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Methodenartikel

Anwendungen von pHluorin für Quantitative, Kinetic und Hochdurchsatz-Analyse von Endozytose in Bäckerhefe

10K Aufrufe

DOI:

10.3791/54587

23. Oktober 2016

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Eine genaue Quantifizierung vesikulärer Transportereignisse liefert oft wichtige Einblicke in die Rolle bestimmter Proteine und die Auswirkungen von Mutationen. In diesem Artikel werden Methoden zur Verwendung von superekliptikem pHluorin, einer pH-sensitiven GFP-Variante, als Werkzeug zur Quantifizierung endozytärer Ereignisse in lebenden Zellen mittels quantitativer Fluoreszenzmikroskopie und Durchflusszytometrie vorgestellt.

Zusammenfassung

Das grün fluoreszierende Protein (GFP) und seine Varianten sind Werkzeuge zur Untersuchung von Proteinlokalisierung und Dynamik von Ereignissen wie Zytoskelett-Umbau und Vesikeltransport in lebenden Zellen weit verbreitet. Quantitative Methoden unter Verwendung von chimären GFP-Fusionen wurden für viele Anwendungen entwickelt; jedoch GFP ist etwas resistent gegen Proteolyse, wodurch seine Fluoreszenz bleibt im Lysosom / Vakuole, die Quantifizierung von Frachthandels in der endocytischen behindern können. Ein alternatives Verfahren zur Quantifizierung Endozytose und post-endocytic Handel Ereignisse nutzt superecliptic pHluorin, eine pH-sensitive Variante von GFP, die in sauren Umgebungen abgeschreckt wird. Chimäre Fusion von pHluorin zum Zytoplasmaschwanz von Transfracht-Proteine ​​führt zu einer Dämpfung der Fluoreszenz bei der Gründung der Ladung in multivesicular Körper (MVBs) und Auslieferung an die Lysosomen / Vakuole Lumen. Somit Löschung der Vakuole Fluoreszenz erleichtert quantifiKation der Endozytose und der frühen Ereignisse im endocytischen. Dieses Papier beschreibt Methoden pHluorin-markierte Frachten für die Quantifizierung der Endozytose über Fluoreszenzmikroskopie sowie populationsbasierten Assays Durchflusszytometrie verwendet wird.

Einleitung

Vesikeltransport spielt eine wichtige Rolle Organell Identität und Funktion in eukaryontischen Zellen beibehalten wird, und ist ein Schlüsselmechanismus Protein und Membranzusammensetzung der einzelnen zellulären Kompartimenten zur Regulierung. An der Plasmamembran, Fusion von Vesikeln Exozytose liefert neue Proteine ​​und Membranen auf der Oberfläche der Zelle, während die erzeugten Bläschen durch Endozytose Membran und Proteine ​​von der Oberfläche zum Lysosom zur anschließenden Wiederverwertung oder Targeting entfernen. Somit ist Endozytose wichtig für die Nährstoffaufnahme und für Reaktionen auf die extrazelluläre Umgebung. Exozytose und Endozytose werden ausgewo....

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Protokoll

1. Lösungen und Medien

  1. Bereiten Sie die folgenden Aktien, Medien und Platten:
    1. Zur Vorbereitung 10x YNB, lösen sich 67 g Hefe-Stickstoffbasis Aminosäuren in 1 l Wasser fehlt. Sterilisieren durch Filtration durch ein 0,22 um-Nitrocellulosefilter.
    2. Bereiten Sie YNB-Medium mit 1x YNB (von 10fach) mit 2% Dextrose (aus einer sterilen 50% w / v Lager) und 1x Aminosäure / Nährstoffmischung (von 100x Lager, siehe Schritt 1.1.4). Für Plasmid-Selektion, lassen Sie einzelne Aminosäuren oder Nährstoffe nach Bedarf. Zur Induktion der Expression MUP1 zusätzlich Methionin aus der Aminosäure / Nährstoffmischung auszulassen.
    3. Bereiten Sie YNB-Plat....

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Ergebnisse

Steady-State - Lokalisierung und Quantifizierung des konstitutiv internalisiert endocytic Fracht Protein STE3

Um zu demonstrieren, dass pHluorin-tagged cargos kann zur Quantifizierung von Endozytose in lebenden Zellen, Lokalisierung von chimären GFP und pHluorin Fusionen mit der zytoplasmatischen C-terminalen Schwanz von STE3 verwendet werden, die a-Faktor-Pheromon-Rezeptor in Hefe, wurden ver.......

