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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dieses Protokoll beschreibt die Isolierung von gereinigten Astrozyten und Mikroglia aus dem Rückenmark der erwachsenen Maus und erleichtert spätere Anwendungen wie RNA-Analyse und Zellkultur. Es umfasst detaillierte Zelldissoziationsmethoden und -verfahren, die darauf ausgelegt sind, sowohl die Qualität als auch die Ausbeute isolierter Zellen zu verbessern.
Astrozyten und Mikroglia spielen eine zentrale Rolle bei der Entwicklung des zentralen Nervensystems, bei Verletzungsreaktionen und bei neurodegenerativen Erkrankungen. Diese hochdynamischen Zellen reagieren schnell auf Umweltveränderungen und weisen eine signifikante Heterogenität in Bezug auf Morphologie, Transkriptionsprofile und Funktionen auf. Während unser Verständnis der Funktionen von Gliazellen in Gesundheit und Krankheit erheblich fortgeschritten ist, besteht nach wie vor Bedarf an zellspezifischen In-vitro-Analysen, die im Zusammenhang mit Beleidigungen oder Verletzungen durchgeführt werden, um unterschiedliche Zellpopulationen umfassend zu charakterisieren. Die Isolierung von Zellen aus der adulten Maus bietet mehrere Vorteile gegenüber Zelllinien oder neonatalen Tieren, da sie die Analyse von Zellen unter pathologischen Bedingungen und zu bestimmten Zeitpunkten ermöglicht. Darüber hinaus ermöglicht die Fokussierung auf die rückenmarksspezifische Isolierung unter Ausschluss der Hirnbeteiligung die Erforschung von Rückenmarkspathologien, einschließlich experimenteller autoimmuner Enzephalomyelitis, Rückenmarksverletzungen und amyotropher Lateralsklerose. Dieses Protokoll stellt eine effiziente Methode zur Isolierung von Astrozyten und Mikroglia aus dem Rückenmark der erwachsenen Maus dar und erleichtert die unmittelbare oder zukünftige Analyse mit potenziellen Anwendungen in funktionellen, molekularen oder proteomischen Downstream-Studien.
Astrozyten und Mikroglia sind vielseitige Gliazellen, die eine wichtige Rolle im zentralen Nervensystem (ZNS) spielen und Aufgaben wie die Regulierung der neuronalen Funktion, den Beitrag zur Entwicklung des ZNS, die Aufrechterhaltung der Blut-Hirn-Schranke und die Beteiligung an anderen kritischen Prozessen übernehmen 1,2,3,4 . Neben ihrer Rolle bei der Aufrechterhaltung der Homöostase spielen diese Gliazellen auch eine zentrale Rolle bei Verletzungs- und Reparaturmechanismen. Mikroglia sind bekannt für ihre phagozytären, entzündlichen und migrierenden Fähigkeiten nach Beleidigungen oder Verletzungen 5,6,7. Die Reaktionen von Astrozyten auf Krankheiten sind ebenso vielfältig und umfassen Beiträge zu Entzündungen, zur Bildung von Glianarben und zur Beeinträchtigung der Blut-Hirn-Schranke 8,9. Obwohl unser Verständnis der schädlichen und reparierenden Rolle von Mikroglia und Astrozyten im ZNS gewachsen ist, erfordert die inhärente Heterogenität sowohl in ihrer Struktur als auch in ihrer Funktion robuste Werkzeuge, um sie in verschiedenen Kontexten zu untersuchen.
Um weitere Einblicke in die Rolle von Mikroglia und Astrozyten in Gesundheit und Krankheit zu gewinnen, ist ein kombinierter Ansatz von In-vivo - und In-vitro-Untersuchungen erforderlich. In-vivo-Techniken nutzen die komplizierte Kommunikation zwischen Gliazellen und Neuronen innerhalb des ZNS, während sich In-vitro-Methoden als wertvoll erweisen, wenn es darum geht, Einzelzellfunktionen oder -reaktionen unter bestimmten Stimuli zu beurteilen. Jede Methode bietet einzigartige Vorteile; In-vitro-Studien sind unerlässlich, um die spezifischen Rollen dieser Zelltypen ohne direkten oder indirekten Input von benachbarten Zellen zu verstehen. Darüber hinaus bieten In-vitro-Assays mit unsterblichen Zelllinien bestimmte Vorteile, darunter die Fähigkeit, sich unbegrenzt zu vermehren, Kosteneffizienz und einfache Wartung. Es ist jedoch wichtig zu beachten, dass Primärzellen im Vergleich zu Zelllinien normale physiologische Reaktionen besser nachahmen. Diese physiologische Relevanz ist bei funktionellen Assays und transkriptomischen Analysen von entscheidender Bedeutung.
