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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dieses Protokoll beschreibt einen Ansatz, der statische und dynamische Methoden kombiniert, um die Wirksamkeit organischer Peroxysäuren zur Beseitigung von Biofilmen in der Milchindustrie zu bewerten. Dieser Ansatz kann auch verwendet werden, um die Wirksamkeit neuer biologischer oder chemischer Formulierungen zur Bekämpfung von Biofilmen zu testen.
Das Vorhandensein von Biofilmen in der Milchindustrie ist von großer Bedeutung, da sie aufgrund ihrer hohen Beständigkeit gegen die meisten Clean-in-Place-Verfahren (CIP), die häufig in Verarbeitungsbetrieben verwendet werden, zur Herstellung unsicherer und veränderter Milchprodukte führen können. Daher ist es unerlässlich, neue Strategien zur Biofilmkontrolle für die Milchindustrie zu entwickeln. Dieses Protokoll zielt darauf ab, die Wirksamkeit organischer Peroxysäuren (Peressigsäure, Perpropionsäure und Permilchsäure sowie ein kommerzielles Desinfektionsmittel auf Peressigsäurebasis) zur Beseitigung von Milchbiofilmen mit einer Kombination aus statischen und dynamischen Methoden zu bewerten. Alle Desinfektionsmittel wurden an den stärksten Biofilm-produzierenden Bakterien entweder in einem einzelnen oder einem gemischten Biofilm unter Verwendung des MBEC-Assays (Minimum Biofilm eradication Concentration), einer statischen Hochdurchsatz-Screening-Methode, getestet. Eine Kontaktzeit von 5 Minuten mit den Desinfektionsmitteln in den empfohlenen Konzentrationen beseitigte erfolgreich sowohl die einzelnen als auch die gemischten Biofilme. Derzeit laufen Studien, um diese Beobachtungen mit dem Biofilmreaktor des Center for Disease Control (CDC), einer dynamischen Methode zur Nachahmung von In-situ-Bedingungen , zu bestätigen. Diese Art von Bioreaktor ermöglicht die Verwendung einer Edelstahloberfläche, die die meisten industriellen Geräte und Oberflächen ausmacht. Die vorläufigen Ergebnisse des Reaktors scheinen die Wirksamkeit organischer Peroxysäuren gegen Biofilme zu bestätigen. Der in dieser Studie beschriebene kombinierte Ansatz kann verwendet werden, um neue biologische oder chemische Formulierungen zur Bekämpfung von Biofilmen und zur Ausrottung von Mikroorganismen zu entwickeln und zu testen.
Die Milchindustrie ist ein wichtiger Industriezweig weltweit, auch in Kanada, wo es mehr als 10.500 Milchviehbetriebe gibt, die jedes Jahr fast 90 Millionen hl Milch produzieren1. Trotz der strengen Hygieneanforderungen in der Milchindustrie, auch in Verarbeitungsbetrieben, stellt Milch ein hervorragendes Nährmedium für Mikroorganismen dar, und daher enthalten Milchprodukte wahrscheinlich Mikroorganismen, einschließlich Verderb oder pathogener Mikroorganismen. Diese Krankheitserreger können verschiedene Krankheiten verursachen; Zum Beispiel können Salmonella sp. und Listeria monocytogenes Gastroenteritis bzw. Meningitisverursachen 2. Verderbnisfördernde Mikroorganismen können die Qualität und die organoleptischen Eigenschaften von Milchprodukten beeinträchtigen, indem sie Gase, extrazelluläre Enzyme oder Säuren produzieren3. Auch das Aussehen und die Farbe der Milch können verändert sein, z.B. durch Pseudomonas spp.4.
Einige dieser Mikroorganismen können Biofilme auf verschiedenen Oberflächen, einschließlich Edelstahl, bilden. Solche Biofilme ermöglichen die Persistenz und Vermehrung von Mikroorganismen auf der Oberfläche der Geräte und damit die Kontamination der Milchprodukte5. Biofilme sind auch problematisch, da sie die Wärmeübertragung behindern und die Korrosion der Geräte beschleunigen können, was zu einem vorzeitigen Austausch der Geräte und damit zu wirtschaftlichen Verlusten führt6.
