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Alle Tierversuche wurden nach den Richtlinien für die Pflege und Verwendung von Labortieren durchgeführt und wurde vom zuständigen Behörden (Regierung von Oberbayern, München und Stanford institutionelle Tier Pflege und verwenden Ausschuss genehmigt Stanford, CA, USA). Eine Liste der alle Plasmide zum Klonen (Schritt 1 bis 4) ist in ergänzenden Tabelle S1 zur Verfügung gestellt.
1. Klonen ein Transgen konstitutive Genexpression
- Design-Primer für Transgene Verstärkung13,14.
- Fügen Sie Restriktionsschnittstellen für PacI (TTAATTAA), 5'-Ende des Primers vorwärts. 5'-Ende des rückwärts-Primer Restriktionsschnittstellen für AscI (GGCGCGCC) oder FseI (GGCCGGCC) hinzufügen.
- Verstärken Sie Transgene durch PCR mit Hilfe von Bedingungen, die für die gewünschte Transgen14optimiert. Reinigen Sie mit einem im Handel erhältlichen DNA-Reinigung-Kit.
Hinweis: Glühen Zeit richtet sich nach den Primer im Schritt 1.1 entworfen., Dehnung Zeit richtet sich nach der Länge des Konstrukts. Zum Beispiel für ein Konstrukt von 1.000 bp Länge Verwendung 60 s Dehnung Zeit.
- Verdauen Sie Transgen und Vektor für konstitutive gen Ausdruck15 mit jeweiligen Einschränkung Nukleasen (siehe Schritt 1.2) und Puffer in einem Gesamtvolumen von 50 µL bei 37 ° C über Nacht. Zum Beispiel, verdauen Konstrukt mit 5 Einheiten PacI und 5 Einheiten FseI gegebenenfalls (siehe Schritt 1.2).
- Gel reinigen verdauten Vektor und Insert mit einem kommerziellen Gel Extraction Kit gemäß den Anweisungen des Herstellers. Führen Sie eine standard Ligatur der 100 ng des Vektors und 100 – 1.000 ng Insert mit 400 U T4 Ligase bei 14 ° C 16 h Wärme inaktivieren bei 65 ° C für 10 Minuten.
- Zuständigen Bakterien mit einer standard-Hitze-Schock-Protokoll16zu verwandeln.
- Platte auf Agar-Platten mit 100 µg/mL Ampicillin. Inkubation bei 30 ° C für 24 h.
- Wählen Sie einzelne Kolonien, Plasmid-DNA mit einem kommerziellen Miniprep Kit gemäß den Anweisungen des Herstellers zu reinigen und überprüfen Sie die Reihenfolge von Sanger-Sequenzierung17 (Sequenzierung Grundierung: 5' TGCTGGAGTTCTTCGCC 3').
- Verwenden Sie positive Kolonien für Maxi Verstärkung von Plasmid DNA zu skalieren und reinigen, mit einem Endotoxin-freie Plasmid Vorbereitung Kit18 gemäß den Anweisungen des Herstellers.
- Konstrukt ist fertig für die Injektion, so fahren Sie mit Schritt 5 fort.
2. Klonen ein Transgen induzierbaren Genexpression
- Design-Primer für Transgene Verstärkung13,14.
- 5'-Ende des Primers vorwärts Restriktionsschnittstellen für SacI (GAGCTC), SpeI (ACTAGT) oder KpnI (GGTACC) hinzufügen. 5'-Ende des rückwärts-Primer Restriktionsschnittstellen für NotI (GCGGCCGC) oder XhoI (CTCGAG) hinzufügen.
- Verstärken Sie Transgene durch PCR mit Hilfe von Bedingungen, die für die gewünschte Transgen14optimiert. Reinigen Sie mit einem kommerziellen DNA-Reinigung-Kit.
- Die gereinigten Transgen und 4 µg Eintrag Vektors zu verdauen (pEN_TTmcs-Vektor, siehe Tabelle der Materialien)19 separat mit entsprechenden Einschränkung Nukleasen (siehe Punkt 2.2) und Puffer in einem Gesamtvolumen von 50 µL bei 37 ° C über Nacht.
- Gel reinigen verdauten Vektor und Insert mit einem kommerziellen Gel Extraction Kit gemäß den Anweisungen des Herstellers. Führen Sie standard Ligatur mit 100 ng des Vektors und 100 – 1.000 ng Insert mit 400 U T4 Ligase bei 14 ° C 16 h Wärme inaktivieren bei 65 ° C für 10 Minuten.
