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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier präsentieren wir ein Protokoll zum Sammeln der blumigen Duftflüchtige aus blühenden Blüten, mit einem zerstörungsfreien Probenahmeverfahren.
Düfte vieler Blumenfamilien wurden beprobt und die Flüchtigen analysiert. Das Wissen um die Verbindungen, aus denen die Düfte bestehen, kann ein wichtiger Schritt zur Erhaltung bedrohter oder gefährdeter Blüten sein. Da Blumenduft ist entscheidend für die Anziehung von Bestäubern, Diese Methode könnte verwendet werden, um besser zu verstehen oder sogar die Bestäubung zu verbessern. Wir präsentieren ein Protokoll mit einem tragbaren Kohleluftfilter und Vakuum, um florale Duftflüchtige zu sammeln, die dann von einem GC-MS analysiert werden. Mit dieser Methode können Duftflüchtige mit einer zerstörungsfreien Methode mit einer Maschine, die leicht transportiert werden kann, beprobt werden. Diese Methode verwendet ein schnelles Probenahmeverfahren, bei dem die Probenahmezeit von 2-3 Stunden auf etwa 10 Minuten verkürzt wird. Mit GC-MS können die Duftstoffe individuell identifiziert werden, basierend auf authentischen Standards. Die Schritte zum Sammeln von Duft- und Steuerdaten werden dargestellt, vom Materialaufbau bis zum Sammeln der Datenausgabe.
Blumen produzieren in der Regel einen Duft verwendet, um Bestäuber anzuziehen. Diese Düfte bestehen aus vielen chemischen Verbindungen, die alle zusammen als florale Mischung1,2,3. Ohne diese Düfte würden Blumen ihre genetischen Informationen seltener mit Bestäubern weitergeben. Floral Duft wurde in vielen blühenden Pflanzenfamilien dokumentiert, mit Orchidaceae ist eine der häufigsten Familien untersucht4. Um die Rolle des Blumendufts bei der Bestäubung zu verstehen, ist es wichtig, die chemischen Verbindungen, die von den Blüten zu verschiedenen Tageszeiten emittiert werden, und während der verschiedenen Tage bis Wochen die Blüten geöffnet sind, da der Duft im Laufe der Zeit variieren kann5.
Ein frühes Protokoll für diese Art der Probenahme wurde von Heath und Manukian6entwickelt. Ziel ihrer Probenahmemethoden war es, die Belastung der untersuchten Probe (z. B. Pflanzen, Insekten) zu verringern. Frühere Papiere dokumentierten, dass zerstörerische Verfahren an der Pflanze erforderlich waren, wie das Entfernen blühender Blumen, um den Duft zu sammeln. Neuere Blumenduft-Publikationen von Cancino und Damon7,8 verwendeten ähnliche Methoden. Diese Studie legte die Blumen in Glaskammern und übergab gereinigte Luft über sie; dann wurden Duftstoffe aus der Kammer auf poröse Polymeradsorbentien in klaren Pasteurpipetten absorbiert. Die Düfte wurden während dieser Studie für mindestens zwei Stunden gesammelt. Sadler et al.9 führten blumenflorale Duftstudien an einer epiphytischen Orchidee in Südflorida durch, ähnlich wie die ursprüngliche Studie10. Auch in dieser Studie mussten die Blüten über zwei Stunden lang beprobt werden, um den Duft flüchtig zu sammeln, wobei der Duft auf dem porösen Polymeradsorbent gesammelt wurde. Das Papier hier präsentiert eine zerstörungsfreie Methode, die eine viel schnellere Probenahme ermöglicht, die nur 10 Minuten dauert. Anstelle eines Glaskammerofens werden Auch Backbeutel verwendet, die eine flexiblere Bewegung der Kammer ermöglichen und die Wahrscheinlichkeit von Schäden an den Blüten verringern. Diese Beutel sind in verschiedenen Größen erhältlich, so dass die Option, die Größe des Beutels zu wählen, die leicht einzelne Proben passen, ohne die Probe oder das umgebende Material zu beschädigen. Das in dieser Studie verwendete Adsorbentwart war Tenax Porous Polymer Adsorbent. Dies unterscheidet sich von Porapak, da die Probe zur Analyse thermisch auf die GC-MS-Säule eingespeist werden kann, wodurch die Verwendung eines chemischen Lösungsmittels vermieden wird.