Clean-in-Place-Verfahren (CIP) ermöglichen es der Lebensmittelindustrie, das Wachstum von Mikroorganismen zu kontrollieren. Diese Verfahren beinhalten die sequentielle Verwendung von Natriumhydroxid, Salpetersäure und manchmal Desinfektionsmitteln, die hypochlorige Säure und Peressigsäure 7,8 enthalten. Obwohl hypochlorige Säure hochwirksam gegen Mikroorganismen ist, reagiert sie auch mit natürlichen organischen Stoffen, was zur Bildung toxischer Nebenprodukte führt9. Peressigsäure erzeugt keine schädlichen Nebenprodukte10; Seine Wirksamkeit gegen Biofilme in der Lebensmittelindustrie ist jedoch sehr unterschiedlich10,11. In jüngster Zeit wurden andere Peroxysäuren, einschließlich Perpropion- und Permilchsäuren, auf ihre antimikrobielle Aktivität untersucht, und sie scheinen eine gute Alternative für die Kontrolle des mikrobiellen Wachstums in Biofilmen zu sein12,13.
Daher zielte diese Studie darauf ab, die Wirksamkeit organischer Peroxysäuren (Peressigsäure, Perpropionsäure und Permilchsäure sowie ein Desinfektionsmittel auf Peressigsäurebasis) zur Beseitigung von Milchbiofilmen unter Verwendung eines Ansatzes zu bewerten, der den MBEC-Assay (Minimum Biofilm eradication Concentration), eine statische Hochdurchsatz-Screening-Methode und den Biofilmreaktor des Center for Disease Control (CDC), eine dynamische Methode, die in situ nachahmt Bedingungen. Der MBEC-Assay wird im Folgenden im Protokoll als "Biofilm-Mikrotiterplatten" bezeichnet. Das hier vorgestellte Protokoll und die repräsentativen Ergebnisse belegen die Wirksamkeit organischer Peroxysäuren und ihre mögliche Anwendung zur Bekämpfung mikrobieller Biofilme in der Milchindustrie.
Die in diesem Artikel enthaltenen Arbeiten erfordern ein Labor der Biosicherheitsstufe 2 und wurden zuvor vom institutionellen Biosicherheitsausschuss der Université Laval genehmigt (Projektnummer 119689).
HINWEIS: Das Flussdiagramm in Abbildung 1 stellt eine Zusammenfassung der Methodik dar, die statische und dynamische Ansätze kombiniert, die zur Bewertung der Wirksamkeit organischer Peroxysäuren zur Beseitigung von Biofilmen verwendet wurde.
1. Vorbereitung der Materialien
Gl. (1)
Gl. (2)2. Bildung von einzelnen und gemischten Biofilmen
Gl. (3)3. Quantitative Bewertung der Wirksamkeit organischer Peroxysäuren zur Eraminierung von Biofilmen
Gl. (4)
Gl. (5)
Gl. (6)
Gl. (7)
Gl. (8)4. Qualitative Bewertung der Wirksamkeit organischer Peroxysäuren zur Eraminierung von Biofilmen
ANMERKUNG: Nach der Behandlung mit den Desinfektionsmitteln (Schritt 3.1.1 bis Schritt 3.1.5) wurden die P. azotoformans-Biofilme , die sich bei der statischen Methode auf den Stiften der Biofilm-Mikrotiterplatte bildeten, präpariert und durch Beobachtung an Rasterelektronen- und konfokalen Mikroskopen analysiert.
Die REM-Analyse zeigt das Vorhandensein von Biofilmen, die von P. azotoformans PFl1A produziert werden, auf den Biofilm-Mikroplattenstiften (Abbildung 2A). Es kann eine dreidimensionale Biofilmstruktur beobachtet werden. Der P. azotoformans PFl1A wurde zuvor unter Verwendung von 96-Well-Mikrotiterplatten12 als starker Biofilmproduzent (A570 > 1,5) identifiziert.
