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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Die Mikro-CT ist ein zerstörungsfreies Werkzeug, mit dem Pflanzenstrukturen dreidimensional analysiert werden können. Das vorliegende Protokoll beschreibt die Probenvorbereitung zur Nutzung von Mikro-CT zur Analyse der parasitären Pflanzenstruktur und -funktion. Verschiedene Spezies werden verwendet, um die Vorteile dieser Methode in Verbindung mit spezifischen Präparaten hervorzuheben.
Mikro-CT-Scans haben sich zu einem etablierten Werkzeug zur Untersuchung der Struktur und Funktion von Pflanzen entwickelt. Seine zerstörungsfreie Natur, kombiniert mit der Möglichkeit der dreidimensionalen Visualisierung und virtuellen Schnitte, hat eine neuartige und immer detailliertere Analyse komplexer Pflanzenorgane ermöglicht. Auch die Wechselwirkungen zwischen Pflanzen, auch zwischen parasitären Pflanzen und ihren Wirten, können erforscht werden. Die Probenvorbereitung vor dem Scannen ist jedoch aufgrund der Interaktion zwischen diesen Pflanzen, die sich oft in der Gewebeorganisation und -zusammensetzung unterscheiden, von entscheidender Bedeutung. Darüber hinaus muss bei der Probenahme, Behandlung und Aufbereitung von Parasiten-Wirtsmaterial die große Vielfalt parasitärer Blütenpflanzen berücksichtigt werden, die von stark reduzierten vegetativen Körpern bis hin zu Bäumen, Kräutern und Sträuchern reicht. Hier werden zwei verschiedene Ansätze beschrieben, um Kontrastmittel in den Parasiten und/oder die Wirtspflanzen einzubringen, wobei der Schwerpunkt auf der Analyse des Haustoriums liegt. Dieses Organ fördert die Verbindung und Kommunikation zwischen den beiden Pflanzen. Mit einem einfachen Ansatz können Details der Struktur des Haustoriumsgewebes dreidimensional erforscht werden, wie hier für die parasitären Arten der Euphytoiden, der Rebe und der Mistel gezeigt wird. Die Auswahl spezifischer Kontrastmittel und Applikationsansätze ermöglicht auch eine detaillierte Beobachtung der Ausbreitung von Endoparasiten im Wirtskörper und den Nachweis einer direkten Gefäß-zu-Gefäß-Verbindung zwischen Parasit und Wirt, wie hier für einen obligaten Wurzelparasiten gezeigt. Daher kann das hier diskutierte Protokoll auf die große Vielfalt parasitärer Blütenpflanzen angewendet werden, um das Verständnis ihrer Entwicklung, Struktur und Funktionsweise zu verbessern.
Die hochauflösende Röntgen-Mikro-Computertomographie (Mikro-CT) ist ein bildgebendes Verfahren, bei dem mehrere Röntgenaufnahmen (Projektionen) einer Probe aus unterschiedlichen Blickwinkeln aufgenommen und später zur virtuellen Rekonstruktion der Probe verwendet werden1. Dieses virtuelle Objekt kann dann analysiert, manipuliert und segmentiert werden, was eine zerstörungsfreie Erkundung in drei Dimensionenermöglicht 2. Ursprünglich für medizinische Analysen und später für industrielle Anwendungen konzipiert, bietet die Mikro-CT auch den Vorteil, innere Organe und Gewebe ohne invasive Eingriffe sichtbar zu machen3. Wie andere Formen der Bildgebung arbeitet auch die Mikro-CT mit einem Kompromiss zwischen Sichtfeld und Pixelgröße, was bedeutet, dass eine hochauflösende Bildgebung großer Proben nahezu unerreichbar ist4. Fortschritte bei der Verwendung von hochenergetischen Röntgenquellen (z. B. Synchrotron) und sekundärer optischer Vergrößerung werden ständig gemacht, so dass die kleinste Auflösung unter 100 nm erreichtwerden kann 5,6. Nichtsdestotrotz sind bei großen Proben längere Scanzeiten erforderlich, was die Wahrscheinlichkeit von Artefakten aufgrund von Probenbewegungen oder Verformungen im Inneren des Scanners erhöht. Darüber hinaus ist die Mikro-CT im Allgemeinen durch natürliche Dichteschwankungen innerhalb der Probe und die Art und Weise, wie die Probe mit Röntgenstrahlen interagiert, begrenzt. Während eine höhere Röntgendosis am besten geeignet ist, um dichtere Proben zu durchdringen, ist sie weniger effizient bei der Erfassung von Dichteschwankungen innerhalb und zwischen der Probe und dem umgebenden Medium7. Auf der anderen Seite bietet eine geringere Röntgendosis eine geringere Durchdringungsleistung und erfordert oft längere Scanzeiten, aber eine höhere Empfindlichkeit bei der Dichtedetektion7.
