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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
DetectSyn ist ein unvoreingenommener, schneller fluoreszierender Assay, der Veränderungen der relativen Synapsenzahl (prä- und postsynaptisches Engagement) über Behandlungen oder Krankheitszustände hinweg misst. Diese Technik verwendet eine Proximity-Ligationstechnik, die sowohl in kultivierten Neuronen als auch in festem Gewebe eingesetzt werden kann.
Synapsen sind der Ort der Kommunikation zwischen Neuronen. Die Stärke des neuronalen Schaltkreises hängt mit der synaptischen Dichte zusammen, und der Abbau von Synapsen ist charakteristisch für Krankheitszustände wie schwere depressive Störungen (MDD) und Alzheimer-Krankheit. Traditionelle Techniken zur Untersuchung der Synapsenzahlen umfassen die genetische Expression von fluoreszierenden Markern (z. B. grün fluoreszierendes Protein (GFP)), Farbstoffe, die ein Neuron füllen (z. B. Carbocyaninfarbstoff, DiI), und der immunfluoreszierende Nachweis von Wirbelsäulenmarkern (z. B. postsynaptische Dichte 95 (PSD95)). Ein wichtiger Vorbehalt gegenüber diesen Proxy-Techniken ist, dass sie nur postsynaptische Veränderungen identifizieren. Eine Synapse ist jedoch eine Verbindung zwischen einem präsynaptischen Terminal und einer postsynaptischen Wirbelsäule. Der Goldstandard zur Messung der Synapsenbildung/-elimination erfordert zeitaufwändige Elektronenmikroskopie- oder Array-Tomographie-Techniken. Diese Techniken erfordern spezielle Schulungen und teure Ausrüstung. Darüber hinaus kann nur eine begrenzte Anzahl von Neuronen beurteilt werden und wird verwendet, um Veränderungen in einer ganzen Gehirnregion darzustellen. DetectSyn ist eine schnelle fluoreszierende Technik, die Veränderungen der Synapsenbildung oder -eliminierung aufgrund eines Krankheitszustands oder einer Arzneimittelaktivität identifiziert. DetectSyn verwendet einen schnellen Proximity-Ligationsassay, um nebeneinander liegende prä- und postsynaptische Proteine und die Standard-Fluoreszenzmikroskopie nachzuweisen, eine Technik, die den meisten Labors leicht zur Verfügung steht. Die fluoreszierende Detektion der resultierenden Puncta ermöglicht eine schnelle und unvoreingenommene Analyse von Experimenten. DetectSyn liefert repräsentativere Ergebnisse als die Elektronenmikroskopie, da größere Bereiche analysiert werden können als eine begrenzte Anzahl fluoreszierender Neuronen. Darüber hinaus funktioniert DetectSyn für in vitro kultivierte Neuronen und festsitzende Gewebeschnitte. Schließlich wird eine Methode bereitgestellt, um die von dieser Technik gesammelten Daten zu analysieren. Insgesamt bietet DetectSyn ein Verfahren zur Erkennung relativer Veränderungen der Synapsendichte über Behandlungen oder Krankheitszustände hinweg und ist zugänglicher als herkömmliche Techniken.
Synapsen sind die grundlegende Einheit der Kommunikation zwischen Neuronen1. Viele Synapsen zwischen Neuronen innerhalb derselben Regionen führen zu Schaltkreisen, die das Verhalten vermitteln2. Synapsen bestehen aus einem präsynaptischen Terminal von einem Neuron, das Neurotransmitter oder Neuropeptide freisetzt, die Informationen an postsynaptische Rezeptoren eines anderen Neurons weiterleiten. Die Summe präsynaptischer Signale bestimmt, ob das postsynaptische Neuron ein Aktionspotential auslöst und die Nachricht an andere Neuronen weitergibt.
