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Alle kardialen CT-Daten stammen aus präklinischen Studien von GrOwnValve mit Genehmigung des Rechts- und Ethikausschusses des Landesamtes für Gesundheit und Soziales, Berlin (LAGeSo). Alle Tiere erhielten eine humane Pflege nach den Richtlinien der Europäischen und Deutschen Gesellschaft für Versuchstierkunde (FELASA, GV-SOLAS). In dieser Studie wurde das Pre-CT von Schaf J ausgewählt, um die Verfahren zu veranschaulichen.
1. Führen Sie 3D-Herz-CT bei Schafen durch
- Intravenöse Anästhesie
- Beruhigung von Schafen (3 Jahre, 47 kg, weiblich, Eierstöcke) mit Prämedikation von Midazolam (2 mg/ml, 0,4 mg/kg), Butorphanol (10 mg/ml, 0,4 mg/kg) und Glykopyrroniumbromid (200 mcg/ml, 0,011 mg/kg) durch intramuskuläre Injektion.
- Überprüfen Sie die körperliche Verfassung der Schafe, als sie 15 Minuten nach der Injektion fügsam wurden.
- Platzieren Sie einen 18-G-Katheter mit Injektionsanschluss aseptisch in der Kopfvene mit Perfusionslinien, die mit einem T-Anschluss für Anästhesie und Kontrastmittel verbunden sind.
- Anästhesien der Schafe durch intravenöse Injektion von Propofol (20 mg/ml, 1-2,5 mg/kg) und Fentanyl (0,01 mg/kg). Überprüfen Sie auf Symptome der Beruhigung wie Kieferentspannung, Verlust des Schluckens und Ziliarreflex. Intubieren Sie das Schaf mit einem 6,5 mm - 8 mm langen Trachealtubus und legen Sie eine Magensonde in den Magen für die Magenflüssigkeitsaspiration, gefolgt von einer intravenösen Injektion von Propofol (20 mg / ml, 1-2,5 mg / kg) und Fentanyl (0,01 mg / kg).
- Erreichen Sie eine Vollnarkose durch intravenöse Injektion von Propofol (10 mg / ml, 2,5-8,0 mg / kg / h) und Ketamin (10 mg / ml, 2-5 mg / kg / h) intravenös in Vorbereitung auf die Herz-CT.
- Herz-CT
- Überführung der Schafe aus den Forschungsinstituten für Experimentelle Medizin (FEM) in den CT-Raum des Deutschen Herzzentrums Berlin (DHZB) nach den Vorbereitungen. Scannen Sie alle Schafe in Bauchlage, nachdem Sie sie sicher auf dem CT-Bett mit 3 Bandagen an Armen, Bauch und Beinen befestigt haben.
- Führen Sie Herz-CT auf einem 64-Slice-Dual-Source-Multidetektor-CT-System mit EKG-Gating unter Verwendung der folgenden Parameter durch. Stellen Sie die technischen Standardparameter für die Erfassung wie folgt ein: Gantry-Rotationszeit 0,33 s, 100-320 mAs pro Rotation, 120 kV Rohrspannung, Matrix 256 mit 16 Bit Tiefe, abweichungswirksame Röntgendosis 15,5± 11,6 mSv, Schnittdicke 0,75 mm.
- Erreichen Sie eine Kontrastverstärkung, indem Sie 2 -2,5 ml/kg jodhaltiges Kontrastmittel mit einer Rate von 5 ml/s über den T-Anschluss am Arm verabreichen.
- Führen Sie das 4D-CT-Scanprotokoll sequenziell durch. Teilen Sie den gesamten Herzzyklus in 11 Frames von 0% bis 100% auf, wobei 10% des R-Wellen- bis R-Wellen-Intervalls (RR) den Herzzyklus abdecken. Führen Sie eine enddiastolische Phase bei ca. 70% des RR-Intervalls für die Analyse für die 3D-Serie durch. Erhalten Sie sagittale, koronale und axiale Daten in jedem Frame von 4D CT sowie in 70% 3D-Serien.