Diese Einschränkungen haben den Einsatz der Mikrotomographie für die Pflanzenwissenschaften lange Zeit behindert, da die meisten Pflanzengewebe aus leichtem (nicht dichtem) Gewebe mit geringer Röntgenabsorption bestehen8. Die ersten Anwendungen der Mikro-CT konzentrierten sich auf die Kartierung von Wurzelnetzwerken innerhalb der Bodenmatrix 9,10. Später wurden Pflanzenstrukturen mit deutlicheren Unterschieden in der Gewebedichte, wie z. B. Holz, erforscht. Dies ermöglichte Untersuchungen der Xylemfunktionalität11,12, der Entwicklung komplexer Gewebeorganisationen 13,14 und der Interaktionen zwischen Pflanzen15,16,17. Die Analyse von weichem und homogenem Gewebe wird durch Kontrastmittel, die heute zum Standardverfahren in Präparaten für die Mikro-CT-Untersuchung von Pflanzenproben gehören, immer weiter verbreitet. Protokolle für die Kontrastmitteleinbringung können jedoch je nach Probenvolumen, strukturellen Eigenschaften und Art der verwendeten Lösung zu unterschiedlichen Ergebnissen führen8. Im Idealfall sollte das Kontrastmittel die Unterscheidung zwischen verschiedenen Geweben verbessern, eine Bewertung der Gewebe-/Organfunktionalität ermöglichen und/oder biochemische Informationen über ein Gewebe liefern18. Daher ist eine angemessene Probenbehandlung, -vorbereitung und -montage vor dem Scannen für jede Mikro-CT-Analyse von entscheidender Bedeutung.
Mikro-CT des parasitären Pflanzenhaustoriums
Parasitäre Blütenpflanzen stellen eine eigene funktionelle Gruppe von Angiospermen dar, die durch ein Organ gekennzeichnet ist, das als Haustorium19 bekannt ist. Dieses mehrzellige Organ, ein Entwicklungshybrid zwischen einem modifizierten Stamm und einer Wurzel, wirkt auf die Anheftung, das Eindringen und den Kontakt des Wirts durch einen Parasiten20. Aus diesem Grund wird davon ausgegangen, dass das Haustorium "die Idee des Parasitismus unter den Pflanzen verkörpert"21. Ein detailliertes Verständnis der Entwicklung, Struktur und Funktionsweise dieses Organs ist entscheidend für die Ökologie, Evolution und Managementstudien parasitärer Pflanzen. Dennoch erschweren die Gesamtkomplexität der parasitären Pflanzen und die stark veränderte Struktur und Haustorien oft eine detaillierte Analyse und einen Vergleich. Auch die Haustoriumverbindungen sind in der Regel umfangreich und in der Gewebe- und Zellverteilung nicht homogen (Abbildung 1). In diesem Zusammenhang ermöglicht die Arbeit mit kleinen Gewebefragmenten zwar eine einfachere Manipulation und höhere Auflösung, kann aber zu falschen Rückschlüssen auf die dreidimensionale Architektur komplexer Strukturen, wie z.B. der parasitären Pflanze Haustorium, führen.
