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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dies ist ein einfaches Protokoll eines Gerstenblattscheiden-Assays mit minimalen Reagenzien und gängigen Laborgeräten (einschließlich eines einfachen Smartphones). Ziel ist es, den frühen Infektionsprozess der Blastenkrankheit in Labors ohne Zugang zu fortschrittlichen Mikroskopiegeräten zu visualisieren.
Zu verstehen, wie Pflanzen und Krankheitserreger interagieren und ob diese Interaktion in Abwehr oder Krankheit gipfelt, ist erforderlich, um stärkere und nachhaltigere Strategien für die Pflanzengesundheit zu entwickeln. Fortschritte bei Methoden, die Pflanzenpathogenproben während der Infektion und Besiedlung effektiver abbilden, haben Werkzeuge wie den Reisblattscheiden-Assay hervorgebracht, der sich bei der Überwachung von Infektionen und frühen Kolonisierungsereignissen zwischen Reis und dem Pilzpathogen Magnaporthe oryzae als nützlich erwiesen hat. Dieser hemi-biotrophe Erreger verursacht schwere Krankheitsverluste bei Reis und verwandten Monokotyledonen, einschließlich Hirse, Roggen, Gerste und in jüngerer Zeit Weizen. Der Blattscheiden-Assay liefert, wenn er korrekt durchgeführt wird, einen optisch klaren Pflanzenabschnitt mit einer Dicke von mehreren Schichten, der es den Forschern ermöglicht, während des Pathogenangriffs eine Bildgebung von lebenden Zellen durchzuführen oder feste Proben zu erzeugen, die für bestimmte Merkmale gefärbt sind. Detaillierte zelluläre Untersuchungen der Interaktion zwischen Gerste und M. oryzae hinkten denen des Reiswirts hinterher, trotz der wachsenden Bedeutung dieses Getreides als Nahrungsquelle für Tier und Mensch sowie als fermentierte Getränke. Hier wird über die Entwicklung eines Gerstenblattscheiden-Assays für komplizierte Studien von M. oryzae-Interaktionen während der ersten 48 Stunden nach der Inokulation berichtet. Der Blattscheiden-Assay, unabhängig davon, welche Art untersucht wird, ist heikel; Es wird ein Protokoll bereitgestellt, das alles abdeckt, von den Wachstumsbedingungen für Gerste und der Gewinnung einer Blattscheide bis hin zur Inokulation, Inkubation und Bildgebung des Erregers auf Pflanzenblättern. Dieses Protokoll kann für das Hochdurchsatz-Screening optimiert werden, indem etwas so Einfaches wie ein Smartphone für Bildgebungszwecke verwendet wird.
Magnaporthe oryzae, der Reisexplosionspilz, infiziert eine Reihe von Getreidekulturen, darunter Gerste, Weizen und Reis1. Dieser Erreger verursacht verheerende Krankheiten und stellt eine weltweite Bedrohung für diese wertvollen Nutzpflanzen dar, die zu vollständigen Ernteverlusten führt, wenn er nicht kontrolliert wird. Viele Labore auf der ganzen Welt konzentrieren sich auf die Reisexplosionskrankheit aufgrund ihrer globalen Bedrohung und ihrer Eigenschaften als hervorragendes Modell für Pflanzen-Pilz-Interaktionen2. Es wurde vollständig sequenziert, und die Genetik seines Infektionszyklus, insbesondere der frühen Ereignisse, wurde festgestellt 3,4. Der Lebenszyklus beginnt damit, dass eine Spore auf einer Blattoberfläche keimt und die spezialisierte Penetrationsstruktur bildet, die als Appressorium bezeichnet wird. Das Appressorium dringt in das Blattgewebe ein und die Infektion setzt sich mit der Entwicklung von Läsionen fort, die den Prozess der Sporulation auslösen und die Krankheit verbreiten4. Die Verhinderung eines dieser frühen Ereignisse würde diese verheerende Krankheit drastisch hemmen. Folglich konzentrierte sich der Großteil der aktuellen Forschung zur Blastenerkrankung auf die frühen Infektionsschritte, von den gekeimten Konidien, die ein Appressorium bilden, bis zur Entwicklung der invasiven Hyphen und des biotrophen Grenzflächenkomplexes (BIC)5.
