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Methodenartikel

Modulation der subzellulären Lokalisierung von Tau als Werkzeug zur Untersuchung der Expression krankheitsbedingter Gene

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DOI:

10.3791/59988

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20. Dezember 2019

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In diesem Artikel

Zusammenfassung

Tau ist ein neuronales Protein, das sowohl im Zytoplasma, wo es Mikrotubuli bindet, als auch im Kern, wo es unkonventionelle Funktionen wie die Modulation von Alzheimer-Gene ausübt. Hier beschreiben wir eine Methode zur Untersuchung der Funktion von nuklearem Tau unter Ausschluss von Interferenzen, die von zytoplasmatischem Tau kommen.

Zusammenfassung

Tau ist ein Mikrotubuli-bindendes Protein, das in Neuronen exprimiert wird und seine wichtigste bekannte Funktion mit der Aufrechterhaltung der Zytoskelettstabilität zusammenhängt. Jüngste Erkenntnisse deuten jedoch darauf hin, dass Tau auch in anderen subzellulären Kompartimenten vorhanden ist, einschließlich des Kerns, in dem er in den DNA-Schutz, in die rRNA-Transkription, in die Mobilität von Retrotransposons und in die strukturelle Organisation der Nukleolus. Wir haben vor kurzem gezeigt, dass nukleare Tau an der Expression des VGluT1-Gens beteiligt ist, was auf einen molekularen Mechanismus hindeutet, der die pathologische Zunahme der Glutamatfreisetzung in den frühen Stadien der Alzheimer-Krankheit erklären könnte. Bis vor kurzem war die Beteiligung von Nuclear Tau an der Modulation der Expression von Zielgenen aufgrund technischer Einschränkungen, die den Ausschluss des Beitrags von zytoplasmatischem Tau oder die Wirkung anderer nachgeschaltete Faktoren, die nicht mit dem nuklearen Tau zusammenhängen. Um diese Ungewissheit zu überwinden, entwickelten wir eine Methode, um die Expression von Zielgenen zu untersuchen, die speziell durch das nukleare Tau-Protein moduliert werden. Wir verwendeten ein Protokoll, das die Verwendung von Lokalisationssignalen und der subzellulären Fraktionierung koppelt, was den Ausschluss der Interferenz von den zytoplasmatischen Tau-Molekülen ermöglicht. Vor allem ist das Protokoll einfach und besteht aus klassischen und zuverlässigen Methoden, die allgemein anwendbar sind, um die kernnukleare Funktion von Tau in anderen Zelltypen und zellulären Bedingungen zu untersuchen.

Einleitung

Die Funktionen des Tau-Proteins im Zellkern haben in den letzten Jahren großes Interesse geweckt, da es nachweislich eng mit Nukleinsäuren1,2,3,4,5,6verbunden ist. Tatsächlich hat eine kürzlich durchgeführte genomweite Studie gezeigt, dass Tau in vivo7genic- und intergene DNA-Sequenzen bindet. Eine Rolle in der nukleolaren Organisation wurde vorgeschlagen8,9,10

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Protokoll

1. Zellkultur

  1. Kultur SH-SY5Y-Zellen (menschliche Neuroblastom-Zelllinie, CRL-2266) in vollständigem Medium (Dulbeccos modifiziertes Eagle-Medium:Nährstoff-Mischung F12 [DMEM/F-12] ergänzt durch 10% fetales Rinderserum [FBS], 2 mM L-Glutamin, 100 U/mL Penicillin und 100 g/ml Streptomycin). Bewahren Sie die Zellen in einem Inkubator bei 37 °C und 5%CO2auf. Zellen in 10 cm Platten wachsen und beim Zusammenfluss aufteilen.

2. Zelldifferenzierung

  1. Um SH-SY5Y-Zellen zu unterscheiden, fügen Sie am Tag nach der Beschichtung 10 M Retinsäure (RA) hinzu, um das Medium für 5 Tage zu vervollständigen.
  2. Der se....

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Ergebnisse

Die Strategie zur Sezieren der Auswirkungen von nuklearem Tau in der Genexpression unter Vermeidung des Beitrags von zytoplasmatischen Tau-Proteinen wurde in Abbildung 1dargestellt. Kurz gesagt, Werden Tau-Proteine, die mit NLS oder NES markiert sind, im nuklearen Fach angesammelt bzw. aus dem Nuklearfach ausgeschlossen. Die funktionelle Wirkung dieses Ungleichgewichts ist die Veränderung der Genexpression, gemessen als Produkt des VGluT1-Gens.

