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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Verbesserte Bildgebungstechnologie ermöglicht die dreidimensionale Bildgebung von Organen während der Entwicklung. Hier beschreiben wir ein ganzes Organkultursystem, das eine Live-Bildgebung der sich entwickelnden Zotten im fötalen Mausdarm ermöglicht.
Die meisten morphogenetische Prozesse in der fetalen Darm haben von Dünnschnitten von fixierten Gewebe entnommen worden, die Bereitstellung Schnappschüsse von Veränderungen über die Entwicklungsstadien. Dreidimensionale Informationen aus dünnen Serienschnitten kann eine Herausforderung sein, wegen der Schwierigkeit der Rekonstruktion Serienschnitte perfekt und die Aufrechterhaltung der richtigen Ausrichtung des Gewebes über Serienschnitte zu interpretieren. Jüngsten Erkenntnisse Grosse et al., 2011, die Bedeutung der dreidimensionalen Informationen für das Verständnis der Morphogenese der Entwicklungs Zotten des Darms 1. Dreidimensionale Rekonstruktion des einfach markierten Darmzellen zeigte, dass die Mehrheit der intestinalen Epithelzellen treten sowohl die apikale und basale Oberflächen. Weiterhin dreidimensionale Rekonstruktion des Aktin an der apikalen Oberfläche des Epithels zeigte, dass die Darmlumen kontinuierlich ist und dass die sekundäre Lumen ein Artefakt sectioning. Diese zwei Punkte, zusammen mit dem Nachweis der interkinetic Kernwanderung im Darmepithel, definiert die Entwicklungs Darmepithel als mehrreihigen Epithel und nicht wie bisher angenommen geschichtete 1. Die Fähigkeit, das Epithel dreidimensional beobachten war wegweisend für demonstriert diesen Punkt und die Neudefinition epithelialen Morphogenese in der fetalen Darm. Mit der Entwicklung der Mehrphotonen-Bildgebungstechnik und dreidimensionale Rekonstruktionssoftware, die Fähigkeit zu visualisieren intakt Entwicklungsorgane rasch verbessert. Zwei-Photonen-Anregung ermöglicht weniger schädliches Eindringen tiefer in Gewebe mit hoher Auflösung. Zwei-Photon-Imaging und 3D-Rekonstruktion der gesamten fötalen Mausdarm in Walton et al., 2012, half, das Muster der Zotten Auswuchs 2 definieren. Hier beschreiben wir eine ganze Organkultursystem, das ex vivo Entwicklung der Zotten und Erweiterungen dieser Kultur-System ermöglicht, damitder Darm dreidimensional in ihrer Entwicklung dargestellt werden.
Jeder Darmzotten besteht aus zwei Hauptgewebekompartimenten: einer epithelialen Oberflächenschicht und einem mesenchymalen Kern. Der Dünndarm der Maus wird am embryonalen Tag 10 gebildet, wenn sich eine Endodermschicht schließt und zu einer Epithelröhre versiegelt, die von mesenchymalen Zellen umgeben ist3. Diese flache Epithelröhre durchläuft eine schnelle Proliferation, wächst sowohl in der Länge als auch im Umfang und erfährt dramatische Umlagerungen, die mit dynamischen Veränderungen der Zellform einhergehen1. Gleichzeitig durchläuft das umgebende Mesenchym auch viele Entwicklungsprozesse, einschließlich der Bildung des Gefäßplexus, der Differenzierung der glatten Muskulatur und der Rekrutierung enterischer Neuronen4. Im proximalen Dünndarm beginnen sich am embryonalen Tag 14.5 Kondensationen (Cluster) von Hedgehog- und PDGF-responsiven Zellen neben dem Epithelzu bilden 2,5. Die Bildung von mesenchymalen Clustern breitet sich weiter