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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier beschreiben wir einen kompletten Workflow für die qualitative und quantitative Analyse von immun Synapsen zwischen primären menschlichen T-Zellen und Antigen-präsentierenden Zellen. Die Methode basiert auf bildgebende Durchflusszytometrie, ermöglicht die Erfassung und Auswertung von mehreren tausend Zelle Bildern innerhalb relativ kurzer Zeit.
Die immun Synapse ist der Bereich der Kommunikation zwischen T-Zellen und Antigen-präsentierenden Zellen (APCs). T-Zellen zu polarisieren Oberfläche Rezeptoren und Proteine in Richtung der immun Synapse zu sichern eine stabile Bindung und Austausch zu signalisieren. Klassischen konfokale, TIRF oder Super-Auflösung Mikroskopie verwendet wurden, um die immun Synapse zu studieren. Da diese Methoden manuelle Bilderfassung und zeitraubende Quantifizierung benötigen, ist die Darstellung der seltenen Ereignisse herausfordernd. Hier beschreiben wir einen Workflow, der die morphologische Analyse von Zehntausenden von Zellen ermöglicht. Als APCs sind immun Synapsen zwischen primären menschlichen T-Zellen bei Pan-Leukozyten Vorbereitungen und Staphylococcus Aureus Enterotoxin B SEB geladen Raji Zellen induziert. Bildaufnahme erfolgt mit bildgebenden Durchflusszytometrie, auch genannt In Flow-Mikroskopie, die Eigenschaften von einem Durchflusszytometer und ein Fluoreszenzmikroskop kombiniert. Eine komplette gating Strategie für T-Zell/APC Paare zu identifizieren und zu analysieren die immun Synapsen steht zur Verfügung. Da dieser Workflow ermöglicht die Analyse der immunen Synapsen bei ungereinigten Pan-Leukozyten Vorbereitungen und somit erfordert nur eine kleine Menge Blut (d.h., 1 mL), um Proben von Patienten angewendet werden. Wichtig ist, können parallel mehrere Proben vorbereitet, gemessen, und analysiert werden.
T-Zellen sind wichtige Regulatoren des adaptiven Immunsystems und Aktivierung durch Antigene Peptide, die im Zusammenhang mit der großen Histocompatibility komplexe (MHC) dargestellt werden. Vollständige T-Zell-Aktivierung erfordert zwei Signale, die Kompetenz-Signal über die Antigen-spezifische T-Zell-Rezeptor (TCR) / CD3-komplex und das costimulatory Signal über Zubehör-Rezeptoren. Beide Signale entstehen durch die direkte Interaktion der T-Zellen mit Antigen-präsentierenden Zellen (APCs). Reife APCs bieten das Kompetenz-Signal für die T-Zell-Aktivierung durch MHC-Peptid-komplexe, und sie drücken costimulatory Liganden (z. B., CD80 und CD86) um das Fortschreiten der T-Zell-Aktivierung-1zu gewährleisten. Eine wichtige Aufgabe der Costimulation ist die Umstellung von Aktin Cytoskelett2,3,4. Die kortikalen F-Aktin ist relativ statisch im ruhenden T-Zellen. T-Zell-Stimulation durch Antigen-Lager APCs führt zu eine tiefgreifende Neuordnung des Aktin-Zytoskeletts. Aktin Dynamik (d. h., schnell Aktin Polymerisation/Depolymerisation Kreise) ermöglichen die T-Zellen, Kräfte zu schaffen, die verwendet werden, um Proteine oder Organellen, zum Beispiel zu transportieren. Darüber hinaus ist das Aktin-Zytoskelett wichtig für die Entwicklung einer spezielle Kontaktzone zwischen T-Zellen und APCs, immun Synapse genannt. Aufgrund der Bedeutung des Aktin-Zytoskeletts zur immun Synapse ist es entscheidend für die Entwicklung von Methoden zur Quantifizierung von Veränderungen in der Aktin-Zytoskelett T Zellen5,6,7,8 geworden. , 9.
