Das vorliegende Protokoll beschreibt eine Methode zur Extraktion extrazellulärer Vesikel aus dem peripheren Blut und festem Gewebe mit anschließender Profilierung von Oberflächenantigenen und Proteinladungen.
Methodenartikel
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Das vorliegende Protokoll beschreibt eine Methode zur Extraktion extrazellulärer Vesikel aus dem peripheren Blut und festem Gewebe mit anschließender Profilierung von Oberflächenantigenen und Proteinladungen.
Zirkulierende und geweberesidente extrazelluläre Vesikel (EVs) stellen vielversprechende Ziele als neuartige theranostische Biomarker dar und erweisen sich als wichtige Akteure bei der Aufrechterhaltung der organismischen Homöostase und dem Fortschreiten eines breiten Spektrums von Krankheiten. Während sich die aktuelle Forschung auf die Charakterisierung endogener Exosomen mit endosomalem Ursprung konzentriert, haben Mikrovesikel, die aus der Plasmamembran blähen, zunehmend an Aufmerksamkeit in den Bereichen Gesundheit und Krankheit gewonnen, die sich durch eine Fülle von Oberflächenmolekülen auszeichnen, die die Membransignatur von Elternzellen rekapitulieren. In dieser Arbeit wird ein reproduzierbares Verfahren vorgestellt, das auf der Differentialzentrifugation basiert, um EVs aus dem Plasma und festen Geweben, wie z.B. dem Knochen, zu extrahieren und zu charakterisieren. Das Protokoll beschreibt darüber hinaus die anschließende Profilierung von Oberflächenantigenen und Proteinladungen von EVs, die somit auf ihre Ableitungen zurückgeführt und mit Komponenten identifiziert werden können, die mit einer potenziellen Funktion in Verbindung stehen. Diese Methode wird für die korrelative, funktionelle und mechanistische Analyse von EVs in biologischen, physiologischen und pathologischen Studien nützlich sein.
Extrazelluläre Vesikel (EVs) wurden vorgeschlagen, um zellfreigesetzte Lipiddoppelschicht-eingeschlossene extrazelluläre Strukturenzu definieren 1, die eine wichtige Rolle bei verschiedenen physiologischen und pathologischen Ereignissenspielen 2. EVs, die von gesunden Zellen freigesetzt werden, können grob in zwei Hauptkategorien unterteilt werden, nämlich Exosomen (oder kleine EVs), die durch einen intrazellulären endozytären Transportweg3 gebildet werden, und Mikrovesikel (oder große EVs), die durch die nach außen gerichtete Knospung der Plasmamembran der Zelle4 entstehen. Während sich viele Studien auf die Funktion von EVs konzentrieren, die aus kultivierten Zellen in vitro5 gewonnen wurden, sind EVs, die aus dem Kreislauf oder Gewebe stammen, komplexer und heterogener, was den Vorteil hat, dass sie den wahren Zustand des Organismus in vivo widerspiegeln 6. Darüber hinaus können fast alle Arten von Geweben EVs in vivo produzieren, und diese EVs können als Botenstoffe innerhalb des Gewebes fungieren oder von verschiedenen Körperflüssigkeiten, insbesondere dem peripheren Blut, übertragen werden, um die systemische Kommunikation zu erleichtern7. EVs im Kreislauf und im Gewebe sind auch Ziele für die Diagnose und Behandlung von Krankheiten8.
Während Exosomen in den letzten Jahren intensiv erforscht wurden, haben Mikrovesikel auch wichtige biologische Funktionen, die ohne Ultrazentrifugation leicht extrahiert werden können und so die Grundlagen- und klinische Forschung fördern9. Ein kritisches Problem in Bezug auf EVs, die aus dem Kreislauf und dem Gewebe isoliert wurden, besteht darin, dass sie von verschiedenen Zelltypen stammen10. Da Mikrovesikel von der Plasmamembran abgeblasen werden und durch eine Fülle von Zelloberflächenmolekülen9 gekennzeichnet sind, ist die Verwendung von Markern für die Mutterzellmembran zur Identifizierung des zellulären Ursprungs dieser EVs möglich. Insbesondere kann die Technik der Durchflusszytometrie (FC) zum Nachweis von Membranmarkern eingesetzt werden. Darüber hinaus können die Forscher die Elektrofahrzeuge isolieren und weitere Analysen auf der Grundlage der funktionalen Ladungen durchführen.
Das vorliegende Protokoll bietet ein gründliches Verfahren zur Extraktion und Charakterisierung von EVs aus in vivo Proben. Die EVs werden mittels Differentialzentrifugation isoliert, und die Charakterisierung der EVs umfasst die morphologische Identifizierung mittels Nanopartikel-Tracking-Analyse (NTA) und Transmissionselektronenmikroskopie (TEM), Herkunftsanalyse mittels FC und Proteinfrachtanalyse mittels Western Blot. Das Blutplasma und der Oberkieferknochen von Mäusen werden als Repräsentanten verwendet. Forscher können auf dieses Protokoll für Elektrofahrzeuge aus anderen Quellen zurückgreifen und entsprechende Änderungen vornehmen.