- Verwenden Sie eine Bolus-Tracking-Methode für das Kontrastbolus-Timing in der Region von Interesse an der Hauptlungenarterie, um eine ideale Synchronisation zu erreichen. Verabreichen Sie Betablocker nicht bei Schafen.
- Bringen Sie die Schafe zurück in die FEM und stoppen Sie die Perfusion von Propofol und Ketamin nach dem Scannen. Die Schafe erlangten 10 - 20 Minuten nach der Extubation wieder das Bewusstsein. Anästhesisten und Tierärzte überwachten die gesamte Anästhesiebehandlung, bis die Schafe vollständig wach waren und sich frei bewegen konnten.
2. Open-Source-3D-Rekonstruktionssoftware-Anwendungseinstellungen und Erweiterungsraten
- Klicken Sie im oberen Menü auf Bearbeiten , um die Anwendungseinstellungen nach dem Start der 3D-Rekonstruktionssoftware zu ändern.
- Klicken Sie auf DICOM, dann auf Acquisition Geometry Regularization, und wählen Sie Apply Regularization Transform (Regularisierungstransformation anwenden) im Abschnitt DICOM Scalar Volume Plugin (DICOM Scalar Volume Plugin). Wählen Sie Volume Sequence als bevorzugtes Multi-Volume-Importformat im Abschnitt Multi Volume Importer Plugin aus.
- Klicken Sie auf Ansichten, wählen Sie Kleine Achsen. Wählen Sie in der Ausrichtungsmarke die Option "Dünnes Lineal".
- Starten Sie die 3D-Slicer-Software neu, um die Anwendungseinstellungen zu speichern.
- Klicken Sie in der Symbolleiste auf den Erweiterungs-Manager , um die Seite Erweiterungen zu öffnen.
- Suchen Sie die gewünschten Erweiterungen und klicken Sie mit der linken Maustaste, um sie zu installieren. Verwenden Sie die folgenden Erweiterungen in dieser Studie: Sequence Registration, Slicer Elastix, Sandbox, Slice Heart, Slicer IGT, Slicer VMTK, DICOM web browser, Intensity Segmenter, Markups To Model, Easy Clip, mp Review, Slicer Prostate und VASSTAUgorithms.
- Starten Sie die 3D-Slicer-Software neu, um die Installation der ausgewählten Erweiterungen zu bestätigen.
3. Laden Sie kardiale CT-Daten aus den DICOM-Dateien in den 3D-Datenschnitt
4. Erstellen Sie 4D-schlagendes Herzvolumen und schlagendes rechtes Herzvolumen
- Wählen Sie im Dropdown-Menü der Module die Option Volumen-Rendering und dann die 4D-Sequenz im Dropdown-Menü Volumen aus.
- Wählen Sie CT-Cardiac3 im Dropdown-Menü Preset, um das 4D-Herz anzuzeigen. Passen Sie den Cursor unter dem Dropdown-Menü " Voreinstellung" so an, dass nur das Herz angezeigt wird.
- Klicken Sie im Dropdown-Menü der Module auf Sequenz-Browser, um die 4D-Sequenz auszuwählen und anzuzeigen. Das schlagende Herz ist in der Szene. Ziehen Sie das 4D-Herz in die 3D-Szene, um das Herz aus verschiedenen Richtungen zu beobachten.
- Wählen Sie die Funktionen ROI aktivieren und anzeigen in den Zuschneideoptionen unter der Umschaltleiste, um das 4D-Volumen des schlagenden Herzens zu beschneiden und die Strukturen des Herzens besser zu beobachten.
- Erstellen Sie das 4D-schlagende Herzvolumen wie oben beschrieben. Wählen Sie im Dropdown-Menü der Module die Option Segment-Editor aus, und klicken Sie dann mit dem Vorgang "Füllen im Inneren" auf den Effekt "Schere", um einen einzelnen Frame auszuschneiden.
