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Methodenartikel

Lentiviral CRISPR/Cas9-Vermittelte Genombearbeitung zur Untersuchung hämatopoetischer Zellen in Krankheitsmodellen

11.6K Aufrufe

DOI:

10.3791/59977

3. Oktober 2019

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Beschrieben werden Protokolle für die hocheffiziente Genombearbeitung von murinen hämatopoetischen Stamm- und Vorläuferzellen (HSPC) durch das CRISPR/Cas9-System zur schnellen Entwicklung von Mausmodellsystemen mit hämatopoetischen systemspezifischen Genmodifikationen.

Zusammenfassung

Die Manipulation von Genen in hämatopoetischen Stammzellen mit konventionellen Transgeneseansätzen kann zeitaufwändig, teuer und herausfordernd sein. Durch fortschritte In der Genom-Editing-Technologie und lentivirusvermittelten Transgen-Bereitstellungssystemen wird hier eine effiziente und wirtschaftliche Methode beschrieben, die Mäuse etabliert, bei denen Gene speziell in hämatopoetischen Stammzellen manipuliert werden. Lentiviren werden verwendet, um Cas9-extierende Linien-negative Knochenmarkzellen mit einer Guide-RNA (gRNA) zu transduzieren, die auf bestimmte Gene und ein rotes Fluoreszenz-Reporter-Gen (RFP) abzielt, dann werden diese Zellen in tödlich bestrahlte C57BL/6-Mäuse transplantiert. Mäuse, die mit Lentivirus transplantiert werden, die nicht zielgerichtete gRNA exdrücken, werden als Kontrollen verwendet. Die Transplantation von transduzierten hämatopoetischen Stammzellen wird durch zytometrische Durchflussanalyse von RFP-positiven Leukozyten peripheren Blutes bewertet. Mit dieser Methode können 90 % Transduktion von myeloischen Zellen und 70 % der Lymphzellen nach 4 Wochen nach der Transplantation erreicht werden. Genomische DNA wird aus RFP-positiven Blutzellen isoliert, und Teile der Ziel-Site-DNA werden durch PCR verstärkt, um die Genombearbeitung zu validieren. Dieses Protokoll bietet eine hochdurchsatzhohe Auswertung von hämatopoese-regulatorischen Genen und kann auf eine Vielzahl von Mauskrankheitsmodellen mit hämatopoetischer Zellbeteiligung erweitert werden.

Einleitung

Viele Studien in Hämatologie und Immunologie basieren auf der Verfügbarkeit von genetisch veränderten Mäusen, einschließlich konventioneller und bedingter transgener/knock-out-Mäuse, die hämatopoetische systemspezifische Cre-Treiber wie Mx1-Cre, Vav-Cre und andere verwenden. 1,2,3,4,5. Diese Strategien erfordern die Etablierung neuer Mausstämme, die zeitaufwändig und finanziell belastend sein können. Während revolutionäre Fortschritte in der Genom-Editing-Technologie die Erzeugung neuer Mausstämme in nur 3-....

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Protokoll

Alle Verfahren, die tierische Themen betreffen, wurden vom Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) der University of Virginia genehmigt.

1. Erzeugung und Reinigung von Lentiviruspartikeln

HINWEIS: Lentivirus-Partikel, die die optimierte Guide-RNA enthalten, können durch die detaillierten Protokolle von Addgene erzeugt werden: . Optimierte Methoden für High-Titer Lentivirus Vorbereitung und Lagerung werden an anderer Stelle diskutiert17,18. Kurz gesagt, Lentiviren we....

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Ergebnisse

Mit dem oben beschriebenen Protokoll wurden ca. 0,8-1,0 x 108 Knochenmarkzellen pro Maus erhalten. Die Anzahl der Linien-negativen Zellen, die wir erhalten, beträgt ungefähr 3 x 106 Zellen pro Maus. Typischerweise beträgt die Ausbeute von Knochenmark-Linien-negativen Zellen 4%-5% der Gesamtknochenmark-Kernzellen.

Der Chimäre der transduzierten Zellen (RFP-positiv) wird durch die Durchflusszytometrie des per.......

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Diskussion

Der Vorteil dieses Protokolls ist die Schaffung von Tiermodellen, die spezifische Mutationen in hämatopoetischen Zellen in einer schnellen und äußerst kostengünstigen Weise im Vergleich zu herkömmlichen transgenen Ansätzen der Maus beherbergen. Es wurde festgestellt, dass diese Methode die Erzeugung von Mäusen mit hämatopoetischen Zellgenmanipulationen innerhalb eines Monats ermöglicht. Es gibt mehrere wichtige Schritte in diesem Protokoll, die einer weiteren Prüfung bedürfen.

Screenin.......

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Offenlegungen

Die Autoren haben nichts zu verraten.

