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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier diskutieren wir einen Arbeitsablauf zur Präparation, Sektion, Montage und Bildgebung von lebenden Explantatgehirnen aus Drosophila melanogaster-Larven des dritten Stadiums, um die zelluläre und subzelluläre Dynamik unter physiologischen Bedingungen zu beobachten.
Drosophila-neurale Stammzellen (Neuroblasten, im Folgenden NBs) durchlaufen asymmetrische Teilungen, die den sich selbst erneuernden Neuroblasten regenerieren und gleichzeitig eine differenzierende Ganglienmutterzelle (GMC) bilden, die eine zusätzliche Teilung durchläuft, um zwei Neuronen oder Gliazellen entstehen zu lassen. Studien an NBs haben die molekularen Mechanismen aufgedeckt, die der Zellpolarität, der Spindelorientierung, der Selbsterneuerung neuraler Stammzellen und der Differenzierung zugrunde liegen. Diese asymmetrischen Zellteilungen sind durch Lebendzell-Bildgebung leicht zu beobachten, wodurch sich Larven-NBs ideal für die Untersuchung der räumlich-zeitlichen Dynamik der asymmetrischen Zellteilung in lebendem Gewebe eignen. Bei richtiger Präparation und Abbildung in nährstoffangereichertem Medium teilen sich NBs im Explantatgehirn 12-20 Stunden lang robust. Die zuvor beschriebenen Methoden sind technisch schwierig und können für Neulinge auf diesem Gebiet eine Herausforderung darstellen. Hier wird ein Protokoll für die Präparation, Präparation, Montage und Bildgebung von lebenden Larvenexplantaten des dritten Stadiums unter Verwendung von Fettkörperpräparaten beschrieben. Es werden auch mögliche Probleme diskutiert und Beispiele für den Einsatz dieser Technik gegeben.
Asymmetrische Zellteilung (ACD) ist der Prozess, bei dem subzelluläre Komponenten wie RNA, Proteine und Organellen ungleichmäßig auf die Tochterzellen verteilt werden 1,2. Dieser Prozess ist häufig bei Stammzellen zu beobachten, die ACD durchlaufen, um Tochterzellen mit unterschiedlichen Entwicklungsschicksalen hervorzubringen. Drosophila NBs teilen sich asymmetrisch und erzeugen eine NB, die ihre Stammform beibehält, und eine Ganglienmutterzelle (GMC). Das GMC durchläuft weitere Teilungen, um differenzierende Neuronen oder Gliazellenzu erzeugen 3. Asymmetrisch teilende NBs sind in den sich entwickelnden Gehirnen von Larven des dritten Stadiums reichlich vorhanden, die mit Hilfe der Mikroskopie leicht beobachtet werden können. Im Larvenstadium des dritten Stadiums sind in jedem zentralen Hirnlappen etwa 100 NBsvorhanden 3,4,5,6.
Die asymmetrische Zellteilung ist ein hochdynamischer Prozess. Lebendzell-Bildgebungsprotokolle wurden verwendet, um die Dynamik der Zellpolarität 7,8,9,10, der Spindelorientierung 11,12,13, der Dynamik des Aktomyosin-Kortex14,15,16,17,18, der Mikrotubuli- und Zentrosombiologie 19,20 zu messen und zu quantifizieren,21,22,23,24,25,26,27 und Membran 10,28 und Chromatindynamik 29. Qualitative und quantitative Beschreibungen von ACD basieren auf robusten Methoden und Protokollen, um NBs in intakten lebenden Gehirnen abzubilden. Das folgende Protokoll beschreibt Methoden zur Präparation, Sektion und Bildgebung von Larvengehirnen im dritten Stadium für die Bildgebung lebender Zellen in vivo unter Verwendung von zwei verschiedenen Montageansätzen. Diese Methoden eignen sich am besten für Forscher, die sich für die raumzeitliche Dynamik von Stammzellteilungen sowie für Teilungen in anderen Gehirnzellen interessieren, da sie kurz- und langfristige Beobachtungen zellulärer Ereignisse ermöglichen. Darüber hinaus sind diese Techniken für Neulinge auf diesem Gebiet leicht zugänglich. Wir demonstrieren die Effektivität und Anpassungsfähigkeit dieses Ansatzes mit Larvenhirnen, die fluoreszenzmarkierte Mikrotubuli und kortikale Fusionsproteine exprimieren. Darüber hinaus diskutieren wir Analysemethoden und Überlegungen zur Anwendung in anderen Studien.
