RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
German
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Expression des Malaria-Proteinen in zellbasierten Systemen bleibt eine Herausforderung. Wir zeigen zwei Schritt und einen Schritt IVT (in vitro-Translation) zellfreie Expressionssysteme zur Expression von rekombinanten Malaria-rhoptry Proteine aus HeLa-Zellen. Wir verwenden eine Ni-Harz Affinität Kläranlage, die rhoptry Proteine zu reinigen.
Malaria verursacht erhebliche globale Morbidität und Mortalität. Keine Routine-Impfstoff ist derzeit verfügbar. Einer der wichtigsten Gründe für die mangelnde eines Impfstoffes ist die Herausforderung der Identifizierung geeigneter Impfstoffkandidaten. Malariaproteine exprimiert mit prokaryotischen und eukaryotischen Zellen basierenden Expressionssystemen schlecht glycosyliert allgemeinen unlöslich und unterliegen falsche Faltung führt zu verringerten Immunogenizität. Die Weizenkeime, Kaninchenretikulocytlysat und Escherichia coli Lysat zellfreie Expressionssysteme sind derzeit für die Expression des Malaria-Proteine verwendet. Jedoch ist die Länge des Expressionszeit und unsachgemäße Glykosylierung von Proteinen immer noch eine Herausforderung. Wir zeigen die Expression von Plasmodium Proteinen in vitro unter Verwendung von HeLa-Zelle basierend freie Expressionssysteme, die als "in vitro menschliche Zelle freie Expressionssysteme". Die 2 HeLa anhand zellfreie Expressionssysteme transkribieren mRNA in 75 min und 3 ul transcribed mRNA reicht aus, um Proteine in 90 min zu übersetzen. Die 1-Schritt-Expressionssystem ist eine Transkription und Translation gekoppelt Expressionssystem; die Transkription und Co-Übersetzung erfolgt in 3 Stunden. Das Verfahren kann auch für 6 Stunden, indem zusätzliche Energie erweitert werden. In der 2-Schritt-Expressionssystem wird mRNA transkribiert erste und dann in die Übersetzung Mischung für die Proteinexpression zugegeben. Wir beschreiben, wie die Malaria-Proteine zu exprimieren; eine hydrophobe PF3D7_0114100 Maurers Cleft - 2 Transmembran (PFMC-2TM) Protein, ein hydrophiles PF3D7_0925900 Protein und ein Gürteltier wiederholt mit Protein PF3D7_1361800, mit der HeLa anhand zellfreien Expressionssystem. Die Proteine werden in Mikrovolumina unter Verwendung 2-Schritt und 1-step-Ausdruck Strategien ausgedrückt. Ein Affinitätsreinigungsverfahren zur Reinigung von 25 ul exprimierten Proteine unter Verwendung des in vitro menschliche Zelle frei Expressionssystem wird ebenfalls beschrieben. Proteinausbeute durch Bradford-Assay bestimmt und die zum Ausdruckund gereinigte Proteine durch Western-Blot-Analyse bestätigt werden. Exprimierten rekombinanten Proteine können für Impfungen, Immunoassays und Proteinsequenzierung verwendet werden.
Malariaforschung, Expression von immunogenen Proteinen unter Verwendung von prokaryotischen oder eukaryotischen Systemen auf Zellbasis bleibt eine Herausforderung. Die AT Reichtum des Plasmodium Genom und unbekannte posttranslationale Mechanismen 14,7, auf die Schwierigkeiten bei der Beschaffung richtig gefaltet und immunogene Proteine zur Antikörperproduktion und Impfstoffstudien assoziiert beitragen. Prokaryontischen Systemen wie Escherichia coli für die rekombinante Proteinexpression verwendet. Prokaryotische Systeme sind kostengünstig, effektiv, erzeugen hohe Ausbeuten an rekombinantem Protein und mehrere Klonierungsvektoren. Host E. coli-Zellen sind leicht zu transformieren und Zellen schnell wachsen. Jedoch haben prokaryotischen Systemen Einschränkungen wie der Mangel an Aminosäure-Substitution, eine posttranslationale Modifikation, Verschmutzungsgefahr heterogene Produkte und Akkumulation von rekombinanten Proteinen in Einschlusskörpern 24.