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Die Tierversuche wurden in Übereinstimmung mit den Richtlinien des Komitees für institutionelle Tierpflege und -nutzung der Vierten Militärmedizinischen Universität und den ARRIVE-Richtlinien durchgeführt. Für die vorliegende Studie wurden 8 Wochen alte C57Bl/6-Mäuse (keine Präferenz für Weibchen oder Männchen) verwendet. Die Schritte zur Isolierung von Plasma- und Gewebe-EVs sind in Abbildung 1 dargestellt. Das Plasma wird als Repräsentant herangezogen, um das Verfahren zur Isolierung von EV aus Körperflüssigkeiten zu beschreiben. Der Oberkieferknochen wird als Repräsentant herangezogen, um das Verfahren der EV-Isolierung aus dem festen Gewebe zu erklären.
1. Aufbereitung des Plasmas und der Oberkieferknochenproben
2. Extraktion von Elektrofahrzeugen
3. Morphologische Identifizierung von EVs
4. Herkunftsanalyse von Elektrofahrzeugen
HINWEIS: Die Identifizierung des zellulären Ursprungs von EVs erfordert die Anwendung von Antikörpern für typische Zellmembranmarker. Das minimale Plasmavolumen für die Extraktion der EVs für das folgende Verfahren beträgt 300 μl. Basierend auf den Lipiddoppelschichtstrukturen von EVs kann ein Membranfarbstoff verwendet werden, um sie zu markieren. Für Blutplasmaproben wird CD18 für Lymphozyten14 zur Repräsentation gewählt. Für Oberkieferknochenproben wird beispielhaft der Osteoklasten-assoziierte Rezeptor (OSCAR) für Osteoklasten15 ausgewählt. Stellen Sie vor dem FC sicher, dass das Durchflusszytometer für die Messung von EVs16 geeignet ist, da sich die untere Größengrenze zwischen verschiedenen Durchflusszytometern stark unterscheidet.
5. Analyse des Proteingehalts von EVs
HINWEIS: Die Analyse des Proteingehalts in EVs erfolgt mittels Western Blot. So wurden beispielsweise die Plasma- und Knochen-EVs ausgewählt, um den Stoffwechselstatus der 6-Phosphogluconat-Dehydrogenase (PID) und der Pyruvatkinase M2 (PKM2) zu analysieren. Golgin84 (das Golgi-Organell) wurde als Negativkontrolle verwendet, und Flotillin (Membranprotein), Caveolin (integrales Protein der Caveolae) und β-Aktin (das Zytoskelett)17 wurden als Positivkontrolle in EVs im Vergleich zu Zellproben verwendet. Mitofilin und α-Actinin-4 wurden als große EV-Marker ausgewählt, während CD9 und CD81 als kleine EV-Marker ausgewählt wurden, um die EV-Subpopulationen zu demonstrieren18. Apoa1 wurde als Plasma-Lipopartikel-Markerausgewählt 19. Details zu den jeweiligen Reagenzien finden Sie in der Materialtabelle.
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Entsprechend dem experimentellen Arbeitsablauf können EVs aus dem peripheren Blut und festen Geweben extrahiert werden (Abbildung 1). Der Oberkieferknochen einer Maus im Alter von 8 Wochen beträgt ca. 0,1 ± 0,05 g, und es können ca. 300 μl Plasma aus der Maus entnommen werden. Nach den Protokollschritten können 0,3 mg bzw. 3 μg EVs gesammelt werden. Wie mittels TEM und NTA analysiert, sind die typischen morphologischen Merkmale von EVs runde becherförmige Membranvesikel mit einem Durchmesser...
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Bei der Untersuchung der Merkmale, des Verbleibs und der Funktion von Elektrofahrzeugen ist es von entscheidender Bedeutung, Elektrofahrzeuge mit hoher Ausbeute und geringer Kontamination zu isolieren. Es gibt verschiedene Methoden zur Extraktion von EVs, wie z. B. Dichtegradientenzentrifugation (DGC), Größenausschlusschromatographie (SEC) und Immunocapture-Assays 4,20. Hier kam eine der am häufigsten verwendeten Methoden, die Differentialzentrifugation, zum Eins...
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Die Autoren haben keine Interessenkonflikte offenzulegen.
Diese Arbeit wurde durch Zuschüsse der National Natural Science Foundation of China (32000974, 81870796, 82170988 und 81930025) und der China Postdoctoral Science Foundation (2019M663986 und BX20190380) unterstützt. Wir sind dankbar für die Unterstützung des National Experimental Teaching Demonstration Center for Basic Medicine (AMFU).
