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Research Article
Jiangqu Liu*1, Takaaki Sokabe*2,3, Craig Montell1
1Neuroscience Research Institute and Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of California, Santa Barbara, 2Division of Cell Signaling, National Institute for Physiological Sciences,National Institutes of Natural Sciences, 3Thermal Biology Group, Exploratory Research Center on Life and Living Systems,National Institutes of Natural Sciences
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier präsentieren wir ein Protokoll, um die bevorzugte Umgebungstemperatur von Drosophila -Larven mit einem kontinuierlichen Temperaturgefälle zu bestimmen.
Viele Tiere, einschließlich der Taufliege Drosophila Melanogaster, sind in der Lage, unterscheidende winzige Unterschiede in der Umgebungstemperatur, die ihnen ermöglicht, ihre bevorzugten Thermenlandschaft suchen. Um die Temperatur-Einstellungen von Larven über einen definierten linearen Bereich zu definieren, haben wir einen Test mit einem Temperaturgradienten entwickelt. Um einen Single-direktionalen Verlauf zu etablieren, sind zwei Aluminium-Blöcke mit unabhängigen Wasserbäder, verbunden, die jeweils die Temperatur der einzelnen Blöcke steuert. Die beiden Blöcke setzen die unteren und oberen Grenzen des Farbverlaufs. Der Temperaturgradient entsteht durch eine Agarose-beschichteten Alu-Platte über die zwei Wasser-gesteuerte Blöcke platzieren, damit die Platte erstreckt sich über den Abstand zwischen ihnen. Die Enden der Aluminiumplatte, die oben auf dem Wasser-Blöcke festgelegt ist definiert die minimalen und maximalen Temperaturen und die Regionen zwischen den beiden Blöcken bilden ein linearer Temperaturgradient. Der gradient-Test kann an Larven verschiedener Altersstufen angewendet werden und kann verwendet werden, um durch Mutation entstehende Variationen zu identifizieren, die Ausstellung Phänotypen, wie jene mit Mutationen Gene codieren, TRP-Kanäle und Opsins, die für Temperatur Diskriminierung erforderlich sind.
Thermotaxis wird durch mobile Tiere eingesetzt, um eine Umgebung mit den günstigsten Bedingungen1,2,3auswählen. Wenn das Klima übermäßig heiß oder kalt, dieses Verhalten ist wichtig für das Überleben ist. Darüber hinaus viele Tiere reagieren empfindlich auf sehr kleine Unterschiede in der Temperatur im Bereich von komfortablen und Umgebung mit einer idealen Temperatur aufsuchen. Dies ist von besonderer Bedeutung für wechselwarme Organismen wie Fruchtfliegen, die ihre Körpertemperatur mit der Umgebung equilibrate. Assays, Larven Thermotaxis überwachen wurden maßgeblich bei der Identifizierung und Klärung der Rolle der molekularen Sensoren wie Drosophila Transienten Rezeptor Potential (TRP) Kanäle4,5,6, rhodopsine7,8und Ionotropic Rezeptor-Rezeptoren (IRs)9, die diese Tiere mit Temperatur Empfindlichkeiten in verschiedenen Temperaturbereichen zu verleihen.
Ein zwei-Wege-Choice-Test bietet einen Ansatz zur Untersuchung der thermischer Präferenzen in Larven6,7. Der Test beinhaltet zur Gründung zwei unterschiedliche Temperaturzonen und erlaubt den Tieren, eine Seite über die andere auswählen. Die Ergebnisse von zwei-Wege-Choice-Tests sind robust, vor allem wenn die Temperaturunterschiede zwischen den beiden Optionen groß sind. Darüber hinaus da jedes Assay tabellarisieren nur zwei Gruppen umfasst, können die Daten als einfache Präferenz-Index ausgedrückt werden. Die Leichtigkeit und Einfachheit der zwei-Wege-Wahl-Assays sind auch genetische Bildschirme zugänglich. Eine große Einschränkung ist jedoch, dass viele Experimente erforderlich sind, um die gewünschte Temperatur der Wildtyp oder mutierte Tiere zu etablieren.