Durch Aktin-Zytoskeletts Hilfe werden Oberflächen Rezeptoren und Signalproteine in supramolekularen Aktivierung Clustern (SMACs) innerhalb der immun Synapse getrennt. Die Stabilität der immun Synapse ist durch die Bindung von Rezeptoren zu F-Actin-Bündel gewährleistet, die die Elastizität des Aktin-Zytoskeletts zu erhöhen. Immun Synapse Bildung hat sich gezeigt, für die Generation der adaptiven Immunantwort kritisch zu sein. Die nachteiligen Auswirkungen einer fehlerhaften immun Synapse-Formation in-vivo wurden zuerst bei Patienten aus Wiskott Aldrich Syndrom (WAS), eine Krankheit, bei welcher Aktin-Polymerisation realisiert und begleitend sind immun Synapse Bildung gestört10 . WAR, dass Patienten leiden können Ekzeme, schweren rezidivierenden Infekten, Autoimmunerkrankungen und Melanome. Trotz dieser Feststellung ist derzeit nicht bekannt, ob immun Synapse Bildung unterscheidet sich in den T-Zellen von gesunden Probanden und Patienten immun Mängel oder Autoimmunerkrankungen leiden.
Höchstauflösung Mikroskopie, Fluoreszenz-Mikroskopie, konfokale einschließlich und TIRF wurden verwendet, um die Architektur der immun Synapse11,12,13,14aufzudecken. Die hohe Auflösung dieser Systeme und die Möglichkeit der Durchführung live Cell Imaging ermöglicht die Sammlung von exakten, räumlich-zeitliche Informationen über dem Aktin-Zytoskelett und Oberfläche oder intrazelluläre Proteine in der immun Synapse. Viele Ergebnisse basieren jedoch auf der Analyse von nur ein paar Dutzend T-Zellen. Darüber hinaus müssen die T-Zellen für diese Art von Fluoreszenzmikroskopie gereinigt werden. Für viele Fragestellungen ist jedoch die Verwendung von ungereinigten Zellen anstatt die höchstmögliche Auflösung von größter Bedeutung. Dies ist relevant, wenn T-Zellen von Patienten analysiert werden, da die Menge des gespendeten Blutes begrenzt ist und möglicherweise die Notwendigkeit, viele Proben parallel zu verarbeiten.
Wir haben mikroskopische Methoden, mit denen die Analyse des Aktin-Zytoskeletts in der immun Synapse im menschlichen System15,16,17. Diese Methoden basieren auf imaging Durchflusszytometrie, auch genannt In Flow-Mikroskopie-18. Als Hybrid zwischen multispektralen Flow-Zytometrie und Fluoreszenz-Mikroskopie, Durchflusszytometrie imaging hat seine Stärken in der Analyse morphologischen Parametern und Protein-Lokalisierung in heterogenen Zellpopulationen wie Pan-Leukozyten aus der peripheren Blut. Wir haben eine Methode, die ermöglicht, F-Aktin in T-Zelle/APC Konjugate von menschlichen T-Zellen aus Vollblut Proben, ohne Zeit- und kostenintensive Reinigung Schritte17quantifizieren eingeführt. Die hier vorgestellten Technik umfasst den gesamten Workflow, davor die Blutprobe auf die Quantifizierung der F-Aktin in der immun Synapse.
1. Vorbereitung des Pan-Leukozyten
2. Laden der Raji Zellen mit SEB
(3) Induktion von immun Synapsen und Färbeprotokoll
4. mit einem Durchflusszytometer Bildaufnahme
Hinweis: Das folgende Bild Erwerb Verfahren und Datenanalyse basieren auf imaging Durchflusszytometrie mit einer Software wie Imagestream (IS100), INSPIRE und Ideen. Jedoch kann auch andere fließen Cytometers und Analyse-Software verwendet werden.
