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Der Erfolg des vorliegenden Protokolls beruht auf zwei kritischen Schritten, die unabhängig voneinander optimiert wurden: die mechanische Trennung von OPL und IPL, die so wenig destrukturierend wie möglich sein müssen, gefolgt von der vollständigen Proteinlösung jeder Sublayer, die umgekehrt destrukturiert und denaturierend ist. Er hebt auch einige spezifische Punkte hervor, die berücksichtigt werden müssen, um die erfolgreiche Verwirklichung jedes Einzelnen zu gewährleisten.
Das Protokoll hängt nicht von der Eierschalenfarbe, dem Eigewicht, der Art der Produktion oder dem genetischen Stamm der Henne ab. Es hängt jedoch von der Frische des Eis ab. Tatsächlich erfährt das Ei tiefe interne physikalisch-chemische Veränderungen schnell nach dem Legen, obwohl diese Veränderungen verzögert werden können, wenn die Lagerung unter gekühlten Bedingungen14,15durchgeführt wird. Der Verlust von Kohlendioxid durch die Eierschalenporen während der Lagerung führt zu einer Erhöhung des pH-Werts von Eiweiß (von 7,8 auf 9,5), während einige Wasseraustausche zwischen dem Dotter und dem Weißen in der gesamten PL stattfinden. Beide Modifikationen wirken sich negativ auf die molekulare und histologische Struktur der PL aus, die geschwächt und weniger angespannt wird14,15, wahrscheinlich aufgrund physikalisch-chemischer Veränderungen ihres Proteingehalts16,17,18. Es wird davon ausgegangen, dass die Trennung von Sublayern bei gelagerten Eiern sehr schwierig wird, insbesondere wenn die Lagerung über einen längeren Zeitraum bei Raumtemperatur erfolgt. Bis heute wurde das Protokoll mit Eiern durchgeführt, die weniger als 4 Tage bei 4 °C gelagert wurden, und die maximale Lagerdauer für ein Ei zur effizienten Probe von PL-Sublayern ist noch nicht bekannt. Darüber hinaus ist es entscheidend, wenn das Ziel die Analyse jeder Sublayer ist, ist es entscheidend, unbefruchtete Eier zu verwenden. Am Tag der Verlegung ist der Embryo eines befruchteten Eis 23 h alt und seine Entwicklung ist danach sehr schnell, wenn das Ei inkubiert wird. Tatsächlich dehnen sich die embryonale Entwicklung und das Wachstum einiger extraembryonaler Strukturen aus, indem pl als Substrat umbenutzt wird, das dadurch rasch abgebaut und durch den extraembryonalen Dottersack ersetzt wird19.
Nach der manuellen Trennung von Eigelb und Eiweiß muss das Eigelb von Eiweißspuren und von Chalazae gereinigt werden, die fest an der PL befestigt blieben. Die Spitze ist, das Eigelb vorsichtig auf ein Filterpapier zu rollen und umfangreiche Einwaschungen des Dotters in gepufferten Lösungen (10 mM Tris-HCl pH 8) durchzuführen. Der für den Puffer verwendete pH-Wert entspricht dem physiologischen pH-Wert des Eiweißes14 und hat gezeigt, dass er den Proteinverlust minimiert (Abbildung 3). Die Verwendung eines kühlten Puffers wird dann helfen, die PL aus dem Eigelb zu entfernen, da bei 4 °C der Puffer die PL-Entfernung erleichtert, wenn sich das Lipidgelb zurückzieht und bei dieser Temperatur weniger flüssig wird. Zusätzliche Wässerungen ermöglichen die Entfernung von Dotterrückständen aus der PL. Es ist auch wichtig, die Zone auszuschneiden, die der Keimscheibe entspricht, da diese Struktur, die weiblichen Vorkern enthält, möglicherweise nicht repräsentativ für die PL ist. Es ist der Ort der Befruchtung und Vermehrung der embryonalen Zellen, wenn das Ei befruchtet wird. Es soll eine bestimmte Zusammensetzung haben, die nicht repräsentativ für die gesamte PL sein kann, was der Grund ist, warum es entfernt wurde. Dieser spezielle Schritt wird stark erleichtert, wenn das Eigelb in einen kalten Puffer getaucht wird. Obwohl diese Keimscheibenstruktur im vorliegenden Protokoll (aus den Zielen) verworfen wird, könnten spezifische Analysen dieses Bereichs in befruchteten Eiern für Wissenschaftler, die an der Untersuchung der Entwicklung des PL-Gehalts (Proteomik und Aktivität) und der Struktur (Elektronenmikroskopie) interessiert sind, in den frühen Stadien der Embryogenese19,20,21nützlich sein. In diesem Stadium ist die gesamte PL strukturell intakt und kann für die weitere Strukturanalyse mittels Elektronenmikroskopie verarbeitet werden (Abbildung 2),zu Schritt 1.2 oder zu Schritt 2.1 (wenn das Ziel darin besteht, die gesamte PL zu analysieren).
