Hier wird eine neuartige Methode vorgeschlagen, um die Dynamik und den Umsatz des mitochondrialen Systems in einem kultivierten Astrozyten longitudinal zu verfolgen. Im Gegensatz zu einem Zeitrafferansatz an einer festen Gruppe von Zellen oder einer einzelnen Zelle gleichzeitig (am häufigsten in der Literatur verwendet)24,25, können Forscher die Entwicklung des mitochondrialen Systems während mehrerer Tage auf denselben einzelnen Zellen verfolgen. Im Gegensatz zur Single-Well-Live-Bildgebung, bei der eine hohe Lichtexposition erforderlich ist und die Auswahl vieler einzelner Zellen weniger möglich ist, nutzt die vorgeschlagene Methode die Fähigkeit dieses Mikroskops, mehrere verschiedene Zellen in verschiedenen Bereichen eines Brunnens abzubilden und zu verschiedenen Zeitpunkten zu denselben Zellen zurückzukehren, um sie neu abzubilden. Dank der Normalisierung auf eine Baseline, die für jedes gemessene Kriterium an jeder Zelle von Interesse durchgeführt wird, berücksichtigt es die Komplexität des mitochondrialen Systems und untersucht die Wirkung der Behandlung auf jede Zelle relativ zu ihrem eigenen Baseline-Bild. Die Fähigkeit des Mikroskops, diese Art der Bildgebung autonom an bis zu 16 Vertiefungen gleichzeitig durchzuführen (Abbildung von 5 Zellen pro Vertiefung), ermöglicht es, die Heterogenität des mitochondrialen Systems während der Analyse angemessen zu berücksichtigen, ohne die experimentelle Variabilität, die mit der Abbildung verschiedener Bedingungen an verschiedenen Tagen einhergeht.
Die Qualität der Kulturen, die Konzentration der Virusinfektionen, die den LV-G1-MitoTimer-Biosensor exprimieren, die Art des Mikroskops und der Objektive sowie die Auswahl geeigneter Zellen sind kritische Variablen, die in diesem Protokoll so konsistent wie möglich bleiben müssen. Die Zelldichten, die Art des Vektors und die viralen Titer können je nach Fragestellung angepasst werden. Obwohl frühere Arbeiten gezeigt haben, dass die LV-G1-MitoTimer-Expression keine schädlichen Folgen für die mitochondriale Funktion und Dynamikhat 21,22,26,27, ist es wichtig zu überprüfen, ob die Konzentration für die Zellen nicht toxisch ist (z. B. überprüfung der Gesamtzahl der Zellen in der Kontrolle gut). Da eine einzelne Fokusebene verwendet wird, sollten Astrozyten: (1) so flach wie möglich, (2) von anderen markierten Zellen isoliert sein (um die Analyse im Falle einer Verschiebung in der Schale zu vereinfachen) und (3) hohe Fluoreszenzwerte aufweisen. Da Zellen in Kultur in der Morphologie sehr variabel sein können, kann das mitochondriale System sehr heterogen sein. In diesem Zusammenhang kompensiert die Analyse von ROIs (und nicht der gesamten Zelle) einige problematische Regionen, wie die perinukleären Regionen, und verringert die Variabilität. Es ist wichtig, die Baseline auf relativ ähnlichen Zellen durchzuführen und so viele Zellen wie möglich zu beproben. Daher sind High-Content-Erfassungs- und Analysemikroskope ideal geeignet. Bei diesem Längsschnittmonitoring ist es auch wichtig, die Zellen nicht zu sehr lichtbelichtet zu machen, um eine Bleiche des Biosensors zu vermeiden.