- Klicken Sie auf den Effekt " Maskenvolumen" und wenden Sie ihn an, um die Segmentierung als maskiertes Volumen mit dem 4D-Herzen zu verknüpfen. Das Eingangsvolumen und das Ausgangsvolumen im Maskenvolumeneffekt sind die 4D-Sequenzen.
- Wählen Sie den Effekt " Schere " mit der Operation "Innen löschen", um die Knochen und andere unerwartete Bereiche zu entfernen. Wählen Sie den Effekt "Inseln " mit dem Vorgang " Größte Insel behalten" aus, um kleine Bereiche zu entfernen.
- Wählen Sie den Erase-Effekt mit dem 1-3% Kugelpinsel, um das Gewebe am Aortenbogen mit Anhängen an der Hauptlungenarterie sowie das Gewebe zwischen der aufsteigenden Aorta und der oberen Hohlvene zu entfernen. Wenden Sie nach jedem Schritt den Effekt "Maskenvolumen" an, um das 4D-Volumen zu maskieren.
- Wiederholen Sie die Schritte 4.7 - 4.8, um die Bereiche weiter zu entfernen, bis das Modell des rechten Herzens in der 3D-Szene gezeigt wird.
- Klicken Sie auf den Sequenz-Browser und gehen Sie zum nächsten Frame. Verwenden Sie den Schereneffekt mit der Operation "Innen löschen", um einen beliebigen Bereich in der 3D-Szene zu schneiden. Das Modell des rechten Herzens erscheint automatisch im zeitgenössischen Rahmen. Wenden Sie die gleiche Methode auf den Rest der Frames an, bis die gesamte 4D-Sequenz segmentiert wurde.
- Klicken Sie auf die Schaltfläche Sequenz-Browser , um das 4D-Volumen des rechten Herzens anzuzeigen.
HINWEIS: Wenn die linke vordere absteigende Koronararterie in einigen Rahmen sowie die Verzweigung der linken Koronararterie entfernt werden, wird ein winziger Teil des rechten Ventrikels entfernt. Aus diesem Grund wird dringend empfohlen, ein winziges Stück dieser Koronare aufzubewahren, um das rechte ventrikuläre Volumen in jedem Rahmen aufrechtzuerhalten.
5. Erstellen Sie begradigte Modelle aus der 4D-Sequenz
HINWEIS: Es wird dringend empfohlen, jeden 10% des Herzzyklusrahmens in einem einzigen 3D-Slicer-Ordner zu erstellen, da sonst zu viele Datenbäume im DATA-Modul ausgerichtet sind, was es ineffizient macht, die begradigten Modelle zu erstellen. Um den einzelnen 3D-Slicer-Ordner jedes 10% -Frames zu erhalten, muss die 4D-Sequenz mehrmals geladen, jeder Frame ausgewählt und in einem einzigen Ordner gespeichert werden.
- Erstellen Sie Segmentierungen mit dem rechten Herzen für jeden Frame, indem Sie in der Symbolleiste das Modul Segment-Editor auswählen. Fügen Sie zwei Segmentierungen für jeden 10% Frame der 4D-Sequenz hinzu und benennen Sie sie entsprechend, z. B. 60% Segmentierung und Andere.
- Wählen Sie das Maleffektwerkzeug im Segment-Editor-Modul mit bearbeitbarem Intensitätsbereich , das von den CT-Bildern abhängt, um das rechte Herz mit der Sequenz obere Hohlvene, rechter Vorhof, rechter Ventrikel und Lungenarterie zu malen.
- Klicken Sie auf Andere Segmentierung, verwenden Sie das Malwerkzeug, um andere Bereiche zu malen, um die Grenzen des rechten Herzens im Allgemeinen zu verfolgen.