Die Methoden in dieser Studie bieten eine Möglichkeit, schnell Duftflüchtige, die von Blumen produziert werden, zu proben und könnten auch zur Probe von Flüchtigen von anderen Proben wie Insektenpheromone oder Pilzflüchtigen verwendet werden. Die verkürzte Probenahmezeit bedeutet, dass die Probe weniger belastet wird und viele Proben in kurzer Zeit entnommen werden können. Zum Beispiel, in Sadler et al.9, die Blume war nur duftend in der Nacht, so dass nur zwei oder drei Proben pro Nacht gesammelt werden konnte. Mit der Methode hier konnten die ganze Nacht proben in 15-20-Minuten-Intervallen von der gleichen Blume genommen werden. Darüber hinaus kann durch die Verwendung von Säcken anstelle von Glaskammern der Kopfraum leichter für die Probenahme im Feld für die In-situ-Sammlung an gefährdeten oder bedrohten Pflanzenarten aufgehängt werden. Mit der hier vorgestellten Methode konnten wir 1,5 bis 2 Meter über dem Boden Blühen proben. Diese Methoden sind unglaublich nützlich für die Duftsammlung im Labor und auf dem Feld und bieten Forschern eine Probenahmetechnik, die schnell und zerstörungsfrei für die Probe ist.
HINWEIS: Parfüms oder duftende Lotionen und Produkte dürfen während eines dieser Verfahren nicht getragen werden.
1. Blumenauswahl
HINWEIS: Die verwendeten Blumen können entweder natürlich in der Umwelt angebaut oder unter künstlichen Umweltbedingungen gehalten werden. Temperatur, Luftfeuchtigkeit und Lichtpegel während der Sammlung können je nach verwendeter Blumenart und welcher Art von Daten gesammelt werden können. Zum Beispiel wurden Daten während des Tages und in der Nacht für die gleiche Blume gesammelt, um festzustellen, ob der Duft im Laufe der Tageszeit variiert, und sowohl von In-situ- als auch von Gewächshausblumen gesammelt wurden.
2. Materialaufbereitung
3. Flüchtige Sammlung
HINWEIS: Sterile Neoprenhandschuhe müssen während dieses Vorgangs getragen werden, da die Berührung mit der Tasche oder Filterpatronen die Proben verunreinigen kann.
4. GC-MS
5. Datenanalyse
Repräsentative Daten aus dem GC-MS werden in Abbildung 1als Chromatogramm dargestellt. Neben dem Chromatogramm wird auch eine Datendatei mit Ergebnissen zur Verfügung gestellt (Zusatzdatei 1). Diese Datendatei bietet die Aufbewahrungszeit für jeden Peak (RT) und eine Identifizierung der Verbindung, die dieser Peak ist (Bibliothek/ID). Spitzen zwischen 10:00 und 15:00 Minuten sind florale flüchtige Stoffe, aufgrund des Molekulargewichts der Verbindungen10. Die Zahlen über den Spitzen stellen die Retentionszeiten der identifizierten Verbindungen dar, auf die die Datendatei der Ergebnisse verweist (Ergänzende Datei 1). Durch die Beschaffung des Chromatogramms und der Datendatei für jede Duftprobe können die Verbindungen verglichen und diejenigen identifiziert werden, die für jede Blütenprobe wiederkehren. Sammlungen können aus diesem Dokument unter der Kategorie "Beispiel" identifiziert werden, die benannt ist, um die gesampelte Blume darzustellen, sowie die Uhrzeit und das Datum der Sammlung (Beispiel: UF1 8AM 03/16/15). Seite 1 dieses Dokuments zeigt auch die Identifizierung spezifischer Verbindungen, die aus der Probe (LibraryID) identifiziert wurden, deren Maximale Retentionszeit aus Abbildung 1 der Verbindung entspricht (Pka), und den Prozentsatz des Gesamtdufts, den