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Das okulomotorische System umfasst eine große Anzahl von Gehirnbereichen, einschließlich Teilen der Basalganglien, und verschiedene neurodegenerative Erkrankungen wie Parkinson und Huntington können es stören. Menschen mit Parkinson neigen zum Beispiel zu erhöhten sakkadischen Latenzen. Daher hat die quantitative Messung sakkadischer Augenbewegungen als potenzieller Biomarker für neurodegenerative Erkrankungen große Aufmerksamkeit erhalten. Man kann viel mehr über das Gehirn sowohl bei Gesundheit als auch bei Krankheit lernen, wenn man beobachtet, was mit den Augenbewegungen passiert, wenn die Funktion bestimmter Hirnareale gestört ist. Die Tiefe Hirnstimulation ist ein chirurgischer Eingriff zur Behandlung einer Reihe von neurologischen Erkrankungen, einschließlich der Parkinson-Krankheit, bei dem Stimulationselektroden in bestimmten Gehirnbereichen, einschließlich mehrerer Stellen in den Basalganglien, platziert werden. Mit aus- und eingeschalteten Stimulatorsystemen können dann Augenbewegungsmessungen durchgeführt und die Ergebnisse verglichen werden. Bei geeignetem Versuchsdesign kann dieser Ansatz verwendet werden, um die Pathophysiologie der zu behandelnden Krankheit, den Mechanismus, durch den die THS ihre positiven Wirkungen ausübt, und sogar Aspekte der normalen Neurophysiologie zu untersuchen.