Obwohl es für die meisten parasitären Pflanzenarten eine umfangreiche Literatur über die Anatomie und Ultrastruktur des Haustoriums gibt, ist die dreidimensionale Organisation und die räumliche Beziehung zwischen Parasiten- und Wirtsgewebe noch wenig erforscht17. In einer kürzlich erschienenen Arbeit von Masumoto et al.22 wurden über 300 serielle halbdünne Mikrotomschnitte abgebildet und zu einem dreidimensionalen virtuellen Objekt rekonstruiert, das das Haustorium zweier Parasitenarten darstellt. Der hohe Detaillierungsgrad dieser Methode ermöglicht noch nie dagewesene Einblicke in die zelluläre und anatomische 3D-Struktur des Haustoriums. Eine derart zeitaufwändige Technik würde jedoch eine ähnliche Analyse bei Parasiten mit umfangreicheren Haustoriumverbindungen verbieten. Der Einsatz der Mikro-CT erweist sich als hervorragendes Werkzeug für die dreidimensionale Analyse komplexer und oft sperriger Haustorien parasitärer Pflanzen. Obwohl sie kein Ersatz für detaillierte anatomische Schnitte und andere ergänzende Formen der mikroskopischen Analysesind 17,23, können die durch Mikro-CT-Scans erhaltenen Ergebnisse, insbesondere bei großen Proben, auch als Leitfaden für die Unterprobenahme kleinerer Segmente dienen, die dann mit anderen Instrumenten wie Konfokal- und Elektronenmikroskopie analysiert oder mit hochauflösenden Mikro-CT-Systemen erneut analysiert werden können.

Abbildung 1: Parasitische Pflanzen verschiedener funktioneller Gruppen, die in diesem Protokoll verwendet werden. Euphytoide Parasit Pyrularia pubera (A), Endoparasit Viscum minimum (B) mit grünen Früchten (gestrichelter schwarzer Kreis), parasitische Rebe Cuscuta americana (C), Mistel Struthanthus martianus (D), obligater Wurzelparasit Scybalium fungiforme (E). Segmente der Wirtswurzel (Hr) oder des Stammes (Hs) erleichtern die Anwendung von Kontrastmitteln in das Haustorium des Parasiten (P). Das Vorhandensein der Mutterwurzel/des Stammes des Parasiten (Pfeile) in der Probe ermöglicht die Analyse der Organisation der Haustoriumgefäße. Rechtecke kennzeichnen Segmente der Stichprobe, die für die Analyse verwendet werden. Maßstabsleisten = 2 cm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Da die Mikro-CT zu einer immer beliebteren Technik in den Pflanzenwissenschaften wird, gibt es Leitfäden, Protokolle und Literatur, die sich mit dem Scannen von Proben, der dreidimensionalen Rekonstruktion, der Segmentierung und der Analyse befassen 3,10,24. Daher werden diese Schritte hier nicht besprochen. Wie bei jeder bildgebenden Technik ist die angemessene Behandlung und Einbettung von Proben von grundlegender Bedeutung, auch wenn sie oft übersehen wird. Aus diesem Grund konzentriert sich dieses Protokoll auf die Vorbereitung von Haustoriumproben für Mikro-CT-Scans. Genauer gesagt beschreibt dieses Protokoll zwei Ansätze zur Einbringung von Kontrastmitteln in Haustoriumproben, um die Visualisierung verschiedener Gewebe und Zelltypen im Haustorium zu verbessern, die Detektion von parasitärem Gewebe innerhalb der Wirtswurzel/des Stammes zu erleichtern und die Parasit-Wirt-Gefäßverbindungen in drei Dimensionen zu analysieren. Die hier beschriebenen Präparate können auch an die Analyse anderer Pflanzenstrukturen angepasst werden.
