
| Glucose · H 2 O | 10 | 1,9817 g | ||
| NaHCO 3 | 27,4 | 2,3 g | ||
| 1x hypotonischen Puffer (pH-Wert: 7,9) | HEPES | 10 | 0,23 g | |
| 100 ml | MgCl 2 · 6H 2 O | 1,5 | 0,0304 g | |
| KCl | 10 | 0,07455 g |
Tabelle 1. Puffer.
Wir haben bereits gezeigt, dass die synapto-Kernprotein Bote Jacob sammelt sich im Zellkern nach der Induktion von LTP aber nicht LTD 1. Darüber hinaus Translokation von Jacob nach synaptischer Stimulation erfordert die Aktivierung der MAPK ERK1 / 2 und Phosphorylierung von Jacob in Ser180 (Abbildung 1). Phosphorylierte Jacob transloziert in den Kern in einer Importin-abhängigen Art und Weise und die phosphorylierten Zustand über längere Zeit durch die Verbindung mit dem Zwischen Filament αinternexin 15 (Figur 1) erhalten. Der Phospho-Zustand des Jacob ist wichtig für die Expression aktivitätsabhängigen Gene und das Überleben der Zelle. Interessanterweise Aktivierung extrasynaptischen NMDARs treibt auch Jacob in den Zellkern, aber in diesem Fall ist nicht phosphoryliert Jacob an Ser180 und ihre Akkumulation im Kern induziert CREB "abgeschaltet" 5,10. Die oben beschriebenen Ergebnisse wurden erhalten Protocols in unserer aktuellen Studie festgestellt (siehe 10 für detaillierte Beschreibung des Modells Karpova et al.).
Um zu beweisen, dass Jacob transloziert in den Zellkern nach der Induktion von LTP, wir induziert und gemessen die Induktion von Schaffer Sicherheiten fEPSP Potenzierung in akuten Schnitten des Hippocampus und isoliert neuronalen Zellkerne von CA1-Neuronen anschließend (Abbildungen 2 und 3). Wir verglichen zwei verschiedenen Zeitpunkten nach der Anwendung des Hochfrequenzstimulation (2 min und 30 min) und erfasst die Induktion von LTP für jede Scheibe, die anschließend für die Kernisolierung und Western Blotting verarbeitet wurde (2 und 3). Bereicherung der neuronalen Marker NeuN Kern in der Kern angereicherten Fraktion aus der CA1-Region vorbereitet seziert gesehen werden, während zytosolische Marker Neuron spezifischen enolase2 (NSE) ist vor allem in der nach Zentrifugation erhaltene Überstand lysiert c Fraktion vorhandenEllen (4A). Die Spezifität der Antikörper PS-180 Jacob vorher gekennzeichnet wurden (Details siehe Karpova et al. 10). PS-180 Jacob Stufen unverändert blieb insgesamt CA1 Protein Homogenaten und in der Kern angereicherte Fraktion 2 min nach Tetanisierung (4B), aber wir fanden einen signifikanten Anstieg pJacobS 180 Immunreaktivität von 30 min nach der Induktion von LTP (4C), die bestätigt, dass Jacob Translokation in den Zellkern in diesem zellulären Plastizität Modell ist an Ser180 phosphoryliert.

Abbildung 1 Jacob phosphoryliert bei S180 codiert die synaptische Ursprung NMDARs Signale. Tetanische Stimulation der Schaffer hippocampalen Sicherheiten Fasern zu einer Aktivierung der synaptischen NMDARs und nachfolgende Aktivierung von MAPKERK1 / 2 Signalkaskade. Aktiv ERK1 / 2 bindet und phosphoryliert an Serin 180 Jacob und Jacob-ERK1 / 2 komplexen transloziert in den Kern und das korreliert mit erhöhter Aktivität und CREB-Aktivierung der Plastizität verbundene Genexpression.

Abbildung 2. Ausrüstung und Werkzeuge für LTP-Induktion und Zerlegung der CA1-Region des Hippocampus aus. 3 - Mikromanipulator und Perfusion System;; 4 - Rekodierung Elektrode, 5 - Stimulationselektrode, 6 - Wasser Objektiv - Vibratom) B1-2) Elektrophysiologie und Bildgebung Setup (2 - Mikroskop A) Vibratom für die Vorbereitung der akuten Hippocampus (1 verwendet , 7 - Slice Halter mit Hippocampus-Scheibe) C) Anlagen für die Präparation der CA1-Region des Hippocampus aus verwendet (8. Stereomicroscope; 9 - Insulin-Spritze mit Nadeln; 10 - Kleine chirurgische Scheren, 11 - Skalpell, 12 - Kunststoff Pasteur-Pipette, 13 - Thin Spachtel; 14-100 mm Kunststoff-Kulturschale mit Eiswasser gefüllt ist, und 40 mm Kunststoff-Kulturschale für die Präparation von Scheiben verwendet.

Abbildung 3. Cartoon Demonstration der Versuchsdurchführung. Zahlen geben Schritte im Protokoll. 2,1-2,8) Eine akute Hippocampus Scheibe im Tauchkammer mit Glaselektroden im Stratum radiatum für Potenzierung der Schaffer-CA1 Synapsen Sicherheiten gestellt. Der Einschub stellt die Probe fEPSP analogen Spuren, die horizontale Balken zeigt 5 ms und der vertikale Balken zeigt 0,5 mV. 3.3) Die Scheiben wurden nach in 1,5-ml-Röhrchen gesammeltLTP Aufnahme und schockgefroren. 4.3) Dissektion der CA1-Region von erwachsenen Ratte Hippocampus. 4,4-4,5) CA1 Regionen homogenisiert in hypotone Lyse-Puffer, der osmotische Schwellung der Zellen und die Freisetzung von Keimen verursacht. 4.8) Die Zentrifugation von Lysaten bei 11.000 rpm für 1 min. 4.10) Sammlung der Zytoplasma-und Kern angereicherten Fraktionen für Immunoblotting. 5.3) Laden von zytoplasmatischen und nuklearen angereicherten Fraktionen auf SDS-PAGE und anschließende Standard-Western-Blot.

