Auftreten von Zellen unmittelbar nach der Beschichtung und nach der Aggregation
Unmittelbar nach der Beschichtung kann man die Anwesenheit von einzelnen Zellen in jeder Vertiefung der Platte mit 96 Vertiefungen mit einer Standard invertiert Gewebekulturmikroskop (1B) zu beobachten. Innerhalb von 8 h von Plattieren, werden diese Zellen begonnen, zu dem Boden des Bohrlochs durch die Schwerkraft hinab haben und begonnen haben, in diskrete Cluster (1C) koaleszieren. Nach 24 Stunden werden die Zellen, die das Koaleszieren primären Aggregation abgeschlossen haben, und werden in gut definierte, aber zackig Aggregate, wo einzelne Zellen undeutlich von einander (1D) sind verdichtet haben. Bis zum Ende des zweiten Tages (48 Stunden), müssen die Aggregate sauber aussieht, nachdem aller Zellen innerhalb des Bohrlochs (1E) ist; der Boden der Vertiefung kann einige Zellen, die aus dem Aggregat zu diesem Zeitpunkt vergossen worden sind, haben. Providingdass die Aggregate in N2B27 aggregiert worden ist, zu diesem Zeitpunkt Punkt sie kugelförmig sein sollten, etwa 150-200 um im Durchmesser und frei beweglich innerhalb des Bohrlochs (dh., nicht mit dem Boden der Vertiefungen haftet). Aggregation in anderen Medien (dh., ESLIF oder N2B27 mit bestimmten Faktoren) hat das Potential, sowohl die ursprüngliche Gesamtmorphologie und das Ansprechen auf die folgende Stimuli zu verändern (Turner et al., In Vorbereitung).
Repräsentative morphologische Veränderungen
Zugabe einer 24-Stunden-Impuls von Sekundärmedium, das Chi zwischen 48 und 72 h (1A, 5A) erzeugt genau definierte längliche Aggregate, die polarisierte Expression in spezifischen Marker der Keimblätter 19,21 zeigen. Unmittelbar nach der Chi-Impuls (72 h), werden die Aggregate beginnen, um Zellen zu vergießen und zu starten, um ihre Reaktion auf diese Signale zum Ende des heutigen Tages (3A) zu zeigen. Diese Antwortenwerden durch Änderungen in der Genexpression und Morphologie, die beide in Abhängigkeit von der Behandlung, die die Aggregate nach dem anfänglichen 48 Stunden Aggregation Periode N2B27 (3B) empfangen werden manifestiert. Wenn nur ein Endpunkt-Analyse erforderlich ist, ist die optimale Zeit, um Bild die Aggregate bei etwa 96 bis 120 Stunden. An dieser Stelle werden die Aggregate wird klar, Morphologien und Genexpressionsmuster (3A) entwickelt haben, und ihre Größe und Masse sind immer noch niedrig genug, so dass Ausstoß von Medium aus P200 Pipette ist ausreichend, um alle, die angeschlossen haben können lösen. Versagen der Befestigung des Aggregats zum gut verhindert beeinträchtigen Aggregatbildung (Abbildung 5Biv). Die Morphologien und Genexpressionsmuster der Aggregate in Abhängigkeit von der Behandlung geändert werden. Repräsentative Ergebnisse für anhaltende oder gepulste Regime entweder einzelne Behandlung oder Kombinationen von Faktoren für BMP4, Dorsomorphin H1 (B gezeigt,MP-Rezeptor-Inhibitor), ActivinA, SB43 (Activin / Nodal-Inhibitor), bFGF oder PD03 (MEK-Inhibitor) (3B).
Aggregate Imaging und quantitativer Bildanalyse
Aggregate sind zugänglich für Bildgebung von beiden Weitfeldmikroskopie (hauptsächlich für Zeitraffer-Bildgebung 19) oder fixiert und für die konfokale Abbildung 19,21 (Abbildung 2) immungefärbt. Das aktuelle Protokoll und Abbildungsbeschreibung oben ermöglicht quantitative Informationen aus diesen Aggregaten gewonnen werden. Folgende konfokalen oder Weitfeldbildaufnahme, wobei die Länge und die entsprechende Gen-Expression entlang des Durchmessers oder der Wirbelsäule des Aggregats (sphärisch oder länglich sind; 4A, B) gemessen werden kann. Diese Analysen sind auch direkt auf Zeitraffer-Bilder, wo man Daten von der Wachstumsrate, Größe und Dehnung der Aggregate unter verschiedenen Bedingungen zu erhalten (Abbildung 4 ).