Fünf Arten wurden verwendet, um die Zweckmäßigkeit des hier beschriebenen Protokolls besser zu veranschaulichen. Jede Art repräsentiert eine der fünf funktionellen Gruppen parasitärer Blütenpflanzen und spricht damit spezifische Punkte an, die mit der Funktionalität jeder Gruppe zusammenhängen. Pyrularia pubera (Santalaceae) wurde ausgewählt, um euphytoide Parasiten darzustellen, die im Boden keimen und mehrere Haustorien bilden, die den Parasiten mit den Wurzeln seiner Wirte verbinden25. Die von diesen Pflanzen erzeugten Haustorien sind oft dünn und lassen sich leicht vom Wirt26 (Fig. 1A) abreißen, was einen schonenderen Handhabungsprozess erfordert. Endoparasiten werden hier durch Viscum minimum (Viscaceae) repräsentiert. Spezies dieser funktionellen Gruppe sind außerhalb des Körpers ihrer Wirte nur für kurze Zeit sichtbar (Abbildung 1B) und leben den größten Teil ihres Lebenszyklus als deutlich reduzierte und myzelartige Zellstränge, die in Wirtsgewebe eingebettet sind25. Eine dritte funktionelle Gruppe umfasst parasitäre Reben, die am Boden keimen, aber nur rudimentäre Wurzeln bilden und auf mehrere Haustorien angewiesen sind, die an den Stängeln der Wirtspflanzenansetzen 25 (Abbildung 1C). Hier wird diese funktionelle Gruppe durch Cuscuta americana (Convolvulaceae) repräsentiert. Im Gegensatz zu parasitären Reben keimen Misteln direkt an den Zweigen ihrer Wirtspflanzen und entwickeln entweder mehrere oder einzelne Haustorien25. Die Art, die zur Veranschaulichung dieser funktionellen Gruppe ausgewählt wurde, ist Struthanthus martianus (Loranthaceae ), die verschiedene Verbindungen mit dem Wirtszweig eingeht (Abbildung 1D). Die Analyse solitärer Mistelhaustorien mit einer Kombination aus Mikro-CT und Lichtmikroskopie findet sich in Teixeira-Costa & Ceccantini17. Zu den obligaten Wurzelparasiten schließlich gehören Arten, die am Boden keimen und in die Wurzeln von Wirtspflanzen eindringen, von denen sie von den frühesten Wachstumsstadien an vollständig abhängig sind25. Diese Pflanzen sind hier durch Scybalium fungiforme (Balanophoraceae) vertreten, die große knollenartige Haustorien bilden (Abbildung 1E).
Alle Pflanzenproben, die in diesem Protokoll verwendet wurden, wurden in einem 70%igen Formalinessigsäurealkohol (FAA 70) fixiert. Die Fixierung auf die Probenahme ist entscheidend für die Konservierung von Pflanzengeweben, insbesondere wenn nachträgliche anatomische Analysen erforderlich sind. Auch beim parasitären Pflanzenhaustorium ist eine Fixierung unumgänglich, da dieses Organ oft hauptsächlich aus nicht verholzten Parenchymzellen besteht20. Detaillierte Protokolle für die Fixierung von Pflanzengewebe, einschließlich der Herstellung von Fixierlösungen, finden Sie an anderer Stelle27. Andererseits können Fixiermittel mehr oder weniger zu Veränderungen der physikalischen und chemischen Eigenschaften einer Probe führen, so dass sie für spezifische biomechanische und histochemische Analysen ungeeignet ist. Somit können mit diesem Protokoll auch frische Proben, d.h. nicht fixiertes Material, das unmittelbar vor der Aufbereitung gesammelt wurde, verwendet werden. Details zum Umgang mit neuen Proben und Vorschläge zur Fehlerbehebung bei fixiertem Material finden Sie im Abschnitt "Diskussion".
1. Auswahl parasitärer Pflanzenproben
2. Anwendung kontrastierender Lösungen

Abbildung 2: Perfusionsansatz für die Kontrastmittelapplikation. Kleine (A) und große (B) Versionen der Perfusionsapparatur umfassen einen Vorratsbehälter (st) und zwei Kunststoffschläuche (t1 und t2), die durch ein Ventil (va) verbunden sind. Das proximale Ende des Wirtsstammes (H), an dem ein Parasit (P) über das Haustorium (ha) befestigt ist, ist mit dem offenen Ende des Systems (B, expandiert) verbunden. Ein Dreiwegeventil (C) oder ein Zweiwegeventil (D) wird verwendet, um die Bildung von Luftblasen im Inneren des Schlauchsystems zu verhindern, die den Durchgang der kontrastierenden Lösung (E) blockieren. Die Spitze des proximalen Endes des Wirtsschaftes (H) wird unter Wasser durchtrennt, um den Durchgang der Kontrastmittellösung (F) zu ermöglichen. Kabelbinder, Ventiladapter und Schläuche mit unterschiedlichen Durchmessern helfen, festere Verbindungen zu sichern und Leckagen im System zu vermeiden (G). Die Abbildungen 2B, D und F wurden mit BioRender erstellt. Maßstabsleisten = 2 cm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
3. Probenvorbereitung und -montage
Das Haustorium parasitischer Pflanzen ist ein komplexes Organ, das aus verschiedenen Geweben und Zelltypen besteht, die sich mit dem Gewebe einer anderen Pflanze verflechten und verbinden, die als Wirt verwendet wird20. Mikro-CT-Scans können genutzt werden, um diese komplexe Struktur auf zerstörungsfreie und dreidimensionale Weise besser zu verstehen, wenn sowohl kleine (Abbildung 1A-C) als auch große (Abbildung 1D,E) Haustorien analysiert werden. Dazu können kontrastierende Lösungen in die Parasit-Wirt-Grenzfläche eingebracht werden, wodurch es möglich wird, Proben zu analysieren, die sonst eine geringe und homogene Röntgenabsorption aufweisen würden. Die beiden einfachen Ansätze, die in diesem Protokoll beschrieben werden, beruhen auf der Druckbeaufschlagung der kontrastierenden Lösung, um das Eindringen durch die Probe zu beschleunigen. Erwartungsgemäß funktionieren die hier beschriebenen Protokolle für verschiedene Mikro-CT-Systeme. Die Scaneinstellungen und -parameter unterscheiden sich jedoch je nach System und analysierter Probe (Tabelle 1).
