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Methodenartikel

Automatisierte Bildgebung und Analyse zur Quantifizierung fluoreszenzmarkierter Makropinosomen

3K Aufrufe

DOI:

10.3791/62828

24. August 2021

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Automatisierte Assays mit Multi-Well-Mikroplatten sind vorteilhafte Ansätze zur Identifizierung von Signalwegregulatoren, indem sie die Bewertung einer Vielzahl von Bedingungen in einem einzigen Experiment ermöglichen. Hier haben wir das etablierte Makropinosomen-Bildgebungs- und Quantifizierungsprotokoll an ein 96-Well-Mikroplattenformat angepasst und bieten einen umfassenden Überblick über die Automatisierung mit einem Multimode-Plattenleser.

Zusammenfassung

Makropinozytose ist ein unspezifischer Flüssigkeitsphasenaufnahmeweg, der es Zellen ermöglicht, große extrazelluläre Fracht wie Proteine, Krankheitserreger und Zelltrümmer durch Bulk-Endozytose zu internalisieren. Dieser Signalweg spielt eine wesentliche Rolle bei einer Vielzahl von zellulären Prozessen, einschließlich der Regulierung von Immunantworten und des Stoffwechsels von Krebszellen. Angesichts dieser Bedeutung für die biologische Funktion kann die Untersuchung der Zellkulturbedingungen wertvolle Informationen liefern, indem Regulatoren dieses Signalwegs identifiziert und die Bedingungen für die Entdeckung neuartiger therapeutischer Ansätze optimiert werden. Die Studie beschreibt eine automatisierte Bildgebungs- und Analysetechnik unter Verwendung von Standardlaborgeräten und einem zellbildenden Multimode-Plattenleser zur schnellen Quantifizierung des makropinozytären Index in adhärenten Zellen. Die automatisierte Methode basiert auf der Aufnahme von hochmolekularem fluoreszierendem Dextran und kann auf 96-Well-Mikrotiterplatten angewendet werden, um die Beurteilung mehrerer Bedingungen in einem Experiment oder fester Proben auf Glasdeckgläsern zu erleichtern. Dieser Ansatz zielt darauf ab, die Reproduzierbarkeit zu maximieren und die experimentelle Variation zu reduzieren, während er gleichzeitig zeitsparend und kostengünstig ist.

Einleitung

Der unspezifische endozytäre Weg der Makropinozytose ermöglicht es Zellen, eine Vielzahl von extrazellulären Komponenten, einschließlich Nährstoffen, Proteinen, Antigenen und Krankheitserregern, durch Massenaufnahme von extrazellulärer Flüssigkeit und ihren Bestandteilen zu internalisieren1. Obwohl wichtig für die Biologie zahlreicher Zelltypen, wird zunehmend beschrieben, dass der Makropinozytoseweg eine wesentliche Rolle in der Tumorbiologie spielt, wo Tumorzellen durch makropinozytäre Aufnahme in der Lage sind, in Gegenwart einer nährstoffarmen Mikroumgebung zu überleben und sich zu vermehren2,3

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Protokoll

1. Vorbereitung der Materialien

  1. Lösen Sie 70 kDa Dextran, das mit FITC oder Tetramethylrhodamin (TMR) markiert ist, in PBS, um eine 20 mg/ml-Lösung zu erhalten. Lagern Sie die Aliquots bei -20 °C.
  2. DaPI in ddH2O auflösen, um eine 1 mg/ml Lösung zu erhalten. Lagern Sie die Aliquots bei -20 °C.
    VORSICHT: DAPI ist ein potenzielles Karzinogen und sollte mit Vorsicht behandelt werden.
  3. Bereiten Sie am Tag der Fixierung frisches 3,7% ACS-Formaldehyd in PBS zu.
    VORSICHT: Formaldehyd ist ein Fixiermittel, bekanntes Karzinogen und ist giftig, wenn es eingeatmet wird. Stellen Sie die Lösung in einem chemischen Abzug her, um ein Einat....

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Ergebnisse

Wenn die Schritte und die Anpassung des oben beschriebenen Protokolls entsprechend befolgt werden, sollten die endgültigen experimentellen Ergebnisse Informationen darüber liefern, ob die untersuchten Zellkulturbedingungen oder Inhibitoren die Makropinozytose in der interessierenden Zelllinie induzieren oder reduzieren. Um die Validität dieser Ergebnisse zu stärken, ermöglicht die Einbeziehung von Kontrollbedingungen die Überprüfung der Ergebnisse, um festzustellen, ob das Experiment erfolgreich abgeschlossen wurde. Makr.......