über die gesamte Länge des Darms aus, so dass sie am Embryonaltag den gesamten Dünndarm bedecken 16.52. Wenn sich mesenchymale Cluster bilden, beginnen die Epithelzellen, die den Clustern am nächsten liegen, sich aus dem Zellzyklus zurückzuziehen, während sich die anderen Epithelzellen weiter vermehren. Die Zellen direkt über dem mesenchymalen Cluster, die sich aus dem Zellzyklus zurückgezogen haben, beginnen ihre Form zu verändern, wenn sich der entstehende Zotten in das Lumen einknickt. Das weitere Wachstum der Zotten wird zum Teil durch die anhaltende Vermehrung des Epithels zwischen den entstehenden Zotten vorangetrieben. Die mesenchymalen Cluster bleiben fest mit dem Epithel des wachsenden Zottus verbunden und exprimieren weiterhin eine Vielzahl von Signalmolekülen. Die Welle des Zottenaufkommens breitet sich entlang der Länge des Dünndarms aus, nachdem sich mesenchymale Cluster gebildet haben. Wenn der Darm weiter wächst und sich die Intervillusregion zwischen den entstehenden Zotten ausdehnt, bilden sich neue mesenchymale Cluster neben dem Intervillusepithel und es folgen weitere Runden des Zottenaufkommens und -wachstums6.
Die synchronisierte Entwicklung des Epithels und des Mesenchyms ist essentiell für die Morphogenese des Zottens. Signalmoleküle werden von einer Schicht zur anderen sezerniert, wo Rezeptoren die Signalbotschaft empfangen und weiterleiten, um die Entwicklung zwischen Epithel und Mesenchym zu koordinieren. Mesenchymale Cluster fungieren als Signalzentren und exprimieren eine Vielzahl von Entwicklungsmorphogenen7-10. Eine Störung der Clusterbildung oder des Clustermusters führt zum Verlust des Aufkommens und des Musters der Zotten. Die Hemmung des PDGF-Signalwegs führt zu weniger Clustern und weniger Zotten, und die Zotten, die sich bilden, sind nach den abnormalen Clustern unförmig11. Der Verlust des Hedgehog-Signalwegs führt zum vollständigen Verlust der Clusterbildung und zum Versagen des Zottenaufkommens2,12. Zusammengenommen zeigen diese Daten, dass Cluster die Entwicklung des Zottenepithels mit seinem mesenchymalen Kern koordinieren.
Mit diesem gesamten Organkultursystem sind wir in der Lage, die Signalübertragung zu verändern, die an der epithelial-mesenchymalen Cluster-Cross-Talk beteiligt ist, um die Rolle dieser Signale bei der Zotten-Morphogenese zu bestimmen. Konfokale optische Schnitte und Rekonstruktionen mit zwei Photonen ermöglichen es, die Clusterbildung und das Aufkommen von Zotten dreidimensional zu visualisieren und die räumlichen Beziehungen zwischen den mesenchymalen Clustern und ihrem darüber liegenden Epithel besser zu verstehen. Wenn wir das Kultursystem auf vier Dimensionen erweitern, können wir Z-Stacks von sich entwickelnden Clustern und Zotten im Laufe der Zeit erfassen und diese Wechselwirkungen beobachten. Letztendlich wird die Fähigkeit, die Entwicklung des Zottens auf diese Weise zu verfolgen und Veränderungen zu beobachten, die mit veränderten Signalen auftreten, das Verständnis der epithelialen mesenchymalen Wechselwirkungen in der Zottenmorphogenese revolutionieren.
HINWEIS: Alle Mäuse wurden mit human Protokolle, die von der University of Michigan Medical School Einheit für Labortiermedizin zugelassen und nach den Richtlinien der Universität Ausschuss für Nutzung und Pflege von Tieren behandelt.