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Diskussion

Wir beschreiben eine Methode, um die Auswirkungen des nuklearen Tau-Proteins auf die Genexpression zu messen. Mit diesem Protokoll ist der Beitrag der zytoplasmatischen Tau stark begrenzt. Kritische Schritte dieses Protokolls sind die folgenden: die Differenzierung der menschlichen Neuroblastom-SH-SY5Y-Zellen, die subzelluläre Fraktionierung und die Lokalisierung von Tau-Protein im Kernraum.

Erstens, wie im repräsentativen Ergebnisabschnitt gezeigt, ist die Differenzierung von SH-SY5Y-Zellen d.......

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Offenlegungen

Die Autoren haben nichts zu verraten.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde durch Zuschüsse der Scuola Normale Superiore (SNS14_B_DIPRIMIO; SNS16_B_DIPRIMIO).

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Alexa Fluor 633 Anti-Maus-IgGLife TechnologiesA21050IF 1:500
Anti-Aktin-AntikörperBETHYL LABORATORIEA300-485AAnti-Kaninchen-WB 1:10.000
Anti-GAPDH-AntikörperFitzgerald Industries International10R-G109aAnti-Maus-WB 1:10.000
Anti-H2B-AntikörperAbcamab1790Anti-Kaninchen-WB 1:15.000
Anti-Tau-13-AntikörperSanta Cruz Biotechnologysc-21796Anti-Maus-WB 1:1.000; IF 1:500
Anti-Tubulin alpha AntikörperThermo Fisher ScientificPA5-16891Anti-Maus WB 1:5.000
Anti VGluT1 AntikörperSigma-AldrichAMAb91041Anti-Maus WB 1:500
BCA Protein Assay KitEurocloneEMPO14500
BDNFAlomone LabsB-250
Blotting-Grade BlockerBiorad1706404Fettfreie Trockenmilch
BOVIN SERUM ALBUMINSigma-AldrichA4503-50g
cOmplete MiniRoche11836170001Proteasehemmer
Kriterium TGX 4-20% Fleckenfrei, 10 wellBiorad5678093
DAPIThermo Fisher Scientific62247
DMEM/F-12GIBCO21331-020
Dulbecco's Modified Eagle's Medium Low GlucoseEurocloneECM0060L
EDTASigma-Aldrich0390-100mlpH = 8, 0,5 M
Fötales RinderserumEurocloneEC50182L
GlycerolSigma-AldrichG5516-500ml
Ziege Anti-Maus IgG-HPRSanta Cruz Biotechnologiesc-2005WB 1:1.000
Ziege Anti-Kaninchen IgG-HPRSanta Cruz Biotechnologysc-2004WB 1:1.000
IGEPAL CA-630Sigma-AldrichI8896-50mlOctylphenoxypoly(ethyleneoxy)ethanol
Immobilon WesternMERCKWBKLS0500
Lab-Tech Chamber Slide 8 Well Glasobjektträgernunc177402
L-GlutaminEurocloneECB3000D100X
Lipofectamine 2000 TransfektionsreagenzThermo FisherScientific 12566014kationisches Lipid
MethanolSigma-Aldrich322415-6X1L
MgCl2Sigma-AldrichM8266-100G
NaClSigma-AldrichS3014-1kg
Opti-MEM reduziertes SerummediumGibco31985070
PEISigma-Aldrich40,872-7
Penicillin/StreptomycinThermo Fisher Scientific1514012210.000 U/ml, 100 mL
phosphatgepufferte Kochsalzlösung (Dulbecco A)OXOIDBR0014G
PhosStopRoche4906837001Phosphatase-Inhibitor
QIAGEN Plasmid Maxi KitQiagen12163Schritt 3.10
RetinsäureSigma-AldrichR2625-100mg
Proteinfraktionierungskit für kultivierte ZellenThermo Fisher Scientific78840
Unterstützte NitrozellulosemembranBiorad1620097
TC-Plate 6wellSARSTEDT833,920
TCS SP2 konfokales Laserscanning-MikroskopLeicaN/A
Triton x-100Sigma-AldrichX100-500mlNichtionisches Tensid
Trypsin-EDTAThermo Fisher Scientific154000540,50%
Tween-20Sigma-AldrichP9416-100ml
VECTASHIELD Antifading-EindeckmediumVector LaboratoriesH-1000
Wizard Plus SV Minipreps DNA-AufreinigungssystemePromegaA1330Stufe 3.5
Subzelluläres

Referenzen

  1. Padmaraju, V., Indi, S. S., Rao, K. S. J. New evidences on Tau-DNA interactions and relevance to neurodegeneration. Neurochemistry International. 57 (1), 51-57 (2010).
  2. Rady, R. M., Zinkowski, R. P., Binder, L. I. Presence of tau in isolated nuclei from human brain.....

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Nachdrucke und Genehmigungen

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