Abbildung 4. Induktion von LTP CA1 führt zur Akkumulation von pJacS180 im Kern. A) Immunoblot zum Homogenat, zytosolischen und Kern angereicherten Fraktionen von CA1-Lysat mit zytosolischen und Kernmarken. B) Immunoblot-Analyse von PJAC-S180 Ebene in Homogenat 2 min und 30 min nach indu sondiertktion von Tetanisierung. C) Immunoblot-Analyse von pJacS180 Ebene in Kern angereicherte Fraktion 2 min und min nach Tetanisierung. Diese Ergebnisse sind Teil der in Karpowa et al 10 veröffentlicht Quantifizierung Graphen. Diese repräsentativen Immunoblots sind nicht bei der ursprünglichen Veröffentlichung enthalten.
Die Autoren haben nichts offenzulegen.
Wir stellen ein detailliertes Protokoll für die Induktion von Langzeit-Potenzierung in der CA1-Region des Hippocampus und der anschließenden Trennung der Kern angereicherten Fraktionen aus dem tetanized Bereich der Scheibe. Dieser Ansatz kann verwendet werden, um abhängig Kernproteinimport in Zellmodellen von Lernen und Gedächtnis zu bestimmen Aktivität.
Diese Arbeit wurde gefördert durch die DFG (SFB 779 TPB8, Kr1879/3-1 MRK), DIP grant (MRK), EU FP7 MC-ITN NPlast (MRK), Center for Behavioral Brain Sciences (CBBS, Sahsen-Anhalt), (AK und SB), MM ist Empfänger des European Molecular Biology Organization (EMBO) Long-Term Fellowship (EMBO ALTF 884-2011) und Marie-Curie IEF.
| Ausrüstung | |||
| CED 1401 AD/DA-Wandler | Cambridge Electronics Design, UK | ||
| a href="http://www.iciba.com/stereomicroscope">Stereomikroskop | Leica S4E, Deutschland | ||
| Vibrotom | Leica VT1000S, Deutschland | ||
| Isolierter Pulsstimulator | A-M Systems, USA | Modell 2100 | |
| Zentrifuge | Thermo Scientific | ||
| SDS-PAGE System | Biorad | ||
| Kühler | Julabo | ||
| Hellfeldmikroskop | Nikon Eclipse TS100 | ||
| Zellkultur-Inkubator | Thermo Electron Corporation | ||
| Mikromanipulator | Luigs & Neumann, SM-5, Deutschland | ||
| Blotting-Kammer und Stromlieferant | Hoefer Scientific Instruments, San Francisco, CA | ||
| Untergetauchte Aufnahmekammer | nach Maß U-förmiger | ||
| und untergetauchter Inkubator | maßgefertigte | ||
| kleine chirurgische Schere | |||
| , Skalpell | |||
| , dünner Spatel, | |||
| Kunststoff-Pasteur-Pipette, | |||
| Kunststoff-Kulturschale | |||
| Bunsenbecher | |||
| Spritze | |||
| Reagenzien | |||
| NaCl | Roth | Art.-Nr.3957.1 | ≥ 99.5%, p.a., ACS, ISO |
| KCl | Roth | Art.-Nr.6781.1 | &ge≥ 99,5%, p.a., ACS, ISO |
| CaCl2· 2H2O | Merck | 1.02382.0500 | pro Analyse |
| MgSO4· 2H2O | Merck | 5886.05 | pro Analyse |
| MgCl2· 6H2O | AppliChem | CAS-NR.: 7791-18-6; EC-NO:2320946 | für Molekularbiologie |
| KH2PO4 | Merck | 12034.025 | für Molekularbiologie |
| Na2HPO4· 2H2O | Merck | 1.06574.1000 | extra reine |
| Glukose & Middot; H2 | O Roth | Art.-Nr.6887.1 | für Molekularbiologie |
| HEPES | Roth | Art.-Nr.9105.4 | PUFFERAN, ≥ 99,5 %, p.a. |
| NaHCO3 | Merck | 1.06329.1000 | pro Analyse |
| Proteasehemmer Cocktail | Roche | ||
| Phosphostop | Roche | ||
| Bicuculline | Tocris Bioscience | ||
| Isofluran | Baxter | ||
| Antikörper | |||
| Primärantikörper | Firmenkatalog Nummer | Spezies | |
| pJac-s180 | Biogenes | Kaninchen (verdünnt 1:100) | |
| NeuN | Milipore | MAB377 | Maus (verdünnt 1:1.000) |
| NSE | Cell Signaling | D20H2 | Kaninchen (verdünnt 1:1.000) |
| Beta-Aktin | Sigma | A-5441 | Maus (verdünnt 1:5.000) |
| Sekundärantikörper | Firmenkatalognummer | Spezies | |
| IgG HRP konjugiert | DAKO | Ziege Anti-Maus (1:5.000) | |
| IgG HRP konjugiert | NEB | Ziege Anti-Kaninchen (1:5.000) | |