Danksagungen

S. S. wurde von einem Postdoktorandenstipendium der American Heart Association 17POST33670076 unterstützt. K. W. wurde durch die NIH-Zuschüsse R01 HL138014, R01 HL141256 und R01 HL139819 unterstützt.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
RPMI Medium 1640 (1X)Gibco11875-093Medium
Sulfamethoxazol und Trimethoprim InjektionTEVA0703-9526-01
1/2 cc LO-DOSE INSULINSPRITZEEXELINT26028allgemeine Versorgung
293T ZellenATCCCRL-3216--Zelllinie
APC-Anti-Maus Ly6C (Klon AL-21)BD Biosciences560599Antikörper
APC-Cy7-Anti-Maus CD45R (RA3-6B2)BD Biosciences552094Antikörper
BD Luer-Lok Einwegspritzen, 10 mlBD309604allgemeiner Vorrat
BD Microtainer Blutentnahmeröhrchen, K2EDTA hinzugefügtBD Bioscience365974allgemeiner Vorrat
BD Precisionglide Nadel, 18 GBD305195allgemeiner Vorrat
BD Precisionglide Nadel, 22 G BD305155allgemeiner Vorrat
BV510-Anti-Maus CD8a (Klon 53-6.7)Biolegend100752Antikörper
BV711-Anti-Maus CD3e (Klon 145-2C11)Biolegend100349Antikörper
Kollagen aus KalbslederSigma-Aldrich9007-34-5allgemeiner Nachschub
Corning Costar Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate, 6 Well Millipore SigmaCLS3471allgemeine Versorgung
CRISPR/Cas9 knock-in MäuseThe Jackson Laboratory028555Maus
DietGel 76AClear H2O70-01-5022allgemeine Versorgung
Dulbecco' s Modifizierter Adler" s Medium (DMEM) - hoher GlukosegehaltSigma AldrichD6429Medium
eBioscience 1X RBC LysepufferThermo fisher Scientific00-4333-57Lösung
Falcon 100 mm TC-behandelte ZellkulturschaleLife Sciences353003allgemeiner
Nachschub Falcon 5 mL Reagenzglas aus Polystyrol mit rundem BodenLife Sciences352054allgemeiner Vorrat
Falcon 50 mL konisch ZentrifugenröhrchenFisher Scientific352098allgemeine
Versorgung Falcon 6 Well Clear Flat Bottom TC-behandelte Multiwell-Zellkulturplatte  Life Science353046Allgemeinbedarf
Fisherbrand Mikrohämatokrit-KapillarröhrchenThermo Fisher Scientific22-362566Allgemeinbedarf
Fisherbrand sterile Zellsiebe, 70 μ mFisher Scientific22363548allgemeine Versorgung
FITC-Anti-Maus CD4 (Klon RM4-5)Invitrogen11-0042-85
BD Bioscience554655Solution
Guide-it Compete sgRNA Screening SystemsClontech632636Kit
Isothesie (Isofluran) LösungHenry Schein29404Lösung
Lenti-X qRT-PCR Titrationskit Takara631235Kit
Lineage Cell Depletion Kit, MausMiltenyi Biotec130-090-858Kit
Millex-HV Spritzenfiltereinheit, 0,45 mmMillipore SigmaSLHV004SLallgemeine Versorgung
PBS pH7,4 (1X)Gibco10010023Lösung
PE-Cy7-Anti-Maus CD115 (Klon AFS98)eBioscience25-1152-82Antikörper
PEI MAXPolysciences24765-1Lösung
Penicillin-Streptomycin-GemischLonza17-602FLösung
PerCP-Cy5.5-Anti-Maus Ly6G (Klon 1A8)BD Biosciences560602Antikörper
pLKO5.sgRNA.EFS.tRFP Addgene57823Plasmid
pMG2DAddgene12259Plasmid
Polybren Infektions-/TransfektionsreagenzSigma AldrichTR-1003-GLösung
Polypropylen ZentrifugenröhrchenBECKMAN COULTER326823allgemeine Versorgung
psPAX2 Addgene12260Plasmid
RadDisk – Nagetier-BestrahlungsscheibeBraintree ScientificIRD-P Mallgemeine Versorgung
Rekombinante Maus SCFPeprotech250-03Lösung
Rekombinante Maus TPO Peprotech 315-14Solution
StemSpan SFEMSTEMCELL Technologies09600Solution
TOPO TA Klonierungskit für die Sequenzierung mit One Shot TOP10 Chemisch kompetente E.coliThermo fisher ScientificK457501Kit
Zombie Aqua Fixable Viability KitBioLegend423102Lösung 
Antikörper-Fixierungspuffer

Referenzen

  1. Sasaki, Y., et al. Defective immune responses in mice lacking LUBAC-mediated linear ubiquitination in B cells. EMBO Journal. 32, 2463-2476 (2013).
  2. Ogilvy, S., et al. Transcriptional regulation of vav, a gene expressed thro....

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

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