In dieser Arbeit stellen wir ein hochauflösendes Respirometrie-Protokoll zur Analyse der Bioenergetik in PINK1 B9-Null-mutierten Fruchtfliegen vor. Die Methode verwendet das SUIT-Protokoll (Substrate-Uncoupler-Inhibitor-Titration).
Methodenartikel
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| ADP | Sigma-Aldrich | A5285 | Adenosin-5′-diphosphat sodium sal (CAS-Nummer 72696-48-1); ≥ 95%; Molekulargewicht = 501,31 g/mol. |
| &Aakut; gar | Kasv | K25-1800 | Zur bakteriologischen Anwendung |
| Antimycin-A | Sigma-Aldrich | A8674 | Antimycin A aus Streptomyces sp. (CAS-Nummer 1397-94-0); Molekulargewicht & nbsp; 540 g/mol; |
| Rinderserumalbumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A7030 | Rinderserumalbumin (CAS-Nummer 9048-46-8); pH 7,0 ≥ 98% |
| Datlab software | Oroboros Instruments, Innsbruck, Österreich | 20700 | Software zur Datenerfassung und -analyse |
| Digitonin | Sigma-Aldrich | D 5628 | CAS-Nummer 11024-24-1 |
| Destilliertes Wasser | |||
| Drosophila melanogaster Stamm w[*] Pink1[B9]/FM7i, P{w[+mC]=ActGFP}JMR3 | Gewonnen aus Bloomington Drosophila | ||
| StammcenterDrosophila melanogaster Stamm w1118 | Erhalten von der Federal University of Santa Maria | ||
| EGTA | Sigma-Aldrich | E8145 | Ethylenglykol-bis(2-aminoethylether)-N,N,N',N'-Tetraessigsäure (CAS-Nummer 13638-13-3); ≥ 97%; Molekulargewicht = 468,28 g/mol |
| FCCP | Sigma-Aldrich | C2920 | Carbonylcyanid 4- (trifluormethoxy)phenylhydrazon (CAS-Nummer 370-86-5); ≥ 98% (TLC), Pulver |
| GraphPad Prism Version 8.0.1. | Software zur Datenerfassung und -analyse | ||
| Hepes | Sigma-Aldrich | H4034 | 4-(2-Hydroxyethyl)piperazin-1-ethansulfonsäure (CAS-Nummer 7365-45-9); ≥ 99,5% (Titration), zellkultiviert getestet; Molekulargewicht = 238,30 g/mol |
| Hochauflösendes Respirometer Oxygraph O2K | Oroboros Instruments, Innsbruck, Österreich | 10022-02 | Startup O2K Respirometer Kit |
| KH2PO4 | Sigma-Aldrich | P5379 | Monokaliumphosphat (CAS-Nummer 7778-77-0); Reagenz Plus, molekulares Gewicht = 136,09 g/mol |
| KOH | Sigma-Aldrich | 211473 | Kaliumhydroxid (CAS-Nummer 1310-58-3); ACS-Reagenz, ≥ 85%, Pellets |
| Malat | Sigma-Aldrich | M1296 | Malonsäure (CAS-Nummer 141-82-2); 99%, Molekulargewicht = 104,06 g/mol). Eine Lösung wird auf einen pH-Wert von ca. 7,0 eingestellt. |
| Apfelsäure | Sigma-Aldrich | M1000 | (S)-(−)-2-Hydroxybernsteinsäure (CAS-Nummer 97-67-6); ≥ 95% ; Molekulargewicht = 134,09 g/mol |
| MES | Sigma-Aldrich | M3671 | 2-(N-Morpholino)ethansulfonsäure (CAS-Nummer 4432-31-9); ≥ 99% (Titration); Molekulargewicht = 195,24 g/mol |
| MgCl2 | Sigma-Aldrich | M8266 | Magnesiumchlorid (CAS-Nummer 7786-30-3); wasserfrei, ≥ 98%, Molekulargewicht = 95,21 g/mol |
| Mikrozentrifugenröhrchen | Eppendorf | ||
| O2K-Titration Set | Oroboros Instruments, Innsbruck, Österreich | 20820-03 | Hamilton Spritzen mit unterschiedlichen Volumina |
| Oligomycin | Sigma-Aldrich | O 4876 | Oligomycin aus Streptomyces diastatochromogenes (CAS-Nummer 1404-19-9); ≥ 90 % Gesamt-Oligomycin-Basis (HPLC) |
| Stempel zur Homogenisierung | |||
| Prolin | Sigma-Aldrich | P0380 | L-Prolin (CAS-Nummer 147-85-3); Pulver; 99 %; Molekulargewicht = 115,13 g/mol |
| Pyruvat | Sigma-Aldrich | P2256 | Natriumpyruvat (CAS-Nummer 113-24-6), ≥ 99%; Molekulargewicht = 110,04 g/mol |
| Rotenon | Sigma-Aldrich | R8875 | Roteton (CAS-Nummer 83-79-4); ≥ 95%, Molekulargewicht 394,42 g/mol |
| Succinat | Sigma-Aldrich | S 2378 | Natriumsuccinat zweibasisches Hexahydrat (CAS-Nummer 6106-21-4); ≥ 99% |
| Saccharose | Merck | 107.651.000 | Saccharose für die Mikrobiologie (CAS-Nummer 57-50-1) |
| Taurin | Sigma-Aldrich | T0625 | CAS-Nummer 107-35-7 |
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