Diese Arbeit liefert ein systematisch optimiertes Verfahren zur CRISPR/Cas9-Ribonuklease-basierten Konstruktion homozygoter Heuschreckenmutanten sowie eine detaillierte Methode zur Kryokonservierung und Reanimation der Heuschreckeneier.
Methodenartikel
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Diese Arbeit liefert ein systematisch optimiertes Verfahren zur CRISPR/Cas9-Ribonuklease-basierten Konstruktion homozygoter Heuschreckenmutanten sowie eine detaillierte Methode zur Kryokonservierung und Reanimation der Heuschreckeneier.
Die Wanderheuschrecke Locusta migratoria ist nicht nur eine der weltweiten Pestheuschrecken, die dem Menschen enorme wirtschaftliche Verluste zugefügt hat, sondern auch ein wichtiges Forschungsmodell für die Metamorphose von Insekten. Das CRISPR/Cas9-System ist in der Lage, einen bestimmten DNA-Locus genau zu lokalisieren und innerhalb des Zielorts zu spalten, wodurch Doppelstrangbrüche effizient eingeführt werden, um einen Knockout des Zielgens zu induzieren oder neue Genfragmente in den spezifischen Locus zu integrieren. Die CRISPR/Cas9-vermittelte Genom-Editierung ist ein leistungsfähiges Werkzeug zur Beantwortung von Fragen der Heuschreckenforschung sowie eine vielversprechende Technologie zur Heuschreckenbekämpfung. Diese Studie liefert ein systematisches Protokoll für CRISPR/Cas9-vermittelten Gen-Knockout mit dem Komplex aus Cas9-Protein und Single Guide RNAs (sgRNAs) in wandernden Heuschrecken. Die Auswahl der Zielstellen und das Design der sgRNA werden detailliert beschrieben, gefolgt von der in vitro Synthese und Verifizierung der sgRNAs. Zu den nachfolgenden Verfahren gehören die Entnahme von Eierfloßen und die Trennung von gegerbten Eiern, um eine erfolgreiche Mikroinjektion mit niedriger Sterblichkeitsrate zu erreichen, die Eikultur, die vorläufige Abschätzung der Mutationsrate, die Heuschreckenzucht sowie der Nachweis, die Konservierung und die Passage der Mutanten, um die Populationsstabilität der editierten Heuschrecken zu gewährleisten. Diese Methode kann als Referenz für CRISPR/Cas9-basierte Genom-Editing-Anwendungen sowohl bei Wanderheuschrecken als auch bei anderen Insekten verwendet werden.
Gen-Editing-Technologien könnten verwendet werden, um Insertionen oder Deletionen in einen bestimmten Genomlocus einzuführen, um das Zielgen absichtlich künstlich zu modifizieren1. In den letzten Jahren hat sich die CRISPR/Cas9-Technologie rasant weiterentwickelt und hat ein wachsendes Anwendungsspektrum in verschiedenen Bereichen der Lebenswissenschaften 2,3,4,5,6. Das CRISPR/Cas9-System wurde bereits 1987 entdeckt 7 und ist in Bakterien und Archaeen weit verbreitet. Weitere Untersuchungen deuteten darauf hin, dass es sich um ein prokaryotisches adaptives Immunsystem handelt, das auf die RNA-gesteuerte Nuklease Cas9 angewiesen ist, um Phagen zu bekämpfen8. Das künstlich modifizierte CRISPR/Cas9-System besteht im Wesentlichen aus zwei Komponenten, einer einzelnen Leit-RNA (sgRNA) und dem Cas9-Protein. Die sgRNA besteht aus einer zur Zielsequenz komplementären CRISPR-RNA (crRNA) und einer relativ konservierten trans-aktivierenden crRNA (tracrRNA). Wenn das CRISPR/Cas9-System aktiviert wird, bildet die sgRNA mit dem Cas9-Protein ein Ribonukleoprotein (RNP) und leitet Cas9 über die Basenpaarung von RNA-DNA-Interaktionen an seinen Zielort. Dann kann die doppelsträngige DNA durch das Cas9-Protein gespalten werden und als Ergebnis entsteht der Doppelstrangbruch (DSB) in der Nähe des Protospacer-Nachbarmotivs (PAM) der Zielstelle 9,10,11,12. Um die durch die DSBs verursachten Schäden zu mindern, würden Zellen umfassende DNA-Schadensantworten aktivieren, um die genomischen Schäden effizient zu erkennen und den Reparaturprozess einzuleiten. Es gibt zwei unterschiedliche Reparaturmechanismen in der Zelle: die nicht-homologe Endverbindung (NHEJ) und die homologiegesteuerte Reparatur (HDR). NHEJ ist der häufigste Reparaturweg, der DNA-Doppelstrangbrüche schnell reparieren kann und Zellapoptose verhindert. Es ist jedoch fehleranfällig, da kleine Fragmente von Insertionen und Deletionen (Indels) in der Nähe der DSBs verbleiben, was in der Regel zu einer Verschiebung des offenen Leserasters führt und somit zu einem Gen-Knock-out führen kann. Im Gegensatz dazu ist eine homologiste Reparatur ein recht seltenes Ereignis. Unter der Voraussetzung, dass es eine Reparaturschablone mit Sequenzen gibt, die homolog zum Kontext der DSB sind, würden Zellen gelegentlich den genomischen Bruch gemäß der nahe gelegenen Schablone reparieren. Das Ergebnis von HDR ist, dass die DSB präzise repariert wird. Insbesondere, wenn es eine zusätzliche Sequenz zwischen den homologen Sequenzen in der Vorlage gibt, würden diese durch HDR in das Genom integriert werden, und auf diese Weise könnten die spezifischen Geninsertionen realisiert werden13.