In einemStudie Mehlin et al. (2006) wurden 1000 offenen Leserahmen (ORF) ausgedrückt. Etwa 7% der exprimierten Proteine waren löslich 14. Die beobachtete Unlöslichkeit ist aufgrund der vorgespannten Natur der Gene und der hohen Frequenz von Codons, die idealerweise durch die AT-reiche Plasmodium Genom 14 verwendet. Eine alternative Strategie zur Überwindung dieses Problems wurde durch die Verwendung von Plasmiden oder Wirtszellen, tRNAs, die seltenen Codons oder Codons, die Frequenzen 3 entsprechen erkennen entwickelt. Selbst nach der Durchführung dieser Optimierungen werden sehr kleine Teile von Proteinen als lösliche, aktive und immunogenen 14 ausgedrückt. Die zellfreie Expressionssysteme enthalten sämtliche zur Transkription und Translation notwendigen Komponenten wie Ribosomen, Initiationsfaktoren, Elongationsfaktoren (Übersetzungen Faktoren), tRNA und Aminoacyl-tRNA-Synthetasen. Beide Transkription und Translation Reaktionen werden in einem einstufigen Verfahren 11,29 gekoppelt. Die transcription Reaktion in einem Röhrchen durchgeführt werden, bevor entsprechende Menge an mRNA mit Translationsmaschinerie in einem anderen Rohr 11,29 inkubiert. Obwohl diese Verfahren in Plasmodium sp. Protein Expression erfolgreich sind, ein großer Nachteil ist die Länge der Zeit für die Proteinexpression, die etwa 22 Stunden 29 ist. Darüber hinaus ist die hohen Kosten der Versorgung für die Aufnahme in den Protokollen 29, die arbeitsintensiven Vorbereitungen des Zelllysats und Inkonsistenzen in der Komponente Zubereitungen, stellen diese Systeme unerreichbar. Das Hauptaugenmerk der Forscher für die Entwicklung einer zellfreien Expressionssystem ist abhängig von Faktoren wie schnelle genetische Veränderung, schnelle Erträge mit hohen Konzentrationen und geradlinig Lysat Vorbereitungen 1.
Eukaryontischen Systemen wie Hefe, Säugerzelllinien, Baculovirus-Expressionssystem vermittelt, Tetrahymena thermophilia, Dictyostelium discoideum und parasitären Expressionssysteme such wie Leishmania wurden für die rekombinante Proteinexpression 7 verwendet. Eukaryotische Systeme teilen phylogenetische Verwandtschaft und damit Eigenschaften wie Glykosylierung, Acylierung, Disulfid-Bindungsbildung, Chaperon-Wechselwirkung, Proteolyse und subzellulären Kompartimentierung teilen auch. Proteinsekretion Veranstaltungen in Eukaryoten zu verhindern Anhäufung und verringert die Toxizität für Expressionssysteme 13. Die Verwendung von Hefe-Systemen wird bevorzugt, da sie für die Proteinexpression in großem Maßstab und zur Erzielung hoher Ausbeuten 4 sind. Zwei P. falciparum Proteine PFCP-29 und Pvs25 wurden unter Verwendung des Hefe-System 4 erzeugt. , Ein großer Nachteil bei der Synthese der meisten der Proteine wurde jedoch unregelmäßige N und O-Glykosylierungsmuster, unsachgemäße Falten und Abschneiden von Proteinen aus ihrer nativen Form 4.