Eine der Herausforderungen bei der Gewinnung von Primärzellen, insbesondere aus dem Rückenmark adulter Mäuse, liegt in der Menge und Lebensfähigkeit der Proben. Das Rückenmark von Erwachsenen ist kleiner als das Gehirn und enthält eine beträchtliche Menge an Myelin und stellt einzigartige Schwierigkeiten dar. Es gibt zwar mehrere veröffentlichte Protokolle, die die Isolierung reiner, lebensfähiger Gliazellen aus neugeborenen Tieren oder dem erwachsenen Mäusegehirn beschreiben 10,11,12,13, aber diese Methoden sind möglicherweise nicht für die Untersuchung von Erkrankungen und Verletzungen geeignet, die spezifisch für das Rückenmark sind. In diesem Protokoll bieten wir ein umfassendes Verfahren zur effizienten Isolierung reiner, lebensfähiger Mikroglia und Astrozyten aus dem Rückenmark der adulten Maus an, was nachgelagerte Anwendungen in Zellkulturen und transkriptomischen Analysen erleichtert. Dieses Protokoll wurde erfolgreich eingesetzt, um diese Zellen aus erwachsenen Mäusen im Alter von 10 Wochen bis 5 Monaten zu isolieren, was seine Nützlichkeit in verschiedenen Kontexten unter Beweis stellte, einschließlich Studien mit konditionalen Knockout-Mäusen, Arzneimittelreaktionen, Entwicklungsforschung und altersbezogenen Modellen.
Alle Tierpflege- und Versuchsverfahren wurden nach Genehmigung des Animal Care and Use Committee an der George Washington University School of Medicine and Health Sciences (Washington, D.C., USA; IACUC#2021-004). Für die Studie wurden männliche und weibliche C57BL/6J-Wildtyp-Mäuse (WT) im Alter von 10 Wochen bis 5 Monaten verwendet, die von einem kommerziellen Lieferanten bezogen wurden (siehe Materialtabelle) und an der George Washington University untergebracht waren. Eine Übersicht über den Protokollworkflow ist in Abbildung 1 dargestellt.
1. Vorbereitung des Rückenmarks
2. Enzymatische Zelldissoziation
3. Mechanische Zelldissoziation
4. Myelinentfernung
5. Isolierung von Mikroglia und Astrozyten
6. Plattieren von Zellen für In-vitro-Assays
HINWEIS: Wenn die Zellen nicht plattiert werden und sofort für die RNA-Analyse verwendet werden, fahren Sie mit Schritt 8 fort.
7. Immunhistochemie
HINWEIS: Es ist am besten, immunhistochemische Analysen nach mindestens 3 Tagen durchzuführen, wenn das Medium mindestens einmal ausgetauscht wurde. Dadurch wird sichergestellt, dass Schmutz entfernt wurde und die Zellen vollständig am Deckglas haften.
8. RNA-Extraktion
HINWEIS: Im Idealfall sollten mindestens 100.000 Zellen vorhanden sein, um genügend RNA für die Analyse zu extrahieren. Bei Bedarf können Zellen aus 2-3 Rückenmarks kombiniert werden.
Die in diesem Protokoll beschriebenen Methoden ermöglichen die Isolierung reiner und lebensfähiger Mikroglia und Astrozyten aus dem Rückenmark der erwachsenen Maus und erleichtern verschiedene nachgelagerte Anwendungen, einschließlich funktioneller oder histologischer In-vitro-Assays und RNA-Analysen.
Eine erfolgreiche Isolierung für In-vitro-Studien führt zu einer kontinuierlichen Zellproliferation über mehrere Tage. Adulte Zellen weisen im Vergleich zu Zellen, die von neugeborenen Tieren isoliert wurden, eine langsamere Proliferationsrate auf, und in den ersten Tagen können einige Trümmer vorhanden sein. Nach 4 Tagen in vitro (DIV) sollten die Zellen weitgehend frei von Ablagerungen sein, wobei die meisten Zellen am Kolbenboden haften. Astrozyten beginnen, längere Fortsätze zu bilden, während Mikroglia eine ovale Form mit kürzeren Spindeln annehmen (Abbildung 2). Bis 7 DIV sollten Astrozyten eine zusammenhängende konfluente Schicht bilden, und Mikroglia sollten weniger und kürzere Fortsätze aufweisen (Abbildung 3).