| Funktionelle Gruppe | Euphytoid-Parasit | Endoparasit | Parasitäre Rebe | Mistel (Vorher/Nachher-Kontrast) | Obligater Wurzelparasit |
| Spezies (Familie) | Pyrularia pubera | Viscum minimal | Cuscuta americana | Struthanthus martianus | Scybalium fungiforme |
| Familie | Santalaceae | Viscaceae | Convolvulaceae | Loranthaceae | Balanophoraceae |
| Kontrastlösung | 3% Phosphowolframat | 1% Jod | 1% Jod | 1% Jod | 0,2 % Bleinitrat |
| Art der Anwendung | Vakuum | Vakuum | Perfusion | Perfusion | Perfusion |
| Mikro-CT-System | Zeiss Versa 620 | Nikon X-Tek HMXST225 | Bruker Skyscan 1176 | Bruker Skyscan 1176 | Bruker Skyscan 1176 |
| Projektionen | 4500 | 3140 | 610 | 1200 / 2400 | 5300 |
| Rahmen | 1 | 1 | 3 (gemittelt) | 3 / 3 (gemittelt) | 3 (gemittelt) |
| Belichtung (ms) | 5000 | 1000 | 680 | 1600 / 830 | 750 |
| Filter (mm) | nichts | Al 0.25 | Al 1.0 | Al 1.0 / Al 1.0 | nichts |
| Spannung (kV) | 60 | 85 | 35 | 90 / 45 | 40 |
| Strom (μA) | 108 | 80 | 375 | 180 / 390 | 600 |
Tabelle 1: Scan-Einstellungen und -Parameter für die analysierten Proben.
In Anlehnung an den ersten Ansatz zur Kontrastmittelapplikation (Schritt 2.3) wurde das Haustorium des euphytoiden Parasiten P. pubera mit einer 3%igen Phosphowolframatlösung zwei Stunden lang im Vakuum perfundiert. Die Probe wurde dann in einem 3D-Röntgenmikroskop (XRM) gescannt (siehe Materialtabelle), wobei eine hohe Bildauflösung durch sekundäre optische Vergrößerung4 erreicht wurde. XRM-Bilder erwiesen sich als genauso effektiv wie anatomische Schnitte, die unter einem Lichtmikroskop analysiert wurden, um die Gewebeorganisation und -topologie an der Grenzfläche zwischen Parasit und Wirt zu analysieren (Abbildung 3). Die Verwendung von Phosphowolframat unterstreicht die Fülle an Parenchymgewebe, das aufgrund der hohen Absorption des Kontrastmittels in einem hellen Weißton erscheint. Die Gefäße erscheinen aufgrund der geringen Kontrastabsorption in einem dunklen Grauton. Anhand dieses Farbunterschieds ist es möglich, die Häufigkeit von Parenchymen zu beobachten, die den vaskulären Kern des Haustoriums umgeben (Abbildung 3). Die komplizierten Gefäße und dünnen Parenchymstränge des Gefäßkerns selbst werden ebenfalls beobachtet, insbesondere in Längsschnitten (Abbildungen 3A-C). Im Querschnitt ist der Gefäßkern leicht als zwei durch Parenchym getrennte Gefäßstränge zu erkennen (Abbildungen 3D,E).

