Dies ist eine Methode, um "scarinant" rekombinante Vaknie-Viren mit Host-Range-Auswahl und visuelle Identifizierung von rekombinanten Viren zu generieren.
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Methodenartikel
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Dies ist eine Methode, um "scarinant" rekombinante Vaknie-Viren mit Host-Range-Auswahl und visuelle Identifizierung von rekombinanten Viren zu generieren.
Das Vaccinia-Virus (VACV) war maßgeblich an der Ausrottung des Variolavirus (VARV), des Erregers der Pocken, aus der Natur beteiligt. Seit seiner ersten Verwendung als Impfstoff wurde VACV als Vektor für therapeutische Impfstoffe und als onkolytisches Virus entwickelt. Diese Anwendungen nutzen das leicht zu manipulierende Genom und das breite Host-Sortiment von VACV als hervorragende Plattform, um rekombinante Viren mit einer Vielzahl von therapeutischen Anwendungen zu erzeugen. Mehrere Methoden wurden entwickelt, um rekombinante VACV zu erzeugen, einschließlich Markerauswahlmethoden und transient dominante Selektion. Hier stellen wir eine Verfeinerung einer Hostrange-Auswahlmethode in Verbindung mit der visuellen Identifizierung rekombinanter Viren vor. Unsere Methode nutzt den selektiven Druck, der von der antiviralen Proteinkinase R (PKR) des Wirts erzeugt wird, gekoppelt mit einem fluoreszierenden Fusionsgen, das mCherry-tagged E3L, einen von zwei VACV PKR-Antagonisten, exzessiiert. Die Kassette, einschließlich des Gens von Interesse und der mCherry-E3L Fusion, wird von Sequenzen flankiert, die aus dem VACV-Genom abgeleitet sind. Zwischen dem Gen von Interesse und mCherry-E3L ist eine kleinere Region, die identisch mit den ersten 150 Nukleotiden des 3' Arms ist, um homologe Rekombination und Verlust des mCherry-E3L-Gens nach der Selektion zu fördern. Wir zeigen, dass diese Methode eine effiziente, nahtlose Erzeugung von rVACV in einer Vielzahl von Zelltypen ermöglicht, ohne dass eine Arzneimittelauswahl oder ein umfangreiches Screening auf mutierte Viren erforderlich ist.
Das Vaccinia-Virus (VACV) war entscheidend für die erste erfolgreiche Tilgung eines menschlichen Erregers, des Variolavirus (VARV), aus der Natur. Seit der Ausrottung des Variola-Virus sind Poxviren einschließlich VACV weiterhin nützliche therapeutische Viren für die Human- und Tiermedizin. Beispielsweise hat ein VACV-basierter Tollwutvirus-Impfstoff die Übertragung von sylvatischer Tollwut in Europa1 und den Vereinigten Staaten sehr wirksam verhindert2. In jüngerer Zeit haben rekombinante Poxviren, die eine Vielzahl von Anti-Tumor-Molekülen (z. B. einkettige Antikörper oder menschliches Erythropoietin) exzieren, ermutig....
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1. Generieren des Rekombinationsvektors
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Wir verwendeten das in Abbildung 1 dargestellte Verfahren, um einen VACV zu erzeugen, der sowohl die PKR-Antagonisten E3L als auch K3L fehlte, indem wir E3L durch EGFP in einem Virus ersetzten, das bereits für K3L (vP872) gelöscht wurde. Abbildung 2 zeigt rote fluoreszierende Plaques in PKR-kompetenten RK13-Zellen, die auf eine virale Expression von mCherry-E3L hinweisen, sowie EGFP, ausgedrückt in RK13+E3L+K3L-Zellen, die den Verlust von E3L und den Zusammenbru.......
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Hier stellen wir eine Variation einer transienten Markerauswahlstrategie 32 vor, um rekombinante Impfstoffviren zu erzeugen, ohne fremde DNA im endgültigen rekombinanten Virus zu speichern. Unsere Strategie verwendet selektiven Druck, der vom antiviralen Protein PKR des Wirts vermittelt wird, anstatt andere Formen des selektiven Drucks wie Antibiotika. Die Verwendung von antiviralen Wirtsgenen eliminiert die Möglichkeit chemisch induzierter phäkotypischer Veränderungen in den Zellen oder ein erhöh.......
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Die Autoren erklären keine konkurrierenden finanziellen Interessen.
Dieses Projekt wurde von den National Institutes of Health (AI114851) an SR finanziert.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| 2X-Q5 Master Mix | NEB | M0492L | High-Fidelity-Polymerase für PCR |
| Ampicillin | ThermoFisher Scientific | 11593027 | Bakterielles Selektivmittel |
| Einweg-Zellschaber | ThermoFisher Scientific | 08-100-242 | Zellschaber zur Ernte infizierter Zellen |
| EVOS FL Auto 2 Zell-Bildgebungssystem | ThermoFisher Scientific | AMAFD2000 | Fluoreszenzmikroskop |
| EVOS Light Cube, GFP | ThermoFisher | AMEP4651 | GFP Cube |
| EVOS Light Cube, RFP | ThermoFisher | AMEP4652 | RFP Cube |
| GenJet | SignaGen Laboratories | SL100489 | Transfektionsreagenz |
| Luria Bertani (LB) Bouillon | Gibco | 10855021 | Bakterienwachstumsmedium |
| Monarch DNA Gel-Extraktionskit | NEB | T1020L | Gel-Aufreinigungskit zur Aufreinigung von Amplikons und linearisierten Vektoren |
| Monarch Plasmid Miniprep Kit | NEB | T1010L | Miniprep-Kit zur Aufreinigung von Plasmiden |
| NanoDrop One | ThermoFisher Scientific | ND-ONE-W | Spektralphotometer zur Messung der RNA- und DNA-Konzentration |
| NEBuilder Master Mix | NEB | E2621L | Isothermer enzymatischer Bausatz zur Erzeugung des Rekombinationsvektors |
| Q500 Sonicator | Qsonica | Q500-110 | Sonicator für Viruslysate |
| RK13-Zellen | ATCC | CCL-37 | Kaninchen-Nierenzellen |
| VWR Multiwell-Zellkulturplatten VWR | 10062-892 | Zellkulturplatten |
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