Mit der Optimierung und Entwicklung der sgRNA-Strukturen und Cas9-Proteinvarianten wurde das CRISPR/Cas9-basierte genetische Editierungssystem auch erfolgreich in der Erforschung von Insekten eingesetzt, einschließlich, aber nicht beschränkt auf Drosophila melanogaster, Aedes aegypti, Bombyx mori, Helicoverpa Armigera, Plutella xylostella und Locusta migratoria 14,15,16,17,18 ,19. Nach bestem Wissen der Autoren wurden zwar RNPs, die aus dem Cas9-Protein und in vitro transkribierter sgRNA bestehen, für die Editierung des Heuschreckengenomsverwendet 20,21,22, aber ein systematisches und detailliertes Protokoll für die CRISPR/Cas9-Ribonuklease-vermittelte Konstruktion homozygoter Mutanten der wandernden Heuschrecke fehlt noch.
Die Wanderheuschrecke ist ein wichtiger landwirtschaftlicher Schädling, der weltweit verbreitet ist und eine erhebliche Bedrohung für die Nahrungsmittelproduktion darstellt, da sie besonders für Getreidepflanzen wie Weizen, Mais, Reis und Hirse schädlich ist23. Genfunktionsanalysen, die auf Genom-Editing-Technologien basieren, können neue Angriffspunkte und neue Strategien zur Bekämpfung von Wanderheuschrecken liefern. Diese Studie schlägt eine detaillierte Methode vor, um wandernde Heuschreckengene über das CRISPR/Cas9-System auszuschalten, einschließlich der Auswahl von Zielorten und des Designs von sgRNAs, der In-vitro-Synthese und Verifizierung der sgRNAs, der Mikroinjektion und Kultur von Eizellen, der Abschätzung der Mutationsrate im Embryonalstadium, dem Nachweis von Mutanten sowie der Passage und Konservierung der Mutanten. Dieses Protokoll könnte als basale Referenz für die Manipulation der überwiegenden Mehrheit der Heuschreckengene verwendet werden und kann wertvolle Referenzen für die Genom-Editierung anderer Insekten liefern.
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1. Auswahl der Zielstelle und sgRNA-Design
2. Synthese und Verifizierung der sgRNA in vitro
3. Mikroinjektion und Kultivierung der Eizellen
4. Schätzung der Mutationsrate und das Screening von Mutanten
5. Etablierung und Weitergabe von Mutantenlinien
6. Kryokonservierung und Wiederbelebung von Eizellen
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Dieses Protokoll enthält die detaillierten Schritte zur Erzeugung homozygoter Mutanten der wandernden Heuschrecken mit dem RNP, das aus Cas9-Protein und in vitro synthetisierter sgRNA besteht. Im Folgenden sind einige repräsentative Ergebnisse des CRISPR/Cas9-vermittelten Zielgen-Knockouts in Heuschrecken aufgeführt, einschließlich der Zielauswahl, der sgRNA-Synthese und -Verifizierung (Abbildung 1A), der Eizellentnahme und -injektion, des Mutantenscreenings und der Weiterbildung, d...
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Heuschrecken gehören seit der Zivilisation der Menschheit zu den verheerendsten Schädlingen in der Landwirtschaft23. Die CRISPR/Cas9-basierte Genom-Editing-Technologie ist ein leistungsfähiges Werkzeug, um die biologischen Mechanismen von Heuschrecken besser zu verstehen und eine vielversprechende Schädlingsbekämpfungsstrategie zu entwickeln. Daher ist es von großem Nutzen, eine effiziente und einfach anzuwendende Methode zur CRISPR/Cas9-vermittelten Konstruktion homozygoter Heuschreckenmutanten z...
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Die Autoren erklären, dass keine Interessenkonflikte bestehen.