Synaptopathologie, der Abbau von Synapsen, entsteht bei Krankheiten und Störungen, die durch ein vermindertes neuronales Volumen gekennzeichnet sind, wie Alzheimer-Krankheit und schwere depressive Störung, was zu Schaltkreisen führt, die nicht mehr optimal funktionieren 3,4,5. Die Wiederherstellung der Synapsendichte liegt wahrscheinlich der Wirksamkeit potenzieller Behandlungen für diese Erkrankungen zugrunde. Zum Beispiel wurde kürzlich gezeigt, dass zunehmende Synapsen der Verhaltenswirksamkeit von schnellen Antidepressivazugrunde liegen 6. Um mögliche synaptopathologische Behandlungen schnell zu screenen, benötigen Forscher Techniken, die Veränderungen der Synapsenzahlen schnell identifizieren.
Aktuelle Methoden sind entweder zeitaufwendig und teuer (Elektronenmikroskopie, Array-Tomographie) oder sie untersuchen nur postsynaptische Veränderungen, ohne präsynaptische Interaktion (Wirbelsäulenanalysen, Immunfluoreszenz/-kolokalisation) einzubeziehen. Farbstoffe wie DiI oder fluoreszierende Proteine wie GFP helfen, Neuronen sichtbar zu machen und postsynaptische Stacheln zu charakterisieren. Die Wirbelsäulenanalyse verwendet jedoch von Forschern definierte Verhältnisse, um die Morphologie zu bestimmen, was die Reproduzierbarkeit verringernkann 7. Darüber hinaus wird immer noch aufgedeckt, wie sich die verschiedenen Wirbelsäulenklassen auf funktionelle Synapsen beziehen8. Die Wirbelsäulenbildung kann vorübergehend sein und die postsynaptische Plastizität widerspiegeln, aber diese Stacheln könnten eliminiert werden, bevor sie sich mit einem präsynaptischen Neuron9 zu einer Synapse stabilisieren.
Die Kolokalisation bietet einen besseren Proxy für Synapsen als die Wirbelsäulenanalyse, da man eine Immunstrukturierung für präsynaptische und postsynaptische Proteine durchführen kann. Synaptische Proteine können jedoch niedrige Kolokalisationswerte ergeben, da die Proteine nebeneinander stehen und sich möglicherweise nicht konsistent überlappen. Da die Proteine nicht vollständig überlagert sind, können Kolokalisierungstechniken aufgrund dieser fehlenden Informationen Änderungen der Synapsenbildung möglicherweise nicht genau messen. Obwohl sowohl die Elektronenmikroskopie (EM) als auch die Array-Tomographie hochauflösende Bilder von Synapsen liefern, sind sie zeitaufwendig. EM erfordert außerdem spezielle Ausrüstung, und die Forscher sind auf kleine Gewebevolumina für ein bestimmtes Experiment beschränkt. Während die Array-Tomographie elegant die Möglichkeit bietet, auf ultradünne Abschnitte nach vielen Proteinen zu suchen und mit EM10 kombiniert werden kann, kann diese Technik zu arbeitsintensiv sein und den Rahmen von Experimenten sprengen, die schnell nach Veränderungen der Synapsenbildung suchen müssen.
DetectSyn ist eine spezifische Anwendung des Duolink Proximity Ligation Assay. Der PLA-Assay ermöglicht den allgemeinen Nachweis von Protein-Protein-Interaktionen. DetectSyn überbrückt postsynaptische Proxy-Messungen, indem es ein fluoreszierendes Signal verstärkt, das von markierten prä- und postsynaptischen Proteinen innerhalb von 40 nm voneinander emittiert wird. Wenn sich die synaptischen Proteine innerhalb von 40 nm befinden, wie in einem synaptischen Spalt, dann hybridisieren die sekundären Antikörper, die DNA-Sonden enthalten, zu zirkulärer DNA. Diese hybridisierte zirkuläre DNA exprimiert eine fluoreszierende Sonde, die dann mit Standard-Fluoreszenzmikroskopie-Techniken amplifiziert und nachgewiesen wird (siehe Abbildung 1). Entscheidend ist, dass diese Technik im Gegensatz zu EM und Array-Tomographie keine spezielle Ausrüstung erfordert und etwa die gleiche Zeit in Anspruch nimmt wie die Standard-Immunhistochemie. Die Zugänglichkeit dieser Technik ermöglicht es somit Forschern außerhalb forschungsintensiver Institutionen, an der synaptopathologischen Forschung teilzunehmen. Darüber hinaus kann diese Technik Veränderungen der synaptischen Dichte in mehreren Gehirnregionen innerhalb eines einzigen Experiments untersuchen und bietet eine ganzheitlichere Darstellung synaptischer Veränderungen aufgrund von Krankheit oder Behandlung.
