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Research Article
Marco Cafora1,2, Francesca Forti3, Federica Briani3, Daniela Ghisotti3, Anna Pistocchi2
1Dipartimento di Scienze Cliniche e Comunità,Università degli Studi di Milano, 2Dipartimento di Biotecnologie Mediche e Medicina Traslazionale,Università degli Studi di Milano, LITA, 3Dipartimento di Bioscienze,Università degli Studi di Milano
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Präsentiert hier ist ein Protokoll für Pseudomonas aeruginosa Infektion und Phagentherapie Anwendung bei Mukoviszidose (CF) Zebrafisch-Embryonen.
Antimikrobielle Resistenzen, eine wichtige Folge diagnostischer Unsicherheit und antimikrobieller Überverschreibung, sind eine zunehmend anerkannte Ursache für schwere Infektionen, Komplikationen und Sterblichkeit weltweit mit enormen Auswirkungen auf unsere Gesellschaft und das Gesundheitssystem. Insbesondere Patienten mit geschwächtem Immunsystem oder bereits bestehenden und chronischen Pathologien, wie Zwiespäitische Fibrose (CF), werden häufigen Antibiotikabehandlungen unterzogen, um die Infektionen mit dem Auftreten und der Diffusion multiresistenter Isolate zu kontrollieren. Daher ist es dringend notwendig, alternative Therapien anzugehen, um bakteriellen Infektionen entgegenzuwirken. Die Verwendung von Bakteriophagen, den natürlichen Feinden von Bakterien, kann eine mögliche Lösung sein. Das in dieser Arbeit beschriebene Protokoll beschreibt die Anwendung der Phagentherapie gegen Pseudomonas aeruginosa Infektion bei CF-Zebrafischembryonen. Zebrafisch-Embryonen wurden mit P. aeruginosa infiziert, um zu zeigen, dass die Phagentherapie gegen P. aeruginosa-Infektionen wirksam ist, da sie Dielealität, bakterielle Belastung und pro-entzündliche Immunantwort bei CF-Embryonen reduziert.
Phage-Therapie, die Verwendung der natürlichen Feinde von Bakterien, um bakterielle Infektionen zu bekämpfen, gewinnt neues Interesse als bakterielle Resistenz gegen Antibiotika wird weit verbreitet1,2. Diese Therapie, die seit Jahrzehnten in Osteuropa verwendet wird, könnte als eine ergänzende Behandlung von Antibiotika bei der Heilung von Lungeninfektionen bei Patienten mit CF und als mögliche therapeutische Alternative für Patienten mit Bakterien, die gegen alle derzeit verwendeten Antibiotika2 ,,3. Vorteile der Antibiotikatherapie sind, dass sich Bakteriophagen an der Infektionsstelle vermehren, während Antibiotika metabolisiert und aus dem Körper eliminiert werden4,5. In der Tat hat sich die Verabreichung von Cocktails von virulenten Phagen, die in verschiedenen Laboratorien isoliert wurden, bei der Behandlung von Pseudomonas aeruginosa Infektionen in Tiermodellen, die so unterschiedlich sind wie Insekten und Säugetiere, als wirksamerwiesen.,7,8 Die Phage-Therapie war auch in der Lage, die bakterielle Belastung in Mitpfoten von P. aeruginosa und Escherichia coli infizierten Verbrennungswunden in einer randomisierten klinischen Studie zu reduzieren9.