- Wählen Sie den Effekt "Aus Samen anbauen", wählen Sie "Initialisieren" und "Anwenden", um den Effekt anzuwenden. Klicken Sie im Modul Segmenteditor auf die Schaltfläche 3D anzeigen, um das 3D-Modell des zeitgenössischen Rahmens anzuzeigen.
- Wiederholen Sie die Schritte 4.7 - 4.8, um das 3D-Modell entsprechend den CT-Bildern in den drei Richtungen zu entfernen oder zu verbessern. Entfernen Sie die linken und rechten Äste der Lungenarterie an der Bifurkation. Das rechtsherzige 3D-Modell zeigt dann die 3D-Szene in jedem Bild.
HINWEIS: Es wird dringend empfohlen, die Grenzen des rechten Herzens mit einem Kugelpinsel von 1% - 2% Durchmesser an den Aufsätzen zwischen der Lungenarterie und den Koronararterien sowie der Lungenarterie und der oberen Hohlvene zu malen.
- Klonen Sie die Segmentierungen im DATA-Baum als Backup, nennen Sie die Segmentierungen, z. B. 10% Segmentation Original und 10% Segmentation for Straightened Model.
- Fügen Sie dem Modell des rechten Herzens eine Mittellinie hinzu, wie unten beschrieben.
- Wählen Sie im Dropdown-Menü der Module die Option Mittellinie extrahieren aus.
- Wählen Sie Segmentierung im Dropdown-Menü Oberfläche im Abschnitt Eingaben des Extraktmittellinienmoduls aus. Dadurch wird eine Segmentierung erstellt, z. B. eine Segmentierung von 10 % für ein begradigtes Modell als Segment. Klicken Sie im Dropdown-Menü Endpunkte auf Create New Markups Fiducial . Klicken Sie auf die Schaltfläche Markuppunkt platzieren , um Endpunkte auf der oberen Ebene des SVC und der Endebene der Hauptlungenarterie hinzuzufügen.
- Wählen Sie im Menü Outputs (Outputs) die Option Neues Modell als Mittellinienmodell erzeugen (Create a New Model as a Centerline model) und dann Neue Markierungskurve erzeugen (Create New Markups curve as a centerline curve) aus. Klicken Sie auf Anwenden , um das Mittellinienmodell des rechten Herzens anzuzeigen.
- Klicken Sie auf das DATA-Modul und dann mit der rechten Maustaste auf die Mittellinienkurve, um ihre Eigenschaften zu bearbeiten. Klicken Sie auf das Augensymbol , um die Kontrollpunkte anzuzeigen, und legen Sie im Abschnitt Neuproben die Anzahl der neu abgetasteten Punkte auf 40 fest, um die Computerlast zu verringern.
- Erstellen eines begradigten Modells
- Wählen Sie im Dropdown-Menü der Module die Option Gekrümmte planare Neuformatierung aus.
- Verschieben Sie den Cursor nach der Kurvenauflösung und der Schnittauflösung auf 0,8 mm, legen Sie die Slice-Größe auf 130140 mm fest, was dem Bereich des rechten Ventrikels entspricht, der auf den Bildern angezeigt wird, und wählen Sie dann "Neues Volume als begradigtes Ausgabevolumen" erstellen.
- Klicken Sie auf Übernehmen , um das begradigte Volume zu erhalten.
- Wählen Sie im Dropdown-Menü des Moduls die Option Volume-Rendering aus, um das begradigte Volume anzuzeigen. Wählen Sie im Dropdown-Menü für die Lautstärke die Option Begradigte Lautstärke aus und klicken Sie auf das Augensymbol . Wählen Sie CT-Cardiac3 als Voreinstellung aus, bewegen Sie den Umschaltcursor, um die begradigte Lautstärke des rechten Herzens in der 3D-Szene anzuzeigen.