Diese Arbeit wurde von der National Natural Science Foundation of China (32070502, 31601697, 32072419 und der China Postdoctoral Science Foundation (2020M672205) unterstützt.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| 10 mal; NEBuffer r3.1 | New England Biolabs | B7030S | Der Puffer von in vitro Cas9-Spaltassays |
| 2xEs Taq MasterMix (Farbstoff) | Cwbio | CW0690 | Für die Genamplifikation |
| 2xPfu MasterMix (Farbstoff) | Cwbio | CW0686 | Für die Genamplifikation |
| CHOPCHOP | Online-Website zum Entwerfen von sgRNAs, http://chopchop.cbu.uib.no/. | ||
| CRISPOR | Online-Website zum Entwerfen von sgRNAs, http://crispor.org. | ||
| CRISPRdirect | Online-Website zum Entwerfen von sgRNAs, http://crispr.dbcls.jp/. | ||
| Elektrophorese-Stromversorgung | LIUYI BIOLOGY | DYY-6D | Trennung von Nukleinsäuremolekülen unterschiedlicher Größe |
| Eppendorf Tube | Eppendorf | 30125177 | Zur Probenentnahme, etc. |
| Feine Bürsten | Annigoni | 1235 | Zum Reinigen und Isolieren von Eiern. Online gekauft. |
| Flammender/brauner Mikropipettenabzieher | Sutter Instrument | P97 | Zur Herstellung der Mikroinjektionsnadeln |
| Gel-Extraktionskit | Cwbio | CW2302 | DNA-Rückgewinnung und -Reinigung |
| Gel-Imaging-Analysesystem | OLYMPUS | Gel Doc XR | Beobachten Sie die Elektrophorese-Ergebnisse |
| GeneTouch Plus | Bioer | B-48DA | Für die Genamplifikation |
| Glas Elektroden-Kapillare | Gairdner | GD-102 | Für die Herstellung Injektionsnadeln mit a Mikropipette Abzieher |
| Inkubator | MEMMERT | INplus55 | Für die Kultur von wandernden Heuschreckenembryonen |
| Metallbad | TIANGEN | AJ-800 | Zum Erhitzen der Probe |
| Mikro-Autoinjektor | Eppendorf | 5253000068 | Mikroinjektion von Embryonen in einem frühen Entwicklungsstadium |
| Mikrozentrifuge | Allsheng | MTV-1 | Wird zum Mischen von Reagenzien |
| verwendet Mikromühle | NARISHIGE | EG-401 | Zum Schleifen der Spitze der Injektionsnadel |
| Microloader | Eppendorf 5242956003 | Zum Laden von Lösungen in die Injektionsnadeln. | |
| Mikromanipulationssystem | Eppendorf | TransferMan 4r | Ein alternatives Manipulationssystem für die Mikroinjektion |
| Mikroskop | cnoptec | SZ780 | Für die Mikroinjektion |
| Manipulator mit Motorantrieb | NARISHIGE | MM-94 | Zur Kontrolle der Position der Mikropipette während des Mikroinjektionsprozesses |
| Multi-Sample Tissue Grinder | Jingxin | Tissuelyser-64 | Mahlen und homogenisieren Sie die Eier |
| Eiablagetopf | ChangShengYuanYi | CS-11 | Gefüllt mit nassem sterilem Sand für die Eiablage von Heuschrecken. Aus diesem Behälter werden die Oozysten gesammelt. Online gekauft. |
| Parafilm | ParafilmM | PM996 | Zum Einwickeln der Petrischale. |
| pEASY-T3 Klonierungskit | TransGen Biotech | CT301-01 | Für die TA-Klonierung |
| Petrischale | NEST | 752001 | Für die Kultivierung und Konservierung von Eizellen. |
| Pipettierer | Eppendorf | Research plus | Zum Laden von Proben |
| Kulturbecher | aus Kunststoff Für die getrennte Aufzucht von Heuschrecken und jeder Plastikbecher, der groß genug ist (nicht weniger als 1000 ml Volumen), ist geeignet. Online gekauft. | ||
| Präzisions-gRNA-Synthese-Kit | Thermo | A29377 | Für die sgRNA-Synthese |
| Primer Premier | PREMIER Biosoft | Primer Premier 5.00 | Für das Primer-Design |
| SnapGene | Insightful Science | SnapGene® 4.2.4 | Zum Analysieren von Sequenzen |
| Stahlkugeln | HuaXinGangQiu | HXGQ60 | Zum Schleifen von Proben. Online gekauft. |
| Tipps | bioleaf | D781349 | Zum Laden von Proben |
| Trans DNA Marker II | TransGen Biotech | BM411-01 | Zur Bestimmung der Gengröße |
| TrueCut Cas9 Protein v2 | Thermo | A36496 | Cas9 Protein |
| UniversalGen DNA Kit | Cwbio | CWY004 | Für die genomische DNA-Extraktion |
| VANNAS Schere | Elektronenmikroskopie Sciences | 72932-01 | Zum Abschneiden der |
| Antennen Weizen | Zur Erzeugung von Weizensetzlingen als Nahrung für Heuschrecken. Gekauft von lokalen Bauern. | ||
| ZiFiT | Online-Website zum Entwerfen von sgRNAs, http://zifit.partners.org/ZiFiT/ChoiceMenu.aspx. |
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