Die Verwendung von Säugetierzellen für die Synthese von rekombinanten Proteinen ist arbeitsintensiv und es ist Expensive zu stabilen rekombinanten Zelllinien 4 aufrecht zu erhalten. Daher wurden Säugerzellen für die Analyse von Protein-Signalisierung, Protein-Interaktionen und Parasit-Wirt-Wechselwirkungen beschränkt und auch für das Testen von DNA-Impfstoffen 4. Die menschliche DNA und mRNA in vitro-Proteinexpression zellfreies System ist hierin ein HeLa-Zell-abgeleitete Säugetier-basiertes System, das Proteine in 3 h ausdrückt. Proteine exprimiert Verwendung pT7CFE1-ChiS Expressionsvektor haben einen C-terminalen Tag erleichtert Identifizierung und Reinigung. Die HeLa basiertes System mit Translationsinitiationsfaktoren und einem Übersetzungsregler ergänzt, wodurch die Effizienz des Übersetzungssystems zu verbessern. Proteine können schnell umgesetzt werden, abgeschirmt, überprüft und für den Einsatz in verschiedenen immunologischen und Strukturanwendungen 15 verarbeitet.
Eukaryotischen zellfreie Expressionssysteme wie Weizenkeime und Kaninchen-Retikulozyten sind zur Zeit für die Expression von var verwendetious eukaryotischen Proteinen einschließlich Plasmodium Proteine 11,29. Zusätzlich E. coli basiert zellfreie Systeme sind auch für eukaryotische Proteinexpression. 11 verwendeten Tabelle 1 fasst verschiedene zellfreie Expressionssysteme durch Vergleichen von Merkmalen der Systeme sowie die Leichtigkeit der Verwendung der Systeme für die Proteinexpression. Der menschliche zellfreien System im Vergleich zu den anderen hat die Fähigkeit, Pfosten und co-translationale Modifikationen durchzuführen und ist weniger teuer. Codon-Optimierung ist möglich, und alle Reaktionen in 3 Stunden durchgeführt werden. Die HeLa-System ist eine ideale Übersetzungssystem für die Proteinsynthese in der Laborumgebung.
Ein Hauptvorteil der menschlichen Zelle freie Expressionssysteme gegenüber anderen zellfreien Systemen ist die Verfügbarkeit von mehreren verschiedenen Zelllinien aus verschiedenen Organen und Geweben abgeleitet ist. Mehrere Sorten von zellfreien Systemen können in Abhängigkeit von der Zelllinie ausgebildet sein. Der Extrakts aus Säugerzellen haben einen höheren Wirkungsgrad, große Proteine zu synthetisieren als andere zellfreie Expressionssysteme. Diese zellfreie Expressionssysteme können auch in diagnostischen und Proteincharakterisierung Anwendungen wie Mikro-Arrays 30 verwendet werden. Die beliebten HeLa-Zelllinien werden am häufigsten verwendet, um die Durchführung der Expression von Proteinen, 33. Das endoplasmatische Retikulum in den HeLa-Zelllinien unterentwickelt, was zu einer Abwesenheit von posttranslationalen Glykosylierung Modifikation Aktivität 33. Allerdings ist dieses System glaubten für Plasmodium Proteinsynthese als vorteilhaft, als Plasmodium fehlt auch Glykosylierung Übersetzungs- Änderung 29. Der HeLa-Zell-freien Transkriptions-Translations-Protokoll ist einfach auszuführen, preisgünstig und Proteine können in 90 min ausgedrückt werden, bereit für die Reinigung und Downstream Applikationen.
