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Methodenartikel

Einzelne Liposomen Messungen für das Studium der Protonen-Pumpen Membran Enzyme mit Elektrochemie und Fluoreszenz-Mikroskopie

7.2K Aufrufe

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DOI:

10.3791/58896

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21. Februar 2019

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In diesem Artikel

Zusammenfassung

Hier präsentieren wir ein Protokoll, um den molekularen Mechanismus der Protonen-Translokation über Lipidmembranen der einzelnen Liposomen, studieren mit Cytochrom Bo3 als Beispiel. Kombination von Elektrochemie und Fluoreszenz-Mikroskopie, pH-Änderungen in das Lumen der einzelne Vesikel, mit einzelnen oder mehreren Enzym können individuell erkannt und analysiert werden.

Zusammenfassung

Protonen-Pumpen Enzyme des Elektrons übertragen Ketten paar Redoxreaktionen an Protonen-Translokation durch die Membran, erstellen eine Proton-treibende Kraft für die ATP-Produktion verwendet. Der amphiphilen Charakter der Membranproteine erfordert besonderes Augenmerk auf deren Handhabung und Rekonstitution in die natürliche Lipid-Umwelt ist unverzichtbar, wenn Transport Membranverfahren wie Protonen-Translokation zu studieren. Hier zeigen wir eine Methode, die für die Untersuchung des Protonen-Pumpen-Mechanismus der Membran Redox Enzyme verwendet worden ist, Cytochrom Bo3 aus Escherichia coli als Vorbild nehmen. Eine Kombination der Elektrochemie und Fluoreszenz-Mikroskopie dient zur Steuerung der Redox-Status des Quinone Pool und Monitor pH-Wert ändert sich in das Lumen. Durch die räumliche Auflösung der Fluoreszenz-Mikroskopie können Hunderte von Liposomen gleichzeitig gemessen werden, während die Enzym-Inhalt auf ein einziges Enzym oder Transporter pro Liposomen verkleinert werden kann. Die jeweiligen einziges Enzym Analyse kann Muster in der Enzym-funktionale Dynamik zeigen, die sonst durch das Verhalten der gesamten Bevölkerung verborgen sein könnte. Wir fügen Sie eine Beschreibung eines Skripts zur automatischen Bildanalyse.

Einleitung

Informationen über Enzym Mechanismen und Kinetik ist in der Regel auf das Ensemble oder makroskopischen Ebene mit Enzym Bevölkerung in die Tausende bis Millionen von Molekülen, erhalten wo Messungen einen statistischen Durchschnitt darstellen. Es ist jedoch bekannt, dass komplexe Makromoleküle wie Enzyme Heterogenität in ihrem Verhalten zeigen können und molekulare Mechanismen beobachtet auf der Ensemble-Ebene nicht unbedingt für jedes Molekül gelten. Solche Abweichungen der einzelnen Molekül-Skala wurden weitgehend durch Studien der einzelnen Enzyme mit einer Vielzahl von Methoden, die in den letzten zwei Jahrzehnten1bestätigt. Vor allem, wurd....

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Protokoll

1. Vorbereitung der Lipid/UQ-10/FDLL Mischung

Hinweis: E. coli Lipide die Liposomen Vorbereitung soll regelmÄÑig und gründlich gemischt mit Ubichinon-10 (Enzym-Substrat) und langwellige fluoreszierenden Farbstoff-markierten Lipide (für Liposomen Größenbestimmung) vor der Rekonstitution.

  1. Mit einer Glasspritze, Transfer 200 µL Chloroform Bestand an Lipid polar extrahiert aus Escherichia coli (25 mg/mL) in Glasfläschchen, 5 mg Aliquote zu machen.
  2. Fügen Sie 50 µL von 1 mg/mL Ubichinon-10 (UQ-10; in Chloroform) zu den Lipiden zu endgültigen Verhältnis UQ-10: Lipide 1: 100 (1 % w/w).
  3. Die Li....

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Ergebnisse

Die Qualität des Gold-modifizierte Deckglases (Elektrode) mit einem SAM 6MH wird vor jedem Experiment mit elektrochemische Impedanz Spektroskopie überprüft. Abbildung 2A zeigt repräsentative Cole-Cole-Grundstücke mit elektrochemische Impedanz Spektroskopie vor und nach der Liposomen adsorbiert werden gemessen. Wenn die Qualität der SAM ausreicht, sollte Impedanz Spektroskopie ein fast reines kapazitives Verhalten, was zu einem Halbkreis Cole-Cole-Grundstück z.......

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Diskussion

Die beschriebene Methode eignet sich studieren Proton Pumpen durch respiratorische Membranproteine, die in Liposomen wiederhergestellt werden können und sind in der Lage, Elektronen mit dem Quinone Pool austauschen. Protonen-Pumpen-Aktivität kann auf der Single-Enzym-Ebene mit pH-Sensitive (ratiometrischen) Farbstoffe in den Liposomen Lumen (Abbildung 1A) gekapselt überwacht werden.

