Methodenartikel

Isolierung von Mitochondrien von minimalen Mengen an Maus-Skelettmuskel für die Hochdurchsatz-Mikroplatten-Atemmessungen

DOI:

10.3791/53217

13. November 2015

In diesem Artikel

Zusammenfassung

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Hier präsentieren wir eine Modifikation einer zuvor berichteten Methode, die die Isolierung von qualitativ hochwertigen und gereinigten Mitochondrien aus kleineren Mengen von Maus-Skelettmuskeln ermöglicht. Dieses Verfahren führt zu hochgradig gekoppelten Mitochondrien, die während mikrotiterplattenbasierter Respirometirc-Assays mit hoher Funktion atmen.

Zusammenfassung

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Dysfunktionalen Skelettmuskel Mitochondrien spielen eine Rolle in Zusammenhang mit der Alterung, Übergewicht und Diabetes Typ II beobachtet veränderten Stoffwechsel. Mitochondriale respirometrischen Assays aus isolierten Mitochondrien Zubereitungen erlauben die Beurteilung der Mitochondrienfunktion sowie die Bestimmung des Mechanismus (en) der Wirkung von Arzneimitteln und Proteinen, die den Stoffwechsel modulieren. Aktuelle Isolierungsverfahren erfordern häufig große Mengen von Gewebe, um qualitativ hochwertige Mitochondrien für respirometrischen Assays notwendig ergeben. Die hier vorgestellten Methoden beschreiben, wie hohe Qualität gereinigt Mitochondrien (~ 450 & mgr; g) von geringen Mengen (~ 75-100 mg) von Maus-Skelettmuskel isoliert werden für den Einsatz in Hochdurchsatz-Atemmessungen. Wir stellten fest, dass unsere Trennung Verfahren ergibt 92,5 ± 2,0% intakte Mitochondrien durch Messung Citrat-Synthase-Aktivität spektralphotometrisch. Darüber hinaus Western Blot-Analyse in isolierten Mitochondrien führte das schwache Expression des cytosolic Protein, GAPDH und die robuste Expression des mitochondrialen Proteins, COXIV. Die Abwesenheit eines bekannten GAPDH Band in den isolierten Mitochondrien indikativ für kleine Verunreinigungen von nicht mitochondrialen Quellen während des Isolierungsverfahrens. Am wichtigsten ist, die Messung des O 2 Verbrauchsrate mit Mikroplatte basierte Technologie und Bestimmen des respiratorischen Steuerungsverhältnis (RCR) für gekoppelte respirometrischen Assays zeigen hoch gekoppelt (RCR,> 6 für alle Assays) und funktionelle Mitochondrien. Im Ergebnis ist die Zugabe eines separaten Zerkleinern Schritt und Motor angetrieben Homogenisierungsgeschwindigkeit eines zuvor beschriebene Verfahren erheblich reduziert ist die Isolierung von hoher Qualität und gereinigten Mitochondrien aus kleineren Mengen von Maus-Skelettmuskel, in stark gekoppelt Mitochondrien, die mit hoher Funktions respire Ergebnisse führten während auf Mikrotiterplatte respirometirc Assays.

Einleitung

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Die Hauptfunktion der Mitochondrien besteht darin, ATP aus oxidativer Phosphorylierung zu produzieren. Mitochondrien haben jedoch viele andere wichtige zelluläre Funktionen, einschließlich, aber nicht beschränkt auf: die Produktion und Entgiftung von reaktiven Sauerstoffspezies, die Regulierung von zytoplasmatischem und mitochondrialem Kalzium, den Organellentransport, die Ionenhomöostase und die Beteiligung an der Apoptose1,2. Daher ist es nicht verwunderlich, dass dysfunktionale Mitochondrien bei vielen Krankheitspathologien wie Alterung, neurodegenerativen Erkrankungen, Herz-Kreislauf-Erkrankungen, Krebs, Fettleibigkeit und Diabetes eine Rolle spielen3,4. Wichtig ist, dass die Mitochondrien der Skelettmuskulatur speziell an vielen dieser Pathologien beteiligt sind3-5.