HINWEIS: Abbildung 1 zeigt die Materialien, die für die Durchführung dieser Studie erforderlich sind.
1. Überlegungen und Vorbereitungen für das Experiment
2. Stadien und Sammlung der Larven (Abbildung 2)
3. Sektion des Larvenfettkörpers (Abbildung 3)
HINWEIS: Dieses Protokoll beschreibt die Präparation mit einer 3-Well-Dissektionsschale.
4. Dissektion des Larvengehirns (Abbildung 3)
5. Montage und Belichtung (Abbildung 4)
6. Best Practices für Datenverarbeitung und -verwaltung
7. Beispielhafte Quantifizierung der Zellzykluslänge (Abbildung 5)
HINWEIS: In diesem Beispiel wurden Larven abgebildet, die den Polaritätsmarker Pins (Pins::EGFP16) und das Mikrotubuli-bindende Protein Jupiter25 (cherry::Jupiter13) exprimieren. Die anschließende Analyse erfolgte mit der Software Imaris.
8. Beispielhafte Quantifizierung der Ausrichtung der Zellspindel (Abbildung 5)
HINWEIS: In diesem Beispiel wird die Analyse mit der Imaris-Software durchgeführt.






Dissektion und Bildgebung von zentralen Hirnlappen-NBs, die Pins::EGFP und Cherry::Jupiter exprimieren
Um dieses Protokoll zu demonstrieren, wurden Larven, die UAS-getriebenes Cherry::Jupiter13 exprimieren und endogen mit Pins::EGFP16 markiert sind (w; worGal4, UAS-cherry::jupiter/CyO; Die Pins::EGFP/TM6B, Tb) wurden 4 h lang mit dem beschriebenen Protokoll unter Verwendung von Multi-Well-Imaging-Objektträgern abgebildet (Abbildung 5C,D). Zusätzliche Daten wurden von Larven entnommen, die UAS-getriebenen Cherry::Jupiter13 exprimieren und endogen mit Miranda::EGFP markiert wurden (w; worGal4, UAS-cherry::Zeus/CyO; UAS-Miranda::GFP/TM6B), die 10 h lang mit einem membrangebundenen Objektträger abgebildet wurden (Abbildung 5E,F). Die Larven wurden in Käfigen aufgezogen, wie in Abschnitt 1 dieses Protokolls beschrieben. Im Alter von 72-96 h wurden die Larven präpariert (Abbildung 3), montiert (Abbildung 4) und abgebildet. Für die hier durchgeführten Experimente wurde ein 561 nm Laser mit 10% Laserleistung bei 100 ms Belichtungszeit und ein 488 nm Laser mit 15% Laserleistung mit 100 ms Belichtungszeit verwendet. Z-Stapel (41 μm) wurden mit einer Schrittweite von 1 μm erfasst. Die Bilder wurden alle 5 Minuten bei RT mit einem konfokalen Spinning-Disc-System von Intelligent Imaging Innovations (3i) aufgenommen, das aus einer Yokogawa CSU-W1 Spinning-Disc-Einheit und zwei Prime 95B Scientific CMOS-Kameras besteht. Für die Bildgebung wurde ein 60x/1.4NA Ölimmersionsobjektiv verwendet, das auf einem Nikon Eclipse Ti Mikroskop montiert war. Die Live-Imaging-Voxel betrugen 0,22 μm x 0,22 μm x 0,75 μm (60x/1.4NA Spinning Disc).