1. Vollorgankultursystem
2. Imaging von Fest Darm
3. Live-Imaging von Whole Darm
Darm von fetuse geerntets nach E12.5, mit dem angeschlossenen Netz intakt gelassen, erfolgreich zu entwickeln Zotten in Kultur unter Verwendung der oben System. Daher ermöglicht diese ex vivo-System die Erfassung von lebenden z-Schnittbilder der Entwicklungs Darm, die eine dreidimensionale Ansicht der Morphogenese im Laufe der Zeit wieder aufgebaut werden kann.
Kultur ganzer fötaler Explantate Darm ermöglicht die Analyse der Lage, die Verteilung, und die Dauer der Signalmoleküle, die Darmentwicklung zu koordinieren, da dieses System ermöglicht die Bearbeitung der Signalisierungs pharmakologische Reagenzien oder rekombinante Proteine. Die Transwell-Kultursystem (1A, von Walton et al wiedergegeben., 2012) 2 stellt ein Luft-Flüssigkeits-Schnittstelle, die es ermöglicht, Wirkstoff-oder Protein getränkt Agarosekügelchen auf das Gewebe zu platzieren und dadurch das die lokale Signalquellen ermöglicht (1B ). Darm von Embryonen im E10 E18.5 geerntet überleben in Kultur auf Transwells und unterliegen peristaltische-wie Wellen der Bewegung. Darm begann in der Kultur von E13.5 überleben etwa 10 Tage oder rund um P3, der Phase der Entwicklung der Maus, wenn Kryptenbildung zuerst beobachtet. Obwohl frühzeitig Darm in Kultur überleben, geerntet Darm vorE12.5 nicht Zotten entstehen zuverlässig, wahrscheinlich, weil die Serosa ist nicht gewachsen, um den Darm zu diesem Zeitpunkt vollständig zu bedecken. Mesenchymalen Cluster zu bilden und Zotten beginnen zu entstehen und verlängern in Eingeweiden begann in Kultur bei E12.5, E13.5 E14.5 oder, wenn auch die Entwicklung etwas verzögert im Vergleich zu ungebildet, Bühnen abgestimmte Kontrollen (Abbildung 1, von Walton et wiedergegeben al., 2012) 2. Unabhängig von der Phase des Darms zu Beginn der Kultur (E12.5-E14.5), die Eingeweide erscheinen immer eine ungefähre Verzögerung von 24 Stunden. E14 Darm in der Kultur für zwei Tage gewachsen zeigen Wachstum der Zotten, die mehr Ähnlichkeit mit denen von E15 Darm als Zotten E16 Darm in utero (1C-F) 2 gewachsen sind.
Das regelmäßige Muster von mesenchymalen Cluster wird durch dreidimensionale Rekonstruktion der optischen Abschnitte eines ganzen PDGFRα GFP / + Darm bei E15.5 (2 zeigte </ Strong>, aus wieder Walton et al., 2012) 2. Dieses Bild besteht aus Z-Stapel von 54 Sichtfelder, die von der Leica LAS AF Software-zusammengenäht wurden. Jeder Punkt im Inneren des Darms ist eine mesenchymale Cluster durch Kern getaggt GFP aus der PDGFRα Locus 14 ausgedrückt visualisiert. Die hohe Auflösung des Bildes ermöglicht dem Betrachter, zoom-in, um bestimmte Bereiche, um Details zu prüfen, bietet aber in der Tiefe räumlichen Beziehungen, die nicht von einzelnen Sichtfelder oder niedriger Energievergrößerung aufgelesen werden können. Movie-1 ist eine Reihe Schritt durch die genäht z -stack Bilder, 3D sind in Abbildung 2 rekonstruiert. Die einzelnen optischen Abschnitte ermöglichen weitere Darstellung von Details wie einzelne Zellen innerhalb der Cluster.