Mitochondriale Atmungsassays mit isolierten Mitochondrien ermöglichen die Beurteilung der Elektronentransportkette und der oxidativen Phosphorylierungsfunktion sowie die Bestimmung von Wirkungsmechanismen von Arzneimitteln und Proteinen, die den Stoffwechsel modulieren. Mitochondriale Isolierungsverfahren gibt es für mehrere Gewebe- und Zelltypen für eine Vielzahl von Spezies6,7. Diese Verfahren erfordern jedoch oft große Mengen an Gewebe/Zellen für eine qualitativ hochwertige Mitochondrienausbeute, die für klassische respirometrische Assays erforderlich ist.

Mikrotiterplatten-basierte Respirometirc-Assays ermöglichen Messungen mit hohem Durchsatz mit minimalen Mengen an isolierten Mitochondrien, oft nur einige μg pro Vertiefung8. Daher stellen wir eine Modifikation der zuvor veröffentlichten Methoden7 vor, um die Isolierung hochwertiger Mitochondrien aus kleineren Mengen von Maus-Skelettmuskeln für die Verwendung in Mikrotiterplatten-basierten Respiromerc-Assays zu ermöglichen. Darüber hinaus werden Methoden zur Verfügung gestellt, um die Qualität der mitochondrialen Isolationsvorbereitung und die Integrität der mitochondrialen Membranen zu bestimmen. Angesichts der Tatsache, dass die Mitochondrien der Skelettmuskulatur an vielen pathologischen Zuständen beteiligt sind, wird die Messung des O2 -Verbrauchs in mechanistisch getriebenen Studien in der biomedizinischen Forschung immer häufiger9,10.

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Protokoll

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Tierexperimentelle Studien wurden im Rahmen einer genehmigten Protokoll von der Institutional Animal Care und Verwenden Committee durchgeführt am Virginia Polytechnic Institute und State University.

1. Setup (Zeit: ~ 45 min)

  1. Tauwetter gefrorenen Filialen von 0,25% Trypsin, Isolation Puffer für Mitochondrien (IBM) 1 und IBM2 in einem 37 ° C Wasserbad.
  2. Spülen Sie Gläser und Sezieren Instrumente in 70% Ethanol, gefolgt von hochreinem Wasser.
  3. Bereiten 0,05% Trypsin-Lösung von 0,25% Trypsin Lager durch Verdünnen von 1 Teil Trypsin in 4 Teilen IBM1.
  4. Mischen Sie Protease und Phosphatase-Inhibitor-Cocktail mit Zelllysepuffer (1: 100-Verhältnis) in einem 1,5 ml Mikrozentrifugenröhrchen mit Schraubverschluss.
  5. Aliquots von 5 ml (5 ml / Maus) von 0,05% Trypsin in ein 15 ml Kunststoffröhrchen.
  6. Set Motor angetrieben Gewebehomogenisator zu 80 RPM.