In Übereinstimmung mit früheren Berichten16 bildeten die Pins eine ausgeprägte apikale Sichel bei der Teilung von NBs während der Mitose, und die mitotischen Spindeln richteten sich konsequent auf diese apikale Sichel aus (Abbildung 5C). Die Zellzykluslänge wurde durch Messung der Zeit zwischen aufeinanderfolgenden Metaphasen der einzelnen NBs bestimmt (Abbildung 5D,F).
Bei Proben, die 4 h lang ohne Fettkörpersupplementierung auf einem Multiwell-Objektträger abgebildet wurden, nahm die Zellzykluslänge mit zunehmender Bildgebungszeit zu (Abbildung 5C, D). Proben, die in fettem, körperergänzendem Medium auf einem membrangebundenen Objektträger abgebildet wurden, zeigten keine Zunahme der Zellzykluslänge (Abbildung 5E, F). Des Weiteren wurden NBs mit vier Teilung auf dem 10 h membrangebundenen Objektträger beobachtet (Abbildung 5D vs. Abbildung 5F).
Schließlich wurde der Winkel zwischen der Teilungsachse und der mitotischen Spindel unter Verwendung von GFP-markierten Pins als Referenz bestimmt (schematisch in Abbildung 5G dargestellt). Die Teilungsachse wurde bestimmt, indem der Mittelpunkt der apikalen Sichel identifiziert wurde, die von den Pins in der Mitose gebildet wird, und die Zelle in zwei Hälften halbiert wurde (Abbildung 5G, rote gestrichelte Linie). Wie bereits beschrieben, wiesen die Wildtyp-NBs mitotische Spindeln auf, die nicht mehr als 30° von der Teilungsachse entfernt waren (Loyer und Januschke36 und Abbildung 5H).

Abbildung 1: Materialien. (A) Präpariermikroskop. (B) Sammelkäfig mit Fliegen des gewünschten Genotyps und einem Mehldeckel mit heranwachsenden Larven. (C) Präparier- und Bildgebungsmedium, 5 ml. (D) Mehlkappen mit Larven aus drei verschiedenen Sammlungen. (E,E') Mikrodissektionswerkzeuge, von links nach rechts: Mikrodissektionsschere, Pinzette. (F,F') Schale sezieren. (G) Ein 8-Welle-μ-Objektträger für die Abbildung der Proben. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 2: Beispiel für Mahlzeitkapseln. (A) Zwei Fläschchen mit männlichen und weiblichen Fliegen, die gekreuzt werden sollen, ein leerer Embryonensammelkäfig und ein frischer Mahlzeitverschluss. (B) Die Unterseite des Embryonensammelkäfigs mit der neuen Mahlzeitkappe (links) und die Oberseite des Käfigs mit Fliegen (rechts). (C) Der komplett montierte Fliegenkäfig. (D) Ein Beispiel für eine gut inszenierte Mehlkappe mit Larven zum Sezieren. Beachten Sie, dass das Futter durch die Larven gestört, aber nicht übermäßig gestört wird. (E,F) Zwei Beispiele für 4 Tage alte, überfüllte Mahlzeitkappen. Beachten Sie, dass dieses Essen jetzt eine suppenartige Konsistenz hat. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 3: Präparation . (A) Dorsale Ansicht einer Larve im dritten Stadium. Die rote Linie am hinteren Ende der Larve zeigt an, wo der erste Schnitt gemacht werden sollte. (B) Dorsale Ansicht der Larve nach Entfernung des hinteren Endes. (C) Diagramm, das zeigt, wie man die Larve umdreht. Halten Sie die Larve mit einer Pinzette an der Nagelhaut in der Nähe der Stelle, an der der erste Schnitt gemacht wurde. Drücken Sie mit der anderen Pinzette in das vordere Ende der Larve, um sie umzudrehen. Die schwarzen Pfeile zeigen die Richtung der Pinzette an, wobei einer von der