Optische Schnitte Wholemount Immundarmgefäß mit PECAM-Antikörper (BD Pharmingen 557355, verdünnt 1: 1000) wurde mit der Zweiphotonenanregung und Recon fangenkonstruiert mit Imaris Software (Abbildung 3). Diese dreidimensionale Ansicht der Darmblutgefäße enthüllt eine komplizierte Netzwerk von Gefäßen, die nicht vollständig durch dünne Schnittpräparate geschätzt werden kann. Movie 2, eine rotierende dreidimensionale Projektion des rekonstruierten Bildes in Abbildung 3, ermöglicht weitere Aufwertung, wie die erhöht Information, die durch dreidimensionale Rekonstruktion des Verständnisses der Strukturmuster verbessern.
Vibratom Schnitte ermöglicht dreidimensionale Betrachtung des Darmes von einer Quer Vorteil. In 4 ist das Verhältnis der Entwicklungs Cluster 14 mit dem Epithel und Mesenchym Umgebung (mit PDGFRα GFP / + markiert) (mit Membran Tomate (Rosa26 mT / mg) 15 beobachtet wird markiert.
Alternativ kann dieses Verhältnis von Antikörper immunofluore betrachtenscence Färbung (Abbildung 5) der mesenchymalen Cluster (grün, mit Anti-PDGFRα (Santacruz C-20 markiert ist, verdünnt 1: 200)) mit dem Epithel (rot, mit Anti-Ecadherin (BD Transduction Labs 610181 markiert ist; 1: 1.000 Verdünnung).
Diese ganze Organkultur-System kann auch erweitert werden, um für zwei-Photonen-Imaging von der Entwicklung fetalen Darm ermöglichen. In diesem Aufbau wird die fetale Darm auf eine Polycarbonat-Membran durch ein Maschensieb in einem größeren Kulturplatte (6) verklebt. Je größer und Größe der Kulturplatte ermöglicht die konfokale Mikroskopobjektive auf den Darm innen gut zu kontaktieren.

Abbildung 1. Entwicklung der gesamten fetalen Darm in einem Transwell-Kultursystem. (A) Fetal Darm auf einem Transwell-mem gesetztbran in einer 6-Well-Kulturplatte mit BGJb Medien. Top zwei Darm E12.5, unten zwei Darm E13.0. (B) Rinderserumalbumin getränkt Agarose-Kügelchen (helleres Blau) auf einem Zwölffingerdarm in der Transwell-Kultursystem platziert. Die dunkleren blauen Fleck ist X-gal-Färbung für PTC LacZ / + in den Hedgehog-Reporter Mauslinie Kennzeichnung mesenchymalen Cluster 16. (CF) Querschnitte von frisch geernteten E14.0 (C), E15.0 (D) und E16. 0 (E), Zwölffingerdarmgewebe mit E-Cadherin (grün) und DAPI (blau) gefärbt. Bei E14.0 wird das Epithel unremodeled noch pseudostratified, während bei E15.0 und E16.0, sichtbar werdende Zotten. (F) ein Darmsegment identisch mit der in (C) zu sehen ist, aber für zwei Tage kultiviert (E14 + 2 Tage) zeigt, dass die Zotten entwickeln in der Kultur, wenn auch etwas verzögert. Panels (CF) werden von Walton et al nachgedruckt., 2012 2 sup>. Scalebars sind 50 um. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 2. Dreidimensionale Rekonstruktion von genähten Bereichen z-Stacks von einem E15.5 wholemount PDGFRα EGFP / + Darm. Das Bild ist eine teilweise Rekonstruktion (fünf Abschnitte 1 um von der Mitte der 65 z-Sektionen) ab 54 genäht Felder Blick erfasst mit Hilfe des Motortisch des LeicaSP5X konfokalen Mikroskop auf einem umgekehrten DMI 6000 Stand mit Zwei-Photonen-Laser-Anregung bei 900 nm auf. Leica LAS-AF Software genähte Z-Stapel zusammen, um das ganze Bild zu bilden. Maßstabsleiste 1 mm.