(5) Datenanalyse
Ein wesentliches Ziel des hier beschriebenen Verfahrens ist die Quantifizierung der Proteinanreicherung (z. B., F-Aktin) in der immun Synapse zwischen surrogate APCs (Raji Zellen) und T-Zellen im ungereinigten Pan-Leukozyten niedrig-Volumen (1 mL) menschlichen Blutproben entnommen. Der Screenshot in Abbildung 1 gibt einen Überblick über die kritischen gating Strategie dieser Methode. Es zeigt die Bildergalerie auf der linken Seite und die Analyse-Bereich auf der rechten Seite (Abbildung 1). Die Bildergalerie zeigt das Tor "In Focus". Die dargestellten Bilder sind vor allem Granulozyten und zwei T-Zelle/APC-Paare. F-Aktin und CD3 sind in paar Handynummer 30272 bereichert. Die gating-Strategie, die Höhe der Zelle Paare mit derartigen Bereicherung zu quantifizieren ist im Analysebereich dargestellt und wird im Protokoll beschrieben (siehe Schritt 5,8) oder anderswo17,19. Die letzte Dot-Plot im Analysebereich zeigt den Betrag (Prozent Eiweiß) des CD3 (x-Achse) und F-Aktin (y-Achse) in der immun Synapse. Wenn mehr als 30 % des Proteins innerhalb der Maske immun Synapse befand, galt es als Proteinanreicherung immun Synapse-20. Dot Grundstücke mit Anreicherung von Daten verwendet wurden, um eine typische Endergebnis (Abbildung 2A). Die Bilder auf der linken Seite zeigt Beispielbilder der T-Zelle/APC-Konjugate mit geringen Mengen an CD3 und F-Aktin in der immun Synapse, während auf der rechten Seite, T-Zelle/APC-Konjugate mit einer starken Anreicherung von CD3 und F-Aktin dargestellt werden. Die Höhe der CD3 an immun Synapse (Prozent Eiweiß) wird auf der x-Achse gezeichnet, und die Menge der F-Aktin an der immun Synapse ist auf der y-Achse aufgetragen. Der Prozentsatz in das Tor entspricht dem Betrag der T-Zellen, die eine Bereicherung der CD3 und F-Aktin an der immun Synapse in Anwesenheit einer Superantigen haben. In Ermangelung von Superantigen zeigte 15 % Prozent der T-Zellen eine Bereicherung an der immun Synapse CD3 und F-Aktin. Die Anzahl der Zellen erhöht auf 29 % im Beisein von Superantigen. Eine einzelne Quantifizierung der CD3 Bereicherung (Abb. 2 b) oder F-Aktin Bereicherung (Abbildung 2) zeigt die Anwesenheit und Abwesenheit von Superantigen. Diese Ergebnisse zeigen, dass in der Abwesenheit von Superantigen, 18,3 ± 3,5 % und im Beisein von Superantigen, 34,3 ± 4,0 % des Gesamtbetrags F-Aktin in den Zellen an der immun Synapse angesammelt wurden. Interessanterweise gab es bereits CD3 Ansammlung in der Abwesenheit von Superantigen (16,6 ± 2,1 % des Gesamtbetrags CD3), die durch die Zugabe von Superantigen (24,6 ± 3,0 % des Gesamtbetrags CD3) deutlich erhöht wurde. Diese Methode erlaubt die Quantifizierung von wie viel Protein an der immun Synapse zwischen T-Zellen und APCs akkumuliert wird.