vorderen Seite in die Larven "hineindrückt" und der andere das abgeschnittene hintere Ende in Richtung des vorderen Endes bewegt. Der kleinere rote Pfeil kennzeichnet eine Karikatur von dicken Körpern. (D) Ansicht einer umgedrehten Larve, an der die Fettkörper und der Verdauungstrakt noch befestigt sind. (E) Ansicht einer invertierten Larve, bei der das Nicht-ZNS-Gewebe entfernt wurde. Die rote gestrichelte Linie umreißt das noch anhaftende Gehirn. (F) Schematische Darstellung der Entfernung des Gehirns aus der Nagelhaut. Die rote gestrichelte Linie zeigt den Weg an, der mit einer Mikrodissektionsschere geschnitten werden muss, um das Gehirn von der umgekehrten Nagelhaut zu befreien, und die schwarzen Pfeile zeigen die Entfernung des Gehirns aus der Nagelhaut an. (G) Eine Ansicht des umgekehrten Gehirns, das immer noch durch eine kleine Anzahl von axonalen Verbindungen unter dem ventralen Nervenstrang (VNC) mit der Kutikula verbunden ist. (H) Ein isoliertes Larvengehirn. Die Hirnlappen sind mit gestrichelten orangefarbenen Linien umrandet. (I) Isolierte Fettkörper. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 4: Montage und Belichtung. (A) Ansicht der Bauteile für die Montage eines membrangebundenen Metallschiebers. (B) Schematische Darstellung der Bestandteile des membrangebundenen Objektträgers und ihrer Montage. (C) Seitenansicht der in den Metallschieber eingesetzten Membran, die durch den geteilten Metallring an Ort und Stelle gehalten wird. (D) Draufsicht auf den zusammengebauten Objektträger ohne Deckglas. Das Präparations- und Bildgebungsmedium mit Fettkörpern und präparierten Gehirnen wurde auf die Membran aufgebracht. (E) Vergrößerte Ansicht der Fettkörper und Gehirne im Tropfen des Mediums. (F) Draufsicht auf den Metallschieber nach dem Hinzufügen des Glasdeckglases. (G) Draufsicht auf den zusammengebauten Objektträger mit dem Glasdeckglas, das mit geschmolzener Vaseline am Objektträger befestigt ist. Das Abdecken der Ränder des Deckglases mit Vaseline verhindert zudem die Verdunstung des Mediums. (H) Schematische Darstellung des zusammengebauten Objektträgers mit Gehirnen, die für die Beobachtung auf einem inversen Mikroskop ausgerichtet sind. Die blauen Kreise kennzeichnen NBs in den zentralen Hirnlappen und VNC. (I) Ansicht eines leeren Multi-Well-Objektträgers. (J) Vergrößerte Ansicht einer Vertiefung des Multi-Well-Objektträgers. (K) Schematische Darstellung der Gehirnorientierung für die Abbildung der zentralen Hirnlappen auf einem inversen Mikroskop mit einem Multi-Well-Objektträger. Die blauen Kreise kennzeichnen NBs in den zentralen Hirnlappen und VNC. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 5: Quantifizierung der Zellzykluslänge . (A) Diagramm eines Larvengehirns im dritten Stadium, das die Hirnlappen, den Sehlappen (OL, dunkelgrau), den ventralen Nervenstrang (VNC), NBs (dunkelblau), GMCs (hellblau) und Neuronen (violett) innerhalb der zentralen Hirnlappen und VNC hervorhebt. (B) Schematische Darstellung der NB- und GMC-Abteilungen. (C) Bildserie eines Wildtyp-NB mit weiß markierten Mikrotubuli (MTs, UAS-Cherry::Jupiter) und apikalen Pins (Pins::EGFP in grün), abgebildet in einem Multiwell-Objektträger ohne Fettkörpersupplementierung für 