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Diskussion

Die Qualität der Experimente und der Datenerfassung hängt stark von der Qualität der Reagenzien, der Optimierung der Einstellungen und der Sauberkeit der Deckgläser und der Mikrotiterplatte ab. Die Endergebnisse sollten eine minimale Variation zwischen den Replikaten ergeben; Biologische Variationen kommen jedoch natürlich vor oder können anderweitig durch eine Reihe von Faktoren verursacht werden. Die Zelldichte kann dazu führen, dass Zellen mehr oder weniger auf Makropinozytose-Induktoren oder -inhibitoren reagieren. E.......

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Offenlegungen

C.C. ist Erfinder eines erteilten Patents mit dem Titel "Cancer diagnostics, therapeutics, and drug discovery associated with macropinocytosis", Patent Nr.: 9,983,194.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde durch NIH/NCI-Zuschüsse (R01CA207189, R21CA243701) an C.C unterstützt. KMO.G. erhielt einen TRDRP Postdoctoral Fellowship Award (T30FT0952). Der BioTek Cytation 5 ist Teil des Sanford Burnham Prebys Cell Imaging Core, der finanzielle Unterstützung aus dem NCI Cancer Center Support Grant (P30 CA030199) erhält. Die Abbildungen 1-3 wurden mit BioRender erstellt.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
0,25 % TrypsinCorning25053CI0,1 % EDTA in HBSS ohne Calcium-, Magnesium- und Natriumbicarbonat
1,5 mL MikrozentrifugenröhrchenFisherbrand05-408-129
10 cm GewebekulturschaleGreiner Bio-One664160CELLSTAR
15 mL ZentrifugenröhrchenFisherbrand07-200-886
2 LBecherglas Fisherbrand02-591-33
24-Well-GewebekulturplatteGreiner Bio-One662160CELLSTAR
25 mL ReagenzreservoirGenesee Scientific Corporation28-121
500 mL BecherglasFisherbrand02-591-30
6-cm GewebekulturschaleGreiner Bio-One628160CELLSTAR
8-Kanal-AspirationsadapterIntegra Biosciences155503
8-Kanal-Aspirationsadapter für StandardspitzenIntegra Biosciences159024
95% EthanolDecon Laboratories Inc4355226
Ammoniakfreier GlasreinigerSparkleFUN20500CT
Black 96-Well-High-Content-Screening-MikroplattePerkinElmer6055300CellCarrier-96 Ultra
Applikator mit BaumwollspitzeFisherbrand23-400-101
DeckgläserFisherbrand12-545-80
Cytation 5 Cell Imaging Multi-Mode ReaderBiotekCYT5FW
DAPIMillipore Sigma5.08741
Dextran 70 kDa - FITCLife TechnologiesD1822Lysin-fixierbar
Dextran 70 kDa - TMRLife TechnologiesD1819
DMSOMillipore SigmaD1435
DPBSCorning21031CVOhne Calcium- und
MagnesiumzangeFine Science Tools11251-20Dumont #
Formaldehyd, 37%Ricca ChemicalRSOF0010-250AACS Reagenzqualität
GlycerinFisher BioReagenzienBP229-1
Härtungsfluoreszenz-EindeckmedienAgilent TechS302380-2DAKO
Hoechst 33342Millipore SigmaB2261
Salzsäure (HCl)Fisher ChemicalA144-212zertifiziert ACS Plus, 36,5%– 38.0%
Fusselfreie TücherKimberly-Clark34155Kimwipes
MiscroscopeObjektträger Fisherbrand12-544-1Premium Glattglas
MehrkanalpipetteGilsonFA100138 Kanäle, 0,5– 10 & Mikro; L
MehrkanalpipetteGilsonFA10012 12 Kanäle, 20– 200 & Mikro; L
MehrkanalpipetteGilsonFA100118 Kanälen, 20 Kanäle; 200 & Mikro; L
Parafilm MPechineyPM996
PlastikfolieKirkland Signature208733Stretch-Tite
SilikonisolatorenGrace Bio Labs Inc66410713 mm Durchmesser x 0,8 mm Tiefe ID, 25 mm x 25 mm
SchiebeadapterBiotek1220548
WaschflascheFisherbrandFB0340922C
mit 12 mm Durchmesser 5

Referenzen

  1. Lin, X. P., Mintern, J. D., Gleeson, P. A. Macropinocytosis in different cell types: similarities and differences. Membranes. 10 (8), 21(2020).
  2. Recouvreux, M. V., Commisso, C. Macropinocytosis: a metabolic adaptation to nutrient stress in cancer. Frontier....

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

Quantifizierung der MakropinozytoseFluoreszenz Dextran AufnahmeMakropinosomen AnalyseHigh Content ScreeningCell Imaging PlattenleserDAPI F rbungserumfreies MediumZellviabilit tsassayRac1 abh ngige Makropinozytose