Zebrafische (Danio rerio) hat sich vor kurzem als ein wertvolles Modell zur Untersuchung von Infektionen mit mehreren Krankheitserregern, einschließlich P. aeruginosa10,11, Mycobacterium abscessus und Burkolderia cepacia12,13. Durch die Mikroinjektion von Bakterien direkt in die Embryo-Blutzirkulation14 ist es einfach, eine systemische Infektion zu etablieren, die durch das angeborene Immunsystem des Zebrafisches entgegengewirkt wird, das evolutionär mit Neutrophilen und Makrophagenähnlichgeneration ähnlich dem menschlichen Pendant konserviert wird. Darüber hinaus fehlt zebrafischembryonen im ersten Lebensmonat die adaptive Immunantwort, was sie zu idealen Modellen für die Untersuchung der angeborenen Immunität macht, die der kritische Abwehrmechanismus bei menschlichen Lungeninfektionenist 15. Zebrafish hat sich vor kurzem als ein leistungsfähiges genetisches Modellsystem herausgebildet, um den CF-Beginn besser zu verstehen und neue pharmakologische Behandlungen zu entwickeln10,16,17. Das CF-Zebrafischmodell von cftr knock-down, das mit Morpholino-Injektion in Zebrafische erzeugt wurde, präsentierte eine gedämpfte Atemausbruchsreaktion und reduzierte Neutrophilenmigration10, während der cftr-Knock-out zu einer beeinträchtigten inneren Organposition und zur Zerstörung der exokrinen Bauchspeicheldrüse führt, einem Phänotyp, der die menschliche Krankheit widerspiegelt16,17. Von größtem Interesse war die Feststellung, dass die bakterielle Belastung von P. aeruginosa bei cftr-Funktionsverlust-Embryonen signifikant höher war als bei Kontrollen nach 8 Stunden nach der Infektion (hpi), was den Ergebnissen von Mäusen und menschlichen Bronchialepithelzellen2,18entspricht. cftr
In dieser Arbeit zeigen wir, dass die Phagentherapie gegen P. aeruginosa Infektionen in Zebrafischembryonen wirksam ist.
Erwachsene Zebrafische (Danio rerio) aus dem AB-Stamm (European Zebrafish Resource Center EZRC) werden gemäß internationalen (EU-Richtlinie 2010/63/EU) und nationalen Richtlinien (italienisches Dekret vom4. März 2014, Nr. 26) über den Schutz von Tieren, die für wissenschaftliche Zwecke verwendet werden, gepflegt. Die Standardbedingungen werden in der Fischanlage mit einem 14 h Licht/10 h-Dunkelzyklus und einer Tankwassertemperatur bei 28° C festgelegt.
1. Vorbereitung von Lösungen und Werkzeugen
2. P. aeruginosa (PAO1) Inokulumzubereitung
3. Phage Stockvorbereitung
4. Phage-Cocktail-Zubereitung
5. Sammlung und Herstellung von Zebrafischembryonen zur cftr morpholinos Mikroinjektion
HINWEIS: Sammeln Sie 1-2 Zellembryonen von wildlebenden Zebrafischen für cftr morpholinos (cftr-MOs) Mikroinjektion.
6. Mikroinjektion von Zebrafischembryonen mit Bakterien und Phagencocktail
HINWEIS: Um eine systemische Infektion durchzuführen, muss der Embryo eine Durchblutung haben, die in der Regel nach 26 hpf beginnt.
7. Bewertung der bakteriellen Belastung von Embryonen, die mit PAO1 und Phagen injiziert werden
8. Bewertung der Letalität von Embryonen, die mit PAO1 und Phagen injiziert werden
9. Embryo-Vorbereitung für Stereomikroskop-Zeitraffer-Bildgebung der GFP+ PAO1-Infektion
10. Expressionsanalysen von proinflammatorischen Zytokinen
Die hier vorgestellten Ergebnisse und Zahlen beziehen sich auf CF-Embryonen, die durch injektion von cftr morpholinos erzeugt wurden, wie zuvorbeschrieben 10 und in Schritt 5. Zur Validierung des CF-Phänotyps wurde die eingeschränkte Position der inneren Organe wie Herz, Leber und Bauchspeicheldrüse, wie zuvor beschrieben17 (Abbildung 1) berücksichtigt. Ähnliche Ergebnisse wurden bei den WT-Embryonen erzielt, wie in unserer vorherigen Publikation19berichtet.