1. Herstellung von Parasite Zellkulturen, Sammlung von Parasite Pellets
2. Vorbereitung Plasmid Vektor
3. Protein Expression mittels in vitro Menschliche Zelle Kostenlose Expression System
4. Reinigung des exprimierten rekombinanten Proteins
5. Coomassie (Bradford) Protein Assay 34
6. Western Blotting
Validierung der exprimierten rekombinanten Proteine durch Reaktivität mit spezifischen Antikörpern ist ein wichtiger erster Schritt bei der Bestätigung der korrekten Faltung der exprimierten Proteine. Rekombinanten Malaria-Proteine wurden mit dem einen Schritt und zwei Schritt in vitro menschliche Zelle frei Expressionssystemen exprimiert. Die rekombinanten Proteine werden gereinigt Ni-Chelat-Affinitäts-Verfahren. Dann verwendeten wir Antiseren gegen ganze Merozoiten Rhoptrien in Western-Blotting von SDS-PAGE getrennt rekombinanten Proteinen.
1 zeigt PCR amplifiziert Genfragmente PY17X_1139200, PY17X_1402200, PY17X_1366000, PY17X_0830000 und PF3D7_1436300 in einem 1% Agarosegel. DNA-Banden wurden ausgeschnitten und die DNA durch Einfrieren in der DNA-Extraktion Spin-Säule gereinigt.
Malaria-Gene erfolgreich amplifiziert aus genomischer DNA (in Tabelle 2 gezeigt) wurden in den pT7CFE-ChiS Expressionsvektor kloniert. Re-Amplifikation der Gene aus dem recombinant Plasmide zeigte die Anwesenheit der klonierten Genfragmente in dem Vektor. Das Flussdiagramm von Expressionssystemen für die Proteintranslation verwendet wird in Abbildung 2 dargestellt. 2A und 2B zeigt eine schrittweise Prozedur der 2-Schritt in vitro menschliche Zelle freie Expressionssystem und dem 1-Schritt-IVT-Übersetzungssystem gekoppelt. Erfolgreiche Expression von Proteinen unter Verwendung von Plasmodium in vitro menschliche Zelle freie Expressionssysteme wurde von rhoptry spezifischen Kaninchen-Antiseren bestätigt. Wie in 3A dargestellt ist, wurden die rekombinanten Proteine durch rhoptry spezifischen Kaninchen-Antiserum # 676 erfasst. Wie zuvor gezeigt, exprimierten rekombinanten Proteine nicht durch Antiseren gegen parasitophoren Vakuole Proteine aus P. anerkannt falciparum und P. yoelii die Spezifität Kaninchenantiseren 676 gegen die exprimierten Proteine 32. Normales Kaninchenserum (NRS) nicht mit rekombinanten Proteinen reagierenübersetzt mit 2-Stufen-in-vitro-Zell kostenlos Expressionssystem von Mensch und 1-Schritt-IVT gekoppelt Übersetzungssystem (3B). Die erfolgreiche Expression von Plasmodium rekombinanten Proteine wurde durch verschiedene Techniken wie In-Gel-Histidin-Färbung und Nickel-HRP Färbung 32 bestätigt. Exprimierten Proteine wurden durch Affinitätsreinigungssystem gereinigt. Die Reinigung wird in Batch-Verfahren durchgeführt (keine Spalten verwendet). Die Technik wird durch Veränderung der Konzentration von Imidazol von 60 mm bis 100 mm optimiert. Die optimale Konzentration für die Elution ist 250 mM. 4 zeigt erfolgreiche Reinigung des translatierten Proteine aus 25 ul translatierten Proteinprodukte. 4A zeigt erfolgreiche Reinigung von Maurer Spalt Transmembranprotein 18. 4B zeigt erfolgreiche Reinigung von PF3D7_0925900, P. falciparum Ortholog von Plasmodium yoelii Gen PY17X_0830000 einhypothetisches Protein 32. 4C zeigt erfolgreiche Reinigung des Gürteltier-Wiederholungen enthält Protein PY17X_1139200, ein hypothetisches Protein unter Verwendung von Ni-Harzkügelchen und 100 mM Imidazol in 1x Elutionspuffer. Die Ausbeute an Protein nach Reinigung beträgt 3,5 ug / 25 ul.