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Diskussion

Anwendungen von pHluorin zur Quantifizierung von endocytischen Ereignisse in Hefezellen macht von Transmembran- cargos in der die fluoreszierende Markierung an den zytoplasmatischen Schwanz des Proteins (1A) fusioniert ist. Für die Tests hier beschriebenen Frachten sind hell fluoreszierende, wenn die pHluorin Tag neutralen Umgebungen ausgesetzt ist, aber abgeschreckt werden, wenn die pHluorin Tag sauren Bedingungen trifft. So a pHluorin-markierte endocytic Ladung leicht an der zytoplasmatischen Gesicht .......

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Offenlegungen

Die Autoren erklären, dass keine konkurrierenden Interessen bestehen.

Danksagungen

Wir danken Gero Miesenböck und Tim Ryan für das Teilen von pHluorin cDNA, die zur Erzeugung von Reagenzien in dieser Studie verwendet wurde, Nathan Wright, Joanna Poprawski und Lydia Nyasae für die hervorragende technische Unterstützung, Mitgliedern des Wendland-Labors für hilfreiche Diskussionen und Michael McCaffery und Erin Pryce vom Integrated Imaging Center (Johns Hopkins) für Ratschläge und Unterstützung bei der Mikroskopie und Durchflusszytometrie. Diese Arbeit wurde durch Zuschüsse der National Institutes of Health (an B.W., GM60979) und der National Science Foundation (an B.W., MCB 1024818) unterstützt. K.W. wurde teilweise durch ein Ausbildungsstipendium der....

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
AdeninSigmaA8626-25GZur Herstellung von Aminosäuregemischen und Stammlösungen
Bacto-AgarFisherBP1423-2Zur Herstellung von Plattenmedien
BD Difco Hefe Stickstoffbase (ohne Aminosäuren)BD291920Zur Herstellung von flüssigen und Plattenmedien
Concanavalin ASigmaC5275-5MGZur Beschichtung der Kammer Objektträger
DextroseFisherBP350-1Verwendung zur Herstellung von flüssigen und plattenförmigen Medien
L-HistidinFisherBP382-100Verwendung zur Herstellung von Aminosäuremischung und Stammlösung
L-LeucinAcros125121000Verwendung zur Herstellung von Aminosäuremischung und Stammlösung
L-LysinFisherBP386-100Zur Herstellung einer Aminosäuremischung und einer Stammlösung
verwenden L-MethioninFisherBP388-100Zur Herstellung einer Aminosäuremischung und einer Stammlösung
verwenden L-TryptophanFisherBP395-100Zur Herstellung einer Aminosäuremischung und einer Stammlösung
verwenden L-TyrosinAcros140641000Zur Herstellung einer Aminosäuremischung
verwenden Nunc Lab-Tek Kammeriges Deckglas ( 8-Well)Thermo Scientific155411Zur Verwendung für kinetische und Endpunkt-Assays zur Mup1-pHluorin-Internalisierung
UracilSigmaU0750-100GZur Herstellung einer Aminosäuremischung und einer Stammlösung
Axiovert 200 Inverses MikroskopCarl ZeissCustom Build
100X/1.4 Plan-Apochromat Oil Immersion Objective LensZeissObjektiv sollte 100X betragen, 1,4 NA oder höher
SensicamCooke Corporationsollte einen Dynamikbereich von 12 Bit oder höher haben
X-Cite 120PC Q BeleuchtungsquelleExcelitas Technologies
Slidebook 5 SoftwareIntelligent Imaging Innovations
ImageJ SoftwareNational Institutes of Healthhttp://imagej.nih.gov/ij/
Carl Die Kamera der

Referenzen

  1. Kaksonen, M., Sun, Y., Drubin, D. G. A pathway for association of receptors, adaptors, and actin during endocytic internalization. Cell. 115 (4), 475-487 (2003).
  2. Kaksonen, M., Toret, C. P., Drubin, D. G. A modular design for the clathrin- and actin-mediated endo....

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

FluoreszenzmikroskopieDurchflusszytometrieHefezellenvesikul rer TransportGFP FusionMethionin BehandlungTime Lapse ImagingFluoreszenzquantifizierung