Schritt 1.2 muss unter einem binokularen Sezierenmikroskop durchgeführt werden, da die PL sehr dünn und zerbrechlich ist (ca. 10 m dick). Die Trennung von Sublayern ist im Wasser oder im Puffer ohne minimales Salz nahezu unmöglich, und erste Versuche mit diesen Optionen haben zu schweren PL-Schäden geführt. Somit bleibt der für diesen Schritt gewählte Puffer bei physiologischem pH-Wert (pH 8) und enthält 50 mM NaCl. Dieser Schritt ist anstrengend und muss sorgfältig und schonend durchgeführt werden, um PL-Reißen zu verhindern. Nach der Trennung können die beiden Sublayer leicht identifiziert werden, da sie besondere physikalische Merkmale aufweisen (undurchsichtig versus transluzent). Ein Mangel an Homogenität der IPL unter dem Licht des Mikroskops sollte eine unvollständige Trennung und damit das Vorhandensein der verbleibenden OPL-Spots widerspiegeln, die auf IPL vorhanden sind. Darüber hinaus ist es sehr schwierig, die gesamte Membran zu behandeln und die Verwendung von 2 cm x 3 cm Stücken erhöht die Erfolgschancen erheblich. Die resultierende Sublayer erhalten ist für die histologische Untersuchung durch Elektronenmikroskopie geeignet (Abbildung 1). Bemerkenswert ist, dass auf dem Mikrographen(Abbildung 1) eine spezifische lineare Struktur (0,05 bis 1 m dick) mit dem Namen "Kontinuierliche Membran" (CM) sichtbar ist und während des Trennungsprozesses in der Regel an der einen oder anderen Sublayer befestigt bleibt. Es wurde bereits veröffentlicht, dass bei Verwendung einer relativ hohen Salzmolarität für die Trennung (500 mM), die CM an OPL7 befestigt blieb, während die Verwendung von Wasser5 die Befestigung von CM an IPL begünstigt. In diesem Protokoll wird eine niedrige Salzmolarität verwendet, um die spezifischen Ziele zu erreichen (PL Sublayer strukturell intakt und minimaler Verlust von Proteinen), was bedeutet, dass dieser CM wahrscheinlich mit IPL verbunden ist. Eine zusätzliche Analyse von IPL und OPL durch Transmissionselektronenmikroskopie würde diese Hypothese jedoch eindeutig aufzeigen. PL-, OPL- oder IPL-Schichten, die am Ende von Schritt 1 erhalten wurden, können auch für In-vitro-Assays für Spermien-Ei-Bindungsanalysen22 oder zur Analyse der frühen Schritte der embryonalen Entwicklung23,24verwendet werden.