Abbildung 3: Haustorium des euphytoiden Parasiten. Längsschnitte (A-C) und Transversale (D-E) Schnitte durch das Haustorium wurden unter einem Lichtmikroskop (A,E) und mittels 3D-Röntgenmikroskopie nach Applikation von 3%iger Phosphowolframatlösung im Vakuum (B-D) beobachtet. Rote Umrisse stehen für Parenchymgewebe (par) und blaue Umrisse für den Gefäßkern (vc). Hx: Wirts-Xylem. Hb: Wirtsrinde. Maßstabsbalken = 500 μm (A, E) und 2,5 cm (B-D; Voxelgröße = 2,8382 μm). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Der gleiche Ansatz wurde verwendet, um Kontrast in den Stängel einer sukkulenten Wirtspflanze (Euphorbia polygona, Cactaceae) einzubringen, die von V. minimum parasitiert wurde. Hier wurde 1%ige Jodlösung als Kontrastmittel gewählt, basierend auf einer vorläufigen histochemischen Analyse, die zeigte, dass Parenchymzellen des Endoparasiten Kohlenhydrate in Form von Stärke speichern (Abbildung 4A). Gleichzeitig speichern Zellen in der Wirtsrinde keine nachweisbare Menge an Stärke (Abbildung 4B-D). Nach der Kontrastmittelapplikation wurde die Probe dann mit einem Nikon X-Tek Mikro-CT-System gescannt (siehe Materialtabelle). Der Unterschied in der Jodaufnahme ermöglichte den Nachweis des komplizierten Netzes kortikaler Stränge, das vom Endoparasiten im Wirtskörper gebildet wird (Abbildung 4E). Nach dieser Methodik wurde beobachtet, dass sich kortikale Stränge um das vaskuläre Zentrum des Wirts konzentrieren und sich schließlich in Richtung der Peripherie des Wirtsstamms verzweigen, wenn sie mit dem Auftauchen einer parasitären Blüte assoziiert werden (Abbildungen 4F, G).

Abbildung 4: Gewebenetzwerk der Endoparasiten. Anatomische (A) und Makroschnitte (B-D) zeigen eine Reaktion mit 1%iger Jodlösung, was darauf hinweist, dass Stärke (schwarz gefärbt) im Parenchym (par) vorhanden ist, das mit den Gefäßen (ve) des Parasiten verbunden ist. Da Stärke im Wirtskortex (Hc) und Xylem (Hx) fehlt, wurden selektiv 1%ige Jodlösungen verwendet, um den Kontrast des kortikalen Stranggewebes des Parasiten (violette Umrisse, E-G) vor dem Wirtshintergrund (H) zu erhöhen. Das Vorhandensein einer Blüte (Pf) bestätigt, dass das gefärbte Gewebe Teil der Endoparasitenstruktur (A,F,G) ist. Maßstabsleisten = 0,25 cm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.
Bei dem zweiten Ansatz, der hier beschrieben wird (Schritt 2.4), wird ein Vorratsbehälter, der die kontrastierende Lösung enthält, von dem Niveau angehoben, in dem die Probe platziert wird, wodurch die Schwerkraft genutzt wird, um den Durchgang der Lösung durch die Probe zu steuern. Nach der Kontrastmittelperfusion wurde die Untersuchung mit einem Bruker Skycan Mikro-CT-System durchgeführt (siehe Materialtabelle). Die Ergebnisse von C. americana (Abbildungen 5A, B) und S. martianus (Abbildungen 5C-G) verdeutlichen die Bequemlichkeit dieses Ansatzes sowohl für kleine als auch für große Proben. Der Vergleich von Proben, die vor (Abbildung 5C, E) und nach (Abbildung 5D,F) Perfusion von 1%iger Jodlösung gescannt wurden, unterstreicht die Bedeutung der Kontrastmittelapplikation auch in holzigen Haustoriumproben. Bemerkenswert ist, dass Parasiten in den Assoziationen zwischen C. americana und S. martianus (Abbildung 5) und ihren jeweiligen Wirten wenig bis gar keinen Stärkegehalt in ihrem Gewebe aufweisen. Dies erklärt die unterschiedlichen Ergebnisse, die für den Endoparasiten V. minimum (Abbildung 4) beschrieben wurden, bei denen die gleiche Methode und Art der Kontrastlösung verwendet wurde.