Ein gradienter Assay bietet die Möglichkeit, die gewünschte Temperatur in einem einzigen Test8aufzunehmen. Darüber hinaus ermöglicht es im Gegensatz zu den zwei-Wege-Choice-Test, die Auswertung der Verteilung der einer Gruppe von Tieren, konfrontiert mit einer kontinuierlichen Reihe von Temperaturen. Ein gradient Assay verwendet eine Petrischale und Einzeltiere und eignet sich gut für die Charakterisierung von detaillierten Verhaltens einzelner Tiere10. Jedoch da Petrischalen Runde sind, die Größen der Temperaturzonen variieren und sind abhängig von der Entfernung vom Zentrum nach und nach kleiner. Dieses Setup ist daher nicht ideal für die Überwachung der Temperatur-Auswahl der Populationen von Tieren.
Eine kontinuierliche thermischen Gradienten Apparat, der gut geeignet, um die Temperatur-Einstellungen von Gruppen von Larven zu beurteilen ist eine rechteckige Arena beschäftigt und wird hier beschrieben. Das Gerät ist einfach zu konstruieren und montieren. Die Steigung ist linear und ist flexibel, da es verwendet werden kann, inwieweit Thermotaxis über große Temperaturbereiche von 10 ° C bis 42 ° C. Der Test ist schnell und unkompliziert durchzuführen und liefert reproduzierbare Daten. Neben der Berichterstattung der bevorzugten Temperatur der Larven, zeigt es die Präferenzen der Bevölkerung von Tieren über eine gesamte lineare Bereich in einem einzigen Experiment. Aufgrund dieser Vorteile ist es eine ausgezeichnete Wahl für die Identifizierung von Genen, die für Thermotaxis erforderlich.
1. Ausrüstung Herstellung und Montage Vorrichtung zur Gradient Assays
2. Larven Synchronisation
(3) Temperaturgradient Setup
(4) Larven Sammlung und waschen
5. Test und Berechnung
Um eine 18 ° C - 28 ° C Single-direktionale etablieren soll Gefälle, wir die Temperaturen der zwei Wasserbäder 16,8 ° C und 31 ° C. Wir erreichen die Temperaturen auf 13 Punkte durch Messen der Temperatur bei 26 Positionen innerhalb der oberen und unteren Abschnitte aller 6 Zonen, die Grenzlinien zwischen den Zonen und an den äußersten Enden der Agarose-Gel-Oberfläche (Abbildung 2, 2E). Die Temperaturverteilung entlang der Steigung war fast linear (Y = 0,9672 * X + 16.19, R2 = 0.9961) (Abb. 2E).
Wir untersucht die Temperatur Präferenzen der Kontrolle (w1118) Larven in verschiedenen Altersstufen. 1St (24 ± 1,5 h AEL), 2Nd (48 ± 1,5 h AEL) und frühen 3rd Larven (72 ± 1,5 h) zeigte Gipfeln in die 24 ° C-Zone (Abb. 3A, B). Die Temperatur-Einstellungen geändert während 3rd instar Larvalentwicklung. Der größte Anteil der Mitte 3rd Instar (96 ± 1,5 h AEL) angesammelt in den 18 ° C-Zone (Abb. 3A, B), und diese Tendenz erhöht sich mit zunehmendem Alter. Unter den späten 3rd Instar Larven (Pre-Klettern; 120 ± 1,5 h AEL), ~ 50 % gruppierten in 18 ° C-Zone, und die Auswahl von dieser Temperatur war ~ 4-fach höher als die angrenzenden 20 ° C-Zone (18 ° C-Zone, 50,2 %; 20 ° C-Zone, 15,1 %; Abbildung 3A " B). Die Neigung zu akkumulieren in der 18 ° C-Zone w 1118 lag nicht an ein Randeffekt seit den späten 3rd instar Larven noch angesammelt in der 18 ° C-Zone mit einem bidirektionalen Temperaturgradienten (Abbildung 3E, F ).