Die umfangreiche Forschung zur Explosionskrankheit wurde bei Reis durchgeführt, obwohl M. oryzae ein bedeutender Krankheitserreger für eine Vielzahl von Nutzpflanzen ist und neu entwickelte Stämme zu einer globalen Bedrohung für Weizen werden6. Während Reis neben Weizen und Mais zu den drei wichtigsten Grundnahrungsmitteln gehört, um die Bevölkerung zu ernähren, ist Gerste das vierte Getreidekorn in Bezug auf Viehfutter und Bierproduktion7. Mit dem Wachstum der Craft-Beer-Industrie wächst auch der wirtschaftliche Wert von Gerste. Es gibt deutliche Vorteile bei der Verwendung von M. oryzae und Gerste als Pathosystem zur Untersuchung von Blastenkrankheiten. Erstens gibt es Stämme von M. oryzae , die nur Gerste infizieren, sowie Stämme, die mehrere Grasarten infizieren können. Zum Beispiel infiziert 4091-5-8 hauptsächlich nur Gerste, während Guy11 und 70-15 sowohl Gerste als auch Reis8 infizieren können. Diese Stämme sind genetisch ähnlich und der Infektionsprozess ist vergleichbar9. Zweitens ist Gerste unter Standard-Labor- und Gewächshausbedingungen einfacher zu züchten, da sie nicht die komplizierten Anforderungen von Reis hat (präzise Temperaturkontrolle, hohe Luftfeuchtigkeit, spezifische Lichtspektren). Es gibt auch Herausforderungen bei der Bildgebung von Reis aufgrund der Hydrophobie der Blattoberfläche, die Gerste nicht aufweist10.
Dieses Protokoll stellt eine einfache Methode zur Isolierung und effektiven Nutzung von Gerstenblatthüllen für die mikroskopische Analyse mehrerer Infektionsstadien dar, wobei gängiges Laborzubehör und ein Smartphone zur Datenerfassung verwendet werden. Diese Methode für den Gerstenblattscheiden-Assay ist für Labore auf der ganzen Welt anpassbar, da sie nur minimale Vorräte erfordert und dennoch ein klares Bild der mikroskopischen Wechselwirkung zwischen dem Erreger und den ersten Zellen, die er infiziert, liefert. Während Pathogenitätstests, wie z. B. eine Spray- oder Tröpfchenimpfung, eine Makroansicht der Fähigkeit des Erregers, Läsionen zu bilden, liefern können, ermöglicht dieser Assay dem Forscher, bestimmte Schritte der frühen Infektion zu visualisieren, von Ereignissen vor der Penetration bis zur Besiedlung von Epidermiszellen. Darüber hinaus können die Forscher die Infektion mit dem Wildtyp-Pilz leicht mit einer Infektion mit einer Mutante vergleichen, deren Virulenz reduziert ist.
1. Vorbereitung von Versuchsmaterialien
2. Färbeprozess
3. Montage- und Bildgebungsprozess
4. Bildbeurteilung und -zählung mit ImageJ (FIJI)
Eine Darstellung des anfänglichen Arbeitsablaufs für diese Technik ist in Abbildung 1 dargestellt. Die Scheiden wurden von 14 Tage alten anfälligen "Lacey"-Gerstenpflanzen (H. vulgare) geerntet. Die Konidien wurden aus 10 Tage alten sporulierenden M. oryzae OMA-Platten geerntet, wobei eine konidiale Suspension unter Verwendung von sterilem ddH2O für eine Endkonzentration von 5 x 104 Sporen pro ml hergestellt wurde. Die Inokulumsuspension wurde direkt auf die Blattscheiden aufgetragen, die an sterilen Petriplatten befestigt waren. Die Platten wurden in einer warmen, feuchten Kammer für 48 h ohne Licht aufbewahrt. Nach der Inkubationszeit wurden die Blattscheiden mit Trypanblau gefärbt und für die Bildgebung vorbereitet.