- Zuständigen Bakterien mit einer standard-Hitze-Schock-Protokoll16zu verwandeln.
- Platte auf Agar-Platten mit 15 µg/mL Gentamicin. Inkubation bei 37 ° C 16 h.
- Wählen Sie einzelne Kolonien, Plasmid DNA zu reinigen und überprüfen einfügen durch Sequenzierung17 mit dem pCEP forward Primer: 5' AGAGCTCGTTTAGTGAACCG 3'.
Hinweis: PCR auf einzelne Kolonien kann durchgeführt werden, ohne vorherige Reinigung mit Primer pCEP vorwärts und pCEP umkehren (5' AGA AAG CTG GGT CTA GAT ATC TCG 3'). Dieser Schritt kann nützlich für die Vorauswahl der positiven Kolonien.
- Fahren Sie mit Schritt 4 fort.
(3) Klonen von einer MiR ShRNA für induzierbarer Gene Knock-down
- MiR-ShRNA Oligonukleotide nach dem Klonen Protokoll19pSLIK zu entwerfen. Tempern Sie und reinigen Sie Oligonukleotide und verdünnen Sie 01:20 in DdH2O.
- Digest 3 µg Eintrag Vektors mit 5 U BfuAI bei 50 ° C für 3 h dann inaktivieren die Reaktion bei 65 ° C für 20 Minuten.
Hinweis: Wenn Co Ausdruck des grün fluoreszierenden Proteins (GFP) gewünscht wird, verwenden Sie pEN_TTGmiRc19 , als ein Eintrag Vektor, sonst Verwendung pEN_TTmiRc219.
- Gel reinigen verdauten Vektor wie in Schritt 2.5. Führen Sie standard Ligatur der 100 ng des Vektors und 1 µL gereinigt und verdünnt ShRNA Oligonukleotide (Schritt 3.1) mit 400 U T4 Ligase bei Raumtemperatur für 1 h Wärme bei 65 ° C für 10 Minuten inaktivieren.
- Zuständigen Bakterien mit einer standard-Hitze-Schock-Protokoll16zu verwandeln.
- Platte auf Agar-Platten mit 15 µg/mL Gentamicin. Inkubation bei 37 ° C 16 h.
- Wählen Sie einzelne Kolonien, Plasmid DNA zu reinigen und überprüfen Einfügen von Sanger-Sequenzierung17 (Sequenzierung Grundierung: 5' TAGTCGACTAGGGATAACAG 3').
- Fahren Sie mit Schritt 4 fort.
4. recombinational Klonen um bereit für Injection-Klone zu erzeugen
- Mix-150 ng Eintrag Vektors (aus Schritt 2 oder Schritt 3) und 150 ng von pTC-TET-Vektor-20.
- Hinzufügen ein Gesamtvolumen von 8 µL TE-Puffer (pH = 8).
- Die LR-Clonase-Enzym-Mix II (siehe Tabelle der Materialien) zu Eis, inkubieren 2 min. Vortex zweimal zu übertragen.
- Die Reaktion 2 µL der LR-Clonase-Enzym-Mix II hinzu und inkubieren Sie bei 25 ° C für 1 h.
- Stoppen Sie die Reaktion durch Zugabe von 1 µL Proteinase K-Lösung. Inkubation bei 37 ° C für 10 Minuten.
- Stbl3 zuständigen Bakterien mit 2 µL recombinational Klonen Mischung mithilfe einer standard Hitze-Schock-Protokoll16zu verwandeln.
- Platte auf Agar-Platten mit 100 µg/mL Ampicillin. Inkubation bei 30 ° C für 24 h.
- Wählen Sie einzelne Kolonien, reinigen Sie Plasmid-DNA mit Hilfe einer Endotoxin-freie Plasmid Vorbereitung Kit18 gemäß den Anweisungen des Herstellers zu und bestätigen Vektor Integrität durch Sanger-Sequenzierung17 (Sequenzierung Primer 5' AGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGG 3').
- Konstrukt ist fertig für die Injektion, fahren Sie mit Schritt 5 fort.
5. Vorbereitung Lösung für hydrodynamische Tail Vene Injektion
Hinweis: Vorbereitung der Konstrukte für die konstitutiven und induzierbaren Genexpression in Schritt 1, 2, 3 und 4 beschrieben.