Die Reinheit kann durch doppelte Markierung von ACSA2-sortierten Zellen mit GFAP und O4 zur Beurteilung der Oligodendrozytenkontamination in Astrozytenkulturen und CD11b-sortierten Zellen mit Iba1 und GFAP zur Bewertung der Astrozytenkontamination in Mikrogliakulturen bestätigt werden (Tabelle 1).
Ein erfolgreiches Protokoll liefert auch qualitativ hochwertige RNA mit minimalem Abbau und ausreichender Menge (Abbildung 4A). Elektropherogramme von RNA, die aus isolierten Zellen extrahiert wurden, sollten markante 18S- und 28S-Peaks aufweisen. Eine Überdissoziation von Zellen oder eine längere Zeit zwischen Perfusion und Zellsortierung kann zu einem RNA-Abbau führen (Abbildung 4B). Eine unzureichende enzymatische und/oder mechanische Dissoziation oder eine unzureichende Myelinentfernung kann zu einer verminderten Zellausbeute und RNA führen (Abbildung 4C). Isolierte Astrozyten können sequenziert werden, um Entzündungsmarker zu identifizieren. Der Vergleich gesunder Astrozyten mit entzündungsaktivierten Astrozyten (z. B. von einem experimentellen autoimmunen Enzephalomyelitis-Tier) zeigt relative Hemmungen von Entzündungswegen bei gesunden und entzündlichen Astrozyten (Abbildung 4D).

Abbildung 1: Überblick über die Rückenmarkspräparation, die Gewebedissoziation und die Zellsortierung. Die Abbildung gibt einen Überblick über den Prozess der Rückenmarkspräparation, einschließlich der Gewebedissoziation und der Zellsortierung. Nach der Rückenmarksdissektion kommt es zu einer enzymatischen und mechanischen Dissoziation des Gewebes. Myelin wird entfernt und die Zellen werden mit Anti-ACSA2- oder Anti-CD11b-Antikörpern markiert, um Astrozyten und Mikroglia anzugreifen. Die sortierten Zellen können dann für Zellkulturen und RNA-Analysen verwendet werden. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Phasenkontrastaufnahmen von Astrozyten und Mikroglia nach 4 Tagen in vitro (4DIV). (A) Zeigt ein repräsentatives Beispiel von ACSA2+-sortierten Zellen mit verlängerten Fortsätzen. (B) CD11b+-Zellen weisen ovale Zellkörper und kurze Fortsätze auf. Maßstabsbalken = 50 μm. Diese Abbildung wurde von Ahn, J. J. et al.16 übernommen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Fluoreszenzbilder von Astrozyten und Mikroglia nach 8 Tagen in vitro (8DIV). (A) ACSA2+-Zellen, die mit GFAP (grün) und O4 (rot) markiert sind, zeigen eine minimale O4-Färbung und bilden eine zusammenhängende konfluierende Schicht von Astrozyten. (B) CD11b+-Zellen, die mit Iba1 (grün) und GFAP (rot) markiert sind, zeigen ein minimales Vorhandensein von GFAP. Maßstabsbalken = 50 μm. Diese Abbildung wurde von Ahn, J. J. et al.16 übernommen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Repräsentative Elektropherogramme von RNA-Proben. (A) Nach einer erfolgreichen Zellisolierung wird eine hohe Ausbeute und qualitativ hochwertige RNA erwartet. (B) Geringe Ausbeute, minderwertige RNA oder (C) geringe Ausbeute, hohe Qualität RNA kann in Fällen von Zelltod, unzureichender Dissoziation oder unzureichender Trümmerentfernung erwartet werden. (D) Die RNA-Sequenzierungsanalyse ausgewählter Entzündungswege in gesunden Astrozyten im Vergleich zu entzündlichen Astrozyten zeigt eine relative Hemmung der Entzündung in sortierten gesunden Astrozyten im Vergleich zu entzündlichen Astrozyten. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
| Zelltyp | Gesamte Zellzahl | Sortierte Zellen | % sortiert/gesamt | Durchschnittliche Rentabilität in % |
| ACSA2-KARTON | 6,3 x 105 | 1,7 x 105 | 27 | 92 |
| CD11b | 6,3 x 105 | 8,0 x 104 | 12.7 | 93 |
Tabelle 1: Zellausbeute, Reinheit und Lebensfähigkeit nach Sortierung für ACSA-2- und CD11b-Zellen. Diese Tabelle ist eine Adaption von Ahn, J. J. et al.16.