Wir testeten auch spät-3rd Instar Larven (120 ± 1,5 h AEL) mit Mutationen in Genen, die für anspruchsvolle Temperaturunterschiede im Bereich von komfortablen erforderlich. Dazu gehören trpA1, was für normale Temperaturwahl in 18 ° C - 24 ° C Reihe5,7,8erforderlich ist. Larven mit einer null-Mutation im trpA1 (trpA11) verteilen sich gleichmäßig über die gesamte 18 ° C-28 ° C Farbverlauf (Abbildung 3). Fehlt nur der A und B Isoformen (trpA1-ABG4) oder der C und D Isoformen (trpA1-CDG4) auch Larven zeigen schwere Beeinträchtigungen (Abbildung 3). Fliegen zwei Isoformen von Phospholipase Cβ (PLC21C und NORPA) kodieren, und Mutationen NorpA (NorpAP24) aber nicht plc21c (plc21cP319) auch stören Akkumulation im Bereich von 18 ° C ( 3D Abbildung).

Abbildung 1: Vorrichtung zur Durchführung von Einzel-direktionale Temperaturgradient Assay. (A) Aluminium Platte verwendet für Untersuchung Larven Thermotaxis Verhalten testen. Die 13 schwarzen Linien am oberen und unteren abzugrenzen 12 Zonen (10 mm). Die Unterseite der Platte ist mit schwarzer Farbe eloxiert, so dass es einfacher ist, die Larven zu visualisieren. (B) Dimensionen der Aluminiumplatte (angegeben in mm). Die äußere Größe der Aluminiumplatte ist 140 x 100 x 9 mm. Die innere Größe der Aluminiumplatte ist 130 x 90 x 8 mm. Die Abgrenzungen sind um 10 mm getrennt. Die erste und letzte Abgrenzung ist 5 mm von den Kanten des inneren Bereichs der Platte. (C) Top und Seitenansichten eines Aluminium-Blöcke verwendet, um die Temperatur des Verlaufs zu kontrollieren. Der Block hat zwei Steckverbinder Anfügen an Silizium-Röhren, die mit einem Wasserbad verbinden. (D) Dimensionen von einem Aluminiumblock. Die äußere Größe der Aluminiumblock ist 255 x 50 x 14 mm. Der Durchmesser des inneren Wasserweg beträgt 7 mm. Zwei 30-mm-Anschlüsse auf der linken Seite verbinden Sie mit Silikon-Schläuche, die auf dem Wasserbad erstreckt. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 2: Einzel- und bidirektionale gradient Assay-Setups. (A) Single-direktionale gradient Setup mit zwei Aluminiumplatten Assay auf zwei Aluminium-Blöcken. Die Temperaturen der Aluminium-Blöcke werden durch zirkulierende Wasser aus zwei Wasserbäder gesteuert. (B) die Anordnung der drei Aluminium-Blöcke, Wasserbäder und eine Alu-Platte (250 x 220 mm) für einen bidirektionalen Farbverlauf. Die linken und rechten Blöcke mit dem gleichen Wasserbad verbunden sind und der mittleren Block mit anderen Wasserbad verbunden ist. Assay Aluminiumplatte wird mit Klebeband auf eine 10 mm Wand um 1 % Agarose enthalten bilden umwickelt. (C) Positionen, Temperaturen (durch Punkte gekennzeichnet) zu überprüfen und zu Larven auf der Platte zu lösen. Überprüfen Sie vor der Einleitung eines Experiments die Temperatur an zwei Punkten innerhalb jeder Zone zu bestätigen, dass der gewünschte linearer Temperaturgradient entsteht. Larven werden innerhalb des angegebenen Bereichs in der Nähe der Mittellinie freigegeben. Die Larven werden in jedem der 2-cm-Zonen gezählt. (D) Positionen, Temperaturen (durch Punkte gekennzeichnet) und die Freigabe-Zonen für die Larven auf einer bidirektionalen Steigung zu überprüfen. Eine gleiche Anzahl von Larven werden entlang der Mittellinie des jeweils die Hälfte des bidirektionalen Verlaufs freigegeben. Die Zahl der Larven sind in jedem der 10 (2 cm) Zonen gezählt. Ein typischer Satz von Temperaturen (18 ° C - 26 ° C) auf der Oberfläche der Agarose wird angezeigt. (E) Temperaturen gemessen entlang der Grenzlinien und Mittellinien der einzelnen Zonen in einem Beispiel Single-direktionale Farbverlauf. Darstellung von Daten Mitteltemperaturen ± SD n = 8 Assays (150 ± 50 Larven/Assay). Teile davon werden von Sokabe Et Al. reproduziert. 