Die Infektionsstellen wurden mit einem Smartphone und einem Smartphone-Mikroskopadapter abgebildet. Für jeden der getesteten Stämme von M. oryzae wurden mindestens 10 Bilder aufgenommen. Das Experiment wurde dreimal wiederholt, um mindestens 30 Bilder für jeden Pilzstamm zu erhalten. Abbildung 2A zeigt die repräsentativen Ergebnisse eines erfolgreichen Hüllen-Assays sowie ungefärbte und falsch gefärbte Bilder als Referenz.
Je nach Hypothese können diese Bilder auf vielfältige Weise quantifiziert und analysiert werden. Für dieses Experiment wurde 48 h nach der Inokulation die Gesamtzahl der lebenden Sporen (gekeimte Sporen) zusammen mit der Anzahl der Appressorien und der Anzahl der erfolgreich infizierten Zellen gezählt. Eine Sammlung von 2.000 zufällig mutagenisierten M. oryzae-Stämmen in einem Gersten-infizierenden Hintergrund wurde im Labor erzeugt. Pathogenitätstests unter Verwendung von Spray- und Tropfenimpfungen ergaben viele Mutanten mit reduzierter Läsionsgröße im Vergleich zum Wildtyp (ein häufiger Phänotyp für M. oryzae-Mutanten )11. Um diese Phänotypen auseinander zu nehmen, wurde die Hypothese aufgestellt, dass die reduzierte Läsionsgröße durch die Hemmung eines der frühen Infektionsschritte (Sporenkeimung, appressoriale Bildung, Penetrationsstiftbildung, anfängliche epidermale Zellbesiedlung) verursacht wurde, die am einfachsten über den Blattscheiden-Assay getestet werden kann. Ein vielversprechender Kandidat aus dem Mutagenese-Projekt wurde unter Verwendung eines Vorwärtsgenetikums namens J99A12 identifiziert. Diese Mutante zeigte während des Screenings keine Empfindlichkeit gegenüber stickstoffarmen oder reaktiven Sauerstoffbedingungen. Während der Folgeexperimente produzierte J99A eine signifikante Anzahl von Appressorien auf einer hydrophoben Oberfläche, zeigte jedoch eine reduzierte Läsionsgröße auf lebender Gerste. Bei Tests mit dem Scheidenassay entwickelte J99A erfolgreich Appressorien und Penetrationsstifte, die in die Blattscheide eindrangen, aber im Inneren keine invasiven Hyphen produzierten, was darauf hindeutet, dass die Infektion am Penetrationsstift gestoppt wurde (Abbildung 2B). Erfolgreich infizierte Zellen wurden durch das Vorhandensein infektiöser Hyphen im Gewebe der Blattscheide identifiziert. Der Vergleich der Anzahl der Appressorien mit der Anzahl der infizierten Zellen ergab einen Prozentsatz der erfolgreich infizierten Appressorien. Beim Wildtyp 4091-5-8 drangen 87% der Appressorien erfolgreich in die Zelle ein und besiedelten sie, während in der Mutante J99A nur 36% der Appressorien Hyphen in der Zelle12 aufwiesen.