Schritt 2 bezieht sich auf die Löslichkeit des Proteingehalts, teilweise (Schritt 2.1) oder vollständig (Schritt 2.2). PL und/oder OPL werden zuerst lyophilisiert, um Wassermoleküle zu entfernen und präzise Gewichtsmessungen zu ermöglichen. Tatsächlich besteht PL hauptsächlich aus Wasser (88%)7, während die Trockenmasse im Wesentlichen Proteine (80% bis 90% je nach Studien), Kohlenhydrate, Fette und Mineralien2,7,25enthält. Wenn man bedenkt, dass das in PL enthaltene Wasser durch Gefriertrocknung entfernt wird, dass Kohlenhydrate im Wesentlichen in PL-Glykoproteinen gewonnen werden und dass Fett und Mineralien aus Dotter stammen, die im Wesentlichen durch umfangreiche Wäschen verworfen werden, wird davon ausgegangen, dass die resultierende PL fast ausschließlich aus Proteinen besteht. Daher sollte der gewichtswert, der nach vollständiger Lyophilisierung ermittelt wird, hauptsächlich Proteinen entsprechen. Die gleiche Menge pl, OPL und/oder IPL werden dann im Puffer mit 0,5 M NaCl verdünnt. Die hohe Salzmolarität, die mit der mechanischen Zerstörung des Fasernetzes durch Schleifen kombiniert wird, erleichtert die Proteinlöslichkeit unter nicht-denaturierenden Bedingungen erheblich. Diesem Schritt folgt die vollständige Löslichkeit mit Siede-, SDS-Waschmittel und dem Reduktionsmittel Beta-Mercaptoethanol (Schritt 2.2). Tatsächlich sind einige IPL-Proteine SDS-lösliche Glykoproteine25,26,27 und die Hauptbestandteile von OPL sind NaCl-löslich1,11. Mit diesem Protokoll haben wir nach der Zentrifugation kein verbleibendes Pellet unlöslicher Proteine gesehen, was darauf hindeutet, dass die Löslichkeit wahrscheinlich abgeschlossen war. Proteine aus PL, OPL und/oder IPL wurden dann von SDS-PAGE analysiert. Die resultierenden Proteinprofile stimmen mit der veröffentlichten Literatur2,4,11,16, aber die Auflösung und Intensität des Signals ist stark verbessert und viel homogener zwischen verschiedenen IPL- und OPL-unabhängigen Proben.
Darüber hinaus wird ein quantitativer Vergleich zwischen OPL und IPL durch die Genauigkeit des Gewichts ermöglicht, das wir für die jeweiligen Sublayer2,7abgeleitet haben. Darüber hinaus sind sowohl OPL- als auch IPL-Profile sehr unterschiedlich und mit Ausnahme eines schwachen Bandes bei 14 kDa und 75 kDa teilen sich beide PL-Sublayer nicht sichtbar Bänder mit dem gleichen Molekulargewicht. Diese Beobachtung bestätigt die Effizienz der Sublayer-Trennung ohne signifikante Kreuzkontamination. Nach der einzigen PL-proteomischenAnalyse,die 1 veröffentlicht wurde, sollten die intensivsten Bänder in OPL (<30 kDa) Lysozym (14 kDa), Vitelline-Membran-Außenschichtprotein 1 (17 kDa), Aviärebeta-Defensin entsprechen. 11 (scheinbares Molekulargewicht von 12 kDa), während die intensiven Bänder von IPL (>30 kDa) wahrscheinlich Zona-Pellucida-Protein 1 (102 kDa) und Zona-Pellucida-Protein 3 (47 kDa) sind. Die Verteilung der sehr reichlich vorhandenen PL-Proteine Ovotransferrin (78 kDa), ovalbumin-bezogenes Protein X (45 kDa), Ovalbumin (43 kDa)1 zwischen Sublayern muss noch aufgeklärt werden. Tatsächlich deutet das hohe Molekulargewicht dieser Proteine (>30 kDa) darauf hin, dass es sich um IPL-Proteine handelt, die auf dem SDS-PAGE-Profil basieren, aber ihre Gewebespezifität (oviduct-expressed proteins) würde diese Proteine lieber OPL28,29zuordnen. Darüber hinaus haben einige eine mögliche Kontamination von PL-Proben durch Eiweiß- und Eigelbproteine aufgrund unzureichender Waschungen vorgeschlagen1. Diese fehlenden Informationen sind die Grundlage für die Entwicklung des vorliegenden Protokolls, das weiter für die eingehende quantitative Proteomik von PL, OPL und IPL verwendet werden soll.