Abbildung 1: Strategie zur Identifikation des immun Synapsen im Pan-Leukozyten Vorbereitungen Gating. Die Abbildung zeigt einen Screenshot der Software und enthält einen vollständige Analyse-Workflow für die Bewertung der CD3 und F-Aktin Anreicherung in der immun Synapse von T-Zellen zu APCs im Beisein von SEB konjugiert. Werden die Bilder in der Bildergalerie auf der linken Seite (Ch2 = DAPI; Ch5 = CD3-PETxR; CH6 = Phalloidin AF647; und verschmelzen = kombinierte Bild mit Ch2, Ch5 und Ch6). Die Software bietet eine Anzeige Bildsymbolleiste für Lookup-Tabellen, Maske Display und Farbe/Graustufen-Modus anpassen. Der Rechte Teil der Abbildung zeigt die Analyse-Bereich und Analyse-Symbolleiste. Die Analyse-Bereich enthält Histogramme und Dot Grundstücke wie folgt: 1) Histogramm, Zellen im Fokus nach der gradient RMS Merkmal der DAPI-Färbung zu finden. (2) gating auf T-Zellen nach dem Ausdruck von CD3 (Intensity_MC_Ch05, x-Achse) und die Streuung Seitenprofil (Intensity_MC_Ch01, y-Achse). (3) Herbeirufung auf potenzielle T-Zelle/APC Paare nach dem Seitenverhältnis des DAPI-Fleck (Aspekt ratio_M02, y-Achse) und die Streuung Seitenprofil (Intensity_MC_Ch01, x-Achse). (4) gating auf wahre T-Zelle/APC-Paare nach der Gegend Synapse Maske (x-Achse) und den Bereich der CD3 Fleck (y-Achse). (5) gating auf Reife immun Synapsen definiert durch Anreicherung (> 30 % Proteingehalt in der Schnittstelle) von CD3 (x-Achse) und F-Aktin (y-Achse) in der immun Synapse. Klicken Sie bitte hier, um eine größere Version dieser Figur.<!--

Abbildung 2: Flow Cytometry Bilddaten auf CD3 und F-Aktin Bereicherung in der immun Synapse. (A) den Punkt Grundstücke in der Mitte zeigt den Prozentsatz der CD3 (x-Achse) und F-Aktin (y-Achse) in der immun Synapse. T-Zelle/APC konjugiert mit einer ausgereiften immun Synapse in Abwesenheit (oberer Teil) oder Präsenz (unterer Teil) der SEB sind dargestellt. Die Bilder auf der linken zeigen Paare T-Zelle/APC mit einem niedrigen Grad an CD3 und F-Aktin Bereicherung, wohingegen die Bilder auf der rechten Seite T-Zelle/APC-paar mit einem hohen Maß an CD3 und F-Aktin Bereicherung (Reife immun Synapse) anzeigen. Maßstabsleiste = 10 µm (unten links). Das Ergebnis ist Vertreter von drei unabhängigen Experimenten. (B-C) Meine CD3 (B) oder F-Aktin (C) Bereicherung in der immun Synapse in das Vorhandensein oder Fehlen von SEB erscheint als Prozent Eiweiß (n = 3; (SE). Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Die Autoren haben nichts preisgeben.
Hier beschreiben wir einen kompletten Workflow für die qualitative und quantitative Analyse von immun Synapsen zwischen primären menschlichen T-Zellen und Antigen-präsentierenden Zellen. Die Methode basiert auf bildgebende Durchflusszytometrie, ermöglicht die Erfassung und Auswertung von mehreren tausend Zelle Bildern innerhalb relativ kurzer Zeit.
Die Arbeit wurde Nein vom deutschen Forschungsrat (DFG) mit Zuschüssen finanziert SFB-938-M und SA 393/3-4.
| >Multifuge 3 SR | Heraeus | ||
| RPMI 1640 | LifeTechnologies | #11875085 | 500 mL |
| FCS | Pan Biotech#3302-P101102 | ||
| Polystyrol Rundbodenröhrchen | Falcon | #352054 | 5 mL |
| Kulturflasche | Thermo Scientific | #178883 | |
| Dulbecco's Phosphat Buffered Kochsalzlösung | Sigma | D8662 | |
| Rinderserumalbumin | Roth | #8076.3 | |
| Saponin | Sigma | S7900 | |
| Paraformaldehyd | Sigma Aldrich | #16005 | |
| FACS Waschsaponin | PBS 1% BSA 0,15 Saponin | ||
| ReaktiosgefaB | Sarstedt | 72.699.002 | 0,5 mL |
| Speed Bead | Amnis | #400041 | |
| Minishaker MS1 | IKA funktioniert | MS1 | |
| Mikrotiterplatte | Greiner Bio One | #650101 | 96U |
| Enterotoxin SEB | Sigma Aldrich | S4881 | |
| DAPI | Sigma Aldrich | D9542 | 1:3000 |
| CD3-PeTxR | Invitrogen | MHCD0317 | 1:30 |
| Phalloidin-AF647 | Molekulare Sonden | A22287 | 1:150 |
| IS100 | Amnis | Bildgebendes Durchflusszytometer | |
| IDEAS | Amnis | Software | |
| INSPIRE | Amnis | Software |