4 h. Zusammengeführte Bilder und der entsprechende Abstammungsbaum mit Zellzyklus-Timing sind unten dargestellt. Maßstabsbalken = 10 μm. (D) Quantifizierung der Zellzykluslänge (Metaphase - Metaphase) für die erste, zweite und dritte Teilung in Proben, die auf einem Multiwell-Objektträger ohne Fettkörper abgebildet wurden. (E) Bildserie eines Wildtyp-NB mit weiß markierten Mikrotubuli (MTs, UAS-Cherry::Jupiter), abgebildet mit einem membrangebundenen Objektträger mit Fettkörpersupplementierung für 10 h mit dem entsprechenden Linienbaum und Zellzyklus-Timing. Maßstabsbalken = 10 μm. (F) Quantifizierung der Zellzykluslänge (Metaphase - Metaphase) für die erste, zweite, dritte und vierte Teilung in Proben, die auf einem membrangebundenen Objektträger mit Fettkörpern abgebildet wurden. (G) Schematische Darstellung der Bestimmung des Winkels zwischen Spindelachse (orange gestrichelte Linie) und Teilungsachse (θ, rote gestrichelte Linie). (H) Quantifizierung von θ aus 10 Zellen, die mit einem Multi-Well-Objektträger ohne Fettkörper abgebildet wurden. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Die Autoren haben keine finanziellen Angaben zu machen.
Hier diskutieren wir einen Arbeitsablauf zur Präparation, Sektion, Montage und Bildgebung von lebenden Explantatgehirnen aus Drosophila melanogaster-Larven des dritten Stadiums, um die zelluläre und subzelluläre Dynamik unter physiologischen Bedingungen zu beobachten.
Diese Forschung wird durch R35GM148160 (C. C.) und einen National Institutes of Health (NIH) Training Grant T32 GM007270 (R. C. S) unterstützt
| 0,22 &Mikro; m Polyethersulfon (PES)-Membran | Genesee | 25-231 | Vakuumfilter |
| Agar | Genesee | 20-248 | granulierter |
| Agar Analysecomputer | Dell | NA | Intel Xeon Gold 5222 CPU mit zwei 3,80-GHz-Prozessoren unter Windows 10 auf einem 64-Bit-Betriebssystem |
| Rinderwachstumsserum | HyClone | SH30541,02 | |
| Kammer-Bildgebungsträger | Ibidi | 80826 | |
| Konfokales Mikroskop | Nikon | NA | |
| Kundenspezifischer Metallobjektträger | NA | NA | Spezifikationen siehe Cabernard and Doe 2013 (Ref. 34) |
| Sezierschalen | Fisher Scientific | 5024343 | 3-Well-Porzellan-Mikropunktplatte |
| Präparierzange | World Precision Instruments | Dumont #5 | |
| Seziermikroskop | Leica | NA | |
| Sezierschere | Fine Science Tools (FST) | 15003-08 | |
| Käfig für die Embryonenentnahme | Genesee | 59-100 | |
| Flypad mit Zugang zu CO2 zur Betäubung erwachsener Fliegen | Genesee | 59-172 | |
| Gasdurchlässige Membran | YSI | 98095 | Gasdurchlässige Membran |
| Glasabdeckung Objektträger | Elektronenmikroskopie Sciences | 72204-03 | # 1,5; 22 mm x 40 mm Glasdeckgläser |
| Imaris | Oxford Instruments | NA | Alternativen: Fiji, Volocity, Aivia |
| Imaris File Converter | Oxford Instruments | NA | |
| Instant Hefe | Saf-Instant | NA | |
| Melasse | Genesee | 62-117 | |
| Petrischale | Greiner Bio-One | 628161 | 60 mm x 15 mm Petrischale |
| Vaseline | Vaseline | NA | |
| Schneider's Insect Medium mit L-Glutamin und Natriumbicarbonat flüssig | Millipore Sigma | S0146 | |
| SlideBook Erfassungssoftware | 3i | NA | |
| Vakuum-Driven Filtration Unit mit einem 0,22 & Mikro; &Mikro; m PES-Membranfilter | Genesee Scientific, GenClone | 25-231 |