8 mit geringfügigen Änderungen. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 3. Repräsentative Ergebnisse mit Single-direktionale und bidirektional gradient Assays. (A, B) Bedeuten Sie Prozentsätze der Larven in 6 Zonen auf der Single-direktionalen Verlauf. Daten umfassen 3rd Instar Larven angegebenen Stunden nach der Eiablage (AEL). n = 6-7. Die Fehlerbalken in ein dar ±SEM. (C) thermische Distributionen des Pre-Klettern Ende 3rd instar Larven der Kontrolle (w1118) und trpA1 Mutanten auf der Single-direktionalen Verlauf. n = 3-4. Die Fehlerbalken darzustellen ±SEM. (D) thermische Verteilungen der späten 3rd Instar Larven der Kontrolle (w1118) und PLCβ Mutanten auf der Single-direktionalen Verlauf. n = 4-6. Die Fehlerbalken darzustellen ±SEM. (E) repräsentative Verteilung der Pre-Klettern, spät-3rd Instar Larven (w1118) auf den bidirektionalen Farbverlauf. Die linken und rechten Assay-Zonen sind durch punktierte Linien gekennzeichnet und getrennt durch die keine-Count-Zone in der Mitte (schattigen Bereich). (F) Prozentsatz des Kletterns bereits Ende 3rd instar Larven (w1118) in jeder Zone entlang das Temperaturgefälle. Larven wurden in der linken und der rechten Seite lassen Sie Zonen. Der Assay-Zonen sind durch eine 3 cm-keine-Graf-Zone in der Mitte getrennt und die Verteilungen werden unabhängig voneinander berechnet. Die Fehlerbalken darzustellen SEMs. n = 3 Assays (200-400 Larven/Assay). Teile davon werden von Sokabe Et Al. reproduziert. 8 mit geringfügigen Änderungen. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
| Stunden AEL | Larvenstadium |
| 24 | 1St instar |
| 48 | 2Nd instar |
| 72 | Ersten 3rd instar |
| 96 | Mitte-3rd instar |
| 120 | Spät-3rd Instar, kurz vor der Bühne Klettern |
Tabelle 1. Die Beziehung zwischen den Stunden nach der Eiablage (AEL) und Larvenstadien.
| Temperaturgradienten auf Agarose-Teller (Steigung) | Temperaturen von Wasserbäder | Temperaturen von Aluminium-Blöcken |
| 10,0-25,0 ° C (1,5 ° C/cm) | ~6.5-7°C/~28.5°C | ~8.5°C/~26.8°C |
| 18.0-28,0 ° C (1° C/cm) | ~16.8°C/~31.0°C | ~17.8°C/~29.7°C |
| 14.0-34,0 ° C (2° C/cm) | ~10.0°C/~40.0°C | ~11.8°C/~36.8°C |
| 12,5-42,0 ° C (2,95 ° C/cm) | ~7.0°C/~55.0°C | ~9.4°C/~49.4°C |
Tabelle 2. Typische Temperaturgradienten und die entsprechenden Temperaturen der Wasserbäder und Aluminium Blöcke für einzelne gerichtete Steigungen.
| Temperaturgradienten auf Agarose-Teller | Temperaturen von Wasserbäder | Temperaturen von Aluminium-Blöcken |
| 22.10.22 ° C (1,5 ° C/cm) | ~5.0°C /~25.0°C | ~7.5°C/~24.0°C |
| 26-18-26 ° C (1° C/cm) | ~15.8°C /~30.6°C | ~16.9°C/~28.4°C |
| 30-14-30 ° C (2° C/cm) | ~8.5°C /~36.4°C | ~10.9°C/~32.8°C |
| 36-12,5-36 ° C (2,95 ° C/cm) | ~5.0°C /~47.2°C | ~7.9°C/~40.9°C |
Tabelle 3. Typische Temperaturgradienten und die entsprechenden Temperaturen der Wasserbäder und Aluminium Blöcke für bidirektionale Farbverläufe.
| Larven Alter (AEL) | Assay-Zeit (einzelne Richtungen) | Assay-Zeit (bidirektional) |
| 24 h | 30 min | 35 min |
| 48 h | 22 min. | 27 min |
| 72 h | 16 min. | 21 min. |
| 96 h | 13 min. | 18 min. |
| 120 h | 10 min | 15 min |
Tabelle 4. Larval Altersgruppen (AEL) und die entsprechenden Assay-Zeiten.