Nichts
Dieses Protokoll beschreibt die Isolierung von gereinigten Astrozyten und Mikroglia aus dem Rückenmark der erwachsenen Maus und erleichtert spätere Anwendungen wie RNA-Analyse und Zellkultur. Es umfasst detaillierte Zelldissoziationsmethoden und -verfahren, die darauf ausgelegt sind, sowohl die Qualität als auch die Ausbeute isolierter Zellen zu verbessern.
Wir danken Castle Raley vom George Washington University Genomics Core für RNA-Analysen und Q2 Lab Solutions für RNA-Sequenzierungsanalysen. Diese Arbeit wurde vom National Institute of Neurological Disorders and Stroke [Fördernummer F31NS117085] und dem Vivian Gill Research Endowment an Dr. Robert H. Miller unterstützt. Abbildung 1 wurde mit BioRender.com erstellt.
| 2,2,2-Tribromethanol | Sigma Aldrich | T48402 | |
| 24-Well-Gewebekulturplatte | Avantor | 10861-558 | |
| 2-Methyl-2-butanol, 98% | Thermo Fisher | A18304-0F | |
| 4',6-Diamidino-2-phenylindol, Dihydrochlorid | Invitrogen | D1306 | 1:1000 |
| 45%ige Glukoselösung | Corning | 25-037-CI | |
| 5 mL Röhrchen mit Deckel | Eppendorf | 30122305 | |
| Essigsäure | Sigma-Adlrich | A6283 | |
| Dissoziationskit für das Gehirn bei Erwachsenen | Miltenyi | 103-107-677 | |
| Anti-ACSA2 Microbead Kit | Miltenyi | 130-097-679 | |
| Anti-Iba1 | Wako | 019-1974 | |
| Bioanalysator | Agilent Technologien | G2939BA | |
| C57BL/6J Wildtyp-Mäusen (WT) | Jackson Laboratories | ||
| CD11b (Mikroglia) Mikroperlen | Miltenyi | 130-093-634 | |
| Celltrics 30 & micro; m Filter | Sysmex Partec | 04-004-2326 | |
| Zählkammer (Hämazytometer) | Hausser Scientific Co | 3200 | |
| Desoxyribonuklease I aus der bovinen Bauchspeicheldrüse | Sigma Aldrich | D4527-40KU | |
| Destilliertes Wasser | TMO | 15230001 | |
| DMEM/F12 | Thermo Fisher | 11320074 | |
| DNase für die RNA-Aufreinigung | Qiagen | 79254 | |
| Dulbecco's phosphatgepufferte Kochsalzlösung | Thermo Fisher | 14040117 | |
| fötales Rinderserum | Thermo Fisher | A5209401 | |
| GFAP-Antikörper (Maus) | Santa Cruz | sc-33673 | 1:500 |
| GFAP-Antikörper (Kaninchen) | Dako | Z0334 | 1:500 |
| Ziegen-Anti-Maus 594 IgG | Invitrogen | a11032 | 1:500 |
| Ziege Anti-Maus 594 IgM | Invitrogen | a21044 | 1:300 |
| Ziege Anti-Kaninchen 488 IgG | Invitrogen | a11008 | 1:500 |
| Iba1 Antikörper (Kaninchen) | Wako | 019-1974 | 1:500 |
| MACS Separator | Miltenyi | 130-042-303 | |
| Masterflex C/L Pumpensystem | Thermo Fisher | 77122-22 | |
| MEM | Corning | 15-015-CV | |
| Methanol | Sigma-Adlrich | 439193 | |
| Eindeckmedium | Vector Laboratories | H-1000-10 | |
| MS-Säulen | Miltenyi | 130-042-401 | |
| O4 Antikörper | R& D | MAB1326 | |
| Penicillin-Streptomycin | Gibco | 15070063 | |
| verstopfte 9" Glaspasteurpipette | VWR | 14672-412 | |
| RNeasy Plus Micro Kit | Qiagen | 74034 | |
| Royal-tek Chirurgische Skalpellklinge Nr. 10 | Fisher scientific | 22-079-683 | |
| Infusionsset für kleine Venen, 23 G x 19 mm | Kawasumi | D3K2-23G |