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| 4% Paraformaldehyd | Biosharp | 143174 | Transmissionselektronenmikroskop |
| Alexa Fluor 488 Anti-Ziegen-Sekundärantikörper | Yeason | 34306ES60 | Durchflusszytometrie |
| Alexa Fluor 488 Anti-Kaninchen-Sekundärantikörper | Invitrogen | A11008 | Durchflusszytometrie |
| Anti-CD18-Antikörper | Abcam | ab131044 | Durchflusszytometrie |
| Anti-CD81-Antikörper | Abcam | ab109201 | Western-Blot-Anti-CD9-Antikörper |
| Huabio | ET1601-9 | ||
| Abcam | ab110329 | Western-Blot | |
| APOA1 Kaninchen-pAb | Abclone | A14211 | Western-Blot |
| BCA-Protein-Assay-Kit | TIANGEN | PA115 | Western-Blot |
| BLUeye Vorgefärbte Proteinleiter | Sigma-Aldrich | 94964-500UL | Western Blot |
| Rinderserumalbumin | MP Biomedical | 218072801 | Western Blot |
| Caveolin-1 Antikörper | Santa Cruz Biotechnology | sc-53564 | Western Blot |
| CellMask Orange Plasmamembranfärbung | Invitrogen | C10045 | Durchflusszytometrie |
| Chemilumineszenz | Amersham Biosciences | N/A | Western Blot |
| Gebogene Operationsschere | JZ Chirurgisches Instrument | J21040 | EV-Isolierung |
| Elektronische Waage | Zhi Ke | ZK-DST | EV-Isolierung |
| Epochen-Spektralphotometer | BioTek | N/A | Western Blot |
| Eppendorf Röhrchen | Eppendorf | 3810X | EV Isolierung |
| Flotillin-1 Antikörper | PTM BIO | PTM-5369 | Western Blot |
| Gel-Imaging-System | Tanon | 4600 | Western Blot |
| Golgin84 | Novus | nbp1-83352 | Western Blot |
| Gitter - Formvar/Carbon Coated - Kupfer 200 mesh | Polysciences | 24915 | Transmissionselektronenmikroskop |
| Heparin Lösung | StemCell | 7980 | EV-Isolierung |
| Liberase Research Grade | Sigma-Aldrich | 5401127001 | EV-Isolierung |
| Mikroskopische Pinzette | JZ Chirurgisches Instrument | JD1020 | EV-Isolierung |
| NovoCyte Durchflusszytometer | ACEA | N/A | Durchflusszytometrie |
| Omni-PAGE Hepes-Tris Gele Hepes 4~20%, 10 Wells | Epizyme | LK206 | Western Blot |
| OSCAR( D-19) Antikörper | Santa Cruz Biotechnology | SC-34235 | Durchflusszytometrie |
| PBS (2x) | ZHHC | PW013 | Western Blot |
| Pentobarbital Natrium | Sigma-Aldrich | 57-33-0 | Anästhesieperoxidase |
| AffiniReine Ziege Anti-Maus IgG (H+L) | Jacson | 115-035-003 | Western Blot |
| Peroxidase AffiniReine Ziege Anti-Kaninchen IgG (H+L) | Jacson | 111-035-003 | Western Blot |
| Phosphotungssäure | RHAWN | 12501-23-4 | Transmissionselektronenmikroskop |
| PKM2(d78a4) xp Kaninchen mab | Cell Signaling | 4053t | Western Blot |
| Polyethylen (PE) Film | Xiang yi | 200150055 | Transmissionselektronenmikroskop |
| Polyvinylidenfluorid-Membranen | Roche | 3010040001 | Western Blot |
| Protease-Inhibitoren | Roche | 4693132001 | Western Blot |
| Rekombinanter Anti-PID-Antikörper | Abcam | ab129199 | Western Blot |
| RIPA Lysepuffer | Beyotime | P0013 | Western Blot |
| SDS-PAGE Ladepuffer (5x) | Cwbio | CW0027S | Western Blot |
| Beads | Invitrogen | F13839 | Durchflusszytometrie |
| Tisch-Hochgeschwindigkeits-Mikrozentrifugen | Hitachi | CT15E | EV-Isolierung |
| Transmissionselektronenmikroskop | HITACHI | H-7650 | Transmissionselektronenmikroskop |
| Tween-20 | MP Biomedicals | 19472 | Western Blot |
| Vortex Mixer Genie | Scientific Industries | SI0425 | EV-Isolierung |
| ZetaView BASIC NTA - Nanopartikel-Tracking-Videomikroskop PMX-120 | Particle Metrix | N/A | Nanopartikel-Tracking-Analyse |
| α-Actinin-4 Kaninchen mAb | Abclone | A3379 | Western Blot |
| β-Aktin | Cwbio | CW0096M | Western Blot |
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