2. Isolierung der Skelettmuskulatur Mitochondrien (Zeit: ~ 90 min)

  1. Euthanize eine Maus mit CO 2 Einatmen, gefolgt durch zervikale Dislokation.
  2. Entfernen Sie rote Muskel von der Quadrizeps und M. gastrocnemius, der die soleus (~ 75-100 mg insgesamt), wie in den folgenden Schritten beschrieben beinhaltet:
    1. Schälen Sie die Haut in Richtung der Maus.
    2. Entfernen Sie die Fettpolster über der Quadrizeps-Ursprungspunkt. Schneiden Sie die Quadrizeps-Sehne, die die Kniescheibe mit feiner Spitze Schere angebracht ist.
      Hinweis: Der Quadrizeps durch seine anatomische Position an dem vorderen Abschnitt des proximalen Femur identifiziert.
    3. Langsam schnippeln die Aponeurose zwischen dem Knochen und der Quadrizeps, unter Vermeidung der Oberschenkelschlagader, um die Quadrizeps aus dem Knochen zu befreien. Schneiden Sie die Sehne mit feiner Spitze Schere am Ursprungspunkt auf dem Femur um den Quadrizeps zu befreien und legen Sie die Quadrizeps in gekühltem PBS.
    4. Entfernen Sie sichtbaren Fettgewebe in den Quadrizeps mit einer Schere. Flip Quadrizeps um, so dass der Teil des Muskels, der über den Oberschenkelknochen wurde zugewandt ist uSeite Öffnen Sie die Quadrizeps mit einer Pinzette in einem pendelnden Bewegungen. Entfernen Sie die beiden sichtbaren roten Muskelabschnitte von jedem Lappen mit feiner Spitze Schere und in ein Becherglas mit 5 ml gekühlt IBM1.
      Hinweis: Quadrizeps als zwei Lappen mit einem Streifen aus roten Muskel in der Nähe der Seitenkante jedes Flügels angeordnet angezeigt.
    5. Schneiden Sie die Haut über der Achillessehne mit feiner Spitze Schere und schälen die Haut in Richtung der Maus. Schneiden Sie die freiliegenden Achillessehne und schälen die Muskeln auf den Körper der Maus.
    6. Schneiden Sie die Sehne am lateralen und medialen Kondylen des Oberschenkelknochens mit feiner Spitze Schere, um die gastrocnemius zu befreien und legen Sie die gastrocnemius, seine Sehnen in gekühltem PBS angeschlossen.
    7. Klappen Sie den gastrocnemius auf und ziehen Sie die Soleusmuskel und legen Sie in den Becher, die 5 ml gekühlt IBM1. Fan öffnen Sie die gastrocnemius. Entfernen Sie die drei visuellen roten Muskelabschnitte (zwei seitlichen und einem medialen oberflächliche rote Streifen) mit feinen Spitzen versehenen Scherens und übertragen diese zu dem Becherglas gegeben, 5 ml gekühlter IBM1.
  3. Entfernen weiteres ~ 75-100 mg von roten Muskel aus dem anderen Schenkel des Maus (wie in Schritt 2.2 beschrieben) und in einen 1,5 ml-Mikrozentrifugenröhrchen mit Protease- und Phosphatase-Inhibitor-Cocktail und Zelllyse-Puffer (50 mM Tris-HCL, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, 1% Natriumdodecylsulfat, 0,5% Natriumdeoxycholat, 1% Polyoxyethylen (9) nonylphenylether, verzweigt. Unmittelbar Blitz-einfrieren dieses zweite Probe in flüssigem Stickstoff für die spätere Verwendung in Western Blot (siehe Schritt 6.1).
  4. Legen Sie eine vorgekühlte, flache Kunststoffoberfläche auf Eis in einem großen Eimer. Gießen Sie einen Tropfen IBM1 auf die Kunststoffoberfläche und verwenden Pinzette, um das gesamte geschnittene rote Muskel (Schritt 2.2.4 und 2.2.7) in IBM1 Tröpfchen zu platzieren. Hackfleisch das Muskelgewebe für 2 min mit 3 Einzelklingen durch Ändern Rasierer alle 40 sec.