Diese Bildgebungsmethode ist nicht ohne Komplexität, und während des gesamten Protokolls sind mehrere Notizen enthalten, die die Fehlerbehebung bei früheren Tests mit dem Mikroskop berücksichtigen. Zum Beispiel hängt die Wahl der verwendeten Plattenbeschichtung vom beabsichtigten Assay ab, aber Empfehlungen für die am besten geeignete Auswahl für Astrozyten-Primärkulturen wurden enthalten. Darüber hinaus sollte die Bildaufnahme aufgrund der interzellulären Variabilität an mindestens 5 Zellen pro Zustand durchgeführt werden. Genauer gesagt, einige Zellen, die bei der Baseline-Bildgebung ausgewählt werden, sterben ab, einige bewegen sich aus dem Rahmen des zugewiesenen Bildaufnahmebereichs und einige ändern ihre Morphologie, was die Individualisierung der Mitochondrien in der Analyse sehr schwierig macht. Die Abbildung vieler Zellen von Anfang an erhöht die Wahrscheinlichkeit einer ausreichend großen Stichprobengröße von Zellen, die am Ende des Experiments analysiert werden können. Zusätzlich zu den komplexeren Aspekten dieser Bildgebungstechnik gibt es einige absolute Einschränkungen, wer von dieser Art der Bildgebung und Analyse profitieren kann. Um die Vorteile der Automatisierung der Bildaufnahme voll ausschöpfen zu können, muss das verwendete Mikroskop über ein Autofokussystem verfügen, das die Geschwindigkeit der Zeitintervalle zwischen den Bildern (d. H. Alle 3 s in diesem Protokoll) bewältigen und sich konsequent auf die betreffende Zelle konzentrieren kann, bevor jedes Bild aufgenommen wird. Darüber hinaus wird diese Methode ohne die JOBS-Software, die den gesamten Bildaufnahmeprozess automatisiert, mühsam und möglicherweise unmöglich, abhängig von der Anzahl der zellen, die abgebildet werden, da es erforderlich wäre, jede Zelle zum richtigen Zeitpunkt manuell zu finden und abzubilden. Schließlich ist diese bildgebende Methode nicht immun gegen das Problem des Photobleichens. Aus diesem Grund ist es, wie bei jeder Langzeiterfassungsmethode, wichtig, fluoreszierende Marker zu wählen, die weniger anfällig für Photobleiching sind, und die Bildaufnahme so anzupassen, dass dieses Problem so weit wie möglich vermieden wird.
Diese Technik unterscheidet sich von anderen, die derzeit verwendet werden, in entscheidender Weise. Im Gegensatz zu anderen Zeitrafferstudien erfordert diese Technik keine Bildgebung an der gleichen Position im Bohrloch die ganze Zeit, noch erfordert sie eine manuelle Bewegung der Platte, um andere Bereiche abzubilden. Dies ermöglicht es den Forschern, viele Zellen unter vielen Bedingungen in einem Zeitrahmen von 24 Stunden abzubilden. Folglich liefert die Fähigkeit, diese Bildgebung und Analyse an vielen Zellen in jedem Bohrloch durchzuführen, die gleichen Populationsinformationen, die man durch die umfassende Untersuchung einer großen Gruppe von Zellen erhalten würde, während zusätzlich spezifische Messungen von jeder abgebildeten Zelle bereitgestellt werden. Während einige Besonderheiten dieser Methode möglicherweise nicht für andere Bildaufnahmemethoden gelten (siehe oben), überwiegen die Vorteile die Komplikationen bei der Art der Analyse, die nach der Aufnahme möglich ist. Diese Technik ermöglicht es den Forschern, die genauen Auswirkungen verschiedener Behandlungen auf das mitochondriale System und folglich auf die kultivierten Astrozyten zu sehen.
Darüber hinaus ist diese Methode in hohem Maße an viele verschiedene wissenschaftliche Fragen zum mitochondrialen Verhalten und zu den Rollen in bestimmten Kontexten anpassbar. Hier befasst sich das skizzierte Protokoll speziell mit kultivierten Astrozyten. Es können jedoch viele andere Zelltypen verwendet werden, und die Behandlungen, die getestet werden können, sind nur durch die untersuchten Fragen begrenzt. Diese Art der Bildgebung hat das Potenzial, das kollektive Wissen und Verständnis des mitochondrialen Verhaltens, der zugrunde liegenden Mechanismen, die zu mitochondrialer Dysfunktion führen, und der Auswirkungen vieler Pathologien auf die angeborene Dynamik in verschiedenen Zelltypen zu verbessern.