Die Autoren haben nichts preisgeben.
Hier präsentieren wir ein Protokoll, um die bevorzugte Umgebungstemperatur von Drosophila -Larven mit einem kontinuierlichen Temperaturgefälle zu bestimmen.
C.m. wird unterstützt durch die Finanzierung von NEI (EY008117, EY010852), NIDCD (DC007864, DC016278) und die NIAID (1DP1AI124453).
| Gradienten-Assay-Gerät | |||
| PolyScience 9106, gekühltes/beheiztes 6-Liter-Zirkulationsbad | Thomas Scientific | 9106 | Dieses Modell wird nicht mehr hergestellt. Zu den aktualisierten Ersatzmodellen gehören: 1186R00 und 1197U04 für 120 V, 60 Hz oder 1184L08 und 1197U04 für 240 V, 50 Hz. |
| Aluminium-Prüfplatte (für einseitigen Gradienten) | Außenmaße: 14 x 10,1 x 0,9 cm, Innenmaße: 12,9 x 8,7 x 0,8 cm, schwarz eloxiert. | ||
| Aluminiumplatte (für bidirektionales Gefälle) | 25 x 22 x 0,2 cm, schwarz eloxiert. | ||
| Aluminiumblock | Außenmaße: 25,5 x 5 x 1,4 cm, die Parameter der Innenkanäle sind in Abbildung 1D dargestellt. | ||
| Verbinder für Aluminiumblöcke und -schläuche | McMaster-Carr | 91355K82 | |
| Tygon Sanitärsilikonschlauch | Tygon | 57296 | 1/4" ID x 3/8" OD x 1/16" Wand |
| Name | <>Unternehmen< | strong>Katalognummer | <>Kommentare |
| Artikel und Reagenzien für Assay | |||
| Stößel | USA Scientific | 17361 | Stößel für 1,5 mL Mikrozentrifugenröhrchen |
| Thermometer | Fluke | 51II | |
| Thermoelement | Fluke | K Typ | |
| Universal Mikroplattendeckel | Corning | 6980A77 | |
| 35 mm Schale | Corning | 9380D40 | |
| Beschriftungsband (für bidirektionalen Gradienten) | Fisher Scientific | 15-951 | Fisherbrand Beschriftungsband 2 Zoll x 14 yds |
| Agarose | Invitrogen | 16500500 | 1%ige Lösung vorbereiten |
| Saccharose | Sigma | S0389-5KG | 18%ige Lösung direkt vor Beginn des Assays |
| Pinsel | Fisher Scientific | 11860 | |
| 50 mL Zentrifugenröhrchen | Denville | C1062-P | |
| Scoopula | Fisher Scientific | 14-357Q | |
| 500 mL runde Weithalsflasche | Pyrex | 1395-500 | |
| Zellsieb (300 mm Pore) | PluriSelect | 43-50300 | Optionaler Artikel zum Waschen von Larven |
| Karton (Fläschchenschale) | Genesee Scientific | FS32-124 | |
| Name | Company | <>Katalognummer | Comments |
| Drosophila food | |||
| Destilliertes Wasser | 22.400 mL | ||
| Maismehl, gelb (extra feinmaschig, beflockt) 20 kg | LabScientific Inc. | NC0535320 | 1.609 g |
| Bierhefe 100 lbs | MP Biomedicals | ICN90331280 | 379 g |
| NutriSoy® Sojamehl (10 kg/Einheit) | Genesee Scientific | 62-115 | 221 g |
| Drosophila Agar, Typ II (5 kg) | Genesee Scientific | 66-103 | 190 g |
| Karo leichter Maissirup | Karo | 1.700 mL | |
| Methyl-4-hydroxybenzoat (suspendiert in 200 proof Ethanol) | Sigma Aldrich | H5501-5KG | 72 g/240 mL |
| Propionsäure puriss. p.a., >99,5% (GC) | Sigma Aldrich | 81910-1 L | 108 mL |
| Phosphorsäure ACS-Reagenz, ≥ 85 Gew.-% in H2O | Sigma Aldrich | 438081-500 mL | 8,5 mL |