  5. Übertragen des zerkleinerten Gewebes mit einem neuen Becherglases mit 5 ml frischem IBM1, indem die Kunststoffoberfläche, über the-Becherglas und Abkratzen der Muskeln in den Becher mit einer Rasierklinge. Nutzen Sie diese Lösung und lassen es durch einen 100 & mgr; m Zellsieb auf eine 50 ml konischen Röhrchen platziert.
  6. Tupfen Sie das Gewebe mit einer heiklen Aufgabe Wischer und dann übertragen sie in 5 ml 0,05% Trypsin-Lösung. Verwenden einer Pinzette, um das Gewebe von der Aufgabe Wischer zu entfernen.
  7. Inkubieren des Muskelgewebes auf Eis für 30 min in 0,05% Trypsin-Lösung.
  8. Spinnen Sie die 15 ml konischen Röhrchen mit Trypsin / Muskel Mischung bei 200 × g für 3 min bei 4 ° C.
  9. Gießen Sie die Trypsin-Überstand in einen Abfallbehälter und das Pellet mit 3 ml eiskaltem IBM1. Übertragen Sie das Gewebe bis zu einer 45 ml Glas-Homogenisator Rohr. Mit einem weiteren 1,5 ml IBM1 Spülen Sie die 15 ml konischen Röhrchen, um alle verbleibenden Proben sammeln und fügen Sie diese in die Glas-Homogenisator Rohr.
  10. Legen Sie das Glas-Homogenisator Rohr in ein Becherglas oder Kunststoffbehälter gefüllt zur Hälfte mit Eis, so dass die Glas-Homogenisator bewegt sich minimal in das Becherglas.
  11. Homogenisieren des Gewebes / IMB1 Mischung mit den PTFE-Pistill zu einem Motor angetrieben Gewebehomogenisator mit 10 Durchgängen bei 80 UpM angebracht ist. Halten Sie den unteren Rand jeder Pass für ca. 2 Sek.
  12. Übertragen Sie die Gewebehomogenat auf ein neues 15 ml konischen Rohr und spülen Sie das Glas-Homogenisator Rohr mit 6,5 ml IBM1. Gießen Sie die IBM1 in die 15 ml konischen Röhrchen mit Gewebehomogenat.
  13. Spin der konischen 15 ml-Röhrchen bei 700 g für 10 min bei 4 ° C. Gießen Sie vorsichtig den Überstand in ein Glas mit hoher Festigkeit Zentrifugenröhrchen und entsorgen Sie das Pellet.
  14. Spin der Überstand aus dem obigen Schritt bei 8.000 × g für 10 min bei 4 ° C.
  15. Entfernen Sie den Überstand und IBM1 resuspendieren Sie das Pellet durch langsame Zugabe von 500 ul IBM2. Schnitt das Ende einer Pipettenspitze und schonend homogenisiert das Pellet in IBM2 mit Mischen und Rühren von Bewegungen. Fügen Sie ein weiteres 4,5 ml IBM2 zu der Mischung, nachdem das Pellet vollständig aufgehängt ist.
    Hinweis: Vermeiden Sie übermäßige Verreiben, während brechen größere Pellet Stücke tsein kann die Mitochondrienmembranen beschädigen.
  16. Spin der IBM2 / Gewebehomogenisat bei 8.000 × g für 10 min bei 4 ° C.
    Hinweis: Dieser Schritt kann in einem sauberen hohe Festigkeit Zentrifugenröhrchen für eine genauere Quantifizierung der Protein isolierten Mitochondrien in Schritt 4, da Rest BSA wiederholen kann, um den Gesamtproteingehalt beiträgt.
  17. Entfernen Sie den Überstand und sanft, aber vollständig resuspendieren Sie das Pellet durch Zugabe von zwei 25 & mgr; l-Schritten IBM2 mit einer Pipettenspitze mit der Spitze abgeschnitten. Vorsichtig umrühren und mischen das Pellet nach jeder Zugabe von 25 ul IBM2. Dieses mitochondriale Lager auf Eis.

