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Methodenartikel

Schnelle, nahtlose Generierung von rekombinanten Poxviren mit Host Range und visueller Auswahl

5.2K Aufrufe

DOI:

10.3791/61049

24. Mai 2020

* These authors contributed equally

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Dies ist eine Methode, um "scarinant" rekombinante Vaknie-Viren mit Host-Range-Auswahl und visuelle Identifizierung von rekombinanten Viren zu generieren.

Zusammenfassung

Das Vaccinia-Virus (VACV) war maßgeblich an der Ausrottung des Variolavirus (VARV), des Erregers der Pocken, aus der Natur beteiligt. Seit seiner ersten Verwendung als Impfstoff wurde VACV als Vektor für therapeutische Impfstoffe und als onkolytisches Virus entwickelt. Diese Anwendungen nutzen das leicht zu manipulierende Genom und das breite Host-Sortiment von VACV als hervorragende Plattform, um rekombinante Viren mit einer Vielzahl von therapeutischen Anwendungen zu erzeugen. Mehrere Methoden wurden entwickelt, um rekombinante VACV zu erzeugen, einschließlich Markerauswahlmethoden und transient dominante Selektion. Hier stellen wir eine Verfeinerung einer Hostrange-Auswahlmethode in Verbindung mit der visuellen Identifizierung rekombinanter Viren vor. Unsere Methode nutzt den selektiven Druck, der von der antiviralen Proteinkinase R (PKR) des Wirts erzeugt wird, gekoppelt mit einem fluoreszierenden Fusionsgen, das mCherry-tagged E3L, einen von zwei VACV PKR-Antagonisten, exzessiiert. Die Kassette, einschließlich des Gens von Interesse und der mCherry-E3L Fusion, wird von Sequenzen flankiert, die aus dem VACV-Genom abgeleitet sind. Zwischen dem Gen von Interesse und mCherry-E3L ist eine kleinere Region, die identisch mit den ersten 150 Nukleotiden des 3' Arms ist, um homologe Rekombination und Verlust des mCherry-E3L-Gens nach der Selektion zu fördern. Wir zeigen, dass diese Methode eine effiziente, nahtlose Erzeugung von rVACV in einer Vielzahl von Zelltypen ermöglicht, ohne dass eine Arzneimittelauswahl oder ein umfangreiches Screening auf mutierte Viren erforderlich ist.

Einleitung

Das Vaccinia-Virus (VACV) war entscheidend für die erste erfolgreiche Tilgung eines menschlichen Erregers, des Variolavirus (VARV), aus der Natur. Seit der Ausrottung des Variola-Virus sind Poxviren einschließlich VACV weiterhin nützliche therapeutische Viren für die Human- und Tiermedizin. Beispielsweise hat ein VACV-basierter Tollwutvirus-Impfstoff die Übertragung von sylvatischer Tollwut in Europa1 und den Vereinigten Staaten sehr wirksam verhindert2. In jüngerer Zeit haben rekombinante Poxviren, die eine Vielzahl von Anti-Tumor-Molekülen (z. B. einkettige Antikörper oder menschliches Erythropoietin) exzieren, ermutig....

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Protokoll

1. Generieren des Rekombinationsvektors

  1. Design-Primer, um die Auswahlkassette zu generieren. Entwerfen Sie jedes einzelne Amplikon mit überlappenden Sequenzen mit benachbarten Amplikonen und dem Vektor, um die isotherme enzymatische Montage von DNA-Molekülen, auch Gibson-Montage genannt, mit einem von mehreren Online-Primer-Design-Tools zu erleichtern.
    HINWEIS: Dieses Protokoll kann auch mit herkömmlichen, auf Einschränkungen endonukleasebasierten Klonierungsmethoden abgeschlossen werden. In diesem Fall können Sie Primer mit den entsprechenden Einschränkungssites anstelle von überlappenden Sequenzen entwerfen.
  2. Mit den in Schritt 1.1 entworfenen ....

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Ergebnisse

Wir verwendeten das in Abbildung 1 dargestellte Verfahren, um einen VACV zu erzeugen, der sowohl die PKR-Antagonisten E3L als auch K3L fehlte, indem wir E3L durch EGFP in einem Virus ersetzten, das bereits für K3L (vP872) gelöscht wurde. Abbildung 2 zeigt rote fluoreszierende Plaques in PKR-kompetenten RK13-Zellen, die auf eine virale Expression von mCherry-E3L hinweisen, sowie EGFP, ausgedrückt in RK13+E3L+K3L-Zellen, die den Verlust von E3L und den Zusammenbru.......

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Diskussion

Hier stellen wir eine Variation einer transienten Markerauswahlstrategie 32 vor, um rekombinante Impfstoffviren zu erzeugen, ohne fremde DNA im endgültigen rekombinanten Virus zu speichern. Unsere Strategie verwendet selektiven Druck, der vom antiviralen Protein PKR des Wirts vermittelt wird, anstatt andere Formen des selektiven Drucks wie Antibiotika. Die Verwendung von antiviralen Wirtsgenen eliminiert die Möglichkeit chemisch induzierter phäkotypischer Veränderungen in den Zellen oder ein erhöh.......

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Offenlegungen

Die Autoren erklären keine konkurrierenden finanziellen Interessen.

Danksagungen

Dieses Projekt wurde von den National Institutes of Health (AI114851) an SR finanziert.

....

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
2X-Q5 Master MixNEBM0492LHigh-Fidelity-Polymerase für PCR
AmpicillinThermoFisher Scientific11593027Bakterielles Selektivmittel
Einweg-ZellschaberThermoFisher Scientific08-100-242Zellschaber zur Ernte infizierter Zellen
EVOS FL Auto 2 Zell-BildgebungssystemThermoFisher ScientificAMAFD2000Fluoreszenzmikroskop
EVOS Light Cube, GFPThermoFisherAMEP4651GFP Cube
EVOS Light Cube, RFPThermoFisherAMEP4652RFP Cube
GenJetSignaGen LaboratoriesSL100489Transfektionsreagenz
Luria Bertani (LB) BouillonGibco10855021Bakterienwachstumsmedium
Monarch DNA Gel-ExtraktionskitNEBT1020LGel-Aufreinigungskit zur Aufreinigung von Amplikons und linearisierten Vektoren
Monarch Plasmid Miniprep KitNEBT1010LMiniprep-Kit zur Aufreinigung von Plasmiden
NanoDrop OneThermoFisher ScientificND-ONE-WSpektralphotometer zur Messung der RNA- und DNA-Konzentration
NEBuilder Master MixNEBE2621LIsothermer enzymatischer Bausatz zur Erzeugung des Rekombinationsvektors
Q500 SonicatorQsonicaQ500-110Sonicator für Viruslysate
RK13-ZellenATCCCCL-37Kaninchen-Nierenzellen
VWR Multiwell-Zellkulturplatten VWR10062-892Zellkulturplatten

Referenzen

  1. Brochier, B., et al. Large-scale eradication of rabies using recombinant vaccinia-rabies vaccine. Nature. 354 (6354), 520-522 (1991).
  2. Pastoret, P. P., Brochier, B. The development and ....

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

Rekombinantes Vaccinia-VirusWirtsbereichsselektionfluoreszierende Markerselektionhomologe RekombinationmCherry-E3L-FusionPKR-kompetente ZellenPlaque-ReinigungFluoreszenzmikroskopiePoxvirus-ModifikationImpfstoffherstellung