Die Isolierung von Zellen und Gewebe von Tieren erfolgte in Übereinstimmung mit dem Leitfaden der National Institutes of Health für die Pflege und Verwendung von Labortieren und wurde vom Wake Forest Institutional Animal Care and Use Committee genehmigt.
HINWEIS: Dieses Protokoll wird für Proben verwendet, die bereits gemäß bestimmten experimentellen Paradigmen und Anforderungen behandelt und fixiert wurden. Zu Demonstrationszwecken wird die Synapsenbildung durch eine schnelle antidepressive Behandlung verwendet, um diese Synapsennachweistechnikhervorzuheben 6. Neuronen, die zuvor auf Deckgläsern kultiviert, behandelt, in 4% Paraformaldehyd (PFA) fixiert und in 1x phosphatgepufferter Kochsalzlösung (PBS) gelagert wurden, werden verwendet, um die In-vitro-Verfahren hervorzuheben. Zuvor geschnittenes Hippocampusgewebe (25 μm dick) von behandelten Mäusen, transkardial perfundiert mit eiskaltem PBS und 4% PFA und dann in Kryoprotektor gelagert, wird verwendet, um die Schneideverfahren hervorzuheben. Bitte beachten Sie11,12 für weitere Informationen darüber, wie man Neuronen oder transkardial perfusionierte Nagetiere. Eine grafische Darstellung dieses Verfahrens finden Sie in Abbildung 1.

Abbildung 1: Grafische Darstellung des DetectSyn-Assays. Nach der Permeabilisierung der Zellmembranen binden primäre Antikörper für Synapsin1 und PSD95 an diese synaptischen Proteine. Secondaries mit Oligonukleotid-Tags binden dann an die primären Antikörper. Wenn Synapsin1 und PSD95 wie bei einer Synapse innerhalb von 40 nm liegen, interagieren die Oligonukleotide und ein fluoreszierender Tag wird verstärkt. Dieses fluoreszierende Signal kann dann mittels Standardmikroskopie abgebildet und analysiert werden. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
1. Proben spülen
2. Proben blockieren und durchpermeabilisieren
3. Inkubieren von Proben in primären Antikörpern
4. Proben waschen und dann in sekundären Antikörpern inkubieren
5. Ligation
6. Verstärkung
7. Montage
8. Erhalten Sie digitale Bilder mit einem konfokalen Mikroskop
9. Analyse
Daten, die von Heaney et al.6 modifiziert wurden, werden vorgestellt, um ein Experiment zu demonstrieren, bei dem eine erhöhte Synapsenbildung erwartet wird (siehe6 für weitere Informationen und eine eingehendere Diskussion des Mechanismus). Zuvor konnte gezeigt werden, dass schnelle Antidepressiva die Aktivierung des inhibitorischen metabotropen Rezeptors GABAB (Gamma-Aminobuttersäure-Subtyp B) erfordern, um wirksam zu sein13. Darüber hinaus deuteten frühere Daten darauf hin, dass schnelle Antidepressiva die postsynaptischen Marker erhöhen14; Daher wurde DetectSyn verwendet, um die Hypothese zu testen, dass schnelle Antidepressiva die Synapsenzahlen erhöhen, um wirksam zu sein.
In kultivierten Neuronen werden vier Bedingungen getestet. Zuerst wurden in der oberen Tafel von Abbildung 2A kultivierte Neuronen mit dem Fahrzeug unter den gleichen Bedingungen wie die experimentelle Kontrolle behandelt. Der primäre Antikörper PSD95 wird jedoch weggelassen, um eine technische Kontrolle für den DetectSyn-Assay bereitzustellen (siehe Abbildung 1, wie jede Komponente zum Signal beiträgt). Als nächstes werden Neuronen im Control Panel erneut mit dem Fahrzeug behandelt, erhalten aber sowohl PSD95- als auch Synapsin1-Primärwerte. Als nächstes werden kultivierte Neuronen nur mit dem schnellen Antidepressivum Ro-25-6981 (Ro) oder Ro plus dem GABAB-Agonisten Baclofen (Bac) behandelt. Wie bereits gezeigt13, sind sowohl das schnelle Antidepressivum Ro-25-6981 als auch der GABAB-Agonist Baclofen für die in vitro Wirksamkeit von Ro-25-6981 erforderlich. So wird eine Zunahme der Synapsenbildung durch eine Zunahme der weißen Puncta nachgewiesen (Abbildung 2A). Ohne Baclofen wird kein Anstieg der Synapsenbildung in vitro beobachtet.
