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Prostatakrebs (PC) ist die 2. häufigste Krebserkrankung bei Männern und die 5. häufigste Todesursache weltweit1. Die Behandlung und Prognose des Patienten hängt vom Staging und der Einstufung (Gleason-Score) des Tumors ab, was sich in den höheren 5-Jahres-Überlebensraten von lokalisierten und niedriggradigen Tumoren (Gleason-Grad 6) (99 %) im Vergleich zu hohen Gleason-Tumoren und metastasierten Tumoren (31 %) zeigt2.
Das PC-Lokalrezidiv und das Versagen der Behandlung wurden mit der charakteristischen hohen genetischen Intratumorheterogenität dieses Tumortyps3 in Verbindung gebracht. Darüber hinaus wird die PC als multifokale Erkrankung mit mehreren Tumorherden mit unterschiedlichen morphologischen, histologischen und molekularen Merkmalen4 angesehen, die unabhängig voneinander oder von einem gemeinsamen Tumorzell-Vorfahren 5 stammenkönnen. Frühere Studien haben gezeigt, dass sich die Tumorevolution bei Patienten aufgrund spezifischer genetischer Treiber unterscheidet, die die Metastasierung fördern oder die Zelllinie auf die Prostata beschränken können5. Daher ist die molekulare Charakterisierung der verschiedenen Tumorherde nicht nur für eine genauere Diagnose und Prognose von entscheidender Bedeutung, sondern auch für eine maßgeschneiderte und personalisierte Behandlung für den Patienten.
In diesem Zusammenhang bieten die biomedizinische Forschung und integrative Multi-Omics-Ansätze beispiellose Möglichkeiten, Krebserkrankungen in verschiedene Subtypen zu klassifizieren, diagnostische und prognostische Biomarker zu identifizieren und Marker zu entdecken, die mit dem Ansprechen auf die Behandlung zusammenhängen. Darüber hinaus tragen diese Ansätze zu einem besseren Verständnis der Biologie dieser Erkrankung bei 6,7. Biologische Proben, ob Gewebe oder Bioflüssigkeiten, können mit verschiedenen Multi-Omics-Plattformen (Genomik, Transkriptomik, Proteomik, Metabolomik usw.) analysiert werden, um die biologischen Merkmale aufzudecken, die der Pathophysiologie von Krebs zugrunde liegen, und damit die derzeitigen Einschränkungen im Zusammenhang mit genetischer und phänotypischer Heterogenität zu beheben6. Es ist jedoch wichtig zu bedenken, dass die Qualität der aus Omics-Studien abgeleiteten Daten von der Qualität der von Tumoren entnommenen Proben, ihrer genauen Charakterisierung und der anschließenden Verarbeitung und Lagerung abhängt8.
In diesem Zusammenhang stellt die Gewinnung von frischem PC-Gewebe für die Forschung eine methodische Herausforderung dar, da eine erfolgreiche Tumorprobenahmeschwierig ist 9. Bisherige Methoden beinhalteten Zufallsstichproben nach radikaler Prostatektomie, die zu schlechten Ergebnissen führten10. Neuere Ansätze beinhalten jedoch gezielte Protokolle, die sowohl auf Magnetresonanztomographie (MRT) als auch auf Biopsiedaten basieren, was zu einer verbesserten Wirksamkeit bei der Entnahme von Tumorproben führt11.
Auf der anderen Seite stellt auch die histopathologische Charakterisierung von Proben vor ihrer Lagerung ohne signifikante Gewebeveränderungen eine interessante Herausforderung dar. Daher wird in vielen Fällen die histopathologische Bestimmung von Proben nach ihrer Analyse durchgeführt (z. B. HR 1H NMR-Metabolomanalyse)12. Diese Praxis führt zu unnötigen Kosten, Zeitaufwand und dem Verlust einer erheblichen Anzahl von Proben, die schließlich von der Analyse ausgeschlossen werden (z. B. Proben, die sich nach der histopathologischen Analyse als keine Tumorproben herausstellen). In anderen Fällen erfolgt die histopathologische Charakterisierung der Proben vor ihrer Analyse. In der Tat haben einige frühere Studien versucht, Methoden zur Bereitstellung repräsentativer, qualitativ hochwertiger Forschungsproben aus radikalen Prostatektomieproben für die Genomik und Metabolomik zu standardisieren13,14. Nichtsdestotrotz ist die Probenahmeeffizienz signifikant höher, wenn sie aus bereits histologisch bestätigten Schnitten (88 %) durchgeführt wird, die das Gewebe stören, verglichen mit unbestätigten Schnitten (45 %)1.
Hier wird eine neue Methodik vorgestellt, um diese Einschränkungen zu überwinden, die darauf abzielt, frische und gut charakterisierte PC-Proben vor der Lagerung in der Biobank zu erhalten. Diese Methode wurde in Zusammenarbeit zwischen verschiedenen klinischen Diensten (Urologie, Pathologie und Biobank des Krankenhauses La Fe) entwickelt. Es ist wichtig hervorzuheben, dass Biobanken eine wesentliche Rolle bei der Entnahme, Verarbeitung, Konservierung und Lagerung biologischer Proben spielen und gleichzeitig die hohe Qualität der Proben und Daten sowie die Einhaltung ethischer und rechtlicher Anforderungen gewährleisten 8,15,16.