Abbildung 5: Schmarotzerisches Reben- und Mistelhaustorium. Längsschnitte durch das Haustorium einer parasitären Rebe (A,B) und einer Mistel (C-G). Der Vergleich zwischen Scan und Makroschnitt von frischem Material zeigt, dass die komplizierte Haustoriumstruktur in Mikro-CT-Scans gut erfasst wird (A,B). Der Vergleich zwischen fixierten Proben vor (C,E) und nach (D,F) der Perfusion von 1%iger Jodlösung zeigt, dass der Kontrast auch in verholzten Proben erhöht ist, was die Beobachtung von Parasitenstrukturen (P) wie Gefäßen in der Epikortikalwurzel (rosa Pfeilspitzen), Gefäßsträngen (blaue Pfeilspitzen) und Senker (gelbe Pfeilspitze) erleichtert. Gefäße und Jahresringe des Wirtsxylems (Hx) und der Stärke in der Wirtsrinde (Hb) sind ebenfalls leichter zu beobachten. Maßstabsleisten = 1 cm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Ein Endergebnis, das mit dem hier beschriebenen Perfusionsprotokoll erzielt wird, ist die Möglichkeit, vaskuläre Verbindungen zwischen Parasiten und Wirtspflanzen zu erkennen. Dies wurde erreicht, indem eine 0,2%ige Bleinitratlösung durch ein Segment der Wirtswurzel perfundiert wurde, um das sich die Knolle des obligaten Wurzelparasiten S. fungiforme entwickelt hatte. Nach der Kontrastmittelapplikation wurde auch das Scannen mit einem Bruker Skyscan Mikro-CT-System durchgeführt (siehe Materialtabelle). Sequenzielle Projektionen zeigen, dass sich Gefäße in der Wirtswurzel in die Parasitenknolle gabeln (Abbildung 6A-C). Nach der Analyse dieser Ergebnisse wurde dieselbe Probe in eine kleinere Teilprobe zerlegt, für anatomische Untersuchungen vorbereitet und lichtmikroskopisch analysiert. Die serielle Schnittung dieser Teilprobe bestätigt, dass die Xylem-Kontinuität zwischen den beiden Anlagen durch die Verbindung von Gefäß zu Behälter über Perforationsplatten gebildet wird (Abbildung 6D-F).

Abbildung 6: Obligater Wurzelparasit Haustorium. Längsschnitte durch das Haustorium, wie sie durch Mikro-CT-Scans (A-C) und anatomische Schnitte unter dem Lichtmikroskop (D-F) beobachtet wurden. Die Akkumulation von 0,2%iger Bleinitratlösung im Gefäßsystem der Wirtswurzel (Hr, rosa Umriss) ermöglicht die Beobachtung von Wirtsgefäßen, die sich innerhalb der Parasitenröhre (Pt) verzweigen, und den Nachweis einer direkten vaskulären Verbindung zwischen den beiden Pflanzen (gestrichelter weißer Umriss). Maßstabsbalken = 1 cm (A-C) und 500 μm (D-F). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Der Autor hat nichts zu verraten.
Die Mikro-CT ist ein zerstörungsfreies Werkzeug, mit dem Pflanzenstrukturen dreidimensional analysiert werden können. Das vorliegende Protokoll beschreibt die Probenvorbereitung zur Nutzung von Mikro-CT zur Analyse der parasitären Pflanzenstruktur und -funktion. Verschiedene Spezies werden verwendet, um die Vorteile dieser Methode in Verbindung mit spezifischen Präparaten hervorzuheben.
