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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Das Manuskript wird beschrieben, wie zu synthetisieren und Transplantat einen molekulare Motor auf Oberflächen für einzelne molekulare Bildgebung.
Das Design und die Synthese eines synthetischen Systems, das Ziel für die direkte Visualisierung von einer synthetischen Drehmotor der Ebene der einzelnen Moleküls auf Oberflächen werden demonstriert. Diese Arbeit erfordert sorgfältige Planung, synthetischen Aufwand und genaue Analyse. Die Drehbewegung des molekularen Motors in Lösung 1H NMR und UV-Vis Absorption Spektroskopie Techniken zeigen. Darüber hinaus ist die Methode, um den Motor auf ein Amin-beschichtete Quarz-Transplantat beschrieben. Diese Methode hilft, mehr Einblick in molekulare Maschinen.
In lebenden Organismen gibt es reichlich molekulare Motoren funktionieren um Alltag aufrecht zu erhalten. Sie sind in der Lage, verschiedene Aufgaben wie Brennstoff-Produktion, Transport, Mobilität, etc.1. Von der Inspiration dieser faszinierende Beispiele in der Natur haben, Wissenschaftler eine Reihe von künstlichen molekulare Motoren in den letzten Jahrzehnten, verschiedene Arten von Energie in kontrollierte Bewegung auf der molekularen Ebene2 umzuwandeln entwickelt , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9 , 10. drei Pioniere auf diesem Gebiet erhielt den Nobelpreis für Chemie im Jahr 2016. Ben Feringa, einer der Preisträger, hat den lichtgetriebenen molekularen Motor entwickelt, der in der Lage, kontinuierliche unidirektional Drehbewegung zu unterziehen ist.
Brownsche Bewegung, auch bekannt als die zufällige Bewegung durch molekulare Kollisionen und Vibrationen, ist jedoch auf molekularer Ebene, in der Regel das größte Hindernis für einen weiteren Antrag dieser molekularen Motoren. Brownsche Bewegung kann eine gerichtete Bewegung stören. Beschränken die molekularen Motoren auf Oberflächen kann eine der Optionen, um dieses Problem zu überwinden sein. Auf diese Weise wird die relative Drehung eines Teils des Moleküls in Bezug auf die andere in die absolute Drehung des Rotors im Verhältnis zu der Oberfläche11konvertiert. Darüber hinaus kann die einzelne molekulare bildgebende Technik der Bewegung visualisieren. Daher werden die Ergebnisse dieser Arbeit helfen, mehr Einblick in die synthetische molekulare Motor.
Die Pionierarbeit von Yoshida und Kinosita (Abbildung 2a)12,13 diente als Inspiration für das Design in der aktuellen Arbeit, dargestellt in Abbildung 2 b. Die untere Hälfte der lichtgetriebenen molekularen Motor ist zu einer Oberfläche zu dienen als der Stator befestigt. Der Rotor-Teil ist mit einem steifen Arm und fluoreszierende Label funktionalisiert. Wenn Sie zwei verschiedene Bestrahlung Wellenlängen auf das System anwenden, löst man die Drehrichtung des Motors, während der andere das fluoreszierende Tag begeistern. Im Prinzip löst die Drehbewegung des Rotors Teil die Rotation der Fluoreszenz-Gruppe. Daher kann die Rotation des fluoreszierenden Tags defokussierten Weitfeld-Fluoreszenzmikroskopie folgen. Diese Methode bietet zum ersten Mal eine Methode, um absolute Drehung, und daher ein Weg, um die Rotation eines synthetischen Motors visualisieren die Relativdrehung der molekularen Motor umzuwandeln.
Dieser Artikel enthält Details über Design, Synthese und Lösung Isomerisierung Studien molekulare Motoren, die für einzelne molekulare Bildgebung verwendet wird. Die molekulare Struktur ist in Abbildung 3dargestellt. Darüber hinaus ist die Methode, um molekulare Motoren auf Quarzoberfläche Anhängen beschrieben.
Hinweis: Organischer Synthese ist der große Kern dieses Projektes. Abbildung 1 zeigt die wichtigsten Schritte und wie das Zielmolekül zu erreichen.
1. Vorbereitung der 1 b
Hinweis: Lösungsmittel wurden analysenrein erworben.
2. Vorbereitung des Motors funktionalisiert Monolage MS-1 b
Bestrahlung des molekularen Motors erfolgt mit UV-Licht (λMax. = 365 nm). Bei der Bestrahlung tritt eine Foto-induzierte E-Z -Isomerisierung rund um die zentralen Doppelbindung. Während dieses Prozesses wird das Molekül aus einem Stall zu einem instabilen Isomer verwandelt. Ein thermisch aktivierten Helix Inversion Schritt folgt dann um die Belastung des gesamten Moleküls zu lösen. Dies führt zu stabilen Ursprungszustand. 1 H-NMR-Spektroskopie wird dann eingesetzt, um den rotary Prozess (Abb. 4a). Eine Lösung der Probe erstellt, bei dem ein NMR-Röhrchen, dann eine Lampe von UV-Licht (λMax. = 365 nm) befindet sich neben dem Rohr. Nach 2 h der Bestrahlung finden Sie verschiedene Änderungen in der 1H-NMR-Spektrum. Diese Veränderungen zeigen die Generation eine neue Isomer, das betrachtet wird, zu instabil-1 b (Abbildung 4 b). Es sieht in der 1H-NMR-Spektroskopie, die Heine von 2,9 ppm (Wams) auf 3,3 ppm (doppelte Wams) verschiebt. Das Signal bei 1,4 ppm als Absorption der Methylgruppe zugeordnet werden kann, und es downfield verschiebt sich von 1,4 ppm bis 1,6 ppm. Wenn die Probe über Nacht bei Raumtemperatur im Dunkeln gehalten wird, kann das ursprüngliche Spektrum wiederhergestellt (Abb. 4a). Es zeigt den Prozess der thermischen Helix-Inversion, die instabil-1 b in Stall-1 b umwandelt.
Um die Drehbewegung des Motors 1 b Studie über Oberflächen, Oberfläche befestigt Motorbaugruppen MS-1 b (MS = Motor auf Oberflächen) sind bereit. Die Quarz-Folien sind zunächst mit Amin funktionalisiert. Nach diesem Schritt wird die Quarz in einer DMF-Lösung (10-4 M) 1 b bei RT über Nacht getaucht. Die daraus resultierende Quarz wird mit MeOH, DMF und Wasser gespült. Die vorbereiteten Quarz-Folien werden dann zur UV/Vis-Studien vorgelegt. Abbildung 5 bzeigt ein UV/Vis-Absorptionsspektrum des MS-1 b (durchgezogene Linie). Wie im Spektrum gesehen, sind die großen Absorptionsbande und Absorption Profil ähnlich dem in Lösung (Abb. 5a) beobachtet. Es zeigt auch die charakteristischen Absorptionen für Motor (420 nm) und PBI (456 nm, 490 nm, 524 nm). Diese Spitzen schlagen die erfolgreiche Befestigung der motor 1 b zu den Amin-beschichteten Oberflächen. Darüber hinaus wird die Quarz-Folie für 15 min bestrahlt, und spektrale Veränderungen sind ähnlich wie die Lösung unter Angabe der instabilen MS-1 b-Generation beobachtet.