Abbildung 1. Die Amplifikation von P. falciparum und P. yoelii Gene. 1% Agarosegel, das Ethidiumbromid PCR-Produkte von Genfragmenten der PFc14_0344, PF3D7_0925900, PF3D7_1361800, PY07482 und PFA0680cw aus P. amplifizierte falciparum genomischer DNA.

Abbildung 2 Flussdiagramm von HeLa-bas ed zellfreien Expressionssystem. Schematische Darstellung der beiden 2-Stufen und 1-Schritt in vitro menschliche Zelle freie Expressionssysteme. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 3. Immunoblotting Bestätigung der Proteinexpression. Western Blot-Analyse des exprimierten rekombinanten Proteinen unter Verwendung von ganzen rhoptry spezifischen Kaninchen-Antiserum # 676 und normales Kaninchenserum. (A) Reaktivität von Antiseren 676 mit exprimierten rekombinanten Proteine. (B) normalem Kaninchenserum nicht mit der exprimierten rekombinanten Proteine reagieren. Parasitophoren Vakuole Protein nicht mit rekombinanten Proteinen 32 reagieren.hres.jpg "target =" _ blank "> Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Figur 4. Reinigung von Proteinen aus Mikrovolumina Translationsprodukt. Reinigung des exprimierten rekombinanten Proteinen unter Verwendung von Nickel-Chelatharzes Affinitätsverfahren. Exprimierten Proteine (Übersetzung) (A) PF3D7_0114100, (B) PY17X_0830000 und (C) PY17X_1139200 Proteine wurden mit Nickel inkubiert - Chelatharze mit Nickel- chelatbildenden Harz in Abwesenheit von Imidazol in Bindungspuffer und Reinigungspuffer gereinigt. Nach der Inkubation wurden die Perlen zentrifugiert, ungebundenen Proteine wurden getrennt, und die Perlen zweimal mit Waschpuffer gewaschen. Gebundenen rekombinanten Proteine wurden eluiert, zweimal durch Waschen der Kügelchen folgt. Übersetzt Proteine, Waschanlagen, Eluaten und Perlenwurden in Elektrophorese-Probenpuffer solubilisiert. Imidazol im Wash (20 mM Imidazol) und Elution (100 mM Imidazol) Puffer verwendet. Antiseren # 676 erfolgreich erkannt exprimiert und gereinigte rekombinante Proteine. Normales Kaninchenserum nicht mit exprimierten Proteine als zeigen in 3B zu reagieren. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.
| Eigenschaften | Menschenzellfreien Expressionssystem | Weizenkeimzelle frei Expressionssystem | Kaninchen-Retikulozyten-Expressionssystem | E.coli-Lysat-Protein-Expressionssystem |
| Zeit | Geschehen Transkription und Translation in 3 Stunden | Transkription für 6 Stunden und Übersetzung für 10 - 20 h | RNA zu isolieren Übersetzung erfolgt 90 min | Done in 1 h |
| Geeigneten Vektor | T7 Vektor kann | SP6-Vektor | T7 verwendet werden | T7 verwendet werden |
| Geeigneten Maßstab | Geeignet für die Laborsynthese | Wird für die Proteinsynthese im großen Maßstab | Geeignet für Labor und Immunisierungsstudien | Geeignet für Labor und Immunisierungsstudien |
| Extrakt | HeLa zellfreien Extrakten | Embryo Weizenextrakten | Retikulozyten-Zellextrakten | E. coli Zelllysat Extrakten |
| Änderung | Co-translationale und posttranslationale Modifikation | Posttranslationale Modifikation | Co-translationale Modifikation | Posttranslationale Modifikation |
| Größe des Proteins übersetzt | 8 KDa und 250 KDa | 220 KDa | 250 KDa | <td> 200 kDa|
| Codon-Optimierung | Fest | Fest | Lose | Fest |
| Disulfid-Bindungsbildung | Ja | Ja | Nein | Ja |
| Ausbeute | Geringe Ausbeute | Hohe Ausbeute | Low Yield | Sehr hoher Ausbeute |
| Kosten | $ 130,00 für 10 Reaktionen | $ 173,00 für 10 Reaktionen | $ 136,00 für 5 Reaktionen | $ 159,00 für 8 Reaktionen |
| Die Proteinkonzentration | 3 bis 5 & mgr; g pro Reaktion | 100 & mgr; g / ml | 100 & mgr; g / ml | 500 & mgr; g / ml |
| Referenzen | 32, 30 | 7, 28, 29 | 7 | 7, 24, 25 |
Tabelle 1. Zellfreie Expressionssysteme in Malaria-Forschung. Vergleich von Zellfreie Expressionssysteme derzeit in Malaria-Forschung eingesetzt.