jeder flüchtige Stoff umfasst (Fläche %). Alle gesammelten flüchtigen Stoffe, die unter "Bibliothek/ID" aufgeführt sind, können in Pherobase referenziert werden, um festzustellen, ob sie zuvor in einem floralen Duft beschrieben wurden. In der Zusatzdatei 1wurde z. B. eine zusammengesetzte #21 mit einer Retentionszeit (RT) von 10.311 als Benzaldehyd identifiziert. In zukünftigen Proben, wenn Benzaldehyd vorhanden ist, kann es auf Pherobase referenziert werden, um festzustellen, ob es eine wahrscheinliche florale Verbindung für die Blume ist. In Abbildung 2wurde Benzaldehyd auf Pherobase durchsucht. Sobald eine Verbindung ausgewählt wurde, zeigt die Seite eine Liste aller Blumenarten, organisiert nach Pflanzenfamilie, aus der diese Duftverbindung identifiziert wurde. Hervorgehoben in der unteren rechten Ecke von Abbildung 2 ist eine kleine Teilmenge der Orchideenart (Orchidaceae), von der Benzaldehyd bestimmt wurde, um im floralen Duft vorhanden zu sein.

Abbildung 1: GC-MS flüchtige Spitzenergebnisse. Grafische Ergebnisse, die die Spitzenflüchtigen der floralen Duftprobe zeigen. Zahlen über den Spitzen entsprechen einer Liste aller gesammelten flüchtigen Verbindungen, die den Peak zum spezifischen flüchtigen identifiziert. Spitzen zwischen 10:00 und 15:00 Minuten sind am ehesten flüchtige Stoffe aus einem blumigen Duft. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Pherobase-Beispielergebnisse. Ein Beispiel für Ergebnisse einer Pherobase-Suche nach einer Duftverbindung. In dieser Abbildung wurde Benzaldehyd durchsucht, und die Ergebnisse zeigen eine Liste aller Blütenarten, aus denen dieser Duft identifiziert wurde. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Ergänzende Datei 1: Ergebnisdaten. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei anzuzeigen (Rechtsklick zum Herunterladen).
Die Autoren erklären keine Interessenkonflikte.
Hier präsentieren wir ein Protokoll zum Sammeln der blumigen Duftflüchtige aus blühenden Blüten, mit einem zerstörungsfreien Probenahmeverfahren.
USDA-ARS Forschungsprojekt Nummer 6036-22000-028-00D. Die Verwendung von Handels-, Firmen- oder Unternehmensnamen in dieser Publikation dient der Information und Bequemlichkeit des Lesers. Eine solche Verwendung stellt keine offizielle Billigung oder Genehmigung eines Produkts oder einer Dienstleistung durch das Landwirtschaftsministerium der Vereinigten Staaten oder den Agriculture Research Service dar, mit Ausnahme anderer, die geeignet sein könnten. Darüber hinaus stellten das University of Florida Biology Department-Lewis und Varina Vaughn Fellowship in Orchid Biology (2017) sowie ein University of Florida Graduate Research Fellowship (2014-2018) ebenfalls Fördermittel zur Verfügung. Wir danken auch Cindy Bennington von der Stetson University für die Orchideenpflanze, die während der Dreharbeiten zu diesem Video verwendet wurde.
| Schott Union | Cole-Palmer | UX-06390-10 | |
| FEP-Schlauch | Cole-Palmer | UX-06407-60 | |
| Gaschromatographie | Hewlett Packard | 6890 | |
| Glaswolle, silanisiert | Sigma-Aldrich | 20411 | |
| Einlassauskleidung | Agilent | 5062-3587 | |
| Massenspektrometer | Hewlett Packard | 5973 | |
| Reynolds Ofentasche | Reynolds Consumer Products | Truthahngröße | |
| Tenax Poröses Polymer-Adsorptionsmittel | Sigma-Aldrich | 11982 |