Ich danke Dr. Simone Gomes Ferreira (Mikrotomographie-Labor, Universität von São Paulo, Brasilien) und Dr. Greg Lin (Center for Nanoscale Systems, Harvard University, USA) für ihre überragende Hilfe und unverzichtbare Anwenderschulung für verschiedene Mikrotomographie-Systeme und Datenanalyse-Software. Ich danke auch den Mitarbeitern des EEB-Gewächshauses an der Universität von Connecticut (USA), insbesondere Clinton Morse und Matthew Opel für die Bereitstellung der Exemplare von Viscum minimum. Dr. John Wenzel bot die Möglichkeit und große Hilfe bei der Probenahme von Pyrularia pubera. MSc. Carolina Bastos, MSc. Yasmin Hirao und Talitha Motta halfen sehr bei der Probenahme von Scybalium fungiforme. MSc. Ariadne Furtado sowie Dr. Fernanda Oliveira und Dr. Maria Aline Neves lieferten die Referenz für die Verwendung von Phloxin B für die Analyse endophytischer Pilze. Die Videoaufzeichnung an der Vrije Universiteit Brussel wurde durch die Hilfe von Dr. Philippe Claeys, Dr. Christophe Snoeck, MSc. Jake Griffith, Dr. Barabara Veselka und Dr. Harry Olde Venterink ermöglicht. Die Finanzierung erfolgte durch die Coordination for the Improvement of Higher Education Personnel (CAPES, Brasilien) und die Harvard University Herbaria (USA).
| 3D-Röntgenmikroskop (XRM) System | Zeiss Versa 620 | zum Scannen von Pyrularia pubera | |
| 3D-Röntgenmikroskop + A2:D22 | Zeiss | Versa 620 | Zum Scannen der Spezies P. pubera |
| CT-Pro 3D-Software | Nikon | Version XT 3.1.11 | Wird zur dreidimensionalen Rekonstruktion von Scans |
| CT-Vox Software | Bruker | Version 3.3.1 | Wird für die Analyse und Erfassung von Bildern und Videos verwendet |
| Dragonfly Software | Object Research Systems - ORS-Version | Wird für die Analyse und Aufnahme von Bildern und Videos verwendet | |
| Glasfläschchen Glasfläschchen | Inc. SE | V2708C-FM-SP | Verkauft von VWR - USA; stellen Sie sicher, dass die Fläschchen einem Vakuum von ca. 10 psi standhalten |
| Inspect-X | Zeiss | Version XT 3.1.11 | Zur Steuerung des Nikon X-Tek HMXST225 Systems |
| Jodlösung 0,0282 N | WR Chemicals BDH | BDH7422-1 | Verkauft von VWR - USA |
| Blei Nitrat II PA 500 g | Vetec | 361.08 | Verkauft von SPLab |
| Mikrotomographie-Scanner | Bruker | Skyscan1176 | Wird zum Scannen der Spezies C. americana, S. martianus, und S. fungiforme |
| Mikrotomographie-Scanner | Nikon | X-Tek HMXST225 | Wird zum Scannen der Spezies verwendet V. minimum |
| NRecon Software | Bruker | Version 1.0.0 | Wird für die dreidimensionale Rekonstruktion verwendet |
| Phosphotungssäurehydrat 3% in wässriger Lösung | Elektronenmikroskopie Sciences | 101410-756 | Verkauft von VWR - USA |
| Kunststofffolie (Parafilm) | Heathrow Scientific | PM996 | Verkauft von VWR - USA |
| Plastik IV Beutel 500 mL | Taylor | 3478 | Verkauft von Fibra Cirurgica Produkte für Saude |
| PVC Schlauch 3/4'' | Nalge Nunc International | SC63013-164 | Verkauft von VWR - USA |
| Scansystem | Nikon X-Tek HMXST225 | zum Scannen von Viscum minimum | |
| Scansystem | Bruker Skyscan 1176 | zum Scannen von C. americana | |
| Scout-and-ScanTM Software | Zeiss | Version 16 | Wird zur Steuerung des Zeiss Versa 620 Systems und zur dreidimensionalen Rekonstruktion von Scans verwendet |
| Dreiwegeventil | ToToT | DMTWVS-5 | Verkauft von Amazon USA |
| Zweiteilige Spritze | HSW Henke-Ject | 4850001000 | Verwendet ohne der Kolben |
| Vakuumkammer | Binder | 80080-434 | Verkauft von VWR - USA; inklusive Pumpe und Verbindungsschläuchen |
| VG Studio Max Software | Volume Graphics | Version 3.0 | Wird für Analysen und die Aufnahme von Bildern und Videos verwendet |