| Gene ID | Ortholog ID | Protein | Primer-Sequenz für die PCR |
| PF3D7_1436300 | Translocon Komponente | CTCGAGAATAATAACAATCATAATAATAAG | |
| GAATTCATTATCATCAGGTTTAGCTAATTTTC | |||
| PF3D7_0114100 | PFMC-2TM Maurers Spalte Protein | GGATCCATGTTAGGTCAAAAAAACACAAATA | |
| CTCGAGTGTTATTTGCTTTTTGTTTTGAAAA | |||
| PY17X_0830000 | PF3D7_0925900 | Hypothetisches Protein | GGATCCATGAAATTTTTTAATATTCTCGCA |
| CTCGAGTCCTTGGACAACATATATACT60; | |||
| PY17X_1139200 | PF3D7_1361800 | Hypothetisches Protein | GGATCCATGGGGTGCGACCCTGGGGTCAGCA |
| CTCGAGGCTCTTCAGATACTAAGCTACTAAT |
Tabelle 2. rhoptry Gene in der Studie. Primers verschiedener Gene in dieser Untersuchung 19 ausgedrückt.
| Name des Materials | Unternehmen | Katalog-Nummer | Beschreibung |
| 2-Stufen-in vitro menschliche Zelle frei Expressionssystem 32 | Thermo Fisher | 88.856 | Nicht mehr. Speichern Sie immer bei -80 ° C. Sie in warmem Wasser auftauen nicht. |
| 1-Schritt-in vitro-Translationssystem gekoppelt | Thermo Fisher | 88.860 | Speichern Sie immer bei -80 ° C. Th nichtaw in warmem Wasser. |
Tabelle 3. Hela anhand zellfreie Expressionssysteme. Kits für die Expression von Proteinen verwendet.
Wir haben keine konkurrierenden finanziellen Interessen an dieser Studie.
Expression des Malaria-Proteinen in zellbasierten Systemen bleibt eine Herausforderung. Wir zeigen zwei Schritt und einen Schritt IVT (in vitro-Translation) zellfreie Expressionssysteme zur Expression von rekombinanten Malaria-rhoptry Proteine aus HeLa-Zellen. Wir verwenden eine Ni-Harz Affinität Kläranlage, die rhoptry Proteine zu reinigen.
Diese Forschung wurde von den Fakultätsentwicklungsfonds der Cleveland State University unterstützt.
| 2-stufiges in vitro System zur freien Expression menschlicher Zellen | Thermo Fisher | 88856 | Eingestellt. Immer bei -80 °C lagern. Nicht in warmem Wasser auftauen |
| 1-stufiges in vitro gekoppeltes Translationssystem | Thermo fischer | 88860 | Immer bei -80 °C lagern. Nicht in warmem Wasser auftauen |
| ProBond Reinigungssystem | Invitrogen | K850-01 | Bei RT aufbewahren |
| Probond Nickel-Chelat-Harz | Invitrogen | R801-01 | Bei 4oC lagern. |
| A + Human Blood | Interstate Blood Bank | Store bei 4 &Grad; C. |