Darüber hinaus schien der PFl1A-Biofilm von P. azotoformans , der sich auf einem Edelstahlobjektträger unter Verwendung des Bioreaktors bildete, sehr dicht zu sein und die morphologischen Merkmale eines reifen Biofilms mit einer dreidimensionalen Struktur aufzuweisen (Abbildung 2B). Darüber hinaus zeigten die Ergebnisse der Keimzahlen der Biofilme, die von diesem Isolat im dynamischen System entwickelt wurden, signifikante Zelldichten, die 8,74 log KBE/cm2 bzw. 7,86 log KBE/cm2 in TSB-Kulturmedium bzw. steriler Magermilch entsprechen (Abbildung 2C).
Darüber hinaus zeigten die in Abbildung 3 gezeigten Ergebnisse, die mit dem B. vesicularis-Isolat erzielt wurden, dass bestimmte Faktoren einen wichtigen Einfluss auf die Biofilmbildung im Bioreaktor haben können. Durch Variation einiger Parameter, wie z. B. der Rührgeschwindigkeit innerhalb des Bioreaktors, der Mediumsflussrate, der mittleren Nährstoffkonzentration und der Dauer des kontinuierlichen Modusschritts, kann die Zellanhaftung verbessert und dichtere Biofilme beobachtet werden. Beispielsweise führte die Erhöhung der Nährstoffkonzentration von 100 mg/L auf 900 mg/L (Zustand A im Vergleich zu Zustand F) zu einem Anstieg der Keimzahl der Biofilme von 6,11 log KBE/cm 2 auf 8,71 log KBE/cm2. Darüber hinaus wurde ein signifikantes Wachstum von Biofilmen beobachtet, wenn die Flussrate auf 6,0 ml/min (im Zustand C) reduziert wurde, was zu einer längeren Verweilzeit führte, die mit der Wachstumsrate dieses Isolats übereinstimmte.
Die mikroskopischen Beobachtungen der Biofilme, die sich auf den Biofilm-Mikrotiterplatten bildeten, oder die Vor- und Nachdesinfektionsbehandlung des Bioreaktors waren komplementär zu den lebensfähigen Zellzahlen. Abbildung 4 zeigt, dass keiner der Biofilme nachweisbare lebensfähige Zellen zum Zeitpunkt der Kontaktzeit (5 min) und Konzentrationen (500 ppm mit organischen Peroxysäuren und 100.000 ppm mit Wasserstoffperoxid) von Desinfektionsmitteln enthielt, die üblicherweise in Molkereien angewendet werden. Diese Ergebnisse wurden durch Mikroskopie bestätigt (Abbildung 5). Abbildung 5A zeigt die dreidimensionale Struktur eines unbehandelten MBEC-Biofilms (Kontrolle), während behandelte MBEC-Biofilme (mit Wasserstoffperoxid, Peressigsäure, Permilchsäure, Perpropionsäure und einem handelsüblichen Desinfektionsmittelpräparat) ihre dreidimensionale Konformation verlieren, wie durch REM bestimmt. Obwohl die Biofilme mit Desinfektionsmittel behandelt wurden, blieb eine scheinbare Biofilmstruktur erhalten, insbesondere mit Wasserstoffperoxid. Nichtsdestotrotz bestätigte die Verwendung einer Lebend-Tot-Technik, in diesem Fall der konfokalen Mikroskopie (CM) mit Fluoreszenz-Viabilitätsfärbung, dass die verbleibende Biofilmstruktur nach einer Desinfektionsbehandlung weitgehend leblos war (Abbildung 5B).