In vivo reichen die basalen GABA-Spiegel aus, damit das schnelle Antidepressivum13 wirkt, so dass nur das schnelle Antidepressivum Ro-25-6981 über intraperitoneale Injektion an Mäuse verabreicht wird (Abbildung 2B). Das linke Feld von Abb. 2B stellt eine weitere technische Kontrolle für den DetectSyn-Assay dar. Hippocampusales Gewebe einer mit Kochsalzlösung behandelten Maus wurde mit beiden Primärgeweben auf PSD95 und Synapsin1 untersucht, aber eine der sekundären Maus wurde weggelassen. Eine Zunahme der Synapsenbildung aufgrund der Behandlung mit dem schnellen Antidepressivum Ro-25-6981 im Vergleich zu mit Kochsalzlösung behandelten Mäusen ist in den mittleren und rechten Panels von Abbildung 2B nachgewiesen.
Repräsentative Bilder für technische Kontrollen in vitro und ex vivo werden gezeigt. In Abbildung 2A wird eine der primären Paare für die synaptischen Paare weggelassen (d. h. PSD95), und in Abbildung 2B wird eine der sekundären Paare weggelassen. Während einige Puncta in den technischen Kontrollbildern erscheinen, haben sie im Allgemeinen nicht die gleiche Größe, wie der weiße Fleck im oberen Bereich von Abbildung 2A im Vergleich zu den großen Puncta in den anderen Panels zeigt. Darüber hinaus befinden sich diese Puncta nicht an der gleichen Stelle wie die quantifizierte Puncta, wie einige Puncta zeigen, die innerhalb des soma der technischen Kontrolle in Abbildung 2B erscheinen. Typischerweise treten unspezifische Puncta in den Kernen auf, möglicherweise aufgrund des Vorhandenseins von DNA.
Um die repräsentativen Ergebnisse in Abbildung 2A zu analysieren, wurden Dendriten (visualisiert durch MAP2-Färbung und hier in einem grauen Umriss dargestellt) mit einem Freihand-Zeichenwerkzeug verfolgt, um Bereiche von Interesse (ROIs) zu erstellen. Zunächst wurde der Bereich der MAP2-ROIs mit der Funktion NIS-Elemente, ROI-Daten, auf der Registerkarte Automatisierte Messergebnisse ermittelt. Als Nächstes wurden Puncta mit der Schwellenwertfunktion in NIS-Elementen erkannt. Diese Funktion erstellt eine binäre Maske von Objekten, die innerhalb eines definierten Intensitätsschwellenwerts liegen. Anschließend wurde die Anzahl der binären Objekte innerhalb der MAP2-ROIs mithilfe der NIS-Elementfunktion Binär in ROI auf der Registerkarte Automatisierte Messergebnisse erkannt. Die in der Grafik rechts von Abbildung 2A dargestellten Daten sind die normalisierten Werte der Puncta dividiert durch die Fläche des ROI.
Um die repräsentativen Ergebnisse in Abbildung 2B zu analysieren, wurde das Stratum Radiatum des CA1 mit einem Freihand-Zeichenwerkzeug verfolgt, um einen ROI zu erzielen. Erstens wurde der Bereich des ROI mit Hilfe der ROI-Datenfunktion ermittelt, wie im obigen Absatz beschrieben. Als nächstes wurden Puncta mit der Funktion "Spot-Erkennung - Helle Flecken" erkannt, die sich im Menü "Binär" befindet. Als nächstes wurden die Durchmesser- und Kontrastwerte basierend auf der visuellen Inspektion mehrerer Scheiben aus allen Behandlungen ausgewählt. Sobald diese Werte festgelegt waren, wurden sie einheitlich auf alle analysierten Bilder angewendet. Die Funktion Spot-Erkennung erstellt binäre Masken von Objekten innerhalb der definierten Durchmesser- und Kontrastparameter. Anschließend wurde die Anzahl der binären Objekte innerhalb der MAP2-ROIs mithilfe der NIS-Elementfunktion Binär in ROI auf der Registerkarte Automatisierte Messergebnisse erkannt. Die in der Grafik rechts von Abbildung 2B dargestellten Daten sind die normalisierten Werte der Puncta dividiert durch die Fläche des ROI.