- Spalten Sie das begradigte Volume in der DATA-Struktur im Namen des begradigten Volumes für die Segmentierung auf, und klicken Sie mit der rechten Maustaste, um dieses begradigte Volume zu segmentieren.
- Wählen Sie im Segment-Editor-Modul den Effekt "Schwellenwert" aus, um das gewünschte begradigte rechte Herz einzufärben, und klicken Sie auf "Anwenden", um den Vorgang anzuwenden. Wählen Sie den Effekt "Lautstärke maskieren", um das begradigte Volumen zu maskieren, indem Sie die Option "Begradigte Lautstärke" für die Segmentierung, die Lautstärke als Eingangslautstärke und die Option "Ausgabelautstärke" auswählen, und klicken Sie auf "Anwenden", um den Vorgang anzuwenden.
- Klicken Sie auf Anwenden , um den gleichen Vorgang wie oben in den Schritten 4.7 bis 4.8 beschrieben anzuwenden, um nur die geradlinige Segmentierung des rechten Herzens beizubehalten. Überprüfen Sie das begradigte Volumen des rechten Herzens und das 3D-Modell der begradigten Segmentierung des rechten Herzens in der 3D-Szene.
- Klicken Sie auf Anwenden , um den oben beschriebenen Vorgang auf andere Frames anzuwenden, um das Rendering des geraden rechten Herzvolumens und die geraden Segmentierungen zu erhalten und sie im Ordner jedes Frames zu speichern.
6. Exportieren Sie die Zahlen und STL-Dateien
- Exportieren Sie die Figuren des begradigten Volumen-Renderings, indem Sie auf Capture klicken und einen Szenenansichtseffekt in der Symbolleiste benennen und die Szenen in der 3D-Ansicht speichern.
- Exportieren Sie die STL-Dateien der begradigten 3D-Segmentierungen, indem Sie auf das Modul Segmentierung klicken.
7. Führen Sie fünf planare Messungen durch
- Führen Sie eine fünffache Messung des Umfangs, der Querschnittsfläche und des Umfangs in den begradigten Modellen aus der 4D-Sequenz und der rechtsventrikulären Volumenmessung im begradigten Modell durch, wie unten beschrieben.
- Wenden Sie die folgenden fünf planaren Einstellungen an: Ebene A: an der Hauptlungenarterie 2 cm versetzt von der Ebene der sinotubulären Verbindung; Ebene B: an der sinotubularen Kreuzung; Ebene C: am Sinus; Ebene D: am unteren Rand des Flugblatts; Ebene E: bei RVOT 1 cm versetzt von D.
- Fügen Sie alle oben genannten fünf Ebenen in die begradigten Modelle in jedem Frame ein, indem Sie die Umschalttaste auf der Tastatur gedrückt halten und die Fadenkreuzfunktion in der Symbolleiste zu den fünf Ebenen verwenden. Klicken Sie in der Symbolleiste auf das Modul Erstellen und Platzieren , um den Ebeneneffekt auszuwählen.
- Wählen Sie den Effekt "Linie " aus, um die Umfänge zu messen, und wählen Sie den Effekt " Geschlossene Kurve" aus, um die Umfänge und die Querschnittsfläche zu erhalten. Kopieren Sie die Daten, um das Dataset zu erstellen.
- Führen Sie rechtsventrikuläre Volumenmessungen im begradigten Modell wie unten beschrieben durch.
- Spalten Sie die begradigte Segmentierung in jedem Frame, die aus der 4D-Sequenz erhalten wurde, und beschriften Sie die Segmentierung entsprechend dem passenden Frame für die Volumenmessung.
- Wählen Sie im Dropdown-Menü des Moduls das Modul Segmentstatistik aus. Wählen Sie im Eingangsmenü die X%-Segmentierung für die Volumenmessung nach Segmentierung und Skalarvolumen aus. Wählen Sie Neue Tabelle als Ausgabetabelle erstellen und klicken Sie dann auf Übernehmen , um die Vorgänge zum Abrufen der Volumetabelle anzuwenden.