- Injektion sterilen 0,9 % Kochsalzlösung vorbereiten (tun Sie nicht Gebrauch PBS). Verwenden Sie Volumen entspricht etwa 10 % des Körpergewichts Maus. Beispiel: für eine Maus mit einem Gewicht von 20 g, bereiten Sie 2 mL der Lösung vor.
- Bereiten Sie die Injektion Vektoren, die gereinigt wurden mit einem Endotoxin-freie Plasmid Reinigung Kit18 (siehe Schritt 1,8 oder 4,8, beziehungsweise).
- Fügen Sie 10 µg oder 15 µg von Endotoxin-freie Dornröschen Vektor Konstrukt (aus Schritt 1 Einsatz 10 µg aus Schritt 4 Verwendung 15 µg, beziehungsweise) und 1 µg von Endotoxin-freien pc-HSB521 pro mL steriler Kochsalzlösung.
- Shop-Lösung für bis zu 4 h bei 4 ° C. Nicht einfrieren.
6. Durchführung der hydrodynamischen Tail Vene Injektion
- Verwenden Sie eine einschränkende Injektionslösung Schweif Vene (kommerzielle oder aus einem 50 mL konische Rohr mit Löchern für die Atmung und die Rute bereit). Füllen Sie Boden des Röhrchens mit Seidenpapier.
- Zur Injektion verwenden Sie Mäuse von ca. 8 – 10 Wochen alt mit Gewichten von 20 – 25 g.
- Mäuse vor der Injektion zu wiegen und bereiten Injektionsvolumen nach dem Körpergewicht (entspricht 10 % des Körpergewichts, siehe Punkt 5.1). Bereiten Sie eine sterile 3 mL-Spritze mit einer 27 G-Nadel für Einspritzung und füllen sich mit der erforderlichen Menge.
- Platzieren Sie den Mauszeiger in die Restrainer. Passen Sie die Höhe der Tissue-Papier (siehe Punkt 6.1), nur minimalen Raum für Bewegung lassen aber genügend Platz zum Atmen.
- Stellen Sie sicher, dass die Maus regelmäßig atmet.
- Warm die Rute mit einer Infrarotlampe für 30-60 s. sorgfältig achten Sie auf Anzeichen einer Überhitzung.
- Reinigen Sie das Heck mit einem Alkoholtupfer.
- Stechen Sie die Nadel fast horizontal in einer der zwei seitlichen Schweif Venen in der Nähe der Schwanzwurzel.
Hinweis: Wenn erfolgreich, könnte eine kleine Menge Blut zurück in den Konus der Nadel fließen. Es empfiehlt sich nicht aktiv abzusaugen, da jede zusätzliche Bewegung der Nadel zu seiner Vertreibung und/oder Verletzung der Vene führen kann.
- Injizieren Sie das Gesamtvolumen in den Schweif Vene innerhalb von 8-10 s.
- Entfernen Sie sofort die Maus aus die Restrainer. Komprimieren der Injektion gewickelt für mindestens 30 s oder bis eine Blutung nachlässt.
- Platzieren Sie den Mauszeiger in einem separaten Käfig. Sobald die Maus aus dem Verfahren (ca. 30 – 60 min) erholt hat, übertragen Sie die Maus zurück zu seinem ursprünglichen Käfig. Schauen Sie auf die Maus regelmäßig für die nächsten 24 h.
Hinweis: Leichter Sedierung der Maus wird routinemäßig für bis zu 2 Stunden nach der Injektion beobachtet.
- Warten Sie bevor Sie mit weiteren Experimenten (d.h. Schritt 7) 10-15 Tage für die Abfertigung von nichtintegrierten Vektoren.
(7) Induktion von transfizierten CreER mit Tamoxifen
Achtung: Tamoxifen ist schädlich kann, Krebs oder Fruchtbarkeit Schaden. Entnehmen Sie bitte dem Sicherheitsdatenblatt.
- Planen Sie intraperitoneale Tamoxifen Injektionen an drei aufeinanderfolgenden Tagen.
- Am 1. Tag 10 mg Tamoxifen in 40 µL Ethanol zu lösen. Inkubieren Sie bei 55 ° C für 10 min. Vortex mehrere Male, bis die Tamoxifen aufgelöst hat.
- Nachfüllen Sie 960 µL Maisöl. 5 min. bei 55 ° c inkubieren Vortex mehrmals, um eine eindeutige Lösung zu erhalten.
- Bereiten Sie die Lösung in einer 1-mL Insulin-Spritze mit einer Nadel 27 G.