Die bakterielle Belastung wurde durch phagentherapie bei MIT PAO1 infizierten CF-Embryonen verringert. Darüber hinaus haben wir die bakterielle Belastung bei 8 PSi durch Homogenisierung von Gruppen von 15 Embryonen bewertet: Die durchschnittliche Anzahl der Bakterien (cfu/embryo) in den PAO1-infizierten Embryonen wurde nach der Phagenbehandlung auf etwa 20 % reduziert und bestätigte damit eine weniger schwere Infektion in Gegenwart des Phagencocktails (Abbildung 2).
Die Letalität wurde durch Phagentherapie bei CF-Embryonen reduziert, die mit GFP+ Bakterien PAO1 infiziert waren. CF-Zebrafischembryonen mit 48 pspf wurden mit GFP+ Bakterien des PAO1-Stamms in einer Dosis injiziert, die 50% Letalität nach 20 PSi verursachte (30 cfu/embryo, Abbildung 3A). Die Injektionsstelle war das Eigelb oder der Kanal von Cuvier, um eine systemische Infektion zu erzeugen. Die Phage-Therapie gegen paO1-Infektionen wurde durch Injektion von 2 nL des ebenfalls gemischten Phagencocktails (300-500 pfu/embryo) getestet. Die Injektion wurde zu zwei verschiedenen Zeitpunkten durchgeführt: 30 min (früh) und 7 Stunden (spät) nach bakterieller Injektion. In beiden Fällen wurde die Letalität mit 20 PSi reduziert, was darauf hindeutet, dass die Phagentherapie wirksam ist (Abbildung 3B).
Mit Live-Bildgebung, mit einem fluoreszierenden Stereomikroskop, verfolgten wir auch das Fortschreiten der Infektion in CF-Embryonen, die mit GFP+ PAO1 injiziert wurden, und zeigten die Wirksamkeit der Phagentherapie bei der Verringerung der Ausbreitung fluoreszierender Bakterien über den Dottersack. Der CF+PAO1-injizierte Embryo mit GFP+-Bakterienmultiplikation bei 4, 9, 14 und 18 PSi ist in der oberen Seite von Abbildung 4dargestellt, während der CF+PAO1+phagen-Embryo mit reduzierter Fluoreszenz durch Phagenwirkung gegen Bakterien im unteren Teil dargestellt ist (Abbildung 4).
Die Phage-Therapie reduzierte die entzündliche Reaktion, die durch eine PAO1-Infektion bei CF-Embryonen erzeugt wurde. Wir haben auch die Immunantwort von PAO1 und PAO1 + Phagen-Injektion auf 8 PSi bewertet. Wie erwartet wurde die Expression der pro-inflammatorischen Zytokine TNF-a und IL-1, die mit qPCR-Techniken analysiert wurden, nach der PAO1-Injektion im Vergleich zu Kontrollen signifikant erhöht, während sie mit der Co-Injektion des Phagencocktails reduziert wurde (Abbildung 5A,B).