Abbildung 1: Blattscheiden, die von 10 Tage alter Gerste geerntet und vorsichtig mit in Ethanol gereinigten Werkzeugen entfernt wurden. Konidien werden gesammelt und die Konzentration wird mit sterilem Wasser auf 0,5-1,0 x 105 pro Milliliter eingestellt. Die isolierten Hüllen werden in eine 60 cm lange Petriplatte geklebt, und die konidiale Suspension wird in die Hülle geladen. Die beimpften Proben werden bei Raumtemperatur im Dunkeln mit Bechern mit heißem Wasser für Feuchtigkeit aufbewahrt. Die Proben werden in 45% Essigsäure + 0,1% Trypanblau für 1-2 h bei 40 °C gefärbt und dann 48 h nach der Inokulation dreimal in 60% Glycerin gespült. Gefärbte Proben werden montiert und bebildert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 2: Repräsentative Ergebnisse aus dem Färbeprotokoll . (A) Abweichungen vom Färbeprotokoll können zu suboptimalen Ergebnissen führen. Die Hitze und die Essigsäure dienen dazu, das Blattgewebe sanft aufzuweichen. Die Nachfärbungsspülungen in 60% Glycerin entfernen nicht nur den überschüssigen Fleck, sondern tragen auch dazu bei, die durch das Blatt verursachte Lichtstreuung zu reduzieren und die Bildqualität zu verbessern. Maßstabsbalken = 50 μm. (B) Repräsentative Bilder, die die Robustheit dieses Assays zeigen, um fehlgeschlagene Penetrations- und nachfolgende Infektionsversuche von J99A (Pfeilspitzen) zu sehen, verglichen mit erfolgreichen Versuchen von 4091WT, die zur Produktion von invasiven Hyphen im Blattgewebe (Pfeile) führten. Maßstabsbalken = 50 μm. Alle Bilder wurden 48 Stunden nach der Infektion aufgenommen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Die Autoren haben nichts zu offenbaren.
Dies ist ein einfaches Protokoll eines Gerstenblattscheiden-Assays mit minimalen Reagenzien und gängigen Laborgeräten (einschließlich eines einfachen Smartphones). Ziel ist es, den frühen Infektionsprozess der Blastenkrankheit in Labors ohne Zugang zu fortschrittlichen Mikroskopiegeräten zu visualisieren.
Die Autoren erkennen die Finanzierung durch den USDA-NIFA-Preis 2016-67013-24816 an.
| Essigsäure | Sigma-Aldrich | A6283 | |
| Mobiltelefon | Pixel 4A | Jedes Smartphone mit einer Rückfahrkamera, die in einer Halterung montiert werden kann, ist ausreichend. | |
| Handy Mikroskop Adapter | Vankey | B01788LT3S | https://www.amazon.com/Vankey-Cellphone-Telescope-Binocular-Microscope/dp/B01788LT3S/ref=sr_1_2_sspa?keywords=vankey+cellphone+telescope+adapter+mount&qid=1662568182&sprefix= vankey+%2Caps%2C63& sr=8-2 -spons& PSC=1& spLa=ZW5jcnlwd GVkUXVhbGlmaWVyPUFKNklBR jlCREJaMEcmZW5jcnlwdGVkSWQ 9QTA2MDMxNjhBRFYxQTMzNk9E M0YmZW5jcnlwdGVkQWRJZD1BM DQxMzAzOTMxNzI1TzE3M1ZGTEI md2lkZ2V0TmFtZT1zcF9hdGYmY WN0aW9uPWNsaWNrUmVkaXJlY3 QmZG9Ob3RMb2dDbGljaz10cnVl |
| Glycerin | Sigma-Aldrich | G5516 | |
| Mikroskop | AmScope | FM690TC | 40x– 2500x Trinokulares aufrechtes Epi-Fluoreszenzmikroskop |
| Haferflocken Old Fashioned Haferflocken | Quaker N | /A | https://www.amazon.com/Quaker-Oats-Old-Fashioned-Pack/dp/B00IIVBNK4/ref=asc_df_B00IIVBNK4/?tag=hyprod-20&linkCode=df0 & hvadid=312253390021& hvpos= & hvnetw=g& hvrand=98212627704 6839544& hvpone=& hvptwo=& hvq mt=& hvdev=c& hvdvcmdl=& hvlocint =& hvlocphy=9007494& hvtargid =PLA-568492637928& psc=1 |
| ProMix BX | ProMix | 1038500RG | |
| Rechteckiges Deckglas | Corning | CLS2975245 | |
| Objektträger, Mikroskop | Sigma-Aldrich | S8902 | |
| Tischmikrometer | OMAX | A36CALM7 | 0,1 mm und 0,01 mm Objektträger für die Mikroskopkalibrierung |
| Trypanblau | Sigma-Aldrich | T6146 |