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Abbildung 3. Dreidimensionale Rekonstruktion des optischen Schnitte Wholemount anti-PECAM Immundarmgefäßsystem in einer E14 Duodenum. Optische Schnitte wurden mit einem konfokalen Mikroskop LeicaSP5X an einer aufrechten DMI 6000 erfasst stehen mit Zwei-Photonen-Anregung bei 900 nm und Drei form rekonstruiert mit Hilfe der Imaris 7.6.1 Software. Maßstabsleiste ist 200 um.

Abbildung 4. Die konfokale Bilder von Vibratom geschnitten E15.5 PDGFRα EGFP / +; Rosa26 mTmG Jejunum, die die enge Verbindung der PDGFRα EGFP / + Zellen der mesenchymalen Cluster (grün) mit ihren darüberliegenden Epithel und Mesenchym Umgebung (rot; Membran Tomate von Rosa26 mTmG). < / Strong> sind Scalebars 50 um den oberen Platten und 25 um den unteren Platten.

Abbildung 5. Dreidimensionale Rekonstruktionen der konfokalen Bilder von E15.5 Vibratom geschnitten Därme, die Antikörper Immunfluoreszenz angefärbt waren. Maßstabsbalken 50 um.

Abbildung 6. Anpassung des Transwell-Kultursystem für 2-Photonen-Live-Bildgebung. (A)-Mesh-Sieb in eine Kulturschale gegeben. (B) Polycarbonatmembran ist mit dem Maschensieb eingeklebt. (C) Därme werden dem Polycarbonat-Membran geklebt und mit phenolfreiem DMEM-Medium kultiviert.
Film 2. Rotierende Film zeigt die dreidimensionale Rekonstruktion der optischen Abschnitte PECAM gefärbten Gefäß im Duodenum E14 in 2.
Die Autoren haben keine finanziellen Konflikte offenzulegen.
Verbesserte Bildgebungstechnologie ermöglicht die dreidimensionale Bildgebung von Organen während der Entwicklung. Hier beschreiben wir ein ganzes Organkultursystem, das eine Live-Bildgebung der sich entwickelnden Zotten im fötalen Mausdarm ermöglicht.
Wir danken Dr. Deborah L. Gumucio als unsere Beraterin und für ihre unschätzbare Unterstützung bei der Definition der Kultur und der bildgebenden Methoden. Wir danken auch Dr. Jim Brodie, Dr. Hong-Xiang Lu, Dr. Charlotte Mistretta und Dr. Ann Grosse für ihre Beiträge zur Entwicklung des gesamten Darmorgankultursystems. Hilfreiche Diskussionen über die Bildgebung lieferten hervorragende Ratschläge von Dr. Chip Montrose, Michael Czerwinski und Sasha Meshinchi. Die gesamte Bildgebung wurde im Labor für Mikroskopie und Bildanalyse an der University of Michigan durchgeführt. Die finanzielle Unterstützung wurde vom NIH R01 DK065850. bereitgestellt.