Abbildung 1. Typische Zeitverlauf und Anfang Morphologien. (A) Der typische Zeitverlauf für die Aggregation Experimenten. Zellen werden für 48 h in N2B27 Unmittelbar nach dem Ausplattieren (t = ~ 5 min) zusammengefasst, die eine Suspension von Maus-ES-Zellen (10 Zellen / ul) in einer 96-Well-Platte (p1, p2). (B), einzelne Zellen sein können in der Suspension gesehen, und haben damit begonnen, um Klumpen von 8h (C). (D) Nach 24 h bilden die Zellen eine einzige Sammel in jeder Vertiefung, die ungefähr 100 um Durchmesser gebildet wird. (E) Nach 48 Stunden Aggregation, die Aggregat Durchmesserbereiche von 150 bis 200 & mgr; m. An diesem Punkt ist die Aggregation Medium (N2B27) entfernt und ein Sekundärmedium wird entweder für den Rest des Experiments (p1 in Teil A) oder 24 Stunden lang, bevor sie verändert b hinzugefügtACK N2B27 (p2 in Teil A). Maßstabsbalken entspricht 100 & mgr; m. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 2. Montage Aggregate auf Objektträger. Sobald die Aggregate wurden behoben, immungefärbt und in Montagemedium platziert wird jedes Aggregat auf einen Objektträger als 17 & mgr; l Tröpfchen pipettiert (A, B, B '). Ausreichend Platz zwischen den aggregierten Tröpfchen ihre Verschmelzung zu verhindern gelassen. Abstandshalter werden mit doppelseitigem Klebeband hergestellt und an jeder Ecke des Objektträgers (A, A ', B) angeordnet sind. Es ist auf diese, die ein Deckglas gelegt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 3: Der Effekt von verschiedenen Behandlungen auf die Morphologie der aggregierten ES-Zellen. Nach 2 Tagen in N2B27 wurden ES-Zellen Aggregate gebildet. Zugabe spezieller Faktoren entweder als 1 Tag Impuls (A) oder kontinuierlich (B) kann der Phänotyp der Aggregate im Hinblick auf die Polarität der Genexpression Dehnungspotential oder ihre Gesamtform zu verändern. Die Beispiele in dieser Figur sind Aggregate entweder von Bra gebildet :: GFP 30 (A) oder SOX1 :: GFP 27 (B) Maus-ES-Zellen nach 120 h belichtet und behandelt wie angegeben. Chi: CHIR 99021 31; SB43: SB 431542 32; DM: DorsomorphinH1 33,34; PD03:. PD0325901 Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version zu sehen thist Figur.

Abbildung 4. Die quantitative Analyse der Aggregate. Ein typisches Aggregat von Bra gebildet :: GFP mESCs 25,30 nach einer 24-Stunden-Puls des Chi und bei 120 h abgebildet. Fusionsbild des Hellfeld-und GFP-Kanal wird mit segmentierten Linie markiert den 'Rückgrat' des Aggregats von Punkt A nach B (A), entlang der die Fluoreszenz und die Länge des Aggregats gemessen werden kann (B) dargestellt ist. Die Länge (C) und "Rundheit" (D) von 24 Aggregaten innerhalb des gleichen Experiments sind dargestellt. Formdeskriptoren wie der Rundheit (D), Kreisförmigkeit, der Umfang und die Fläche kann mit Hilfe der Bildanalyse Koch Plugin von der Bildanalyse-Software FIJI 35 gemessen werden. Bedeuten, durch horizontale Linie bei jedem Zeitpunkt angegeben;Fehlerbalken zeigen die Standardabweichung; Maßstabsleiste in (A) zeigt an, 200 um. So gibt es feine Unterschiede zwischen Reporterzellinien, wird erwartet, dass nach einem Impuls von Chi, die durchschnittliche maximale Länge und die durchschnittliche Mindestrundheit der Aggregate variiert. Zwischen verschiedenen Zelllinien, so finden wir, dass die durchschnittliche maximale Länge kann im Bereich von ~ 400-800 & mgr; m und die durchschnittliche Mindestrundheit zwischen 0,4 und 0,6 sein. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 5. Beispiele für Misserfolge in Aggregatbildung. Die Fähigkeit, reproduzierbare Aggregate (A) zu erzeugen, hängt davon ab, kritische Faktoren wie (Bi) frisch und gut gemischt Sekundärmedium, (Bii, Biii) die Genauigkeit beim Zählen der ersten nUmbra von Zellen und (Biv) Gewährleistung der Aggregate bilden keine adhärenten Kolonien, dh., "Crash" in die Oberfläche des Brunnens. Typische Beispiele für die Fehler in der Aggregatbildung für jede der genannten Bedingungen (B) gezeigt. Scale-bar, wie angegeben; siehe Fehlersuche Tabelle für Details (Tabelle 1). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Tabelle 1 Leitfaden zur Fehlersuche. Typische Fehler bei der Aggregation Protokoll zugeordnet sind Vorschläge, deren Lösung gegeben.

Tabelle 2 Tabelle der getesteten Zelllinien für die Bildung von aggRegates. Eine Anzahl von Zellinien 19,22,27,30,36-40 für die Bildung von Aggregaten und charakterisiert worden, obwohl kleine Unterschiede zwischen Zelllinien werden erwartet und beobachtet wurden, die alle die obigen Zeilen zeigen ähnliche Dynamik bei Dehnung und Morphologie. In Bezug auf die Genexpression ist das Expressionsmuster spezifisch für das Gen exprimiert wird, aber innerhalb der einzelnen Zelllinie ist das Expressionsmuster im Allgemeinen über eine Anzahl von Passagen konsistent. Aus Gründen der Konsistenz erzeugen wir Aggregate von Zellen, die nicht 15 Passagen in Kultur überschritten haben.

Tabelle 3. Liste der repräsentativen Antikörpern in diesen Studien verwendet. Eine Auswahl der Antikörper und der Verdünnungsfaktoren für aggregierte Immunfärbung verwendet.