- Kopieren Sie die Volumendaten, um das Volumenmess-Dataset für jeden Frame der begradigten Segmentierung zu erstellen.
8.3D multiplanare Rekonstruktion (MPR) Messungen und rechtsventrikuläre Volumenmessung aus der 3D-Sequenz (die am besten rekonstruierte Phase am Ende der Diastole)
HINWEIS: In dieser Studie wurde das Schaf J Pre-CT ausgewählt, um die MPR-Messverfahren zu veranschaulichen.
- Laden Sie die diastolische 3D-Sequenz wie in den folgenden Schritten dargestellt. Wählen Sie den Abwärtspfeil neben dem Fadenkreuzeffekt aus, und wählen Sie " Sprungscheiben - Offset", "Basic+ Schnittmenge", "Feines Fadenkreuz" und "Die Schnittkreuzungen" für die Einstellungen für das Fadenkreuz.
- Umschalt + Linksklick, um das Fadenkreuz in die Ebene zu ziehen, zum Beispiel den Sinus. Drücken Sie STRG+ALT, um das Fadenkreuz in den axialen, sagittalen und koronalen Szenen perfekt in der Mitte der Zielposition an die gewünschte Position anzupassen.
- Wählen Sie den Effekt " Linie" aus, um die Messungen in jeder Ebene durchzuführen, wie in Schritt 7.4 dargestellt. Kopieren Sie die Daten, um den 3D-MPR-Messdatensatz zu erstellen.
- Klicken Sie auf das Modul Segmenteditor , um eine rechtsventrikuläre Segmentierung zu erstellen, wie oben in Schritt 5.8.6 beschrieben.
- Klicken Sie auf das Modul Segmentstatistik , um die Messung des rechten ventrikulären Volumens durchzuführen, wie oben in Schritt 7.5.2 beschrieben.
- Kopieren Sie die Volumeninformationen, um das diastolische 3D-Volumen-Dataset für rechtsventrikuläre Volumina zu erstellen.
9. Berechnung für die Auswahl der Herzklappe mit Stented
HINWEIS: In diesem Abschnitt wurden die Messungen des sinotubularen Übergangs verwendet, um das Verfahren zu veranschaulichen.
- Berechnen Sie den Mittelwert der langen axialen (d1) und kurzen axialen Perimeter (d2) = (d3), gefolgt vom Mittelwert von d1, d2 und d3, um d4 zu erhalten, wie in den Formeln (1) - (2) gezeigt.

- Teilen Sie die Berechnung der Querschnittsfläche (S1) durch π, um d5 zu erhalten, gefolgt von der Quadratwurzel von d5, um d6 zu erhalten, und dann den Mittelwert von d5 und d6, wie in den Formeln (3) - (5) gezeigt.


- Teilen Sie den Umfang (C1) durch π, um d8 zu erhalten, wie in Formel (6) gezeigt.
- Erhalten Sie den allgemeinen Gesamtdurchmesser d9, indem Sie den Mittelwert von d4, d7 und d8 berechnen, wie in Formel (7) gezeigt.
- Wenden Sie die Formel (8) an, um die beste Wahl der Ventilgröße (h) zu berechnen.

HINWEIS: Die Herzklappe mit Stented ist in den Durchmessern 30 mm, 26 mm und 23 mm erhältlich. Die Ventilgröße (h) zeigt die Übereinstimmung als Prozentsatz für die drei Durchmesser, nämlich eine ideale Übereinstimmung als 10-20%, groß für die Implantation als 30% und mehr und klein für die Implantation unter 10%.
- Importieren Sie die 3D- und 4D-Daten in eine vielseitige Statistiksoftware, um die Trenddiagramme der Messungen in den fünf Ebenen zu erstellen und die Diagramme im TIFF-Format zu exportieren. Importieren Sie alle Figuren in die Grafiksoftware für die Organisation.