Die Methode beruht auf der Fähigkeit von Ubichinon (oder andere Quinones), in der .......

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Offenlegungen

Die Autoren haben nichts preisgeben.

Danksagungen

Die Autoren erkennen die BBSRC (BB/P005454/1) für die finanzielle Unterstützung. NH wurde durch VILLUM Foundation Young Investigator Programm finanziert.

....

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
6-Mercapto-1-hexanol (6MH)Sigma45108897%
8-Hydroxypyren-1,3,6-trisulfonsäure (HPTS)BioChemika56360
Aluminiumhalter (Elektrochemische Zelle)Sonderanfertigung30x30x7 mm; Innendurchmesser: 26 mm; Lochdurchmesser: 15 mm
HilfselektrodePlatindraht
ChloroformVWR Chemikalien83627
E.coli polare LipideAvanti100600C25 mg/ml in Chloroform
EpoxyEPO-TEK301-2FLEpoxy mit niedriger Fluoreszenz
Fidschi (ImageJ 1.52d)Erforderliche Plugins: StackReg und TurboReg (http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/)
Filterwürfel ("ATTO633")Chroma Technology CorporationBsp.: 620/60 nm; ZW: 660 nm; Em: 700/75 nm
Filterwürfel ("HPTS1")Chroma Technology CorporationEx: 470/20 nm; DM: 500 nm; Em: 535/48 nm
Filterwürfel ("HPTS2")Chroma Technology CorporationEx: 410/300 nm; DM: 500 nm; Em: 535/48 nm
Filterwürfel ("Texas Red")Chroma Technology CorporationEx: 560/55 nm; ZW: 595 nm; Em: 645/75 nm
Fluoreszenzfarbstoffmarkierte Lipide (FDLL)ThermoFisher ScientificT1395MPTexasRed-DHPC wurde in dieser Arbeit verwendet (λ EXC 595 nm; λ em 615 nm)
Fluoreszenzfarbstoffmarkierte Lipide (FDLL) (alternativ)ATTO-TECAD 633-161ATTO633-DOPE kann als Alternative verwendet werden (λ EXC 630 nm; λ em 651 nm)
Gel-FiltrationssäuleGE Healthcare28-9893-33HiLoad 16/600 Superdex 75 pg, für zusätzliche Proteinaufreinigung
GlasdeckgläserVWR International631-0172No 1,5
GlasspritzeHamilton1725 RNR250 µ L
GlasfläschchenScientific Glass Laboratories LtdT101/V11,75 mL Kapazität
GoldGoodFellow99,99%
GramacidinSigmaG5002
Quecksilbersulfat-ReferenzelektrodeRadiometer (Haschisch)E21M012
MikrozentrifugeEppendorfMinispin NL040
MikroskopNikonEclipse Ti
Mikroskop KameraAndorZyla 5.5 sCMOS
Mikroskop LampeNikonIntensilight C-HGFI
NIS-Elements AR 5.0.2NikonMikroskop Erfassungssoftware
n-Octyl β-D-GlucopyranosidMelford LaboratoriesB2007
Nova 1.10MetrohmSoftware zur Potentiostatensteuerung
ObjektivNikonPlan Apo λ 60x/1,4 Öl
OriginPro 2017OriginLabPlotting-Software
O-Ring (Elektrochemische Zelle)OrinokoInnendurchmesser: 16 mm; Querschnitt: 1,5 mm
KunststoffrohreEppendorf3810X1,5 mL
Mikrokügelchen aus PolystyrolBio-RAD152-3920Biobeads, 20-50 mesh
PotentiostatMetrohm AutolabPGSTAT 128N
PotentiostatCH InstrumentsCHI604C
Scripting SoftwareMatlabR2017aBenötigte Toolboxes: 'Image Processing Toolbox', 'Parallel Computing Toolbox', 'Curve Fitting Toolbox', 'System Identification Toolbox', 'Optimization
Toolbox'SiliziumwaferIDB Technologies LtdSi-C2 (N< 100>P)& Oslash; 25 mm, 525 μm dicke
Teflonzelle (elektrochemische Zelle)SonderanfertigungAußendurchmesser: 26 mm; Innendurchmesser: 13,5 mm
Bügelabgestreifte ultraflache GoldoberflächenPlatypus TechnologiesAU.1000.SWTSGAlternative gebrauchsfertige ultraflache Goldoberflächen (Dicke unter 100 nm auf Anfrage)
Dünne MikropipettenspitzenSarstedt70.1190.100oder ähnliche Gelloader-Spitzen 200 & Micro; L
Ubichinon-10SigmaC-9538
UltrazentrifugeBeckman-CoulterL-80XPmit Ti 45
Rotor UltraschallbadFisher ScientificFB15063

Referenzen

  1. Claessen, V. I., et al. Single-Biomolecule Kinetics: The Art of Studying a Single Enzyme. Annual Review of Analytical Chemistry. 3 (1), 319-340 (2010).
  2. Rojek, M. J., Walt, D. R. Observing Single Enzyme Molecules Interconvert between Activ....

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Nachdrucke und Genehmigungen

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