Abbildung 2: Nachweis von Synapsen mittels DetectSyn-Assay. Weiße Puncta repräsentieren Synapsen, die mit dem DetectSyn PSD95-Synapsin1 Proximity-Ligationsassay (gelbe Pfeilspitzen) in (A) in in vitro kultivierten primären Hippocampus-Neuronen und (B) ex vivo CA1 Stratum radiatum nachgewiesen wurden. In (A) stellt der graue Umriss die MAP2-Färbung dar. In (A) stellt die mit PLA-Steuerung gekennzeichnete obere Platte Proben dar, die nur mit einem Fahrzeug behandelt wurden, wie die Steuerung. Die PSD95-Primärquelle wurde jedoch nicht in die Reaktion einbezogen. In den letzten beiden Panels wurden Neuronen 90 min lang mit dem schnellen Antidepressivum Ro-25-6981 (Ro, 10 μM) oder Ro plus dem GABAB-Agonisten Baclofen (Bac, 50 μM) behandelt. Die erhöhte Anzahl von Puncta (identifiziert mit gelben Pfeilspitzen) deutet darauf hin, dass in vitro die Synapsenbildung nur zunimmt, wenn das schnelle Antidepressivum Ro-25-6981 mit dem GABAB-Agonisten verabreicht wird. In (B) steht Grün für Dendriten, die mit MAP2 gefärbt sind, und Blau für Kerne, die mit DAPI gefärbt sind. Einzelne Dendriten, die in den zusammengeführten Bildern mit gelben Rechtecken umrandet sind, werden unter repräsentativen Bildern isoliert, um zu zeigen, dass Puncta zu Dendriten lokalisiert werden. Die Tiere wurden mit Ro-25-6981 (10 mg/kg) behandelt, und 45 Minuten nach der Behandlung wurde Gewebe gesammelt. Die erhöhte Anzahl von Puncta (identifiziert durch gelbe Pfeilspitzen) deutet darauf hin, dass in vivo die Anzahl der Synapsen mit basaler GABA-Signalisierung und dem schnellen Antidepressivum Ro-25-6981 zunimmt. Die Quantifizierung der repräsentativen Ergebnisse wird durch die Balkendiagramme dargestellt und gibt die durchschnittliche Anzahl der DetectSyn-Puncta geteilt durch die MAP2-Fläche an. Die Ergebnisse werden auf die experimentelle Kontrolle normalisiert. Die Bilder wurden mit einem konfokalen Nikon A1plus-Mikroskop aufgenommen. Maßstabsstäbe = (A) 10 μm; (B, oben) 50 μm; (B, unten) 5 μm. Balken stellen den mittleren +/- Standardfehler des Mittelwerts dar. Von der Einweg-ANOVA analysierte Ergebnisse: * p < 0,05, ** p < 0,01, *** p < 0,001, **** p < 0,0001 durch Post-hoc-Analyse. Die Figur wurde von Heaney et al.6 modifiziert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Die Autoren berichten von keinem Interessenkonflikt.
DetectSyn ist ein unvoreingenommener, schneller fluoreszierender Assay, der Veränderungen der relativen Synapsenzahl (prä- und postsynaptisches Engagement) über Behandlungen oder Krankheitszustände hinweg misst. Diese Technik verwendet eine Proximity-Ligationstechnik, die sowohl in kultivierten Neuronen als auch in festem Gewebe eingesetzt werden kann.