Abbildung 1: Flussdiagramm, das einen kombinierten statischen und dynamischen Ansatz zur Bewertung der Wirksamkeit organischer Peroxysäuren zur Beseitigung von Biofilmen darstellt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Analyse der Biofilmbildung durch Pseudomonas azotoformans PFl1A. (A) Rasterelektronenmikroskopische Aufnahmen (300x und 2.000x) des PFl1A-Biofilms von P. azotoformans , der an den Stiften der Biofilm-Mikrotiterplatte gebildet wurde. Diese Abbildung wurde mit Genehmigung von Goetz et al.12 modifiziert (Copyright 2022 American Society for Microbiology. Alle Rechte vorbehalten.). Maßstabsbalken = 50 μm (300x), 100 μm (2.000x). (B) Rasterelektronenmikroskopische Aufnahmen (2.000x) von (1) einem Edelstahlobjektträger, der einen im Bioreaktor gezüchteten PFl1A-Biofilm von P. azotoformans enthält, und (2) einem biofilmfreien Objektträger (Negativkontrolle). Maßstabsleiste = 10 μm. Diese Zahl wurde mit Genehmigung von Niboucha et al.16 geändert. (C) Bakteriendichte von P. azotoformans PFl1A-Biofilmen, die im Bioreaktor in TSB-Kulturmedium und steriler Magermilch gebildet und nach ihrer Entfernung durch Ultraschall von den Edelstahlobjektträgern bestimmt wurden. Die Daten werden als Mittelwert ± SD (n = 3) dargestellt. Der signifikante Unterschied (p < 0,05) basiert auf dem t-Test des Schülers. Diese Zahl wurde mit Genehmigung von Niboucha et al.16 geändert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 3: Bakteriendichte von Brevundimonas vesicularis-Biofilmen , die unter Verwendung des Bioreaktors unter unterschiedlichen Bedingungen des Rührens, der Flussraten, der Zeit im kontinuierlichen Modus und der Nährmedien (TSB) entwickelt wurden. Zustand A: 130 U/min Rührgeschwindigkeit, 11,8 ml/min Durchflussrate, 24 h kontinuierlicher Modus in 100 mg/L TSB-Medium (gemäß dem internationalen ASTM-Protokoll E2562-1714 für die Bildung von Biofilmen durch Pseudomonas aeruginosa); Zustand B: 60 U/min Rührgeschwindigkeit, 11,8 ml/min Durchflussrate, 24 h kontinuierlicher Modus in 100 mg/L TSB-Medium; Zustand C: 60 U/min Rührgeschwindigkeit, 6,0 ml/min Durchflussrate, 24 h kontinuierlicher Modus in 100 mg/L TSB-Medium; Zustand D: 60 U/min Rührgeschwindigkeit, 6,0 ml/min Durchflussrate, 48 h kontinuierlicher Modus in 100 mg/L TSB-Medium; Zustand E: 60 U/min Rührgeschwindigkeit, 6,0 ml/min Durchflussrate, 48 h kontinuierlicher Modus in 300 mg/L TSB-Medium; Zustand F: 60 U/min Rührgeschwindigkeit, 6,0 ml/min Durchflussrate, 48 h kontinuierlicher Modus in 900 mg/L TSB-Medium; Zustand G: 60 U/min Rührgeschwindigkeit, 6,0 ml/min Durchflussrate, 24 h Batch-Modus in 2,7 g/L TSB und 48 h kontinuierlicher Modus in 900 mg/L TSB-Medium. Die Daten werden als Mittelwert ± SD (n = 3) dargestellt. Signifikante Unterschiede (unterschiedliche Buchstaben, p < 0,05) basieren auf der Einweg-ANOVA und dem Tukey-Mehrfachvergleichstest. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 4: Anzahl lebensfähiger Zellen in PFl1A-Biofilmen von Pseudomonas azotoformans vor und nach der Behandlung mit Wasserstoffperoxid, Permilchsäure, Perpropionsäure, Peressigsäure oder handelsüblichem Desinfektionsmittel. Jeder Punkt stellt den Mittelwert der dreifachen Zählungen dar, die an drei unabhängigen Tagen für jedes Isolat erhalten wurden. Die Daten werden als Mittelwert ± SD (n = 3) dargestellt. Diese Abbildung wurde mit Genehmigung von Goetz et al.12 modifiziert (Copyright 2022 American Society for Microbiology. Alle Rechte vorbehalten.). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 5: Mikroskopische Beobachtung der Biofilmstruktur und -lebensfähigkeit. (A) Rasterelektronenmikroskopische Aufnahmen (300x und 2.000x) eines PFl1A-Biofilms von Pseudomonas azotoformans , der vor (Kontrolle) und nach der Behandlung mit Wasserstoffperoxid, Peressigsäure, Permilchsäure, Perpropionsäure und handelsüblichem Desinfektionsmittel auf den Stiften der Biofilm-Mikrotiterplatte vor (Kontrolle) und nach der Behandlung mit Wasserstoffperoxid, Peressigsäure, Permilchsäure, Perpropionsäure und handelsüblichem Desinfektionsmittel bei ihren minimalen Biofilm-Eradikationskonzentrationen (MBEC) gebildet wurde. Maßstabsleiste = 10 μm. Diese Abbildung wurde mit Genehmigung von Goetz et al.12 modifiziert (Copyright 2022 American Society for Microbiology. Alle Rechte vorbehalten.). (B) Lebensfähigkeit eines Biofilms, der von P. azotoformans PFl1A unter Verwendung einer Fluoreszenzzellviabilitätsfärbung auf dem Biofilm-Mikroplattenstift vor (links) und nach (rechts) Behandlung mit Peressigsäure (500 ppm) gebildet wird, sichtbar durch konfokale Laser-Scanning-Mikroskopie (63x/1,40 Öl-Differential-Interferenz-Kontrastobjektiv). Die lebensfähigen Zellen sind grün gefärbt und die toten Zellen sind rot gefärbt. Maßstabsbalken = 20 μm. Diese Zahl wurde von Goetz et al.12 mit Genehmigung geändert (Copyright 2022 American Society for Microbiology. Alle Rechte vorbehalten.). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Die Autoren erklären, dass sie keine Interessenkonflikte haben.
Dieses Protokoll beschreibt einen Ansatz, der statische und dynamische Methoden kombiniert, um die Wirksamkeit organischer Peroxysäuren zur Beseitigung von Biofilmen in der Milchindustrie zu bewerten. Dieser Ansatz kann auch verwendet werden, um die Wirksamkeit neuer biologischer oder chemischer Formulierungen zur Bekämpfung von Biofilmen zu testen.
Diese Forschung wurde vom Consortium de Recherche et Innovations en Bioprocédés Industriels au Québec (CRIBIQ) (2016-049-C22), Agropur, Groupe Sani Marc und dem Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) (RDCPJ516460-17) unterstützt. Wir danken Teresa Paniconi für die kritische Durchsicht des Manuskripts.
| 0,2 &Mikro; m Filter | Corning | 09-754-28 | Durchmesser: 50 mm, PTFE-Membran |
| 316 Edelstahl-Disc Coupon | Biosurface Technologies Corporation | RD128-316 | |
| 316 Edelstahl-Slide Coupon | Biosurface Technologies Corporation | CBR 2128-316 | |
| 96-Mikrotiter-Platte | Corning | 07-200-89 | Zellkultur-behandelte Mikroplatte mit flachem Boden |
| Essigsäure | Sigma Aldrich | 27225 | bei RT |
| aufbewahren Aluminium-Stubs | Elektronenmikroskopie Wissenschaft | 75830-10 | 32x5mm |
| Wässriger Glutaraldehyd EM Grade 25% | Elektronenmikroskopie Wissenschaft | 16220 | bei -20 ° C |
| AB204-S/FACT Analysenwaage | Mettler Toledo | AB204-S | |
| Bakterieller Entlüftungsfilter (0,45 &Mikro; m) | Biosurface Technologies Corporation | BST 02915 | |
| BioDestroy | Groupe Sani Marc | 09-10215 | kommerzielles Desinfektionsmittel auf Peressigsäurebasis, lagern bei RT |
| Carboy LDPE 20 L | Cole Parmer | 06031-52 | |