- SCRUFF der Maus durch den Hals der Maus vorsichtig mit dem Daumen und dem zweiten Finger greifen Befestigung das Heck zwischen der Hand und den vierten und fünften Finger.
- Injizieren Sie 0,1 mL (= 1 mg Tamoxifen) der Lösung intraperitoneal in der linken unteren Quadranten des Abdomens.
- Wiederholen Sie die Injektionen an den Tagen zwei und drei.
8. die Induktion der Tetracyclin-abhängige gen oder ShRNA Ausdruck
Achtung: Doxycyclin kann schädlich sein. Entnehmen Sie bitte dem Sicherheitsdatenblatt.
Hinweis: Je nach Art und Dauer des Experiments, Doxycyclin in Trinkwasser (Schritt 8.1) oder Chow (Schritt 8.2) lieferbar
-
Für kurzfristige Experimente (< 10 Tage) Doxycyclin über das Trinkwasser über das folgende Protokoll zu verwalten.
- 5 g Saccharose in 100 mL Wasser auflösen. Autoklaven.
- 100 mg Doxycycline Hyclate in 5 mL Zuckerlösung (Schritt 8.1.1) in einem 15 mL konische Rohr zu lösen.
- Eine 10-mL-Spritze, Sterilfilter die Lösung durch einen 0,2 µm-Filter verwenden. Hinzufügen der Saccharose-Lösung im Schritt 8.1.1 vorbereitet.
- Doxycyclin-Zuckerlösung als Trinkwasser für die Maus zu liefern. Überprüfen Sie täglich und ersetzen, wenn die Lösung trüb Angabe bakterielle Überwucherung (ersetzen klare Lösung nach spätestens drei Tagen) wird.
- Für langfristige Experimente (> 10 Tage) oder Experimente, die empfindlich auf metabolische Veränderungen verwenden kommerzielle Doxycyclin-Chow (z.B.Doxycycline Hyclate Chow 0,625 g/kg), Dehydrierung und/oder Saccharose-induzierten Veränderungen in der Leber von behandelten Tieren zu vermeiden.
9. Vorbereitung der Maus Leber für die Analyse von Immunostaining
Achtung: Paraformaldehyd kann schädlich sein. Entnehmen Sie bitte dem Sicherheitsdatenblatt.
Hinweis: Das Timepoint wenn Mäuse analysiert werden richtet sich auf das Experiment. Es wird empfohlen, nach nicht weniger als drei Tagen Doxycyclin Behandlung Sicherstellung ausreichender Induktion von Transgen oder ShRNA Ausdruck Lebergewebe zu analysieren.
- Bereiten Sie eine 1 mL Spritze mit einer 27 G Nadel mit 1 mL 4 % Paraformaldehyd Lösung (PFA).
- Die Maus durch eine geeignete Methode nach einem genehmigten Prüfplan Tier einschläfern.
Hinweis: Richtlinien für die geeigneten Methoden der Euthanasie variieren je nach Hochschule.
- Öffnen Sie die Bauchhöhle mit sezierenden Schere und anatomische Pinzette sorgfältig mit eine mediane Laparotomie, die Leber verfügbar zu machen. Bewegen Sie den Dünndarm nach rechts, um die Pfortader und der unteren Hohlvene (IVC) aussetzen.
- Stechen Sie die Nadel der Spritze vorbereitet (siehe Punkt 9.1) in die IVC und Schnitt die Pfortader. Injizieren Sie 1 mL der PFA in die IVC perfundieren das Lebergewebe und entfernen Auto-fluoreszierende Erythrozyten (wünschenswert, wenn immunofluorescent Färbung durchgeführt wird) langsam.
- Entfernen Sie die Leber. Spülen Sie mit Wasser und übertragen Sie auf 5 – 10 mL 4 % PFA-Lösung.
- Für Paraffin Abschnitte ist Fix Gewebe für 36 – 48 h Gewebe bereit für Dehydrierung und Paraffin einbetten.
-
Fix für Gefrierschnitte, Gewebe in 4 % PFA für 1 h.
- Für Cryoprotection auf 10 % Saccharoselösung übertragen. Inkubieren Sie 60 min.
- Auf 20 % Saccharoselösung übertragen. Inkubieren Sie 60 min.
- Transfer zum 30 % Saccharoselösung. 12 – 16 h. Embed Einbettung zusammengesetzte für Gefrierschnitte inkubieren und Einfrieren bei-20 ° C.