Alternativ ist es ab Schritt 2.1 und nach der Zentrifugation möglich, die unlösliche Materie zu entfernen, einige spezifische Proteine für eine weitere biochemische und biologische Charakterisierung zu extrahieren. Ein solcher Ansatz wurde vor kurzem angewendet, um die biologischen Aktivitäten und/oder die 3D-Struktur der beiden Hauptkomponenten der OPL, des Vitelline-Membran-Außenschichtproteins 1 (VMO1) und des Aviären Beta-Defensins 11 (AvBD11)30,31zucharakterisieren. Die Verfügbarkeit dieser Proteine als gereinigte Moleküle kann auch dazu beitragen, spezifische Antikörper für zusätzliche Experimente wie Immunhistochemie oder für die Entwicklung von quantitativen Assays, einschließlich Enzym-Linked Immunosorbent Assays, zu produzieren.
Die beiden Haupteinschränkungen dieses Protokolls sind (1) die Herausforderung bei der Sublayer-Trennung, insbesondere wenn Eier mehr als 4 Tage bei 4°C gelagert wurden und (2) die Tatsache, dass die vollständige Proteinlösung eine Verringerung und Denaturierung von Puffern erfordert, die die intrinsische biologische Aktivität der resultierenden Proben beeinträchtigen. Was die erste Einschränkung betrifft, so erfordert die mechanische Trennung technische Fähigkeiten, die jedoch nach 2 oder 3 experimentellen Trainings leicht erreicht werden können. Einige IPL-Kleinteile bleiben an der OPL befestigt und umgekehrt, da beide Sublayer eng miteinander verbunden sind. Die Kontamination einer Sublayer durch die andere sollte jedoch minimal sein, wenn die mechanische Trennung vorsichtig durchgeführt wird. Typische IPL- und OPL-SDS-PAGE-Profile nach optimaler Sublayer-Trennung sind in Abbildung 5dargestellt. Was die zweite Einschränkung betrifft, so wurden die in diesem Artikel vorgestellten experimentellen Schritte für proteomische Analysen optimiert, um eine erschöpfende Liste der Proteine zu liefern, die jede Subschicht bilden. Für die weitere Charakterisierung der biologischen Aktivitäten jedes Proteins ist es notwendig, bei Schritt 2.1.2 zu stoppen, bevor denaturierende Bedingungen verwendet werden (Schritt 2.2.1, Verwendung von Puffer mit SDS und Beta-Mercaptoethanol gefolgt vom Kochen). Bemerkenswert ist jedoch, dass Proteine, die aus Schritt 2.1.2 resultieren, nur salzlösliche Proteine sind, während salzunlösliche Proteine Aggregate bilden. Eine Möglichkeit zur weiteren Bewertung ihrer jeweiligen Aktivität kann darin bestehen, salzunlösliche Proteine als rekombinante Proteine unter Verwendung heterologer Systeme(E. coli, Baculovirus, Hefe usw.) zu produzieren.
Dieses Protokoll kann für vergleichende Studien an andere Aviäre Eier angepasst werden, um die Originalität jeder Art besser zu schätzen. Tatsächlich zeigt PL einige Vogelspezifitäten sowohl strukturell als auch in Bezug auf die Proteinzusammensetzung, wahrscheinlich aufgrund der Anpassung an neue Umgebungen, aber auch auf Entwicklungsspezifitäten2,6,9,32. Die Entwicklung dieses Protokolls, das maßvolle Technik und klassische Ausrüstung/Materialien erfordert, eröffnet neue Forschungswege auf dem Gebiet der Vogelreproduktions- und -speziationsstudien.