| CDC Biofilmreaktor | Biosurface Technologies Corporation | CRB 90 | Bioreaktor |
| Cer (IV) sulfat | Thermo Scientific | 35650-K2 | bei RT |
| Konfokales Laser-Scanning-Mikroskop laden LSM 700 | Zeiss | LSM 700 | |
| Dey-Engley Neutralisationsbrühe | Millipore | D3435-500G | bei 4 > C |
| EMS950x + 350er Gold Sputter | Elektronenmikroskopie Sciences | ||
| Epoxidharz | Elektronenmikroskopie Sciences | 14121 | mit BDMA |
| Ethylalkohol 95%, USP | Greenfield Global | P016EA95 | bei RT lagern |
| Ferroin-Indikatorlösung | Sigma Aldrich | 318922-100ML | bei RT |
| aufbewahren Füll-/Entlüftungskappe | Cole Parmer | RK-06258-00 | |
| FilmTracer LIVE/DEAD Biofilm Viability Kit | Invitrogen | L10316 | Fluoreszenz-Zellviabilitätskit (SYTO 9: grüner fluoreszierender Farbstoff, Propidiumiodid: roter fluoreszierender Farbstoff), lagern bei - 20 & deg; C |
| Glasströmungsunterbrechung | Biosurface Technologies Corporation | FB 50 | |
| Gold mit silberner Farbe | Elektronenmikroskopie Sciences | 12684-15 | |
| Heizplatten-Set | Biosurface Technologies Corporation | 110V Rührplatte | |
| Sechskantschraubendreher | Biosurface Technologies Corporation | CBR 5497 | |
| Wasserstoffperoxid | Sigma | 216763 | bei 4 & Grad lagern; C |
| Impfösen | VWR | 12000-812 | steril, 10 & micro; l |
| Milchsäure | Laboratoire MAT | LU-0200 | im RT |
| MASTERFLEX L/S 7557-04 W/ 7557-02 mit EASY-LOAD II Schlauchpumpe und 77200-50 Head | Cole Parmer | 77200-60 | |
| MBEC (Minimum Biofilm Eradication Concentration) Assay Biofilm-Impfschrank mit einer 96-Well-Basis | Innovotech | 19111 | Biofilm-Mikrotiterplatte |
| Oxford-Agar-Basis | Thermo Scientific | OXCM0856B | Geschäft bei 4 & deg; C |
| Kunststoff Couponhalter | Biosurface Technologies Corporation | CBR 2203 | |
| Kunststoff Gleithalter Stange | Biosurface Technologies Corporation | CBR 2203-GL | |
| Kaliumiodid | Fisher Chemical | P410-500 | bei RT aufbewahren |
| Präzisions-Schlitzschraubendreher (1,5 mm x 40 mm) | Wiha | 26015 | |
| Propionsäure | Laboratoire MAT | PF-0221 | Store at RT |
| Sartorius BCE822-1S Entris® II Basic Essential Toploading-Waage | Cole Parmer | UZ-11976-3 | |
| Rasterelektronenmikroskop JSM-6360LV Modell | JEOL | JSM-6360LV | REM und Benutzeroberfläche |
| Schraubrohr, 15 mL | Sarstedt | 62.554.205 | (LxØ): 120 x 17 mm, Material: PP, konischer Boden, transparent, HD-PE |
| Schraubrohr, 50 mL | Sarstedt | 62.547.205 | (LxØ): 114 x 28 mm, Material: PP, konischer Boden, transparent, HD-PE |
| Natrium-Cacodylat-Trihydrat-Elektronenmikroskopie-Wissenschaften | 12300 | Filiale bei -20 & Grad; C | |
| Natriumthiosulfat | Thermo Scientific | AC124270010 | bei RT |
| aufbewahren Beschallungsbad | Fisher | 15-336-122 | 5,7 L |
| Stärkelösung | Anachämie | AC8615 | bei RT |
| aufbewahren Schwefelsäure | Sigma Aldrich | 258105-500ML | bei RT |
| aufbewahren Tryptische Soja-Agar | BD Bacto | DF0369-17-6 | bei RT aufbewahren |
| Tryptische Sojabrühe | BD Bacto | DF0370-17-3 | bei RT |
| Tubing Masterflex L/S 16 25'Cole | Parmer | MFX0642416 | |
| Tubing Masterflex L/S 18 25'Cole | Parmer | MFX0642418 | |
| Tygon SPT-3350 Silikonschlauch | Saint-Gobain | ABW18NSF | IDx AD: 1/4 Zoll x 7/16 Zoll |
| Vortex | Cole Parmer | UZ-04724-00 | |
| Wasserbad | VWR | 89202-970 | |
| Zen-Software | Zeiss |