Abbildung 1 : Synthetische Schema zur Vorbereitung der Ziel-Molekül 1 b. Das Schema zeigt die Reagenzien, Lösungsmittel und Reaktionsbedingungen, die verwendet werden in jedem Schritt.

Abbildung 2 : (ein) schematische Darstellung der Struktur des F0F1-ATPase, die auf eine Oberfläche für die Visualisierung der unidirektionalen Rotation (reproduziert mit Erlaubnis12) aufgepfropft. (b) Konzeption eine synthetische Oberfläche gebundene lichtgetriebenen molekularen Motor für die Einzelmolekül-Bildgebung.

Abbildung 3 : Struktur einer Oberfläche gebundene molekulare motor 1 b, trägt einen steifen langen Arm zwischen motorischen Kern und PBI Label.

Abbildung 4 : Aliphatischen Region der 1 H-NMR-Spektren von motor 1 b (CD2Cl2,-20 ° C, C = 10-3 M) (ein) Stall-1 b, vor der Bestrahlung (365 nm). (b) Foto stationären Zustand Mischung nach der Bestrahlung. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 5 : UV/Vis-Absorptionsspektren. UV/Vis-Absorptionsspektren von (einem) motor 1 b (CH2Cl2, 0 ° C), stabile Isomer (durchgezogene Linie) und instabilen Isomer (gestrichelte Linie) an PSS. (b) MS-1 b (Quarz, 4 ° C) vor (durchgezogene Linie) und nach der Bestrahlung (gestrichelte Linie).
Die Autoren haben nichts preisgeben.
Das Manuskript wird beschrieben, wie zu synthetisieren und Transplantat einen molekulare Motor auf Oberflächen für einzelne molekulare Bildgebung.
Diese Arbeit wurde finanziell unterstützt durch die niederländische Organisation für wissenschaftliche Forschung (NWO-CW), der Europäische Forschungsrat (ERC, advanced Grant Nr. 694345, B.L.F.), und das Ministerium für Bildung, Kultur und Wissenschaft (Gravitation Programm keine. 024.001.035).
| NMR-Spektrometer | Varian | AMX400 | für die Protonen-NMR-Studie |
| Reagenz für organische Reaktionen | Sigma | Reagenz in analytischer Qualität | für organische Reaktionen |
| Kieselgel | Merck | 230-400 mesh ASTM | Flash-Chromatographie |
| Lösungsmittel | Acros | spektrophotometrische Qualität | Flash-Chromatographie |
| UV-Lampe | ENB | 280C | für UV-vis-Bestrahlung |
| UV-vis-Absorptionsspektrophotometer | JASCO | V-630 | UV-Vis-Messung |