3. Homogenisierung Whole Gewebelysat (Zeit: ~ 45 min; kann getan werden während Schritt 7)

  1. Entfernen Sie den Muskel aus, dass in den flüssigen Stickstoff aus dem Schritt 2.3 gelegt und bei Raumtemperatur, bis sie vollständig aufgetaut.
  2. Hackfleisch das Gewebe für ~ 30 sec auf Eis mit feiner Spitze Schere.
  3. Fügen Sie zwei 100 ul Kugeln Zirconium-Perlen mit dem 1,5-ml-Mikrozentrifugenröhrchen mit Schraubverschluss aus Schritt 3.2, die das zerkleinerte Gewebe enthält. Homogenisieren des Gewebes in einer Perlmühle Gewebehomogenisator mit zwei, um drei 5-Minuten-Zyklen bei einer Geschwindigkeitseinstellung von 4-6 (mittlere Einstellung).
  4. Spin der Mischung aus Schritt 3.3 bei 12.000 × g für 10 min bei 4 ° C. Entfernen Sie den Überstand mit einer 1.000 ul Pipettenspitze nach dem Spin und Transfer in ein 1,5 ml Mikrozentrifugenröhrchen. Entsorgen Sie das Pellet und platzieren Sie den Überstand auf Eis.

4. Proteinbestimmung (Zeit: ~ 30 min)

  1. Bestimmung der Proteinkonzentration des gesamten Gewebelysat (Schritt 3.4) und mitochondriale Lager (Schritt 2.17) unter Verwendung des BCA-Protein-Assay-Kit nach den Angaben des Herstellers.

5. Mitochondrien Membranintegrität; Citratsynthase (CS) Activity (Zeit: ~ 15 min)

  1. Machen Sie zwei 1: 20-Verdünnungen der mitochondrialen Lager in hochreinem Wasser. Hinzufügen0,1% Triton X-100 zu einer Probe und beschallen es bei einer niedrigen Einstellung (765 Watts, Amplitude 2). Lassen Sie die anderen Verdünnung auf Eis. Bringen Sie die Probe auf Eis nach der Beschallung.
  2. Führen Citratsynthase Assay sowohl die nicht-beschallte und beschallt mitochondrialen Verdünnungen mit einem spektrophotometrischen Test, wie zuvor beschrieben 11,12.
  3. Bestimmen Sie den Prozentsatz der intakten Mitochondrien-Membranen unter Verwendung der folgenden Gleichungen:
    (Non-beschallt CS Aktivität ÷ beschallt CS-Aktivität) * 100


100- N (Prozent von oben erreicht)

6. Mitochondrien Isolation Qualität; Western Blot (Zeit: Nach Lab Protocol)

  1. Zuführen Western Blot auf die gesamte Gewebelysat und isolierte Mitochondrien, wie zuvor beschrieben 12.
    Anmerkung: Die Verwendung Primärantikörper für GAPDH (1: 1.000 Verdünnung in 5% BSA / TBS-T) und COXIV (1: 1.000 Verdünnung in 5% fettMilch / TBS-T), gefolgt von anti-Ziege und Kaninchen-Sekundärantikörper, die jeweils (1: 10.000).

7. Respirometrische Testlauf (Zeit: ~ 90 min)

  1. Führen Sie gewünschte respirometrischen Tests unter Verwendung von Mikroplatten-basierten O 2 Verbrauchsmesstechnik, wie zuvor beschrieben (siehe Begleitartikel und Rogers et al 8).
  2. Bestimmen Sie die Atemkontrollverhältnis (RCR) durch Division State 3 durch staatliche 4o (RCR) oder Division Staat 3U durch staatliche 4o. Verwenden Sie entweder die mittlere (durchschnittliche) Punkt oder die höchste (State 3) und die niedrigsten Preise (State 4o) von den Punkt-zu-Punkt-Spuren bei der Ermittlung RCR.

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Ergebnisse

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Citrat-Synthase-Aktivität als Maß für die Unversehrtheit der Membran, da Citratsynthase ist in der inneren Mitochondrienmembran, und sollte daher nicht in Suspensionen von Mitochondrien mit intakten Membranen vorliegen. 1 stellt Citrat-Synthase-Aktivität in nicht-beschallten mitochondrialen Proben verglichen, die mit beschallter Proben aus der gleichen Isolation. Beschallen der Mitochondrien führt zu einem statistisch signifikanten Anstieg der Citrat-Synthase-Aktivität (P <0,01). Wichtig ist, dass 92...

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Diskussion

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Die hier vorgestellten Methoden liefern eine detaillierte Beschreibung eines mitochondrialen Isolierungsverfahren von minimalen Mengen (~ 75-100 mg) von Maus-Skelettmuskel. Dieses Isolierungsverfahren ist in der Lage, High-Functioning, reine Mitochondrien (~ 450 & mgr; g) zu ergeben, wie durch O 2 Verbrauchsraten, RCR-Werte, Maximal Citrat-Synthase-Aktivität und Proteinexpression von Immunoblotting nachgewiesen. Wichtig ist, dass die Mitochondrien von diesem Verfahren getrennt für mehrere respirometirc As...

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Offenlegungen

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George Rogers ist ein Mitarbeiter von Seahorse Bioscience, die das Instrument herstellen, für das dieses Protokoll modifiziert wurde.