Abbildung 1: Erzeugung und Validierung von CF-Embryonen bei cftr morpholinos(cftr-MOs) Injektion. (A) Eingeschränkte Position und Schleifen des Herzens in CF-injizierten Embryonen im Vergleich zu Wildtyp-Embryonen (WT). Das Herz wird mit cmlc2-Ausdruck durch In-situ-Hybridisierungstechnikvisualisiert. (B) Eingeschränkte Position der Leber (Pfeile) und Bauchspeicheldrüse in CF-Embryonen im Vergleich zu WT. Leber und Bauchspeicheldrüse werden mit Prox1a-Expression durch In-situ-Hybridisierungstechniken visualisiert. Skalenbalken zeigen 100 m an. liv: Leber; p: Bauchspeicheldrüse. Die Abbildung wird von19nachgedruckt Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Bakterielle Belastung in CF-Embryonen, die mit PAO1 oder PAO1+phagen infiziertsind. Der relative Prozentsatz von cfu/embryo in PAO1+phagen vs PAO1 Embryonen wird angegeben. Der Mittelwert und die SD von drei unabhängigen Experimenten werden berichtet. Die Figur wird ab19nachgedruckt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Tödlichkeit von CF-Zebrafischembryonen, die mit PAO1 und PAO1+phagen infiziert sind. (A) Bestimmung von LD50 in 48 hpf Zebrafischembryonen, die mit cftr-MO im 1-Zell-Stadium (CF-Embryonen) mikroinjiziert und bei 48 hpf mit 2 nL einer PAO1-Kultur mit einer zunehmenden Anzahl von Bakterien (cfu/embryo) infiziert wurden. Die Letalität der Embryonen wurde bei 20 PSi beobachtet. (B) Tödlichkeit bei 20 PSi CF-Embryonen, die mit PAO1 bei 48 hpf infiziert und mit dem Phagencocktail behandelt werden (PAO1+ ). Der Mittlere und SD berichtet werden aus sechs und vier Experimente, jeweils mit 25-40 Embryonen. Die Winkeltransformation wurde auf den Prozentsatz der Letalität angewendet und es wurde eine einseitige ANOVA verwendet, gefolgt von Duncans Test. Die Figur wird ab19nachgedruckt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Abbildung der Wirksamkeit der Phagentherapie bei Zebrafischen. Fortschreiten der Infektion in CF-Embryonen nach PAO1-Injektion (Oberembryon) und Wirksamkeit der Phagentherapie bei PAO1+phagen injizierten Embryonen (unterer Embryo) bei 4, 9, 14 und 18 PSi. Die Maßstabsleiste zeigt 100 Mikrometer an. Die Figur wird ab19nachgedruckt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5: Expression von pro- und entzündungshemmenden Zytokinen nach PAO1- und PAO+Phagen-Verabreichung. Expressionsniveaus der TNF-a (A) und IL-1"-Gene, gemessen mit RT-qPCR bei 8 PSi in CF-Embryonen, die mit PAO1 und PAO1+-0 bei 48 hpf injiziert und mit der Expression von rpl8normalisiert wurden. Der Mittelwert und die SD von vier Experimenten werden berichtet. Die statistische Signifikanz wurde von ANOVA bewertet, gefolgt von Duncans Test: für TNF- a (CF) vs (CF+PAO1) p = 0,015*; (CF) vs.(CF+PAO1+) p = 0,019*; (CF+PAO1) vs.(CF+PAO1+ ) p = 0,77 n.s.; für IL-1 (CF) vs (CF+PAO1) p = 0,00014***; (CF) vs.(CF+PAO1+ ) p = 0,00068***; (CF+PAO1) vs.(CF+PAO1+ ) p = 0,031*. Die Figur wird ab19nachgedruckt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
| Lösungen | Vorbereitung |
| Anästhesie-Stammlösung 25X | 4 mg/ml Tricain in destilliertemH2O. |
| Anästhesie-Arbeitslösung 1X | in destilliertemH2O die Tricain-Stammlösung 25X-Präparat verdünnen, um die 1X-Konzentration (0,16 mg/ml) Tricain edestilliertH2O zu erreichen. |
| CsCl d=1,3 | 20,49 g in 50 ml TN |
| CsCl d=1,4 | 20,28 g in 50 ml TN |
| CsCl d=1,5 | 34,13 g in 50 ml TN |
| CsCl d=1,6 | 41,2 g in 50 ml TN |
| E3-Embryomedium für Zebrafisch-Embryo | 1 L 1von E3 (verdünnen Sie den 50X Vorrat mit destilliertem H2O) + 200 l von 0,05% Methylblau . Bei RT aufbewahren. |
| E3 Embryo Mittelstocklösung (50X) | 73,0 g NaCl, 3,15 g KCl , 9,15 g CaCl2 und 9,95 g MgSO4 in 5 L destillierth H2O. Bei RT lagern. |
| LB-Agar | 10 g/L Trypton, 5 g/L Hefeextrakt, 5 g/L NaCl, 10 g/L Agar |
| LB-Brühe | für 1L: 950 mL H2O, 10 g Tryptone, 10 g NaCl, 5 g Hefeextrakt |
| PBST | PBS 1X + Triton X 1% |
| Physiologische Lösung | 0,9% NaCl |
| Pigmentierung sperrt Stammlösung 10X | 0,3 mg/ml Phenylthiourea (PTU) Pulver in E3-Embryomedium für Zebrafisch-Embryo |
| Pronase-Lagerlösung 5X | 5 mg/ml Pronasepulver im E3-Embryomedium für Zebrafisch-Embryo |
| TN-Puffer | 10 mM Tris HCl pH 8.0, 150 mM NaCl |
Tabelle 1: Vorbereitung von Lösungen.