| Feine Präparierzange | Feine wissenschaftliche Werkzeuge | 11254-20 | 2 Paar |
| 70% Ethanol | |||
| 1x sterile Dulbecco's Phosphatgepufferte Kochsalzlösung (DPBS) | Gibco | 14040-133 | 500 ml |
| 6-Well-Platten | Costar | 3516 | |
| 24-Well-Platten | Costar | 3524 | |
| Petrischalen 60 x 15 mm | Falcon | 451007 | |
| Transwell-Platten, 24 mm Einsätze, 8,0 mm Polycarbonat-Membranen | Corning Costar | 3428 | 6 Einsätze pro Platte |
| BGJb Medien | Invitrogen | 12591-038 | 500 ml |
| PenStrep (10.000 U/ml Penicillin; 10.000 mg/ml Streptomycin) | Gibco | 15140 | |
| Ascorbinsäure | Sigma | A0278 | 5 mg/ml Brühe herstellen, filtrieren, aliquotieren und bei -20 &° lagern; C |
| Mundpipette (Drummond 1-15 Zoll Absaugrohrbaugruppe) | Fisher | 21-180-10 | Entfernen Sie die Absaugbaugruppe und ersetzen Sie sie durch eine 1.000 µ l Pipettenspitze, die als Adapter zum Einstecken einer 6-Zoll-Pasteur-Glaspipette dient. |
| 6-Zoll-Glaspasteurpipetten | |||
| Kapillarrohre | World Precision Instruments | TW100F-4 | Ziehnadeln |
| 4% Paraformaldehyd | hergestellt in 1 x PBS, pH bis 7,3 | ||
| Kulturplatten | Falcon | 353037 | |
| Feinmaschiges Edelstahlsieb | kaufen im Baumarkt | ||
| Polycarbonat-Membranen | Thomas wissenschaftlich | 4663H25 | alternativ, schneiden Sie Corning Costar 3428 Membranen von Transwell-Stützen |
| Sofortkleberkauf | im Baumarkt Gel | basierend vorzugsweise | |
| 35 x 10 mm | Platten Falcon | 351008 | |
| 7% agarose | Sigma | A9414 | Vorbereitung w/v in 1x DPBS, Erhitzen zum Auflösen in einem Wasserbad |
| minutien pins | Fine Science Tools | 26002-20 | |
| Phenolrot freie Medien (DMEM) | Gibco | 21063-029 | |
| Xylazin (100 mg/ml) | AnaSed | 139-236 | |
| Matrigel | BD | 356231 | Basalmembranmatrix, Wachstumsfaktor reduziert, phenolrotfrei |
| 3-4% Agarose | Sigma | A9414 | vorbereiten w/v in 1x DPBS, Erhitzen, um sich in einem Wasserbad aufzulösen |
| Bildgebung des festen Darms | |||
| Name des Materials/Ausrüstung | Firma | Katalognummer | Kommentare/Beschreibung |
| Vaseline | Kauf in der Apotheke | zur Herstellung von VALAP verwendet: gleiche Teile Vaseline, Lanolin, Paraffin, | |
| Lanolin | Sigma | L7387 | zur Herstellung von VALAP: zu gleichen Teilen Vaseline, Lanolin, Paraffin |
| , Paraffin | Surgipath | 39601006 | zur Herstellung von VALAP: zu gleichen Teilen Vaseline, Lanolin, Paraffin |
| 70% Glycerin in 1 x PBS | |||
| Focus Clear und Mount Clear | CelExplorer Labs Co. | F101-KIT | |
| Modelliermasse | kaufen im Kunstbedarfsgeschäft | ||
| Doppelklebeband | |||
| Wattestäbchen | |||
| Kunststoffformen, 10mm x 10mm x 5 mm) | Tissue Tek | 4565 | |
| Dias | |||
| Deckgläser | |||
| Labortuch | Kimberly Clark | 34155 | fusselfreies Tuch für zarte Aufgaben |
| Theiler Staging Chart | http://www.emouseatlas.org/emap/ema/theiler_stages/ Downloads/theiler2.pdf | ||
| Leica SP5X Konfokalmikroskop | Leica | Wird für die Durchführung der Live-Bildgebung verwendet | |
| Leica DMI 6000 Standfuß | Leica | Wird für die Durchführung der Live-Bildgebung verwendet | |
| Wässriges Einbettmedium (Prolong Gold) | Molekulare Sonden | P36930 | |
| Name des Materials/der Ausrüstung | Firma | Katalognummer | Kommentare/Beschreibung |
| 24-Well-Platte | Costar | 3524 | |
| Triton X-100 | Sigma | T-8787 | zur Herstellung von Permeabilisierungslösung: 0,5 % Triton X-100 in 1 x PBS |
| Ziegenserum | zur Herstellung von Blockierungslösung: 4 % Ziegenserum, 0,1 % Tween20 in 1x PBS | ||
| Tween20 | Sigma | Nr. P9416 |