Danksagungen

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Das Fralin Life Science Research Institute und das Metabolic Phenotyping Core an der Virginia Tech unterstützten diese Arbeit.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Im Wesentlichen FettSigma AldrichA6003N/A
Säurefrei - BSA
Tris/HClPromegaH5123N/A
KCLSigma AldrichP9541N/A
Tris BasePromegaH5135N/A
EDTASigma AldrichE6511N/A
EGTASigma AldrichE4378N/A
SaccharoseSigma AldrichS7903N/A
D-MannitolSigma Aldrich63559N/A
Trypsin-EDTA (0,25%), PhenolrotThermo Scientific25200-056N/A
Natriumchlorid
weiße Kristalle oder kristallines Pulver
≥ 99,0 %
Fisher ScientificBP3581N/A
NatriumdodecylsulfatSigma AldrichL3771 N/A
NatriumdesoxycholatSigma AldrichD6750 N/A
Polyoxyethylen (12)-nonylphenylether, verzweigtSigma Aldrich238651N/A
Single Edge RasierklingenFisher Scientific12-640N/A
Falcon- 100 uM Nylon ZellsiebeFisher Scientific352360N/A
Halt Protease & Phosphatinhibitor CocktailThermo Scientific1861284N/A
1,5 ml Mikrozentrifugenröhrchen mit SchraubverschlussThermo Scientific3474N/A
ZirkonoxidkügelchenFisher ScientificC9012112N/A
GAPDH Antikörper (1D4)Santa Cruz Biotechnologysc-59540N/A
Anti-COXIV AntikörperZellsignalisierung4844sJedes mitochondriale innere Membranprotein reicht
Peroxidase konjugiert affinipure Esel, Anti Kaninchen IgG (H+L)Jackson ImmunoResearh711-035-152N/A
Peroxidase konjugiert affinipure Ziege, Anti Maus IgG (H+L)Jackson ImmunoResearh115-001-003N/A
Triton-X100Sigma AldrichX100N/A
Pierce BCA Protein Assay Kit Thermo Scientific23225N/A
Brenztraubensäure, 98%Sigma Aldrich107360Bei 4 Grad lagern; C, pH bis 7,4 mit KOH vor der Verwendung im respirometrischen Assay
BernsteinsäureSigma AldrichS9512Bei Raumtemperatur, pH bis 7,4 mit KOH vor der Verwendung im respirometrischen Assay
lagern L(-) Apfelsäure, BioXtra, ≥ 95%Sigma AldrichM6413bei Raumtemperatur, auf 7,4 mit KOH vor der Verwendung in respirometrischen Assays
L-GlutaminsäureSigma AldrichG1251Lagerung bei Raumtemperatur, auf 7,4 mit KOH vor der Verwendung in respirometrischen Assays, auf 7,4 mit KOH vor der Verwendung in respirometrischen Assays
Palmitoyl L-CarnitinchloridSigma AldrichP1645Lagerung bei -20 °C
Oligomycin A, ≥ 95% (HPLC)Sigma Aldrich75351Bei -20 > lagern C
Carbonylcyanid 4-(trifluormethoxy)Sigma AldrichC2920Bei 2-8 μg lagern; C
Phenylhydrazon
≥ 98% (DC), Pulver [FCCP]
Antimycin A aus Streptomyces sp.Sigma AldrichA8674Store at -20 ° C
Adenosin 5′-diphosphat monopotassium salt dehydrate [ADP]Sigma AldrichA5285Bei -20 μg lagern; C, auf 7,4 mit KOH vor der Verwendung im respirometrischen Assay
RotenonSigma AldrichR8875Bei Raumtemperatur lagern
aus Lagerung

Referenzen

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  1. Brand, M., Nicholls, D. Assessing mitochondrial dysfunction in cells. Biochem. J. 435, 297-312 (2011).
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  10. Will, Y., Hynes, J., Ogurtsov, V. I., Papkovsky, D. B. Analysis of mitochondrial function using phosphorescent oxygen-sensitive probes. Nat. Protoc. 1, 2563-2572 (2007).
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MitochondrienisolationMikroplatten RespirometrieCitrat Synthase AssayWestern Blot AnalyseGewebehomogenisierungdifferenzielle Zentrifugationmitochondriale Reinheitrespiratorisches Kontrollverh ltnisHochdurchsatz Screening

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