| Genname | Primer-Sequenz |
| TNF-alpha Fw | 5'-TGCGCGCTCCATAAGACC-3' |
| TNFalpha Rev | 5'-CAAGCCACCTGAAGAAAAGG-3' |
| IL1-beta Fw | 5'-TGGACTTCGCAGCACAAAATG-3' |
| IL1-beta Rev | 5'-CGTTCACTTCACGCTCTTGGATG-3' |
| rpl8 Fw | 5'-CTCCGTCTTCAAAGCCCAT-3' |
| rpl8 Rev | 5'-TCCTTCACGATCCCCTTGAT-3' |
Tabelle 2: Für RT-qPCR verwendete Primer.
Die Autoren haben nichts zu verraten.
Präsentiert hier ist ein Protokoll für Pseudomonas aeruginosa Infektion und Phagentherapie Anwendung bei Mukoviszidose (CF) Zebrafisch-Embryonen.
Diese Arbeit wurde von der italienischen Cystic Fibrosis Foundation (FFC-22/2017; Associazione "Gli amici della Ritty" Casnigo und FFC-23/2019; Un respiro in pié Onlus La Mano tesa Onlus).
| Bacto Agar | BD | 214010 | |
| Calciumchlorid | Sigma-Aldrich | 10043-52-4 | |
| CsCl | Sigma-Aldrich | 289329 | |
| Dulbecco's Phospat gepufferte Kochsalzlösung PBS | Sigma-Aldrich | D8537 | |
| Ethyl-3-aminobenzoat Methansulfonat | Sigma-Aldrich | 886-86-2 | gebräuchlicher Name Tricain |
| Femtojet Mikromanipulator | Eppendorf | 5247 | |
| Fleming/braun P-97 | Sutter Instrument Company | P-97 | |
| LE-Agarose | Sigma-Aldrich | 11685660001 | |
| niedrigschmelzende Agarose | Sigma-Aldrich | CAS 9012-36-6 | |
| Magnesiumsulfat | Sigma-Aldrich | 7487-88-9 | |
| Methylblau | Sigma-Aldrich | 28983-56-4 | |
| Mikroinjektionsnadeln | Harvard-Gerät | ||
| N-Phenylthioharnstoff >=98% | Aldrich-P7629 | 103-85-5 | Oligo-Morpholino-Genwerkzeuge |
| , | entwickelt vom Forscher | ||
| PEG6000 | Calbiochem | 528877 | |
| Phenolrot-Lösung | Sigma-Aldrich | CAS 143-74-B | |
| Kaliumchlorid | Sigma-Aldrich | 7447-40-7 | |
| Pronase | Sigma-Aldrich | 9036-06-0 | |
| Natriumchlorid ACS-Reagenz, ≥ 99.0% | Sigma-Aldrich | S9888 | |
| Stereomikroskop | Leica | S9I | |
| Tris HCl | Sigma-Aldrich | T5941 | |
| Triton X | Sigma-Aldrich | T9284 | |
| Trypton-Oxoid | LP0042B | ||
| Hefeextrakt | Oxoid | LP0021B | |
| Z-MOLDS Mikroinjektion | Wort Präzisionsinstrumente |