Diese Arbeit wurde von den National Institutes of Health NINDS R01 NS105005 (KRG) und NS105005-03S1 (KRG), dem Verteidigungsministerium USAMRMC W81XWH-14-1-0061 (KRG), NIAAA R01AA016852, NIAAA T32AA007565 (CFH) und einem Zuschuss von FRAXA Research (CFH) und der Alzheimer's Association, AARG-NTF-21-852843 (KRG), AARF-19-614794-RAPID (KRG), unterstützt.
| 10x PBS | Fisher Scientific | BP39920 | PBS made in house works, ebenfalls. |
| 24-Well-Platten | Fisher Scientific | FB012929 | Für Gewebeschnitte können vorsterilisierte Platten unnötig sein. |
| 50 mL konische Röhrchen | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
| Aluminiumfolie | Fisher Scientific | 15-078-290 | |
| Hühnchen-Anti-MAP2-Antikörper | Abcam | ab5392 | |
| Klarlack | Fisher Scientific | NC1849418 | Andere Klarlacke funktionieren auch. |
| Cold Block | Fisher Scientific | 13131012 | |
| PC-Arbeitsplatz | HP | ||
| Konfokal- oder Fluoreszenzmikroskop | Nikon | A1R HD25 | |
| Esel Anti-Hühner FITC | Fisher Scientific | SA1-72000 | |
| Duolink Esel Anti-Maus PLUS | Sigma | DUO92001 | |
| Duolink Esel Anti-Kaninchen MINUS | Sigma | DUO92005 | |
| Duolink In-situ-Detektionsreagenzien Fernrot | Sigma | DUO92013 | Enthält Ligationsmaterial, Amplifikationsmaterial, Ligase und Polymerase. |
| Duolink In Situ Eindeckmedium mit DAPI | Sigma | DUO82040 | |
| Duolink In Situ Wash Buffers, Fluorescence | Sigma | DUO82049 | Enthält Wash Buffer A und Wash Buffer B; verdünnen Sie Wash Buffer B auf 1% in diH20 für 1% Wash Buffer B. |
| Fisher Scientific | NC9691026 | Zobelhaar mit feiner Spitze | inder Größe 00 oder 000 ist auch in Bastelgeschäften erhältlich |
| Fisherbrand Deckgläser: Rechtecke | Fisher Scientific | 12545MP | Deckglas ist für kultivierte Neuronen, die sich bereits auf Glasdeckgläsern befinden, nicht erforderlich. |
| Fisherbrand Superfrost Plus Objektträger | Fisher Scientific | 1255015 | Für kultivierte Neuronen, die bereits auf Glasdeckgläsern vorhanden sind, können Superfrost-Objektträger unnötig sein. |
| Gefrierschrank, -20°; C | VWR | 76449-108 | |
| Deckgläser aus Glas | Fisher Scientific | 125480 | |
| Glycin | Fisher Scientific | BP381-1 | |
| Bildverarbeitungssoftware | z.B. NIS Elements, ImageJ | ||
| Inkubator | Fisher Scientific | 15-015-2633 | |
| Große Petrischale, 100mm | Fisher Scientific | FB0875712 | |
| Wasser in molekularer Qualität | Fisher Scientific | BP24701 | |
| Maus Anti-Synapsin1-Antikörper | Synaptic Systems | 106-011 | |
| Normales Eselsserum | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
| Orbitalschüttler | Fisher Scientific | 02-106-1013 | |
| Parafilm | Fisher Scientific | 13-374-10 | |
| Pipettenspitzen | Fisher Scientific | 02-707-025 | |
| Pipetten | Fisher Scientific | 14-388-100 | Arbeitsvolumina von 3 & Mikro; L bis 500 µ L |
| Pasteurpipette aus Kunststoff | Fisher Scientific | 02-708-006 | |
| Präzisionspinzette/Foreceps | Fisher Scientific | 12-000-122 | |
| Kaninchen-Anti-PSD95-Antikörper | Abcam | ab18258 | Andere Antikörperpaare können ebenfalls optimiert wirken. |
| Kühlschrank | VWR | 76470-402 | |
| Kleine Petrischale, 60 mm | Fisher Scientific | FB0875713A | |
| Zeitschaltuhr | Fisher Scientific | 14-649-17 | |
| zwischen 20 | Fisher Scientific | BP337-100 |